Simultaneous Analysis of 97 Primary Metabolites By PFPP: Pentafluorophenylpropyl Column
Aplikace | 2014 | ShimadzuInstrumentace
Metabolická analýza primárních metabolitů je klíčová pro pochopení energetického metabolismu buněk. Kvantifikace aminokyselin, organických kyselin, nukleotidů a koenzymů umožňuje studium glykolýzy, TCA cyklu a dalších biochemických drah. Častou překážkou je vysoká hydrofilita těchto sloučenin, která omezuje jejich separaci v klasické převrácené fázi.
Cílem prezentované studie je vyvinout a demonstrovat metodiku pro simultánní analýzu 97 primárních metabolitů z tkáňových extraktů pomocí PFPP kolonky. Studie ukazuje možnosti detekce a kvantifikace klíčových sloučenin z jater a srdečního svalu myší.
Pro separaci byl použit pentafluorophenylpropyl (PFPP) sloučený s hydrofobní interakcí, což umožňuje udržení i vysoce polárních molekul. Extrakce metabolitů proběhla metodou methanol-chloroform s následnou koncentrací vodné fáze.
Při analýze extraktů z jater a srdce bylo detekováno přes 80 metabolitů s dobře rozlišenými vrcholy. U obou tkání byly identifikovány klíčové sloučeniny jako ATP prekurzory (AMP), glutathion ve formě GSH/GSSG či aminokyseliny leucinu a isoleucinu. Rozdíly v relativních oblastech TCA cyklu, zejména pyruvát, citrát, sukcinát a malát, odrážejí odlišnou energetickou aktivitu mezi tkáněmi.
Měření primárních metabolitů pomocí PFPP kolonky a LC-MS/MS přináší:
Rozšíření metody by mohlo zahrnovat multiplexní metabolomické studie klinických vzorků, dynamické sledování metabolických drah in vivo a integraci s lipidomikou či proteomikou. Vylepšení rychlosti a automatizace přípravy vzorků zvýší throughput a vhodnost pro rutinní rozbory v biomedicíně a farmaceutickém průmyslu.
Použití PFPP kolonky ve spojení s rychlým LC-MS/MS systémem umožňuje efektivní a reprodukovatelné stanovení 97 primárních metabolitů v biologických vzorcích. Metoda poskytuje robustní nástroj pro výzkum energetického metabolismu a klinické aplikace.
Bez uvedené literatury v původním textu.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu, Merck
Souhrn
Význam tématu
Metabolická analýza primárních metabolitů je klíčová pro pochopení energetického metabolismu buněk. Kvantifikace aminokyselin, organických kyselin, nukleotidů a koenzymů umožňuje studium glykolýzy, TCA cyklu a dalších biochemických drah. Častou překážkou je vysoká hydrofilita těchto sloučenin, která omezuje jejich separaci v klasické převrácené fázi.
Cíle a přehled studie
Cílem prezentované studie je vyvinout a demonstrovat metodiku pro simultánní analýzu 97 primárních metabolitů z tkáňových extraktů pomocí PFPP kolonky. Studie ukazuje možnosti detekce a kvantifikace klíčových sloučenin z jater a srdečního svalu myší.
Použitá metodika a instrumentace
Pro separaci byl použit pentafluorophenylpropyl (PFPP) sloučený s hydrofobní interakcí, což umožňuje udržení i vysoce polárních molekul. Extrakce metabolitů proběhla metodou methanol-chloroform s následnou koncentrací vodné fáze.
- Kolonka: Discovery HS F5-3 (2.1×150 mm, 3 μm)
- Mobilní fáze A: 0,1 % kyselina mravenčí/voda
- Mobilní fáze B: 0,1 % kyselina mravenčí/acetonitril, gradient 0–95 % B v 20 min
- Detektor: Shimadzu LCMS-8040 Triple Quadrupole UFMS
- Ionizace: ESI pozitivní/negativní režim, rychlé přepínání polarity
Hlavní výsledky a diskuse
Při analýze extraktů z jater a srdce bylo detekováno přes 80 metabolitů s dobře rozlišenými vrcholy. U obou tkání byly identifikovány klíčové sloučeniny jako ATP prekurzory (AMP), glutathion ve formě GSH/GSSG či aminokyseliny leucinu a isoleucinu. Rozdíly v relativních oblastech TCA cyklu, zejména pyruvát, citrát, sukcinát a malát, odrážejí odlišnou energetickou aktivitu mezi tkáněmi.
