A Rapid Approach to Metabolite Identification Using Xevo MRT Mass Spectrometer and MassMetaSite Software
Aplikace | 2025 | WatersInstrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS, Software
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Metabolitická identifikace je klíčová pro výběr léčivých sloučenin, hodnocení bezpečnosti a porovnání mezi druhy. V počátečních fázích výzkumu umožňuje rychlou selekci kandidátů a podporuje rozhodování o dalším vývoji.Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo demonstrovat vysoce propustnou platformu pro identifikaci metabolitů využívající vysokorychlostní hmotnostní spektrometr Xevo MRT, systém ACQUITY Premier UPLC a software MassMetaSite. Modelovou látkou byl H1-antagonista methapyrilen analyzovaný v moči potkanů pomocí 5minutové LC-MS metody.Použitá metodika a instrumentace
Vzorky moče Wistar potkanů po opakované orální aplikaci methapyrilenu (0, 50, 150 mg/kg) byly připraveny deproteinací mícháním s ACN/MeOH (90:10), chlazeny, centrifugovány a ředěny vodou. Analýza probíhala na reversed-phase ACQUITY Premier UPLC (C18 CORTECS 1,6 µm, 2,1×50 mm, gradient 5–95 % B/5 min, 0,6 ml/min) spojeném s Xevo MRT Mass Spectrometerem v pozitivním ESI módu. Spektrální data byla zpracována pomocí waters_connect pro konverzi do mzML a následně analyzována v MassMetaSite pro automatizovanou identifikaci metabolitů.- ACQUITY Premier UPLC System
- CORTECS C18 1,6 µm, 2,1×50 mm kolona
- Xevo MRT Mass Spectrometer
- waters_connect Software Platform
- MassMetaSite (Mass Analytica)
Hlavní výsledky a diskuse
Celkem bylo identifikováno 42 metabolitů methapyrilenu s hmotnostní chybou pod 1 ppm. Detekovány byly různé biotransformační cesty, včetně demetylace, oxidace, glukuronidace a bioaktivace thiophenového kruhu. Xevo MRT zajistil získání více než 10 spekter na chromatografický pík i při šířce píků okolo 3 s, což dovolilo spolehlivou lokalizaci míst biotransformace.Přínosy a praktické využití metody
- Vysoká propustnost díky krátkému LC běhu a rychlé HRMS akvizici.
- Sub-ppm hmotnostní přesnost zvyšuje důvěru ve struktury metabolitů.
- Automatizovaný workflow redukuje manuální zásahy a čas analýzy.
- Široce aplikovatelná platforma vhodná pro screening i rozsáhlé ADME studie.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace strojového učení pro predikci a přiřazení metabolitů.
- Zahrnutí in vitro systémů (mikrosomy, hepatocyty) pro komplexní ADME profil.
- Propojení s dalšími bioinformatickými nástroji pro holistický pohled na metabolismus.
- Využití ve vývoji biologických léčiv a komplexních farmaceutických formulací.
Závěr
Kombinace ACQUITY Premier UPLC, Xevo MRT MS a MassMetaSite představuje robustní řešení pro rychlou a přesnou identifikaci metabolitů. Díky sub-ppm přesnosti a širokému dynamickému rozsahu lze detekovat a strukturovat i stopové metabolity při vysoké propustnosti.Reference
- Plumb RS et al. J Pharm Biomed Anal. 2025;264:116976.
- Graichen ME et al. Fundam Appl Toxicol. 1985;5:165-174.
- Ratra GS et al. Toxicol Sci. 1998;46:185-196.
- Ratra GS et al. Chem Biol Interact. 2000;129:279-295.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Investigating Drug Metabolism of Methapyrilene Within a Rat Model Using a Data Dependent Acquisition Workflow with the Xevo MRT Mass Spectrometer
2025|Waters|Aplikace
Application Note Investigating Drug Metabolism of Methapyrilene Within a Rat Model Using a Data Dependent Acquisition Workflow with the Xevo MRT Mass Spectrometer Lee A. Gethingsa, Richard Locka, Susan Abatiellob, Jennifer Seymourc, Terri Sosienskic, Jeff Finchc, Jeremy Feltonc , Donald…
Klíčová slova
mrt, mrtmethapyrilene, methapyrileneinvestigating, investigatingxevo, xevorat, ratmetabolism, metabolismdrug, drugdependent, dependentmodel, modelworkflow, workflowspectrometer, spectrometeracquisition, acquisitionwithin, withindata, datamass
Effects on Endogenous Metabolites Following the Administration of Methapyrilene: A Data-Dependent Acquisition Workflow Using the Xevo™ MRT Mass Spectrometer
2025|Waters|Aplikace
Application Note Effects on Endogenous Metabolites Following the Administration of Methapyrilene: A Data-Dependent Acquisition Workflow Using the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Lee A. Gethings,a Susan Abatiello,b Jennifer Seymour,c Terri Sosienski,c Jeff Finch,c Jeremy Felton,c Donald Laudicina,c Richard Lock,a Robert S.…
Klíčová slova
mrt, mrtxevo, xevoworkflow, workflowspectrometer, spectrometermass, massusing, usingmetabolomic, metabolomicidentifications, identificationsprivacy, privacyfalse, falsedeciphering, decipheringphenotypes, phenotypeschallenging, challengingrats, ratseffects
Rapid Identification of the In Vivo Biotransformations of a Targeted Protein Degrader (PROTACs) Using Xevo G3 QTof and waters_connect Software Platform
2025|Waters|Aplikace
Application Note Rapid Identification of the In Vivo Biotransformations of a Targeted Protein Degrader (PROTACs) Using Xevo G3 QTof and waters_connect Software Platform Robert S. Plumb Waters Corporation, United States Published on June 05, 2025 Contact Sales Abstract PROteolysis TArgeting…
Klíčová slova
protacs, protacsgefitinib, gefitinibbiotransformation, biotransformationligase, ligasedrug, drugidentification, identificationmetabolites, metabolitesvivo, vivodata, datauplc, uplcprivacy, privacyformate, formatevhl, vhlmetabolic, metabolichrms
Mining Drug Metabolite Data Using waters_connect™ LC-MS Toolkit, Mass Fragment and Tandem Quadrupole LCMS/ MS
2025|Waters|Aplikace
Application Note Mining Drug Metabolite Data Using waters_connect™ LC-MS Toolkit, Mass Fragment and Tandem Quadrupole LCMS/MS Robert Plumb, Peter Christensen, Nikunj Tanna Waters Corporation, United States Published on December 05, 2025 Application Brief This is an Application Brief and does…
Klíčová slova
toolkit, toolkitmassfragment, massfragmentmethapyrilene, methapyrilenedesmethyl, desmethylcompare, compareprivacy, privacycomparison, comparisonmass, massmetabolite, metabolitexevo, xevoformed, formedusing, usingquadrupole, quadrupoleabsolute, absolutethree