LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

MULTIPLEXED TARGETED IMAGING OF INTACT PROTEINS IN TISSUE BY MULTI REFLECTING TIME OF FLIGHT (MRT) MALDI-IHC

Postery | 2024 | Waters | ASMSInstrumentace
MS Imaging, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu


Multiplexní zobrazování proteinů v tkáni pomocí MALDI-IHC nabízí revoluční přístup ke studiu prostorové distribuce proteinů bez nutnosti jejich trávení či použití tradiční imunofluorescence s omezeným počtem markerů. Díky fotookyvatelným peptidovým štítkům navázaným na protilátky lze sledovat více než 40 cílových proteinů v rámci jedné tkáňové sekce s vysokou přesností a minimálním pozadím.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem prezentované práce bylo ověřit kompatibilitu a výkonnost metody MALDI-IHC na spektrometru SELECT SERIES MRT s MALDI zdrojem. Autoři demonstrovali schopnost zachytit prostorové rozložení proteinových markerů ve FFPE sekcích lidské mandlí a renálního karcinomu pomocí multiplexního zobrazování.

Použitá metodika a instrumentace


Popis vzorků:
  • FFPE sekce lidské mandle (kontrolní vzorek) a ledviny s karcinomem ledvin (ccRCC, ISUP grade 3).
  • Příprava dle protokolu AmberGen MALDI HiPLEX-IHC Miralys Imaging Workflow.

Příprava vzorků:
  • Odparafínování, rehydratace, antigen-retrieval a blokace.
  • Imunobarvení pomocí šesti protilátek (CD3ε, CD68, VIM, kolagen-1A1, PanCK, Ki67 pro mandle; VIM, Actin-aSM, PanCK, Ki67 pro ledvinu).
  • UV osvětlení pro uvolnění peptidových štítků a nanesení CHCA matrix pomocí HTX M5 sprayeru.

Instrumentace:
  • Spectrometr SELECT SERIES MRT s multi-reflektujícím Time-of-Flight analyzátorem.
  • MALDI zdroj, pozitivní ionizační režim, m/z 50–2400, fixní kvadrupól 1000 Da.
  • Laser 2 kHz, scan rychlost 10 s/s, rozlišení >200 000 FWHM, masová přesnost >500 ppb.

Hlavní výsledky a diskuse


Obrazová data při rozlišení 50 µm pixel size ukázala věrné rozložení markerů v mandli i karcinomu ledvin, konzistentní s literaturou a fluorescenčními metodami. V experimentu s 20 µm pixel size bylo možné rozlišit signál Ki67 na úrovni jednotlivých pixelů a detailní architekturu cév pomocí Actin-aSM. Nízké pozadí a vysoké prostorové rozlišení podtrhují schopnost MRT analyzátoru eliminovat překryvy signálů.

Přínosy a praktické využití metody


Metoda MALDI-IHC na MRT spektrometru umožňuje:
  • Simultánní detekci desítek proteinů ve tkáni.
  • Vysoké prostorové rozlišení (<20 µm) s nízkým šumem.
  • Zachování in situ lokalizace intactních proteinů bez nutnosti enzymatické trávení.
  • Potenciál pro aplikace v onkologii, neurovědách a vývoji nových biomarkerů.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekává se rozšíření počtu dostupných peptidových štítků a markerů pro různé biologické dráhy. Integrace s dalšími omickými technologiemi (metabolomika, lipidomika) může vést k komplexnímu prostorově-respektujícímu multi-OMICS přístupu. Automatizace přípravy vzorků a analýzy dat pohltí širší nasazení v klinických laboratořích.

Závěr


Studie potvrdila, že multiplexní MALDI-IHC na SELECT SERIES MRT MALDI spektrometru nabízí vysoce výkonný nástroj pro detailní mapování proteinů v tkáni. Vysoké rozlišení, přesnost a schopnost detekovat desítky markerů otevírají nové možnosti pro výzkum a diagnostiku.

Reference


1. G. Yagnik et al ; J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2021, 32, 4, 977–988

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
MULTIPLEXED TARGETED IMAGING OF INTACT PROTEINS IN TISSUE BY MULTI REFLECTING TIME OF FLIGHT (MRT) MALDI-IHC
MULTIPLEXED TARGETED IMAGING OF INTACT PROTEINS IN TISSUE BY MULTI REFLECTING TIME OF FLIGHT (MRT) MALDI-IHC Authors: Nirav Sheth, Mark Towers, Gabriel Horkovics, Joanne Ballantyne Affiliations: Waters Corporation, Wilmslow, UK INTRODUCTION Multiplexed Matrix Assisted Laser Desorption ionsation immunohistochemistry (MALDI-IHC), is…
Klíčová slova
ihc, ihcmaldi, malditonsil, tonsilimaging, imagingtissue, tissueactin, actinstained, stainedasm, asmmrt, mrtmultiplexed, multiplexedionsation, ionsationisup, isupsections, sectionshuman, humanambergen
Multiplexed Targeted Imaging of Intact Proteins in Tissue by MALDI-IHC, on the SELECT™ SERIES MRT
Application Note Multiplexed Targeted Imaging of Intact Proteins in Tissue by MALDI-IHC, on the SELECT™ SERIES MRT Mark Towers, Lisa Reid, Steven Pringle, Gabriel Stefan Horkovics-Kovats, Joanne Ballantyne Waters Corporation, Hevesy György PhD School, Eötvös Loránd University Abstract Here we…
Klíčová slova
mrt, mrtmaldi, maldiihc, ihcambergen, ambergenselect, selectactin, actinseris, serismiralys, miralyshiplex, hipleximmunohistochemistry, immunohistochemistryseries, seriesendogenous, endogenousasm, asmtissue, tissuekidney
Benchtop Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry Imaging of Human Tonsil Proteins Using HiPLEX-IHC Probes
MALDI-8020/MALDI-8030 EasyCare Application News Benchtop Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry Imaging of Human Tonsil Proteins Using HiPLEX-IHC Probes Caroline J. Jones Shimadzu, Manchester, UK User Benefits  Simplified protein imaging analysis on an affordable benchtop MALDI-TOF system. …
Klíčová slova
cells, cellsmaldi, maldifollicular, folliculartonsil, tonsilimaging, imaginghyperplasia, hyperplasiatag, tagihc, ihcgerminal, germinalionview, ionviewphotocleavable, photocleavablebenchtop, benchtopmass, massblanking, blankingcell
Benchtop Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry Imaging of Human Tonsil Proteins using MALDI HiPLEX-IHC Probes
TP 198 Benchtop Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry Imaging of Human Tonsil Proteins using MALDI HiPLEX-IHC Probes Caroline Jones, Simona Salivo, Matthew E. Openshaw Shimadzu Corporation, Manchester, UK 1. Introduction ◆ MALDI mass spectrometry imaging (MSI) is a…
Klíčová slova
follicular, follicularhyperplasia, hyperplasiatonsil, tonsilimages, imagesphotocleavable, photocleavableihc, ihcmaldi, maldiimaging, imaginghuman, humantags, tagsprobes, probesgerminal, germinalrecrystallisation, recrystallisationionview, ionviewtissue
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.