Simultaneous Quantitation and Untargeted Discovery (SQUAD) workflow using multiple fragmentation techniques for quantitation and characterization of trace level nitrosamine in biological matrices
Postery | 2025 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
N-Nitrosaminy představují skupinu vysoce karcinogenních nízkomolekulárních sloučenin, které se mohou vyskytovat v potravinách, vodě, kosmetice či jako nečistoty ve farmaceutických produktech. Přesné stanovení jejich stopových koncentrací v biologických matricích je klíčové pro hodnocení expozice, riziko vzniku onemocnění a zajištění kvality surovin a finálních výrobků.
Cílem předložené studie bylo vyvinout a optimalizovat SQUAD (Simultaneous Quantitation and Untargeted Discovery) workflow umožňující současnou cílenou kvantifikaci známých nitrosaminů a neřízenou detekci neznámých látek v jediné chromatograficko-hmotnostní analýze. Metodika byla ověřena na spikovaných extraktech lidské moči a lidského séra.
Pro přípravu vzorků byly standardy směsi EPA 521 ve ředění od 100 fg/mL do 25 ng/mL rozpustné v methanolu aplikovány do ředěných extraktů lidské moči a séra. Chromatografická separace probíhala na analytickém a nano UHPLC systému s použitím gradientu vody a methanolu s 0,1 % kyseliny mravenčí. Paralelní měření se provádělo v lineární iontové pasti pro cílenou kvantifikaci a v Orbitrapu ve vysokém rozlišení pro datově závislou neřízenou analýzu. Fragmentace vzorků byla realizována pomocí HCD, CID a UVPD, což umožnilo charakterizovat izomerické formy.
Metoda dosáhla detekčních mezí (LOD) v rozsahu 0,2–2 ppb a kvantifikačních mezí (LOQ) 0,5–5 ppb pro sedm klíčových nitrosaminů (NDMA, NMEA, NDEA, NPYR, NPIP, NIPA, NDBA) v extraktech lidské moči. Při nanoLC byla kvantifikace možná až na úrovni jednotek fg (ppt). Lineární závislost signálu na koncentraci vykázala koeficient R2 nad 0,99. Současně byly neznámé nitrosaminy úspěšně identifikovány v režimu discovery analýzy ve vysokém rozlišení.
Optimalizovaný SQUAD workflow pro Orbitrap IQ-X Tribrid MS nabízí spolehlivou a citlivou metodiku pro paralelní kvantifikaci a objevování nitrosaminů v biologických matricích. Metoda prokázala výborné analytické parametry (LOD, LOQ, linearita) a poskytuje komplexní nástroj pro výzkum, QA/QC i regulaci karcinogenních nečistot.
LC/Orbitrap, LC/HRMS, LC/MS/MS, LC/MS
ZaměřeníMetabolomika, Lipidomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
N-Nitrosaminy představují skupinu vysoce karcinogenních nízkomolekulárních sloučenin, které se mohou vyskytovat v potravinách, vodě, kosmetice či jako nečistoty ve farmaceutických produktech. Přesné stanovení jejich stopových koncentrací v biologických matricích je klíčové pro hodnocení expozice, riziko vzniku onemocnění a zajištění kvality surovin a finálních výrobků.
Cíle a přehled studie
Cílem předložené studie bylo vyvinout a optimalizovat SQUAD (Simultaneous Quantitation and Untargeted Discovery) workflow umožňující současnou cílenou kvantifikaci známých nitrosaminů a neřízenou detekci neznámých látek v jediné chromatograficko-hmotnostní analýze. Metodika byla ověřena na spikovaných extraktech lidské moči a lidského séra.
Použitá metodika
Pro přípravu vzorků byly standardy směsi EPA 521 ve ředění od 100 fg/mL do 25 ng/mL rozpustné v methanolu aplikovány do ředěných extraktů lidské moči a séra. Chromatografická separace probíhala na analytickém a nano UHPLC systému s použitím gradientu vody a methanolu s 0,1 % kyseliny mravenčí. Paralelní měření se provádělo v lineární iontové pasti pro cílenou kvantifikaci a v Orbitrapu ve vysokém rozlišení pro datově závislou neřízenou analýzu. Fragmentace vzorků byla realizována pomocí HCD, CID a UVPD, což umožnilo charakterizovat izomerické formy.
