Unprecedented depth and data quality in immunopeptidome profiling with the Orbitrap Astral mass spectrometer
Technické články | 2025 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Analýza imunopeptidomu poskytuje přímý pohled na peptidy prezentované MHC I molekulami na buněčném povrchu, což je klíčové pro porozumění buněčné imunitě a identifikaci tumor-specifických antigenů pro personalizované imunoterapie. Hlavní analytickou výzvou jsou nízké hladiny těchto peptidů, absence konzistentních enzymatických štěpných míst a omezené množství biologického materiálu (např. biopsie). Zvyšující se citlivost a dynamický rozsah hmotnostních spektrometrů je proto zásadní pro zvýšení hloubky pokrytí a kvality dat v immunopeptidomice.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
ZaměřeníProteomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Analýza imunopeptidomu poskytuje přímý pohled na peptidy prezentované MHC I molekulami na buněčném povrchu, což je klíčové pro porozumění buněčné imunitě a identifikaci tumor-specifických antigenů pro personalizované imunoterapie. Hlavní analytickou výzvou jsou nízké hladiny těchto peptidů, absence konzistentních enzymatických štěpných míst a omezené množství biologického materiálu (např. biopsie). Zvyšující se citlivost a dynamický rozsah hmotnostních spektrometrů je proto zásadní pro zvýšení hloubky pokrytí a kvality dat v immunopeptidomice.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Unlocking the immunopeptidome - High-sensitivity and accurate mass spectrometry with the Orbitrap Astral Zoom mass spectrometer for superior antigen characterization
2025|Thermo Fisher Scientific|Technické články
Technical note | 003923 Omics Unlocking the immunopeptidome High-sensitivity and accurate mass spectrometry with the Orbitrap Astral Zoom mass spectrometer for superior antigen characterization Authors Goal Fernanda Salvato1, Nicholas Cheung2, To assess depth and quality of immunopeptidome coverage using data-dependent…
Klíčová slova
astral, astralzoom, zoompeptides, peptidesfaims, faimsorbitrap, orbitrapimmunopeptidome, immunopeptidomepeptide, peptidehla, hlaneo, neocoverage, coveragequality, qualitysingly, singlymultiply, multiplyinput, inputcharged
Enhancing Immunopeptide Profiling with Orbitrap Astral Mass Spectrometer for Unbiased Discovery of Neoantigens
2024|Thermo Fisher Scientific|Postery
P-III-1101 Orbitrap Astral MS Enhancing Immunopeptide Profiling with Orbitrap Astral Mass Spectrometer for Unbiased Discovery of Neoantigens Fernanda Salvato, Lilian Heil, Ellen Casavant, Amirmansoor Hakimi, Tonya Pekar Hart Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA, USA Abstract Figure 2. Experimental workflow…
Klíčová slova
astral, astralorbitrap, orbitrappeptides, peptidesneo, neovanquish, vanquishdeepnovo, deepnovofaims, faimsimmunopeptide, immunopeptideuhplc, uhplcmhc, mhcspectrometer, spectrometerscan, scanmass, massdeeper, deeperpeptide
Leveraging advanced mass spectrometry technology with Orbitrap Astral Zoom MS for in depth immunopeptidome profiling
2025|Thermo Fisher Scientific|Postery
Orbitrap MS Leveraging advanced mass spectrometry technology with Orbitrap Astral Zoom MS for in depth immunopeptidome profiling Fernanda Salvato1, Nicholas Cheung2, Robert Salzler2, Ellen Casavant1,Tonya Pekar Hart1, Amirmansoor Hakimi1. 1Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA, USA, 2Regeneron Pharmaceuticals, Tarrytown, NY,…
Klíčová slova
faims, faimszoom, zoomastral, astralimmunopeptidome, immunopeptidomecharge, chargeorbitrap, orbitrappeptides, peptidesmultiply, multiplycharged, chargedneo, neoyes, yesmhc, mhcsingly, singlyvanquish, vanquishexclude
Immunopeptidomics: Harnessing cutting-edge technology for unprecedented depth and accessibility in analysis to leverage the immune response for precision therapy
2024|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Case study | 003393 Omics Immunopeptidomics: Harnessing cutting-edge technology for unprecedented depth and accessibility in analysis to leverage the immune response for precision therapy Introduction Rethink what is possible Immunopeptidomics is the study of the peptides presented by The Orbitrap…
Klíčová slova
astral, astralhla, hlaorbitrap, orbitrapimmunopeptidome, immunopeptidomeimmunopeptidomics, immunopeptidomicspeptides, peptidesbiopsy, biopsyantigens, antigensregeneron, regeneronpeptide, peptideneo, neodata, datauhplc, uhplcvanquish, vanquishdependent
