Comprehensive Analysis of Hydrophilic Metabolites Using Shim-pack™ Mix-HILIC
Aplikace | 2024 | ShimadzuInstrumentace
Metabolomika umožňuje komplexní analýzu malých molekul v biochemii.
Hydrofilní metabolity se liší svými fyzikálně-chemickými vlastnostmi, což vyžaduje robustní chromatografické přístupy.
Shim-pack Mix-HILIC spojuje hydrofobní i iontové interakce pro široké spektrum látek.
Cílem bylo ověřit schopnost Shim-pack Mix-HILIC jedním během analyzovat 49 hydrofilních metabolitů.
Ukázala se aplikace na biologických vzorcích Escherichia coli a lidské plazmy.
Chromatografická část:
Hmotnostní spektrometrie:
Vzorky a příprava:
Standardní roztoky: polární sloučeniny (<50 % vody) eluvovaly do 12,8 min, aniontové (>50 % vody) po 12,8 min.
V E. coli detekováno 44 ze 49 sledovaných metabolitů, v plazmě 25.
MRM chromatogramy potvrzují kvalitní separaci aminokyselin, nukleotidů, koenzymů i organických kyselin.
Jedna univerzální metoda pro široké spektrum hydrofilních metabolitů.
Široký provozní pH rozsah (2–13) a vysoká tlaková odolnost (35 MPa) zajišťují robustní provoz.
Aplikace v mikrobiologii i biomedicíně pro metabolomické studie.
Integrace s vysokopropustnými automatizovanými systémy a multi-omickými platformami.
Pokročilá softwarová analýza dat pro hlubší interpretační vrstvy metabolomických profilů.
Validace biomarkerů a rozšíření na klinické a průmyslové aplikace.
Shim-pack Mix-HILIC spolu s Nexera X3 a LCMS-8060NX představuje efektivní a univerzální přístup k analýze hydrofilních metabolitů v biologických vzorcích.
Metoda kombinuje výhody HILIC a aniontové výměny, eliminuje potřebu iontově párovacích činidel.
Žádné literární zdroje nebyly v původním textu explicitně uvedeny.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, Spotřební materiál, LC kolony
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika umožňuje komplexní analýzu malých molekul v biochemii.
Hydrofilní metabolity se liší svými fyzikálně-chemickými vlastnostmi, což vyžaduje robustní chromatografické přístupy.
Shim-pack Mix-HILIC spojuje hydrofobní i iontové interakce pro široké spektrum látek.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo ověřit schopnost Shim-pack Mix-HILIC jedním během analyzovat 49 hydrofilních metabolitů.
Ukázala se aplikace na biologických vzorcích Escherichia coli a lidské plazmy.
Použitá metodika a instrumentace
Chromatografická část:
- LC: Nexera X3 s kolónou Shim-pack Mix-HILIC (150 × 2,1 mm, 5 μm) při 40 °C
- Mobilní fáze A: voda + 40 mmol/L amonný hydrogen uhličitan, pH 9,7
- Mobilní fáze B: acetonitril; gradient z 95 % B na 0 % B během 26,5 min
- Průtok 0,4 mL/min, objem injekce 5 μL
Hmotnostní spektrometrie:
- MS: LCMS-8060NX s ESI IonFocus
- MRM režim, nebulizační plyn 2,0 L/min, sušící 10,0 L/min
- DL 250 °C, rozhraní 300 °C, block 400 °C, tlak CID 270 kPa
Vzorky a příprava:
- E. coli: extrakce methanolem, chloroformem a vodou, vícenásobné centrifugace a koncentrační krok
- Plazma: analogická extrakce methanolem, chloroformem a vodou, centrifugace a koncentrační krok
Hlavní výsledky a diskuse
Standardní roztoky: polární sloučeniny (<50 % vody) eluvovaly do 12,8 min, aniontové (>50 % vody) po 12,8 min.
V E. coli detekováno 44 ze 49 sledovaných metabolitů, v plazmě 25.