Použitá instrumentace
- Thermo Scientific Vanquish Horizon UHPLC
- Thermo Scientific Vanquish Neo UHPLC (nano flow)
- Thermo Scientific Orbitrap IQ-X Tribrid mass spectrometer
- ACQUITY UPLC BEH Phenyl column, 100×2,1 mm, 1,7 µm
- Thermo Scientific EASY-Spray C18 HPLC column pro nanoLC
- Software FreeStyle, Mass Frontier 8.0, Compound Discoverer 3.4, TraceFinder 5.2
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda dosáhla detekčních mezí (LOD) v rozsahu 0,2–2 ppb a kvantifikačních mezí (LOQ) 0,5–5 ppb pro sedm klíčových nitrosaminů (NDMA, NMEA, NDEA, NPYR, NPIP, NIPA, NDBA) v extraktech lidské moči. Při nanoLC byla kvantifikace možná až na úrovni jednotek fg (ppt). Lineární závislost signálu na koncentraci vykázala koeficient R2 nad 0,99. Současně byly neznámé nitrosaminy úspěšně identifikovány v režimu discovery analýzy ve vysokém rozlišení.
Přínosy a praktické využití
- Rychlá a komplexní analýza známých i neznámých nitrosaminů v jednom běhu
- Vysoká citlivost umožňující detekci na úrovni ppt–ppb
- Uplatnění v kontrolách kvality léčiv, potravin, vody a biologických vzorků
- Flexibilita využití různých fragmentačních technik pro detailní charakterizaci sloučenin
Budoucí trendy a možnosti využití
- Další zdokonalení nanoLC pro zvýšení citlivosti a rozlišení
- Aplikace strojového učení pro automatizovanou identifikaci neznámých látek
- Rozšíření workflow na jiné třídy stopových kontaminantů
- Integrace s režimy ion mobility pro lepší separaci izomerů
Závěr
Optimalizovaný SQUAD workflow pro Orbitrap IQ-X Tribrid MS nabízí spolehlivou a citlivou metodiku pro paralelní kvantifikaci a objevování nitrosaminů v biologických matricích. Metoda prokázala výborné analytické parametry (LOD, LOQ, linearita) a poskytuje komplexní nástroj pro výzkum, QA/QC i regulaci karcinogenních nečistot.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap-based mass spectrometers
2023|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
White paper | 002540 Omics Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap-based mass spectrometers Authors Table of contents Bashar Amer, Julian Saba, 1. Introduction Rahul R. Deshpande, and Susan S. Bird 1.1. Untargeted metabolomics…
Klíčová slova
orbitrap, orbitrapsquad, squaduntargeted, untargetedastral, astralmetabolomics, metabolomicstargeted, targeteddiscovery, discoveryhram, hrammetabolites, metabolitesannotation, annotationanalysis, analysisfragmentation, fragmentationconfident, confidentquantitation, quantitationmass
Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) metabolomics workflow implementing parallel analysis on Thermo Ascend Tribrid instrument
2023|Thermo Fisher Scientific|Postery
Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) metabolomics workflow implementing parallel analysis on Thermo Ascend Tribrid instrument Bashar Amer1, Jingjing Huang1, David Bergen1, Rahul Ravi Deshpande1, Vlad Zabrouskov1, and Susan S. Bird1, 1Thermo Fisher Scientific, San Jose, USA ABSTRACT MATERIALS AND METHODS…
Klíčová slova
ascend, ascendtribrid, tribridsquad, squadorbitrap, orbitrapuntargeted, untargetedlinear, lineartrap, trapdiscovery, discoveryfemto, femtoanalyzer, analyzermole, molelabeled, labeledsensitive, sensitivequantitation, quantitationsacrificing
Orbitrap Ascend MultiOmics Tribrid mass spectrometer
2024|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Scale up your multiomics research Orbitrap Ascend MultiOmics Tribrid mass spectrometer Scale up multiomics insight Be prepared for tomorrow’s most challenging demands Built to meet the demands of multiomics research, the Thermo Scientific™ Orbitrap™ Ascend MultiOmics Tribrid™ mass spectrometer incorporates…
Klíčová slova
multiomics, multiomicsascend, ascendtribrid, tribridorbitrap, orbitrapndc, ndcinclusion, inclusionscale, scalemass, massion, ionlist, listscientific, scientificthermo, thermospectrometer, spectrometerglycopeptide, glycopeptidelabile
Simultaneous quantitation and discovery (SQUAD) metabolomics workflow on the orbitrap IQ-X for the analysis of fecal bile acids
2024|Thermo Fisher Scientific|Postery
Metabolomics via SQUAD Simultaneous quantitation and discovery (SQUAD) metabolomics workflow on the orbitrap IQ-X for the analysis of fecal bile acids Allison Stewart1, Bashar Amer2, Rahul Deshpande1, Andrew Percy3, Krista Backiel3, Joshua P. Kline2, Brandon Bills2, and Susan Bird2 1ThermoFisher…
Klíčová slova
squad, squadbile, bilebas, basfecal, fecalacids, acidsmetabolomics, metabolomicsquantitation, quantitationquantify, quantifyprimary, primarysimultaneous, simultaneousdiscovery, discoverysecondary, secondaryworkflow, workflowconjugates, conjugateslist