Intelligent data acquisition for untargeted metabolomics of milk samples coupled with quantitative high-resolution accurate mass data collection
Postery | 2022 | Thermo Fisher Scientific | RAFAInstrumentace
Untargeted metabolomics mléka umožňuje identifikovat rozsáhlou škálu malých molekul, které ovlivňují nutriční hodnotu, bezpečnost potravin a kvalitu mléčných výrobků. Tento přístup je klíčový pro vývoj spolehlivých screeningových metod k ověřování původu a integrity mléka a mléčných alternativ.
Studie popisuje vývoj inteligentního datového akvizičního workflow pomocí AcquireX deep scan na Orbitrap Exploris 240 pro bezcílovou analýzu mléčných vzorků. Cílem je hluboké pokrytí metabolomu, zvýšení důvěry v anotaci sloučenin a identifikace markerů pro následné screeningové studie.
Pro extrakci metabolitů byl použit modifikovaný Folchův protokol (chloroform:methanol 2:1), včetně izotopově značených standardů adipové a asparagové kyseliny pro kontrolu kvality.
AcquireX deep scan významně zvýšil podíl fragmentovaných analytů a omezil fragmentaci pozadí, což vedlo k bohatšímu souboru MS/MS dat.
Navržený workflow nabízí robustní a reprodukovatelnou platformu pro hloubkovou analýzu metabolomu mléka. Může být využit v potravinářském průmyslu pro QA/QC, autentizaci surovin a ochranu spotřebitele před nekvalitními či falšovanými produkty.
Možnosti dalšího rozvoje:
Byl vyvinut end-to-end inteligentní workflow pro bezcílovou metabolomiku mléka s vysokým metabolomickým pokrytím a spolehlivou anotací. Metoda podporuje screening a autentizaci vzorků, čímž přispívá ke zvýšení bezpečnosti potravin a ochraně spotřebitelů.
Žádné literární odkazy uvedeny.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
ZaměřeníPotraviny a zemědělství, Metabolomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Untargeted metabolomics mléka umožňuje identifikovat rozsáhlou škálu malých molekul, které ovlivňují nutriční hodnotu, bezpečnost potravin a kvalitu mléčných výrobků. Tento přístup je klíčový pro vývoj spolehlivých screeningových metod k ověřování původu a integrity mléka a mléčných alternativ.
Cíle a přehled studie / článku
Studie popisuje vývoj inteligentního datového akvizičního workflow pomocí AcquireX deep scan na Orbitrap Exploris 240 pro bezcílovou analýzu mléčných vzorků. Cílem je hluboké pokrytí metabolomu, zvýšení důvěry v anotaci sloučenin a identifikace markerů pro následné screeningové studie.
Použitá metodika a instrumentace
Pro extrakci metabolitů byl použit modifikovaný Folchův protokol (chloroform:methanol 2:1), včetně izotopově značených standardů adipové a asparagové kyseliny pro kontrolu kvality.
- UHPLC: Thermo Scientific Vanquish Horizon s kolonkou Hypersil GOLD C18 (2,1 × 150 mm, 1,9 µm), teplota 45 °C, autosampler 5 °C, injekce 2 µL.
- Mobilní fáze: (A) 0,1 % kyseliny mravenčí ve vodě, (B) 0,1 % kyseliny mravenčí v methanolu, gradient 0–15 min.
- MS: Thermo Scientific Orbitrap Exploris 240 s rozhraním ESI při střídání polarity, scan 70–800 m/z, rozlišení 120 000, Easy-IC kalibrace.
- Akviziční režim AcquireX deep scan: iterativní generování inkluzních a exkluzních seznamů pro maximalizaci MS/MS fragmentace relevantních sloučenin.
Hlavní výsledky a diskuse
AcquireX deep scan významně zvýšil podíl fragmentovaných analytů a omezil fragmentaci pozadí, což vedlo k bohatšímu souboru MS/MS dat.
- PCA analýza rozlišila bovinní mléko podle obsahu tuku a oddělila je od rostlinných alternativ (mandlové, ovocné, kokosové, sójové).
- Rostlinná mléka vykazovala vyšší hladiny aminokyselin (fenylalanin, isoleucin, leucin, valin, prolin), kdežto bovinní mléka měla vyšší množství organických kyselin (maleová, sukcinová, glukonová).
