Extracellular Flux Analysis and 13C Stable-Isotope Tracing Reveals Metabolic Changes in LPS-Stimulated Macrophages
Aplikace | 2020 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Macrofágy po stimulaci lipopolysacharidem (LPS) přecházejí k glykolytickému metabolismu, což je klíčové pro jejich imunologickou aktivaci. Kombinace fenotypové analýzy extracelulárního toku (OCR, ECAR) a stabilně izotopického trasování umožňuje sledovat metabolické dráhy v reálném čase a odhalit mechanismy buněčné energetiky.
Studie demonstruje synergii mezi Agilent Seahorse XF technologií pro měření bioenergetického profilu a 13C trasováním s Agilent LC/Q-TOF pro cílenou analýzu metabolitového toku při stimulaci RAW 264.7 makrofágů LPS po dobu 4 hodin.
Kombinace Seahorse XF analýzy a 13C stabilně izotopického trasování přináší ucelený obraz energetické a metabolické odpovědi makrofágů na LPS stimulaci a otvírá cestu k detailnímu zkoumání buněčného metabolismu.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika, Klinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Macrofágy po stimulaci lipopolysacharidem (LPS) přecházejí k glykolytickému metabolismu, což je klíčové pro jejich imunologickou aktivaci. Kombinace fenotypové analýzy extracelulárního toku (OCR, ECAR) a stabilně izotopického trasování umožňuje sledovat metabolické dráhy v reálném čase a odhalit mechanismy buněčné energetiky.
Cíle a přehled studie
Studie demonstruje synergii mezi Agilent Seahorse XF technologií pro měření bioenergetického profilu a 13C trasováním s Agilent LC/Q-TOF pro cílenou analýzu metabolitového toku při stimulaci RAW 264.7 makrofágů LPS po dobu 4 hodin.
Použitá metodika
- Kultivace RAW 264.7 buněk se směsí 12C/13C glukózy a stimulace LPS (100 ng/mL, 4 h).
- Extrahování metabolitů pomocí acetonitrilu/methanolu/vody (40:40:20) při –20 °C a centrifugace.
- Měření OCR a ECAR s pomocí XF Cell Mito Stress Test.
- Chromatografická separace HILIC metodou (Poroshell 120 HILIC-Z).
- Statistická analýza: Studentův t-test (p < 0,05).
Použitá instrumentace
- Agilent Seahorse XFp Analyzer s kartridžemi XF Cell Mito Stress Test.
- Agilent 1290 Infinity II LC s InfinityLab Poroshell 120 HILIC-Z kolonkou.
- Agilent 6546 LC/Q-TOF (negativní ionizace, m/z 40–1000).
- Software: MassHunter VistaFlux, Profinder, Omix Premium, Pathways to PCDL.
Hlavní výsledky a diskuse
- Aktivace LPS vyvolala 100násobný nárůst uvolněného TNFα, potvrzující funkční odpověď buněk.
- Fenotypová analýza ukázala přechod k glykolýze (zvýšené ECAR, snížená mitochondriální respirace).
- 13C trasování odhalilo silné zařazení značky do glykolytických intermediátů a TCA cyklu, zejména nárůst tvorby itakoniové kyseliny.
- Potlačení reduktivní větve TCA cyklu a přesměrování uhlíku vedoucí k produkci itakoniové kyseliny bylo potvrzeno změnami izotopologové distribuce.
Přínosy a praktické využití metody
- Integrace fenotypových a metabolomických dat umožňuje detailní charakterizaci bioenergetických adaptací buněk.
- Workflow lze aplikovat na různé buněčné typy a podmínky pro rychlou i hloubkovou analýzu metabolismu.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření na další stabilní izotopy (15N, 2H) a buněčné modely pro širší metabolické mapování.
- Přidání automatizovaných a vysokoprůchodových platforem pro flux analýzu.
- Vývoj pokročilých softwarových nástrojů pro komplexní interpretaci izotopologových dat.
Závěr
Kombinace Seahorse XF analýzy a 13C stabilně izotopického trasování přináší ucelený obraz energetické a metabolické odpovědi makrofágů na LPS stimulaci a otvírá cestu k detailnímu zkoumání buněčného metabolismu.
Reference
- O’Neill L.A. et al. Nat Rev Immunol. 2016.
- Loftus R.M., Finlay D.K. J Biol Chem. 2016.
- Kelly B., O’Neill L.A. Cell Res. 2015.
- Lampropoulou V. et al. Cell Metab. 2016.
- Mills E.L. et al. Nature. 2018.
- Kam Y. et al. Agilent Seahorse XF. 2018.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Illuminating the Cellular and Molecular Response to Drug Treatment by Combining Bioenergetic Measurements with LC/MS Omics
2024|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Metabolomics/Lipidomics Illuminating the Cellular and Molecular Response to Drug Treatment by Combining Bioenergetic Measurements with LC/MS Omics Agilent Seahorse XF Pro analyzer Agilent NovoCyte flow cytometer Agilent MassHunter Explorer software Agilent Revident LC/Q-TOF Authors Mark Sartain, Genevieve Van…
Klíčová slova
seahorse, seahorsemitochondrial, mitochondrialnovocyte, novocyteagilent, agilentrevident, revidentatp, atpcell, cellcytometer, cytometermetabolic, metabolicnovosampler, novosamplercells, cellswere, weretof, tofglycolysis, glycolysisexplorer
Your Path to Success - Agilent Solutions for Metabolomics
2019|Agilent Technologies|Brožury a specifikace
Your Path to Success Agilent Solutions for Metabolomics Understanding Metabolomics Agilent is the leading global solution provider for measuring metabolism, offering you a broad array of cutting-edge instrumentation and innovative informatics solutions. What is metabolomics? Metabolomics is the study of…
Klíčová slova
metabolomics, metabolomicsagilent, agilentfiehn, fiehnpathways, pathwaysseahorse, seahorsepathway, pathwayvistaflux, vistafluxmetabolite, metabolitemass, massmetlin, metlinidentify, identifymetabolites, metabolitesmetabolic, metaboliccoa, coadatabase
Discovery of a New Inhibitor for PFKFB2 Kinase Activity Through Mechanistic Studies
2025|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Life Science Research Discovery of a New Inhibitor for PFKFB2 Kinase Activity Through Mechanistic Studies Using complimentary metabolic analyses with an Agilent Seahorse XFe24 analyzer and an Agilent 6546 LC/Q-TOF system Authors Craig Eyster, Satoshi Matsuzaki, Atul Pranay,…
Klíčová slova
nmol, nmolseahorse, seahorseglycolytic, glycolyticinh, inhecar, ecaracid, acidoklahoma, oklahomarelative, relativeglycolysis, glycolysiskinase, kinaseadp, adpintensity, intensityresearch, researchintermediates, intermediatesatp
Illuminating the Cellular and Molecular Response to Drug Treatment by Combining Bioenergetic Measurements with Untargeted Metabolomics
2023|Agilent Technologies|Postery
Poster Reprint ASMS 2023 Poster number ThP 520 Illuminating the Cellular and Molecular Response to Drug Treatment by Combining Bioenergetic Measurements with Untargeted Metabolomics Mark Sartain1, Genevieve C. Van de Bittner1, Natalia Romero2, Yoonseok Kam2, Maria Apostolidi1, Dustin Chang1 1Agilent…
Klíčová slova
production, productionmitoatp, mitoatpatp, atpglycoatp, glycoatpseahorse, seahorsepmol, pmolbasal, basalrate, raterates, ratescellular, cellularuntargeted, untargetedvehicle, vehiclemitochondrial, mitochondriallipids, lipidsocr