Radikalizace hmotnostního spektrometru – OAD-TOF (8. Česká lipidomická a metabolomická konference)
Prezentace | 2024 | ShimadzuInstrumentace
Determinace polohy dvojných vazeb v lipidových molekulách je klíčová pro pochopení jejich biologické funkce, metabolismu a vztahu k onemocněním. Tradiční metody tandemové hmotnostní spektrometrie (CID) poskytují informaci o počtu uhlíků a vazeb, ale nedokážou spolehlivě rozlišit polohové izomery. OAD-TOF (Oxygen Attachment Dissociation s TOF analyzátorem) přináší selektivní štěpení právě na místech C=C, což významně rozšiřuje schopnost strukturní analýzy komplexních lipidů.
Článek představuje inovativní kombinaci OAD s quadrupol–TOF spektrometrem Shimadzu LCMS-9050. Hlavním cílem je ukázat princip funkce OAD, popsat hardware a softwarové zpracování dat, demonstrovat aplikace na různé třídy lipidů a porovnat výsledky s klasickou CID fragmentací. Důraz je kladen na snadnou integraci do rutinního workflow a na aplikaci v různých ionizačních režimech.
OAD vytváří radikály O a OH zahřátím vodní páry v mikrovlnném výboji (induktivně vázané plasma). Tyto radikály vstupují do kolizní buňky quadrupolu a selektivně štěpí C=C vazby. Analytická platforma zahrnuje:
OAD-MS/MS spektrometry ukázaly jasné fragmenty odpovídající štěpení na polohách dvojných vazeb v lipidových řetězcích. Na modelovém fosfolipidu PC 36:4 identifikovalo CID jen délku řetězců a počet vazeb, zatímco OAD umožnilo lokalizovat dvojnou vazbu na pozicích n-6, n-9, n-12 a n-15. Metoda byla úspěšně aplikovaná na:
OAD-TOF slibuje další rozšíření ve studiích lipidomiky, metabolomiky a strukturálního charakterizování bioaktivních molekul. Očekává se kombinace s vysokorozlišenou ion mobility spektrometrií a rozvoj algoritmů pro plně automatizované rozpoznání poloh dvojných vazeb ve velkých datech. Implementace v klinických a potravinářských laboratořích umožní detailní studium biomarkerů a kvality lipidů.
OAD-TOF představuje průlomovou techniku pro strukturní analýzu lipidů, která doplňuje a rozšiřuje tradiční CID metody. Díky selektivnímu štěpení C=C vazeb umožňuje detailní určení poloh dvojných vazeb a otevírá nové možnosti ve výzkumu biochemie lipidů.
1. Nature Communications Chemistry, 2022, „Radical-driven lipid double bond localization via OAD-TOF MS/MS“
2. Shimadzu Application Note: Introduction of OAD-TOF system
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
ZaměřeníMetabolomika, Lipidomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Determinace polohy dvojných vazeb v lipidových molekulách je klíčová pro pochopení jejich biologické funkce, metabolismu a vztahu k onemocněním. Tradiční metody tandemové hmotnostní spektrometrie (CID) poskytují informaci o počtu uhlíků a vazeb, ale nedokážou spolehlivě rozlišit polohové izomery. OAD-TOF (Oxygen Attachment Dissociation s TOF analyzátorem) přináší selektivní štěpení právě na místech C=C, což významně rozšiřuje schopnost strukturní analýzy komplexních lipidů.
Cíle a přehled studie / článku
Článek představuje inovativní kombinaci OAD s quadrupol–TOF spektrometrem Shimadzu LCMS-9050. Hlavním cílem je ukázat princip funkce OAD, popsat hardware a softwarové zpracování dat, demonstrovat aplikace na různé třídy lipidů a porovnat výsledky s klasickou CID fragmentací. Důraz je kladen na snadnou integraci do rutinního workflow a na aplikaci v různých ionizačních režimech.