Přínosy a praktické využití metody
Měření primárních metabolitů pomocí PFPP kolonky a LC-MS/MS přináší:
- Univerzální separaci hydrofilních i hydrofóbních sloučenin
- Krátký analytický běh (<25 min) s vysokou citlivostí
- Možnost simultánní kvantifikace širokého spektra metabolitů
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozšíření metody by mohlo zahrnovat multiplexní metabolomické studie klinických vzorků, dynamické sledování metabolických drah in vivo a integraci s lipidomikou či proteomikou. Vylepšení rychlosti a automatizace přípravy vzorků zvýší throughput a vhodnost pro rutinní rozbory v biomedicíně a farmaceutickém průmyslu.
Závěr
Použití PFPP kolonky ve spojení s rychlým LC-MS/MS systémem umožňuje efektivní a reprodukovatelné stanovení 97 primárních metabolitů v biologických vzorcích. Metoda poskytuje robustní nástroj pro výzkum energetického metabolismu a klinické aplikace.
Reference
Bez uvedené literatury v původním textu.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites Ver.3
2021|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E437 For LabSolutions LCMS LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites Ver.3 Ready-to-use methods for 200 compounds This Method Package enables efficient, simultaneous analysis of a large number of compounds. Optimized LC separation conditions and MS parameters reduce the time and…
Klíčová slova
acid, acidmonophosphate, monophosphatecoenzyme, coenzymethymidine, thymidinecytidine, cytidineguanosine, guanosineadenosine, adenosinediphosphate, diphosphatetriphosphate, triphosphateuridine, uridineshikimic, shikimicpathway, pathwaymethionine, methioninenonmevalonic, nonmevalonicinosine
Mice fecal metabolomics by LC-MS/MS: Comparison between young mice and old mice
2017|Shimadzu|Postery
PO-CON1719E Mice fecal metabolomics by LC-MS/MS: Comparison between young mice and old mice ASMS 2017 MP 455 Takanari Hattori1, 2, Shuichi Kawana1, Yoshihiro Hayakawa1, Eiichiro Fukusaki3, Mitsuharu Matsumoto4 1 Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan. 2 Osaka University Shimadzu Analytical Innovation Research…
Klíčová slova
mice, miceyoung, youngacid, acidold, oldmonophosphate, monophosphatedimethylarginine, dimethylargininepairing, pairingthymidine, thymidinecytidine, cytidineguanosine, guanosinecomparison, comparisonadenosine, adenosinebetween, betweencholic, cholicarginine
Media Component Analysis during Human Primary T Cell Culture using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer
2023|Shimadzu|Postery
TP 114 Media Component Analysis during Human Primary T Cell Culture using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer Evelyn H. Wang1; Stephen Kurzyniec1; Erin Strom2; Tammy Jones-Lepp2; Amanda Leisgang2; Andrew Ortiz2; Jefferson Kinney2; Yoshiyuki Okamura1 1Shimadzu Scientific Instrument, Columbia, MD; 2University…
Klíčová slova
flask, flaskacid, acidmonophosphate, monophosphatemedia, mediacell, cellculture, culturehour, hourexchange, exchangearea, areagln, glncar, carmedium, mediumglu, gluglutamine, glutaminedeoxyguanosine
Selection Guide Metabolite Analysis - Metabolomics Product Portfolio
2019|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E280D Selection Guide Metabolite Analysis Metabolomics Product Portfolio Expanding Metabolomics Metabolomics refers to an array of techniques used to comprehensively detect and analyze various metabolites formed in vivo during biological activity. The qualitative and quantitative changes in metabolites reflect the…
Klíčová slova
acid, acidsba, sbametabolites, metabolitesdatabase, databasepackage, packageacids, acidsmetabolomics, metabolomicsphospholipid, phospholipidanalysis, analysisamino, aminomediators, mediatorsmonophosphate, monophosphatecooh, coohmrm, mrmlcms