Screening of Sample Matrices and Individual Matrix Ingredients for Suitability in AAA-Direct™
Technické články | 2016 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Analýza aminokyselin v komplexních matricích je klíčová pro mnoho oblastí od potravinářského průmyslu po biotechnologii. Elektrochemická detekce pomocí metody AAA-Direct poskytuje citlivé a selektivní stanovení bez nutnosti derivatizace. Nicméně přítomnost složek vzorku může ovlivnit separaci a signál na elektrochemickém detektoru, proto je nezbytné skrínovat vzorkové matrice na možné interference.
Cílem technické zprávy je popsat standardizovaný postup pro hodnocení vlivu složek vzorkové matrice (označovaných jako test sample, TS) na stanovení aminokyselin metodou AAA-Direct. Studie demonstruje tuto proceduru na příkladu ethanolu v rozsahu 0,1–50 % (v/v) a uvádí možná omezení, jako je koeluce s Arg nebo fouling elektrody.
Vzorky a standardy:
Test ethanolu ukázal výraznou koeluci s argininem již při 3 %, což překrylo špičku Arg a ovlivnilo i včasně eluující AK (Lys, Ala, Gly, Val). Plochy a výšky signálů těchto AK klesaly až o 20–40 % s rostoucí koncentrací ethanolu. Retenční doby zůstaly relativně stabilní (<3 % změna), i při 50 % ethanolu. Post-TS injekce prokázaly fouling elektrody při vysokých koncentracích ethanolu, který se však postupně samočisticími pulzy částečně obnovoval. Podobné skrínování nitritu a sulfitu prokázalo, že sulfite koeluje s Asp a reakční produkty ovlivňují plochu signálu.
Popisovaný postup umožňuje rychlou a systematickou kontrolu vhodnosti vzorkové matrice pro elektrochemickou analýzu aminokyselin bez nutnosti časově náročného optimalizačního experimentu. Rozlišení matričních efektů od foulingu elektrody usnadňuje rozhodnutí o úpravě přípravy vzorku nebo parametrech chromatografie. Postup lze adaptovat i pro jiné elektrochemické metody (karbohydráty, antibiotika).
Očekává se vyšší automatizace vyhodnocení a reportingu v rámci LIMS nebo Chromeleonu, rozšíření skrínování na biofluidy a složité fermentační matrice a integrace online čisticích kroků (např. SPE). Využití strojového učení pro predikci možných interferencí z chemické struktury složek vzorku by mohlo dále zrychlit validaci metod.
Navržená skrínovací procedura pro AAA-Direct prokázala robustnost a flexibilitu při identifikaci matričních interferencí a foulingu elektrody. Poskytuje jasná kritéria pro rozhodování o vhodnosti vzorku a pomáhá optimalizovat chromatografické a detekční podmínky.
Iontová chromatografie
ZaměřeníVýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Analýza aminokyselin v komplexních matricích je klíčová pro mnoho oblastí od potravinářského průmyslu po biotechnologii. Elektrochemická detekce pomocí metody AAA-Direct poskytuje citlivé a selektivní stanovení bez nutnosti derivatizace. Nicméně přítomnost složek vzorku může ovlivnit separaci a signál na elektrochemickém detektoru, proto je nezbytné skrínovat vzorkové matrice na možné interference.
Cíle a přehled studie
Cílem technické zprávy je popsat standardizovaný postup pro hodnocení vlivu složek vzorkové matrice (označovaných jako test sample, TS) na stanovení aminokyselin metodou AAA-Direct. Studie demonstruje tuto proceduru na příkladu ethanolu v rozsahu 0,1–50 % (v/v) a uvádí možná omezení, jako je koeluce s Arg nebo fouling elektrody.
Použitá metodika a postup
Vzorky a standardy:
- Aminokyselinový mix (17 AK, 9,6–11,6 µM) připravený z NIST SRM 2389 a Trp 250 µM.
- Testovaný vzorek: ethanol v 0,1, 1, 3, 10 a 50 % (v/v).
- Autosampler injekce sekvence: voda, triplikáty standardu, TS, TS + standardy, opět standardy.
- Hodnocení: posun retenční doby, změny plochy a výšky signálu před a po vystavení TS.
- Výpočet matričních efektů a post-TS efektů pomocí 99% intervalů spolehlivosti.
Použitá instrumentace
- Chromatografický systém Dionex BioLC s pumpou GP50/GS50 (microbore, PEEK, degas).
- Elektrochemický detektor ED50 s programovatelnou pulzní amperometrií.
- Autosampler AS50 s tepelným oddělením a smyčkou 25 µL.
- Eluent organizer EO1, tři lahve 2 L a regulátor tlaku.
- Software Chromeleon Workstation.
- Sterilní mikrocentrifugační zkumavky, filtr 0,2 µm nylon, dusík 4.8 (99,998 %).
