ROUTINE COMPREHENSIVE TISSUE IMAGING ON THE XEVO G3 QTOF MASS SPECTROMETER USING DESI XS
Postery | 2023 | Waters | BMSSInstrumentace
Využití zobrazovací hmotnostní spektrometrie pro analýzu tkání umožňuje detailní mapování molekulárního složení biologických vzorků. Zrychlení akvizice snímků významně zkracuje dobu analýzy, avšak může ovlivnit kvalitu dat a reprodukovatelnost výsledků. Tato studie hodnotí dopad odlišných rychlostí skenování na kvalitu MS imaging dat získaných přístrojem Xevo G3 QTof s DESI XS zdrojem.
Studie si klade za cíl:
Zrychlená MS imaging akvizice přináší:
Zvýšení akviziční rychlosti na Xevo G3 QTof s DESI XS nevede k výrazné ztrátě kvality MS imaging dat. Relativní intenzity, počet detekovaných molekul ani prostorové rozdělení lipidů nejsou ovlivněny a zachována je vysoká hmotnostní přesnost i rozlišení. Metoda představuje rychlý a spolehlivý přístup pro rutinní zobrazování biologických tkání.
MS Imaging, LC/HRMS, LC/MS/MS, LC/MS, LC/TOF
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Využití zobrazovací hmotnostní spektrometrie pro analýzu tkání umožňuje detailní mapování molekulárního složení biologických vzorků. Zrychlení akvizice snímků významně zkracuje dobu analýzy, avšak může ovlivnit kvalitu dat a reprodukovatelnost výsledků. Tato studie hodnotí dopad odlišných rychlostí skenování na kvalitu MS imaging dat získaných přístrojem Xevo G3 QTof s DESI XS zdrojem.
Cíle a přehled studie
Studie si klade za cíl:
- Porovnat biologickou variabilitu mezi po sobě následujícími řezy myšího mozku.
- Vyhodnotit vliv scanovacích rychlostí (5, 10 a 20 snímků/s) na kvalitu dat (intenzita signálu, počet detekovaných molekul, distribuce lipidů).
- Zkoumat dopad rychlosti na hmotnostní rozlišení a přesnost měření.
- Aplikovat segmentační a statistické metody (UMAP, HDBSCAN, PCA) pro různé rychlosti snímání.
Použitá metodika a instrumentace
- Vzorky: Myší mozkové řezy o tloušťce 18 µm na skleněných podložkách.
- Instrumentace: Waters Xevo G3 QTof mass spectrometer s DESI XS zdrojem (výkonný sprayer, zahřívaná přenosová linka).
- Akvizice: MS režim, m/z 50–1200 Da, pixel size 50 µm, krokování 100–1000 µm/s odpovídající 2, 5, 10 a 20 snímkům/s.
- Podmínky DESI: 0,6 kV, 15 psi plyn, 98 % methanol/2 % voda, průtok 2 µL/min, teplota přenosové linky 450 °C.
- Software: MassLynx pro předzpracování, High Definition Imaging (HDI) pro vizualizaci a segmentační analýzu.
Hlavní výsledky a diskuse
- Segmentace (UMAP + HDBSCAN) odhalila konzistentní struktury tkání při všech rychlostech snímání.
- Biologická variabilita mezi řezy byla nízká (maximální korelace R² > 0,97).
- Spektrální profily při 5–20 snímcích/s vykazovaly vysokou shodu (R² > 0,949).
- PCA analýza ukázala jasné seskupení ROI bez zásadního rozlišení způsobeného rychlostí.
- Hmotnostní rozlišení (~30 000 FWHM) a přesnost měření zůstaly stabilní i při vyšších rychlostech.
- Snížení signální intenzity při rychlejší akvizici neovlivnilo relativní zastoupení lipidů ani detekci markerů.
Přínosy a praktické využití metody
Zrychlená MS imaging akvizice přináší:
- Výrazné zkrácení doby analýzy bez ústupku kvality dat.
- Efektivní rutinní nasazení v farmaceutickém výzkumu, patologii a průmyslové analytice.
- Možnost volby akvizičních režimů (MS, MS/MS, SONAR) dle potřeb experimentu.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace multimodálních zobrazovacích technik a AI-poháněné segmentace.
- Vývoj rychlejších, citlivějších zdrojů a automatizovaných workflow.
- Rozšíření rozlišení a hmotnostního rozsahu při zachování vysoké rychlosti.
Závěr
Zvýšení akviziční rychlosti na Xevo G3 QTof s DESI XS nevede k výrazné ztrátě kvality MS imaging dat. Relativní intenzity, počet detekovaných molekul ani prostorové rozdělení lipidů nejsou ovlivněny a zachována je vysoká hmotnostní přesnost i rozlišení. Metoda představuje rychlý a spolehlivý přístup pro rutinní zobrazování biologických tkání.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Routine Comprehensive Tissue Imaging on the Xevo™ G3 QTof Mass Spectrometer Using a DESI™ XS Source
2024|Waters|Aplikace
Application Note Routine Comprehensive Tissue Imaging on the Xevo™ G3 QTof Mass Spectrometer Using a DESI™ XS Source Mark Towers, Lisa Reid, Joanne Ballantyne, Jayne Kirk Waters Corporation Abstract Investigating the performance of the Xevo G3 QTof Mass Spectrometer coupled…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingacquisition, acquisitionprivacy, privacyhbdscan, hbdscanregions, regionstissue, tissuespeed, speedincreased, increasedmanually, manuallyrois, roissegmentation, segmentationinterest, interesthierarchical, hierarchicalnoticeable
Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution
2024|Waters|Aplikace
Application Note Pushing the Boundaries of DESI Imaging With High Spatial Resolution Mark Towers, Lisa Reid, Emrys Jones, Joanne Ballantyne Waters Corporation Abstract Utilizing a commercial DESI™ XS source with minor adjustments, here we demonstrate acquisition of DESI tissue images…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingboundaries, boundariespushing, pushingspatial, spatialresolution, resolutionhigh, highpixel, pixelimage, imagedefinition, definitionhdi, hdiroi, roimicroscope, microscoperescanned, rescannedsurvey
High Resolution Imaging of Adrenal Glands by DESI-MS (ASMS)
2022|Waters|Postery
High Resolution Imaging of Adrenal Glands by DESI-MS Lisa Reid1, Martin Palmer 1, Sheba Jarvis2, Charlotte Bevan2, Mark Towers1, Emmanuelle Claude1, Lee Gethings1, Robert Plumb3, Steven Lai3 1: Waters Corp, Wilmslow, Cheshire, UK; 2: Imperial College London, Hammersmith Hospital, London…
Klíčová slova
mrt, mrtmedulla, medulladesi, desiadrenal, adrenalmass, massimaging, imagingselect, selectseen, seenlipid, lipidwithin, withinglands, glandscoloration, colorationseries, seriesqtof, qtofcortex
High Resolution Imaging of Adrenal Glands by DESI-MS
2022|Waters|Postery
High Resolution Imaging of Adrenal Glands by DESI-MS Lisa Reid1, Martin Palmer1, Sheba Jarvis2, Charlotte Bevan2, Mark Towers1, Emmanuelle Claude1, Lee Gethings1, Robert Plumb3, Steven Lai3 1: Waters Corp, Wilmslow, Cheshire, UK; 2: Imperial College London, Hammersmith Hospital, London UK;…
Klíčová slova
mrt, mrtmedulla, medulladesi, desiadrenal, adrenalmass, massimaging, imagingselect, selectseen, seenlipid, lipidwithin, withinglands, glandsseries, seriescoloration, colorationqtof, qtofcortex