LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Microflow Chromatography Provides Improved Sensitivity and Coverage of Polar Metabolites for Targeted Metabolomics

Aplikace | 2017 | SCIEXInstrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QTRAP
Zaměření
Metabolomika
Výrobce
SCIEX

Souhrn

Význam tématu


Metabolomická analýza hraje klíčovou roli při objevování nových terapeutických cílů, hodnocení toxicity a sledování vlivu stravy či životního prostředí na zdraví. Identifikace a kvantifikace polárních metabolitů v moči, plazmě či buněčných extraktech je zásadní pro potvrzení biomarkerů onemocnění a pochopení metabolických drah. Tradiční RP-LC–MS/MS často selhává v detekci extrémně polárních sloučenin. Nasazení microflow HILIC-LC-MS/MS výrazně zvyšuje citlivost i rozsah pokrytí metabolomu, přičemž zároveň snižuje spotřebu rozpouštědel a provozní náklady.

Cíle a přehled studie


Cílem studie bylo vyvinout robustní a vysoce citlivý mikroflow HILIC LC-MRM workflow pro cílenou analýzu přes 300 polárních metabolitů v komplexních biologických matricích (moči, plazma, MDCK buňky). Konfigurace spojuje M3 MicroLC, kolonu Luna NH₂ a QTRAP 6500+ s IonDrive™ Turbo V zdrojem pro rychlé ± polarity přepínání a monitoring 363 MRM přechodů v jediném 30minutovém běhu.

Použitá metodika a instrumentace


  • Příprava vzorku: odvodnění proteinu acetoni­tril–acetone–methanol (8:1:1), sušení v TurboVap, re‐re‐suspendace v 100 % organického HILIC pufru (95 % ACN + 5 % fáze A, pH 9).
  • Analytická LC: SCIEX ExionLC HPLC, Luna 3 µm NH₂ (150×4,6 mm), flow 350 µL/min, gradient 100→2→100 % B.
  • Microflow LC: SCIEX M3 MicroLC, Luna 3 µm NH₂ (150×0,3 mm) s 1 µm pre-filtrací, flow 10 µL/min, stejný gradient.
  • MS/MS: SCIEX QTRAP® 6500+ s IonDrive™ Turbo V, ± polarity switching (5 ms), Curtain Gas 30, IonSpray 5500 V/–4500 V, teplota 500/300 °C.
  • Data processing: MultiQuant™ 3.0.2, Gaussian smooth 1.0 pt, minimum S/N 10, manuální validace.

Hlavní výsledky a diskuse


Optimalizace re‐re‐suspendace v 100 % fázi B přinesla zlepšení S/N až 60× oproti 75–85 % B. Metoda detekovala 263 unikátních metabolitů ze 312 cílů (296/363 Q1/Q3 přechodů). V porovnání s analytickým HILIC LC-MRM bylo dosaženo o 50 % více metabolitů v MDCK buňkách, 35 % více v moči a 11 % více v plazmě. Zlepšení průměrného S/N o 10× podpořilo detekci stopových úrovní a eliminaci nutnosti opakovaných injekcí či manuální validace.

Přínosy a praktické využití metody


  • Jeden cílený LC-MS/MS běh pokrývá >300 polárních metabolitů napříč hlavními biochemickými drahami.
  • Zvýšená citlivost a spolehlivost detekce minimálně 5–20× vyšší S/N.
  • Snížená spotřeba rozpouštědel a provozní náklady díky microflow režimu.
  • Vhodné pro screening biomarkerů, QA/QC v průmyslových a klinických laboratořích.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Integrace automatizované přípravy vzorků a on-line monitoringu.
  • Rozšíření panelu cílených metabolitů a modulární rozvoj multidimenzionálních přístupů.
  • Standardizace postupů pro klinickou metabolomiku a personalizovanou medicínu.
  • Využití ve vývoji farmakokinetických modelů a toxikologických studiích.

