High quality curated HRAM MSn spectral libraries and real time library search for the confident annotation of flavonoids in tea
Postery | 2022 | Thermo Fisher Scientific | RAFAInstrumentace
Znalost metabolického profilu rostlinných produktů, jako je čaj, je klíčová pro pochopení jejich zdravotních účinků a kvality. Real-time library search v kombinaci s vysoce kvalitními HRAM MSn spektrálními knihovnami umožňuje rychlou a přesnou identifikaci flavonoidů a usnadňuje interpretaci netargetovaných metabolomických dat.
Cílem studie bylo vytvořit a ověřit workflow pro hloubkovou analýzu flavonoidů v čajových extraktech za použití HRAM MSn knihovny a RTLS. Hlavní fáze zahrnovaly:
Separační technika: Vanquish Horizon UHPLC s kolonkou Accucore C18+ (2,1×150 mm, 1,5 µm), gradient 0,1 % FA ve vodě/methanolu, 200 µL/min, 55 °C.
Spektrometrie: Orbitrap IQ-X Tribrid MS s akvizičními režimy:
Implementace RTLS vedla ke zvýšení počtu vyvolaných MS3 spekter z 416 na 591. Díky workflowu bylo v čajových extraktech identifikováno téměř 100 dalších putativních flavonoidů oproti klasickému přístupu bez RTLS. Kombinace AcquireX a real-time knihovny zlepšila hloubku metabolomického pokrytí a spolehlivost anotací.
Popisované workflow využívající HRAM MSn spektrální knihovny a RTLS představuje efektivní strategii pro hlubokou a spolehlivou anotaci flavonoidů v čaji. Implementace inteligentního akvizičního režimu zvýšila počet detekovaných putativních flavonoidů a jejich strukturální charakterizaci, což přispívá k rozvoji netargetované metabolomiky.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
ZaměřeníPotraviny a zemědělství, Metabolomika
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Znalost metabolického profilu rostlinných produktů, jako je čaj, je klíčová pro pochopení jejich zdravotních účinků a kvality. Real-time library search v kombinaci s vysoce kvalitními HRAM MSn spektrálními knihovnami umožňuje rychlou a přesnou identifikaci flavonoidů a usnadňuje interpretaci netargetovaných metabolomických dat.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo vytvořit a ověřit workflow pro hloubkovou analýzu flavonoidů v čajových extraktech za použití HRAM MSn knihovny a RTLS. Hlavní fáze zahrnovaly:
- Vytvoření spektrální knihovny z 40 autentických flavonoidových standardů.
- Optimalizaci LC-MS metody na systému Vanquish Horizon UHPLC a Orbitrap IQ-X Tribrid.
- Implementaci inteligentního akvizičního režimu AcquireX a RTLS pro směřování MSn dat.
- Analýzu zeleného, černého a bylinného čaje s následnou anotací flavonoidů.
Použitá metodika a instrumentace
Separační technika: Vanquish Horizon UHPLC s kolonkou Accucore C18+ (2,1×150 mm, 1,5 µm), gradient 0,1 % FA ve vodě/methanolu, 200 µL/min, 55 °C.
Spektrometrie: Orbitrap IQ-X Tribrid MS s akvizičními režimy:
- AcquireX Deep Scan pro iterativní vytváření vylučovacího a inkluzního seznamu.
- RTLS (Met-IQ) pro real-time porovnávání MS/MS spekter s knihovnou mzVault.
- Fragmentace metodami HCD, CID a UVPD pro sběr MS2–MS5 dat.
Hlavní výsledky a diskuse
Implementace RTLS vedla ke zvýšení počtu vyvolaných MS3 spekter z 416 na 591. Díky workflowu bylo v čajových extraktech identifikováno téměř 100 dalších putativních flavonoidů oproti klasickému přístupu bez RTLS. Kombinace AcquireX a real-time knihovny zlepšila hloubku metabolomického pokrytí a spolehlivost anotací.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšení přesnosti a rychlosti identifikace flavonoidů v komplexních matricích.
