System suitability testing of LC-IMS-HRMS for metabolomics applications
Postery | 2023 | Bruker | ASMSInstrumentace
V rámci vysoce výkonného metabolomického workflow založeného na kombinaci kapalné chromatografie, iontové mobility a vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie je klíčové zajistit konzistentní kvalitu a reprodukovatelnost dat při dlouhodobém sledování velkých souborů vzorků. System suitability test (SST) poskytuje rychlý způsob ověření přesnosti hmotnostních měr, retence, fragmentačních vzorů i kolizního průřezu (CCS), čímž minimalizuje manuální zásahy a riziko chybných anotací v rámci metabolomických studií.
Cílem bylo vyvinout krátký, pětiminutový SST protokol pro nastavení Agilent 1290 Infinity II LC a Bruker timsTOF Pro 2 s VIP-HESI zdrojem. Pro testovací směs bylo zvoleno 18 standardů pokrývajících hmotnostní rozsah ~100–550 m/z, vhodných polarit i izomerů. Studie hodnotila výkon systému v pozitivním i negativním režimu přes 50 po sobě jdoucích injekcí, s důrazem na robustnost parametrů a automatizované vyhodnocení pomocí softwaru TASQ RealTimeQC 2023b.
Seznam klíčové instrumentace a nastavení:
Metoda umožnila spolehlivou chromatografickou separaci isomerů leucinu a isoleucinu do 7 minut a rozlišení trisacharidů melezitózy a maltótriózy na základě mobility. MS/MS fragmentační spektra vykázala vysokou kvalitu a shodu s NIST knihovnou. Při 50 opakovaných bězích v obou polaritách byly udrženy stabilní parametry:
Standardizovaný SST protokol nabízí rychlou validaci celého LC-IMS-HRMS systému do 90 minut, integruje kvalifikaci po instalaci i pravidelnou kontrolu během dlouhých analýz. Automatizované zpracování a reportování v jednom nástroji redukuje administrativní zátěž a předchází degradaci datových výstupů či skrytým hardwarovým poruchám.
Plánované rozšíření zahrnuje sledování průběhu tvaru špiček a zpětného tlaku kolony, doplnění dlouhodobých vizualizací trendů a integraci dalších kvalifikačních parametrů. Koncept lze adaptovat na jiné LC-IMS-MS konfigurace i klinické či průmyslové laboratoře, rozšířit o nové metabolity či matrice.
Byl vyvinut a ověřen robustní, rychlý SST protokol pro LC-IMS-HRMS metabolomiku na bázi 18 referenčních standardů. Metoda potvrzuje vysokou přesnost a stabilitu všech klíčových kvalitativních a kvantitativních parametrů a je připravena pro rutinní nasazení v kvalitativních i kvantitativních metabolomických aplikacích.
Iontová mobilita, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceBruker
Souhrn
Význam tématu
V rámci vysoce výkonného metabolomického workflow založeného na kombinaci kapalné chromatografie, iontové mobility a vysokým rozlišením hmotnostní spektrometrie je klíčové zajistit konzistentní kvalitu a reprodukovatelnost dat při dlouhodobém sledování velkých souborů vzorků. System suitability test (SST) poskytuje rychlý způsob ověření přesnosti hmotnostních měr, retence, fragmentačních vzorů i kolizního průřezu (CCS), čímž minimalizuje manuální zásahy a riziko chybných anotací v rámci metabolomických studií.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo vyvinout krátký, pětiminutový SST protokol pro nastavení Agilent 1290 Infinity II LC a Bruker timsTOF Pro 2 s VIP-HESI zdrojem. Pro testovací směs bylo zvoleno 18 standardů pokrývajících hmotnostní rozsah ~100–550 m/z, vhodných polarit i izomerů. Studie hodnotila výkon systému v pozitivním i negativním režimu přes 50 po sobě jdoucích injekcí, s důrazem na robustnost parametrů a automatizované vyhodnocení pomocí softwaru TASQ RealTimeQC 2023b.