Závěr


Navržené mikroflow HILIC LC-MRM s využitím SCIEX M3 MicroLC a QTRAP 6500+ dosahuje výrazného zlepšení citlivosti, pokrytí a efektivity analýzy polárních metabolitů v komplexních biologických vzorcích. Metoda nabízí škálovatelnou, rychlou a ekonomickou alternativu k tradičním přístupům, usnadňující výzkum metabolomických biomarkerů a aplikace v průmyslu i medicíně.

Reference


  • Contrepois K., Jiang L., Snyder M. Optimized Analytical Procedures for the Untargeted Metabolomic Profiling of Human Urine and Plasma by Combining HILIC and RPLC–MS. Mol Cell Proteomics. 2015;14(6):1684–1695.
  • Ivanisevic J., Zhu Z.J., Plate L. et al. Toward ‘Omic Scale Metabolite Profiling: A Dual Separation–Mass Spectrometry Approach for Coverage of Lipid and Central Carbon Metabolism. Anal Chem. 2013;85(14):6876–6884.
  • Yuan M., Breitkopf S.B., Yang X., Asara J.M. A Positive/Negative Ion–Switching, Targeted Mass Spectrometry–Based Metabolomics Platform for Bodily Fluids, Cells, and Fresh and Fixed Tissue. Nat Protoc. 2012;7(5):872–881.
  • Motamamedchaboki K., Ubhi B.K. Improved Detection of Polar Metabolites in Complex Matrices Using M3 MicroLC and QTRAP 6500+. SCIEX Technical Note RUO-MKT-02-6110-A. 2017.
PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Metabolomics Differentiates Classified Cancer Samples
Metabolomics Differentiates Classified Cancer Samples Microflow Chromatography coupled with Targeted Metabolomics on QTRAP® 6500+ LC-MS/MS System Khatereh Motamedchaboki1, Dan Raftery2 and Baljit K. Ubhi1 1 SCIEX, Redwood City, CA, USA and 2University Washington, Seattle, WA, USA Identification of metabolites from…
Klíčová slova
microflow, microflowhealthy, healthycancer, cancermetabolites, metabolitesmetabolomics, metabolomicstargeted, targetedcolon, colondifferentiated, differentiatedindividuals, individualsclassified, classifiedplasma, plasmasensitivity, sensitivitypathways, pathwaysdarby, darbymadin
APPLICATION NOTEBOOK - UNTARGETED METABOLOMICS  AND LIPIDOMICS
[ APPLICATION NOTEBOOK ] UNTARGETED METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Development of a Metabolomic Assay for the Analysis…
Klíčová slova
neg, negpos, posacid, aciduplc, uplcaminoacid, aminoacidbasmati, basmatitransomics, transomicsbasic, basiclipids, lipidsmobility, mobilitylipid, lipidinformatics, informaticsprogenesis, progenesisnucleoside, nucleosidemetabolomics
Waters Oasis sample preparation - Application Notebook
Waters Oasis sample preparation - Application Notebook
2008|Agilent Technologies|Příručky
Oasis sample preparation Application Notebook Waters Oasis Family of sample extraction products The Oasis® family of sample extraction products is designed to acidic compounds, respectively. In 2004, we introduced mixed-mode simplify and improve your sample preparation by combining the right…
Klíčová slova
oasis, oasishlb, hlbmcx, mcxextraction, extractioncartridge, cartridgequattro, quattroconditions, conditionsesi, esiultima, ultimawaters, waterselectrospray, electrospraymax, maxchromatogram, chromatogramminutes, minutesmethod
ionkey/MS - APPLICATION COMPENDIUM
ionkey/MS - APPLICATION COMPENDIUM
2016|Waters|Příručky
[ ion key / MS ] APPLICATION COMPENDIUM Dear Colleague, The 2014 introduction of the ionKey/MS System was a turning point for LC-MS. The promise of increased levels of sensitivity from smaller sample sizes was finally a reality. We were…
Klíčová slova
ionkey, ionkeyikey, ikeyuplc, uplcsystem, systemplasma, plasmasensitivity, sensitivityion, ionhuman, humanusing, usingmobility, mobilityarea, areaseparation, separationassay, assaydevice, devicequantification
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.