Hlavní výsledky a diskuse
Test ethanolu ukázal výraznou koeluci s argininem již při 3 %, což překrylo špičku Arg a ovlivnilo i včasně eluující AK (Lys, Ala, Gly, Val). Plochy a výšky signálů těchto AK klesaly až o 20–40 % s rostoucí koncentrací ethanolu. Retenční doby zůstaly relativně stabilní (<3 % změna), i při 50 % ethanolu. Post-TS injekce prokázaly fouling elektrody při vysokých koncentracích ethanolu, který se však postupně samočisticími pulzy částečně obnovoval. Podobné skrínování nitritu a sulfitu prokázalo, že sulfite koeluje s Asp a reakční produkty ovlivňují plochu signálu.
Přínosy a praktické využití metody
Popisovaný postup umožňuje rychlou a systematickou kontrolu vhodnosti vzorkové matrice pro elektrochemickou analýzu aminokyselin bez nutnosti časově náročného optimalizačního experimentu. Rozlišení matričních efektů od foulingu elektrody usnadňuje rozhodnutí o úpravě přípravy vzorku nebo parametrech chromatografie. Postup lze adaptovat i pro jiné elektrochemické metody (karbohydráty, antibiotika).
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se vyšší automatizace vyhodnocení a reportingu v rámci LIMS nebo Chromeleonu, rozšíření skrínování na biofluidy a složité fermentační matrice a integrace online čisticích kroků (např. SPE). Využití strojového učení pro predikci možných interferencí z chemické struktury složek vzorku by mohlo dále zrychlit validaci metod.
Závěr
Navržená skrínovací procedura pro AAA-Direct prokázala robustnost a flexibilitu při identifikaci matričních interferencí a foulingu elektrody. Poskytuje jasná kritéria pro rozhodování o vhodnosti vzorku a pomáhá optimalizovat chromatografické a detekční podmínky.
Reference
- Dionex Corporation. Installation Instructions and Troubleshooting Guide for the AAA-Direct Amino Acid Analysis System; 031481.
- Dionex Corporation. Determination of the Amino Acid Content of Peptides by AAA-Direct; Technical Note 50.
- Jandik P. et al. New Technique for Increasing Retention of Arginine on an Anion-Exchange Column. Anal. Biochem. 2000, 287, 38–44.
- Dionex Corporation. Determination of Sulfite in Food and Beverages by Ion Exclusion Chromatography with Pulsed Amperometric Detection; Application Note 54.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Determination of Amino Acids in Cell Cultures and Fermentation Broths
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 150 Determination of Amino Acids in Cell Cultures and Fermentation Broths INTRODUCTION Cell cultures and fermentation broths are used in the manufacture of biotherapeutics and many other biological materials produced using recombinant genetic technology. Broths are also used…
Klíčová slova
amino, aminobroths, brothsfermentation, fermentationacids, acidsbroth, brothsigma, sigmanaoh, naohcarbohydrates, carbohydratescultures, culturesaaa, aaaypd, ypdmedia, mediachemical, chemicalcell, cellculture
Identification of a Hydroxylysine-Containing Peptide Using AAA-Direct
2003|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 130 Identification of a Hydroxylysine-Containing Peptide Using AAA-Direct™ INTRODUCTION One type of protein microheterogeneity is a result of the posttranslational modification of lysine (Lys) to hydroxylysine (Hyl). This modification normally occurs in collagen and a few other proteins…
Klíčová slova
amino, aminopeptide, peptideaaa, aaahydroxylysine, hydroxylysineacid, acidmole, molehyl, hylfractions, fractionsdirect, directexchange, exchangeminutes, minutescation, cationlys, lyspeptides, peptidescystine
Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 163 Determination of Protein Concentrations Using AAA-Direct™ INTRODUCTION Dye-binding assays such as bicinchoninic acid (BCA), Lowry, and Bradford (Coomassie) are the most common methods to determine total protein. The BCA assay depends on Cu (II) reduction to Cu…
Klíčová slova
aaa, aaaprotein, proteinamino, aminohydrolysate, hydrolysatebsa, bsadirect, directundiluted, undilutedconcentrations, concentrationsacid, acidconcentration, concentrationwater, wateracids, acidshydrolysis, hydrolysistotal, totaldetermination
Carbohydrate and Amino Acid Analysis Using 3-D Amperometry
2007|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Application Note 179 Carbohydrate and Amino Acid Analysis Using 3-D Amperometry INTRODUCTION AAA-Direct™ is an established technique for amino acid analysis. This technique has proven capabilities for separation of amino acids and carbohydrates in complex samples containing a large number…
Klíčová slova
waveform, waveformoff, offintegration, integrationcarbohydrates, carbohydratesaaa, aaanaoh, naohamino, aminoproline, prolineglycine, glycineserine, serineamperometry, amperometrybroth, brothranges, rangesglucose, glucoseminutes