System suitability testing of LC-IMS-HRMS for metabolomics applications
Postery | 2023 | Bruker | ASMSInstrumentace
V rámci vysoce výkonného metabolomického workflow založeného na kombinaci kapalné chromatografie, iontové mobility a vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie je klíčové zajistit konzistentní kvalitu a reprodukovatelnost dat při dlouhodobém sledování velkých souborů vzorků. System suitability test (SST) poskytuje rychlý způsob ověření přesnosti hmotnostních měr, retence, fragmentačních vzorů i kolizního průřezu (CCS), čímž minimalizuje manuální zásahy a riziko chybných anotací v rámci metabolomických studií.
Cílem bylo vyvinout krátký, pětiminutový SST protokol pro nastavení Agilent 1290 Infinity II LC a Bruker timsTOF Pro 2 s VIP-HESI zdrojem. Pro testovací směs bylo zvoleno 18 standardů pokrývajících hmotnostní rozsah ~100–550 m/z, vhodných polarit i izomerů. Studie hodnotila výkon systému v pozitivním i negativním režimu přes 50 po sobě jdoucích injekcí, s důrazem na robustnost parametrů a automatizované vyhodnocení pomocí softwaru TASQ RealTimeQC 2023b.
Seznam klíčové instrumentace a nastavení:
Metoda umožnila spolehlivou chromatografickou separaci isomerů leucinu a isoleucinu do 7 minut a rozlišení trisacharidů melezitózy a maltótriózy na základě mobility. MS/MS fragmentační spektra vykázala vysokou kvalitu a shodu s NIST knihovnou. Při 50 opakovaných bězích v obou polaritách byly udrženy stabilní parametry:
Standardizovaný SST protokol nabízí rychlou validaci celého LC-IMS-HRMS systému do 90 minut, integruje kvalifikaci po instalaci i pravidelnou kontrolu během dlouhých analýz. Automatizované zpracování a reportování v jednom nástroji redukuje administrativní zátěž a předchází degradaci datových výstupů či skrytým hardwarovým poruchám.
Plánované rozšíření zahrnuje sledování průběhu tvaru špiček a zpětného tlaku kolony, doplnění dlouhodobých vizualizací trendů a integraci dalších kvalifikačních parametrů. Koncept lze adaptovat na jiné LC-IMS-MS konfigurace i klinické či průmyslové laboratoře, rozšířit o nové metabolity či matrice.
Byl vyvinut a ověřen robustní, rychlý SST protokol pro LC-IMS-HRMS metabolomiku na bázi 18 referenčních standardů. Metoda potvrzuje vysokou přesnost a stabilitu všech klíčových kvalitativních a kvantitativních parametrů a je připravena pro rutinní nasazení v kvalitativních i kvantitativních metabolomických aplikacích.
Iontová mobilita, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceBruker
Souhrn
Význam tématu
V rámci vysoce výkonného metabolomického workflow založeného na kombinaci kapalné chromatografie, iontové mobility a vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie je klíčové zajistit konzistentní kvalitu a reprodukovatelnost dat při dlouhodobém sledování velkých souborů vzorků. System suitability test (SST) poskytuje rychlý způsob ověření přesnosti hmotnostních měr, retence, fragmentačních vzorů i kolizního průřezu (CCS), čímž minimalizuje manuální zásahy a riziko chybných anotací v rámci metabolomických studií.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo vyvinout krátký, pětiminutový SST protokol pro nastavení Agilent 1290 Infinity II LC a Bruker timsTOF Pro 2 s VIP-HESI zdrojem. Pro testovací směs bylo zvoleno 18 standardů pokrývajících hmotnostní rozsah ~100–550 m/z, vhodných polarit i izomerů. Studie hodnotila výkon systému v pozitivním i negativním režimu přes 50 po sobě jdoucích injekcí, s důrazem na robustnost parametrů a automatizované vyhodnocení pomocí softwaru TASQ RealTimeQC 2023b.