- Vybrané markery slouží pro následné cílené screeningové studie ke klasifikaci a autentizaci mléčných vzorků.
Přínosy a praktické využití metody
Navržený workflow nabízí robustní a reprodukovatelnou platformu pro hloubkovou analýzu metabolomu mléka. Může být využit v potravinářském průmyslu pro QA/QC, autentizaci surovin a ochranu spotřebitele před nekvalitními či falšovanými produkty.
Budoucí trendy a možnosti využití
Možnosti dalšího rozvoje:
- Integrace s high-throughput screeningem pro rutinní kontrolu mléčných výrobků.
- Rozšíření databází metabolitů a využití umělé inteligence pro zrychlenou anotaci.
- Aplikace workflow na jiné biologické matrixy a potravinové produkty.
Závěr
Byl vyvinut end-to-end inteligentní workflow pro bezcílovou metabolomiku mléka s vysokým metabolomickým pokrytím a spolehlivou anotací. Metoda podporuje screening a autentizaci vzorků, čímž přispívá ke zvýšení bezpečnosti potravin a ochraně spotřebitelů.
Reference
Žádné literární odkazy uvedeny.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
An intelligent data acquisition workflow for untargeted metabolomics to achieve deep metabolome coverage and confident compound annotation
2022|Thermo Fisher Scientific|Postery
An intelligent data acquisition workflow for untargeted metabolomics to achieve deep metabolome coverage and confident compound annotation Bashar Amer, Rahul Ravi Deshpande, Daniel Hermanson, Susan Bird, and Andreas Hühmer, Thermo Fisher Scientific, 355 River Oaks Parkway, San Jose, California, United…
Klíčová slova
fat, fatmilk, milkorganic, organicwhole, wholearea, areaannotation, annotationbovine, bovineacid, acidpeak, peakreduced, reducedfree, freenon, nondata, dataacquirex, acquirexdeep
Metabolomics: Intelligent data acquisition for untargeted metabolomics followed by high-throughput quantitative metabolomics utilizing high-resolution accurate mass measurements
2022|Thermo Fisher Scientific|Postery
Intelligent data acquisition for untargeted metabolomics followed by high-throughput quantitative metabolomics utilizing high-resolution accurate mass measurements Bashar Amer, Rahul Ravi Deshpande, Daniel Hermanson, Andreas Hühmer, and Susan Bird, Thermo Fisher Scientific, 355 River Oaks Parkway, San Jose, California, United States,…
Klíčová slova
fat, fatmilk, milkorganic, organicwhole, wholeacid, aciduntargeted, untargetedbovine, bovinereduced, reducedfree, freedata, datatargeted, targetednon, nonmetabolomics, metabolomicsacquirex, acquirexannotation
High-throughput quantitative metabolomics utilizing high-resolution accurate mass measurements
2022|Thermo Fisher Scientific|Postery
High-throughput quantitative metabolomics utilizing high-resolution accurate mass measurements Bashar Amer, Rahul Ravi Deshpande, Daniel Hermanson, Susan Bird, and Andreas Hühmer, Thermo Fisher Scientific, 355 River Oaks Parkway, San Jose, California, United States, 95134 3 2 1 0 -1 -2 -3…
Klíčová slova
fat, fatmilk, milkorganic, organicacid, acidbovine, bovinewhole, wholemaleic, maleicreduced, reducednon, nonfree, freealmond, almondhippuric, hippuricorotic, oroticproline, prolinelow
Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap-based mass spectrometers
2023|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
White paper | 002540 Omics Simultaneous Quantitation and Discovery (SQUAD) analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap-based mass spectrometers Authors Table of contents Bashar Amer, Julian Saba, 1. Introduction Rahul R. Deshpande, and Susan S. Bird 1.1. Untargeted metabolomics…
Klíčová slova
orbitrap, orbitrapsquad, squaduntargeted, untargetedastral, astralmetabolomics, metabolomicstargeted, targeteddiscovery, discoveryhram, hrammetabolites, metabolitesannotation, annotationanalysis, analysisfragmentation, fragmentationconfident, confidentmass, massquantitation