Použitá metodika a instrumentace
OAD vytváří radikály O a OH zahřátím vodní páry v mikrovlnném výboji (induktivně vázané plasma). Tyto radikály vstupují do kolizní buňky quadrupolu a selektivně štěpí C=C vazby. Analytická platforma zahrnuje:
- LCMS-9050 (Shimadzu) s TOF detektorem
- OAD doplňkový kit: vodní nádrž s průtokovým regulátorem, mikrovlnný generátor plazmy
- Kolizní buňka a kvadrupolový iontový vodič
- Software LabSolutions pro řízení OAD/CID přepínání
Hlavní výsledky a diskuse
OAD-MS/MS spektrometry ukázaly jasné fragmenty odpovídající štěpení na polohách dvojných vazeb v lipidových řetězcích. Na modelovém fosfolipidu PC 36:4 identifikovalo CID jen délku řetězců a počet vazeb, zatímco OAD umožnilo lokalizovat dvojnou vazbu na pozicích n-6, n-9, n-12 a n-15. Metoda byla úspěšně aplikovaná na:
- Volné mastné kyseliny (LC a SFC separace)
- Triacylglyceroly (PESI přímá ionizace)
- Glycerofosfolipidy, ceramidy a karotenoidy
Přínosy a praktické využití metody
- Vyšší selektivita a citlivost pro polohové izomery než u OzID nebo CID
- Možnost pozitivně/negativně simultánní analýzy
- Kompatibilita s různými ionizačními technikami (ESI, PESI, SFC)
- Rychlá implementace do rutinních laboratoří díky softwarové podpoře
Budoucí trendy a možnosti využití
OAD-TOF slibuje další rozšíření ve studiích lipidomiky, metabolomiky a strukturálního charakterizování bioaktivních molekul. Očekává se kombinace s vysokorozlišenou ion mobility spektrometrií a rozvoj algoritmů pro plně automatizované rozpoznání poloh dvojných vazeb ve velkých datech. Implementace v klinických a potravinářských laboratořích umožní detailní studium biomarkerů a kvality lipidů.
Závěr
OAD-TOF představuje průlomovou techniku pro strukturní analýzu lipidů, která doplňuje a rozšiřuje tradiční CID metody. Díky selektivnímu štěpení C=C vazeb umožňuje detailní určení poloh dvojných vazeb a otevírá nové možnosti ve výzkumu biochemie lipidů.
Reference
1. Nature Communications Chemistry, 2022, „Radical-driven lipid double bond localization via OAD-TOF MS/MS“
2. Shimadzu Application Note: Introduction of OAD-TOF system
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Quadrupole Time-of-Flight Liquid Chromatograph Mass Spectrometer OAD-TOF system
2023|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E481 Quadrupole Time-of-Flight Liquid Chromatograph Mass Spectrometer OAD-TOF system OAD-TOF system Quadrupole Time-of-Flight Liquid Chromatograph Mass Spectrometer Radicalize Your Mass Spectrometer to Solve Unanswered Questions Innovative fragmentation technology Introduction of neutral radicals in positive and negative modes Surprisingly simple Effortless…
Klíčová slova
oad, oadradicals, radicalslinolenic, linolenictof, tofneutral, neutralsurprisingly, surprisinglyendless, endlesspossibilities, possibilitiesdpims, dpimscid, cideffortless, effortlessflight, flightradical, radicalfragmentation, fragmentationspectrometer
Identification of positional isomers of linoleic acid containing phospholipids involved in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024|Shimadzu|Postery
Identification of positional isomers of linoleic acid containing phospholipids involved in pancreatic ductal adenocarcinoma 1 1 2 3 4 1 Emily G Armitage ; Alan Barnes ; Elon Correa ; Sén Takeda ; Wen Chung ; Neil J Loftus 1Shimadzu…
Klíčová slova
oad, oadphosphocholine, phosphocholineradicals, radicalsfragments, fragmentsdouble, doublelipid, lipidhead, headspecific, specificradical, radicalcholine, cholinecid, cidbond, bondgroup, groupdissociation, dissociationpancreatic
Rapid Characterization of Alkaloids using Probe ESI Q-TOF LCMS-9050 in OAD-MS/MS
2023|Shimadzu|Postery
WP 227 Rapid Characterization of Alkaloids using Probe ESI Q-TOF LCMS-9050 in OAD-MS/MS Hidenori Takahashi, Kaoru Nakagawa, Mami Okamoto, Yuta Miyazaki, Yohei Arao, Tetsuo Iida Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan 1. Introduction to OAD-MS/MS 2. Introduction to a direct ionization of…
Klíčová slova
oad, oadfragmentation, fragmentationradical, radicalfragment, fragmentdissociation, dissociationpesi, pesispecific, specificneutral, neutralbased, basedion, ionheterocycles, heterocyclesabstraction, abstractionprobe, probeplate, platephoton
Rapid Characterization of Alkaloids using Probe ESI Q-TOF LCMS-9050 in OAD-MS/MS
2023|Shimadzu|Postery
WP 227 Rapid Characterization of Alkaloids using Probe ESI Q-TOF LCMS-9050 in OAD-MS/MS Hidenori Takahashi, Kaoru Nakagawa, Mami Okamoto, Yuta Miyazaki, Yohei Arao, Tetsuo Iida Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan 1. Introduction to OAD-MS/MS 2. Introduction to a direct ionization of…
Klíčová slova
oad, oadfragmentation, fragmentationradical, radicalfragment, fragmentdissociation, dissociationpesi, pesispecific, specificneutral, neutralbased, basedion, ionheterocycles, heterocyclesabstraction, abstractionprobe, probeplate, platephoton