Použitá metodika a instrumentace
Seznam klíčové instrumentace a nastavení:
- LC systém: Agilent 1290 Infinity II
- Kolona: Avantor ACE Excel AQ, 2.1×100 mm, 2 µm, 50 °C
- Mobilní fáze: A – 0,1 % kyseliny formiové ve vodě, B – 0,1 % kyseliny formiové v acetonitrilu
- Gradient: 0 min 99 % B; 2,5 min 40 % B; 2,6–3,3 min 1 % B; 3,4–5,0 min 99 % B; průtok 600 µL min⁻¹
- MS systém: Bruker timsTOF Pro 2, VIP-HESI zdroj, ESI (+)/(–), scan 20–1300 m/z, mobility 0,1–1,5 1/K0
- Zpřesněná akvizice: prm-PASEF
- Kalibrace: automatizovaná sodná formiátová a Agilent TuneMix
- Software: TASQ RealTimeQC 2023b pro vyhodnocení retence, hmotnostní přesnost, izotopové vzory, MS/MS a CCS
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila spolehlivou chromatografickou separaci isomerů leucinu a isoleucinu do 7 minut a rozlišení trisacharidů melezitózy a maltótriózy na základě mobility. MS/MS fragmentační spektra vykázala vysokou kvalitu a shodu s NIST knihovnou. Při 50 opakovaných bězích v obou polaritách byly udrženy stabilní parametry:
- Relativní odchylka retenčních časů a CCS < 2 %
- Hmotnostní přesnost < 5 ppm
- Konstantní výtěžky fragmentů a izotopové vzory
Přínosy a praktické využití metody
Standardizovaný SST protokol nabízí rychlou validaci celého LC-IMS-HRMS systému do 90 minut, integruje kvalifikaci po instalaci i pravidelnou kontrolu během dlouhých analýz. Automatizované zpracování a reportování v jednom nástroji redukuje administrativní zátěž a předchází degradaci datových výstupů či skrytým hardwarovým poruchám.
Budoucí trendy a možnosti využití
Plánované rozšíření zahrnuje sledování průběhu tvaru špiček a zpětného tlaku kolony, doplnění dlouhodobých vizualizací trendů a integraci dalších kvalifikačních parametrů. Koncept lze adaptovat na jiné LC-IMS-MS konfigurace i klinické či průmyslové laboratoře, rozšířit o nové metabolity či matrice.
Závěr
Byl vyvinut a ověřen robustní, rychlý SST protokol pro LC-IMS-HRMS metabolomiku na bázi 18 referenčních standardů. Metoda potvrzuje vysokou přesnost a stabilitu všech klíčových kvalitativních a kvantitativních parametrů a je připravena pro rutinní nasazení v kvalitativních i kvantitativních metabolomických aplikacích.
Reference
- Žádné externí reference uvedeny v textu
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Bruker Product Overview - Life Science Mass Spectrometry
2020|Bruker|Brožury a specifikace
Product Overview Life Science Mass Spectrometry Innovation with Integrity Mass Spectrometry Empowering Science with Innovation and Integrity As one of the world’s leading analytical instrumentation companies, Bruker offers a broad spectrum of advanced solutions in all fields of research and…
Klíčová slova
maldi, malditof, tofbruker, brukerrapiflex, rapiflexpasef, pasefevoq, evoqscimax, scimaxspectrometry, spectrometrymass, masstimstof, timstofmrms, mrmsproteomics, proteomicsmetaboscape, metaboscapelrf, lrfseries
VITATOX: Next level of targeted screening, which way to go: faster analysis or more certainty in the results?
2021|Bruker|Prezentace
VITATOX 2021 Next level of targeted screening, which way to go: faster analysis or more certainty in the results? Solutions Development – Applied Markets, Bruker, Bremen October 2021 Daniel Vláčil Bruker s.r.o. IN TRODUCT ION QTOF Portfolio - Instruments ©…
Klíčová slova
confidential, confidentialvip, vipinnovation, innovationintegrity, integrityhesi, hesisource, sourcetims, timstimstof, timstofccs, ccsexhaust, exhaustfilter, filterfunnel, funnelmobility, mobilityesi, esiapci
Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023, THP 385 Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS Results Aiko Barsch1; Surendar Tadi², Xuejun Peng³, Narayanaganesh Balasubramanian², Elena Checkmeneva4, Katie E. Chappell4, Niels Goedecke1, Matthew R. Lewis1 1Bruker Daltonics GmbH & Co. KG,…
Klíčová slova
acid, acidtims, timsbile, bilemetaboscape, metaboscapeglycocholic, glycocholicallolithocholic, allolithocholicccs, ccsannotated, annotatedglycoursodeoxycholic, glycoursodeoxycholiclithocholic, lithocholicglycodeoxycholic, glycodeoxycholictaurocholic, taurocholicprofiling, profilingannotation, annotationisoglycocholic
4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023 MP459 4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source Intens. 3. LNP_E5_18_...: +MS, 6.3min, 1/K₀=0.971, #3486-3537 x10 5 4 3 369.3515 2 2Bruker Daltonik GmbH, Fahrenheitstraße 4, 28359 Bremen, Germany 3Bruker Scientific LLC,…
Klíčová slova
vip, viphesi, hesilnp, lnpmobility, mobilityesi, esidry, drytims, timsparameter, parametertemp, tempccs, ccscholesterol, cholesteroloffset, offsetlipids, lipidsprob, probformic