- Vhodné pro výzkum kvality a zdravotních účinků čajových produktů.
- Uplatnění v QA/QC laboratořích při validaci a monitoringu bioaktivních látek.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření knihoven o další třídy metabolitů (alkaloidy, fenolické kyseliny).
- Integrace strojového učení pro automatizaci interpretace MSn dat.
- Využití workflow v klinické metabolomice a nutrigenomice pro studium vlivu potravin na lidské zdraví.
Závěr
Popisované workflow využívající HRAM MSn spektrální knihovny a RTLS představuje efektivní strategii pro hlubokou a spolehlivou anotaci flavonoidů v čaji. Implementace inteligentního akvizičního režimu zvýšila počet detekovaných putativních flavonoidů a jejich strukturální charakterizaci, což přispívá k rozvoji netargetované metabolomiky.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Metabolomics: High quality curated HRAM MSn spectral libraries and real time library search for the confident annotation of metabolites
2022|Thermo Fisher Scientific|Postery
High quality curated HRAM MSn spectral libraries and real time library search for the confident annotation of metabolites Rahul Deshpande1, Bashar Amer1, Daniel Hermanson1, Brandon Bills1, Reza Jafari2, Pedram Rafeie2, Susan Bird1 and Andreas Hühmer1 1Thermo Fisher Scientific, San Jose,…
Klíčová slova
flavonoid, flavonoidrtls, rtlslibrary, librarymsn, msnannotation, annotationarita, aritaspectral, spectralflavonoids, flavonoidsdata, datatribrid, tribridinbuilt, inbuilttemplate, templateutility, utilityconfident, confidentcompounds
High quality curated HRAM MSn spectral libraries and real time library search for the confident annotation of metabolites
2022|Thermo Fisher Scientific|Postery
High quality curated HRAM annotation of metabolites n MS spectral libraries and real time library search for the confident Rahul Deshpande1, Bashar Amer1, Daniel Hermanson1, Brandon Bills1, Eric Tague1, Susan Bird1, Reza Jafari2, Pedram Rafeie2 and Andreas Hühmer1 1Thermo Fisher…
Klíčová slova
rtls, rtlsflavonoid, flavonoidlibrary, libraryflavonoids, flavonoidsspectral, spectralxtm, xtminbuilt, inbuiltannotation, annotationtemplate, templateconfident, confidentcurated, curatedputative, putativetribrid, tribridmsn, msndata
Real time library search for the confident annotation of metabolites on Thermo Ascend Tribrid instrument
2023|Thermo Fisher Scientific|Postery
Real time library search for the confident annotation of metabolites on Thermo Ascend Tribrid instrument Rahul Deshpande1, Bashar Amer1, Jingjing Huang1, David Bergen1, Susan Bird1, and Thomas Moehring2, 1Thermo Fisher Scientific, San Jose, USA, 2Thermo Fisher Scientific, Bremen, Germany ABSTRACT…
Klíčová slova
rtls, rtlslibrary, libraryflavonoids, flavonoidsspectral, spectralputative, putativeascend, ascendannotation, annotationflavonoid, flavonoidmsn, msntribrid, tribridtea, teaconfident, confidentannotate, annotaterelevant, relevantsearch
Novel structure-based profiling and annotation workflow—high-throughput analysis of flavonoids using the Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid MS
2018|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
APPLICATION NOTE 65363 Novel structure-based profiling and annotation workflow—high-throughput analysis of flavonoids using the Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid MS Authors Reiko Kiyonami1, Iwao Sakane2, Seema Sharma1, Graeme McAlister1, Caroline Ding1 and Andreas Huhmer1 Thermo Fisher Scientific, ITO EN, LTD,…
Klíčová slova
flavonoid, flavonoidstructure, structuretree, treespectral, spectralfragment, fragmentcentroids, centroidsmsn, msnunknown, unknownannotation, annotationlibrary, librarymatch, matchcompound, compoundblazer, blazermzcloud, mzcloudflavonoids