MRM chromatogramy potvrzují kvalitní separaci aminokyselin, nukleotidů, koenzymů i organických kyselin.
Přínosy a praktické využití metody
Jedna univerzální metoda pro široké spektrum hydrofilních metabolitů.
Široký provozní pH rozsah (2–13) a vysoká tlaková odolnost (35 MPa) zajišťují robustní provoz.
Aplikace v mikrobiologii i biomedicíně pro metabolomické studie.
Budoucí trendy a možnosti využití
Integrace s vysokopropustnými automatizovanými systémy a multi-omickými platformami.
Pokročilá softwarová analýza dat pro hlubší interpretační vrstvy metabolomických profilů.
Validace biomarkerů a rozšíření na klinické a průmyslové aplikace.
Závěr
Shim-pack Mix-HILIC spolu s Nexera X3 a LCMS-8060NX představuje efektivní a univerzální přístup k analýze hydrofilních metabolitů v biologických vzorcích.
Metoda kombinuje výhody HILIC a aniontové výměny, eliminuje potřebu iontově párovacích činidel.
Reference
Žádné literární zdroje nebyly v původním textu explicitně uvedeny.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Shim-pack™ Mix-HILIC columns
2024|Shimadzu|Technické články
C190-E311 Comprehensive Analysis of Hydrophilic Metabolites in Metabolomics Chromatography Column for Hydrophilic Interactions Shim-pack™ Mix-HILIC Metabolomics is a technique for comprehensively measuring metabolites (the metabolome) in living organisms. The metabolome is equivalent to the furthest stage downstream of the process…
Klíčová slova
coa, coafad, fadcit, cittrp, trpasn, asngln, glncdp, cdpthr, thrfmn, fmnctp, ctptyr, tyrile, ileuracil, uracilala, alamal
LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites Ver.3
2021|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E437 For LabSolutions LCMS LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites Ver.3 Ready-to-use methods for 200 compounds This Method Package enables efficient, simultaneous analysis of a large number of compounds. Optimized LC separation conditions and MS parameters reduce the time and…
Klíčová slova
acid, acidmonophosphate, monophosphatecoenzyme, coenzymethymidine, thymidinecytidine, cytidineguanosine, guanosineadenosine, adenosinediphosphate, diphosphatetriphosphate, triphosphateuridine, uridineshikimic, shikimicpathway, pathwaymethionine, methioninenonmevalonic, nonmevalonicinosine
WP587 Measurement of Metabolites in Feces of Japanese Rock Ptarmigans by LC-MS/MS Takanari Hattori1, Yukari Oka1, Shuichi Kawana1, Koretsugu Ogata1, Sayaka Tsuchida2,6, Atsushi Kobayashi3, Yoshiaki Nakamura4, Hiroshi Nakamura5, Kazunari Ushida3,6 1 Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan. 2 Kyoto Prefectural University, Kyoto,…
Klíčová slova
ptarmigans, ptarmigansfeces, fecesrock, rockjapanese, japaneseraising, raisingartificial, artificialwild, wildunder, underadult, adultmetabolites, metabolitespeak, peakzoo, zoocholate, cholateargininosuccinate, argininosuccinatechicks
Simultaneous Analysis of 97 Primary Metabolites By PFPP: Pentafluorophenylpropyl Column
2014|Shimadzu|Aplikace
LAAN-J-LM-E018 LC-MS Liquid Chromatograph Mass Spectrometer Simultaneous Analysis of 97 Primary Metabolites By PFPP: Pentafluorophenylpropyl Column 49 Energy production is essential for every living organism. Energy production at the cellular level is carried out by various metabolic processes, including the…
Klíčová slova
acid, acidliver, liverheart, heartmonophosphate, monophosphateguanosine, guanosinedimethylarginine, dimethylargininemethionine, methionineacetylcarnitine, acetylcarnitinecreatine, creatinethymidine, thymidineaconitic, aconiticophthalmic, ophthalmicisocitric, isocitriccytidine, cytidineglutathione