Použitá metodika a instrumentace
Seznam klíčové instrumentace a nastavení:
- LC systém: Agilent 1290 Infinity II
- Kolona: Avantor ACE Excel AQ, 2.1×100 mm, 2 µm, 50 °C
- Mobilní fáze: A – 0,1 % kyseliny formiové ve vodě, B – 0,1 % kyseliny formiové v acetonitrilu
- Gradient: 0 min 99 % B; 2,5 min 40 % B; 2,6–3,3 min 1 % B; 3,4–5,0 min 99 % B; průtok 600 µL min⁻¹
- MS systém: Bruker timsTOF Pro 2, VIP-HESI zdroj, ESI (+)/(–), scan 20–1300 m/z, mobility 0,1–1,5 1/K0
- Zpřesněná akvizice: prm-PASEF
- Kalibrace: automatizovaná sodná formiátová a Agilent TuneMix
- Software: TASQ RealTimeQC 2023b pro vyhodnocení retence, hmotnostní přesnost, izotopové vzory, MS/MS a CCS
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila spolehlivou chromatografickou separaci isomerů leucinu a isoleucinu do 7 minut a rozlišení trisacharidů melezitózy a maltótriózy na základě mobility. MS/MS fragmentační spektra vykázala vysokou kvalitu a shodu s NIST knihovnou. Při 50 opakovaných bězích v obou polaritách byly udrženy stabilní parametry:
- Relativní odchylka retenčních časů a CCS < 2 %
- Hmotnostní přesnost < 5 ppm
- Konstantní výtěžky fragmentů a izotopové vzory
Přínosy a praktické využití metody
Standardizovaný SST protokol nabízí rychlou validaci celého LC-IMS-HRMS systému do 90 minut, integruje kvalifikaci po instalaci i pravidelnou kontrolu během dlouhých analýz. Automatizované zpracování a reportování v jednom nástroji redukuje administrativní zátěž a předchází degradaci datových výstupů či skrytým hardwarovým poruchám.
Budoucí trendy a možnosti využití
Plánované rozšíření zahrnuje sledování průběhu tvaru špiček a zpětného tlaku kolony, doplnění dlouhodobých vizualizací trendů a integraci dalších kvalifikačních parametrů. Koncept lze adaptovat na jiné LC-IMS-MS konfigurace i klinické či průmyslové laboratoře, rozšířit o nové metabolity či matrice.
Závěr
Byl vyvinut a ověřen robustní, rychlý SST protokol pro LC-IMS-HRMS metabolomiku na bázi 18 referenčních standardů. Metoda potvrzuje vysokou přesnost a stabilitu všech klíčových kvalitativních a kvantitativních parametrů a je připravena pro rutinní nasazení v kvalitativních i kvantitativních metabolomických aplikacích.
Reference
- Žádné externí reference uvedeny v textu
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Bruker Product Overview - Life Science Mass Spectrometry
2020|Bruker|Brožury a specifikace
Product Overview Life Science Mass Spectrometry Innovation with Integrity Mass Spectrometry Empowering Science with Innovation and Integrity As one of the world’s leading analytical instrumentation companies, Bruker offers a broad spectrum of advanced solutions in all fields of research and…
Klíčová slova
maldi, malditof, tofbruker, brukerrapiflex, rapiflexpasef, pasefevoq, evoqspectrometry, spectrometryscimax, scimaxmass, masstimstof, timstofmrms, mrmsproteomics, proteomicsmetaboscape, metaboscapelrf, lrfseries
VITATOX: Next level of targeted screening, which way to go: faster analysis or more certainty in the results?
2021|Bruker|Prezentace
VITATOX 2021 Next level of targeted screening, which way to go: faster analysis or more certainty in the results? Solutions Development – Applied Markets, Bruker, Bremen October 2021 Daniel Vláčil Bruker s.r.o. IN TRODUCT ION QTOF Portfolio - Instruments ©…
Klíčová slova
confidential, confidentialvip, vipinnovation, innovationintegrity, integrityhesi, hesisource, sourcetims, timstimstof, timstofccs, ccsexhaust, exhaustfilter, filterfunnel, funnelmobility, mobilityesi, esiapci
4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023 MP459 4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source Intens. 3. LNP_E5_18_...: +MS, 6.3min, 1/K₀=0.971, #3486-3537 x10 5 4 3 369.3515 2 2Bruker Daltonik GmbH, Fahrenheitstraße 4, 28359 Bremen, Germany 3Bruker Scientific LLC,…
Klíčová slova
vip, viphesi, hesilnp, lnpmobility, mobilityesi, esidry, drytims, timsparameter, parametertemp, tempccs, ccscholesterol, cholesteroloffset, offsetlipids, lipidsprob, probformic
Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023, THP 385 Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS Results Aiko Barsch1; Surendar Tadi², Xuejun Peng³, Narayanaganesh Balasubramanian², Elena Checkmeneva4, Katie E. Chappell4, Niels Goedecke1, Matthew R. Lewis1 1Bruker Daltonics GmbH & Co. KG,…
Klíčová slova
acid, acidtims, timsbile, bilemetaboscape, metaboscapeglycocholic, glycocholicallolithocholic, allolithocholicccs, ccsannotated, annotatedglycoursodeoxycholic, glycoursodeoxycholiclithocholic, lithocholicglycodeoxycholic, glycodeoxycholictaurocholic, taurocholicprofiling, profilingannotation, annotationreference