Using Agilent Certified Pre-Owned Instruments to Research the Prediction of Covid-19
Ostatní | 2021 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Sledování SARS-CoV-2 v komunálních odpadních vodách poskytuje cenné včasné varování o nástupu epidemií a umožňuje optimalizovat veřejné zdravotní zásahy a sledování šíření viru v populaci.
Denina Simmons z Ontario Tech University analyzuje vzorky odpadních vod z pěti měst regionu Durham, aby určila, zda je možné předpovědět nárůsty pozitivních případů COVID-19 na základě detekce virových proteinů ve vzorcích.
Sběr vzorků z čistíren odpadních vod v Ajaxu, Claringtonu, Pickeringu, Oshawě a Whitby
Ultrafiltrace a centrifugace pro izolaci pevných frakcí
Enzymatické štěpení na peptidy
Analýza peptidů a jejich sekvencí pomocí LC Q-TOF MS a mapování na známé proteinové sekvence včetně SARS-CoV-2
Agilent Certified Pre-Owned LC/Q-TOF MS – pro kvantitativní a kvalitativní analýzu virových proteinů
Agilent Certified Pre-Owned GC/MS – dříve zakoupený systém pro organické kontaminanty
Plánovaný nákup Agilent Certified Pre-Owned LC/QQQ MS pro další rozšíření kapacit analýzy
Detekce zvýšené koncentrace virových proteinů v odpadních vodách přibližně 10 dní před nárůstem potvrzených případů COVID-19
Nalezení lidských proteinů potenciálně spojených s infekcí, naznačující možnost širšího biologického monitoringu
Potenciální zvýšení počtu analytických markerů pro citlivější a robustnější včasný varovný systém
Včasné varování před vlnami nákazy pro lepší přípravu zdravotních služeb
Možnost rozsáhlejšího monitoringu dalších patogenů pomocí obdobné metodiky
Ekonomická úspora při využití certifikovaných repasovaných přístrojů bez kompromisů na kvalitě dat
Integrace odpadních vod do rutinního zdravotního monitoringu
Rozšíření metody na další virové nebo bakteriální patogeny
Vylepšení analytických protokolů a automatizace zpracování vzorků pro vyšší průchodnost dat
Ukázka úspěšného využití Agilent CPO programu při výzkumu SARS-CoV-2 v odpadních vodách potvrzuje hodnotu repasovaných přístrojů a inovativní metodiky pro včasné varovné systémy v oblasti veřejného zdraví.
Agilent Case Study: Ottawa Wastewater Success Story, Agilent Technologies, září 2021
GC/MSD, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Sledování SARS-CoV-2 v komunálních odpadních vodách poskytuje cenné včasné varování o nástupu epidemií a umožňuje optimalizovat veřejné zdravotní zásahy a sledování šíření viru v populaci.
Cíle a přehled studie
Denina Simmons z Ontario Tech University analyzuje vzorky odpadních vod z pěti měst regionu Durham, aby určila, zda je možné předpovědět nárůsty pozitivních případů COVID-19 na základě detekce virových proteinů ve vzorcích.
Použitá metodika
Sběr vzorků z čistíren odpadních vod v Ajaxu, Claringtonu, Pickeringu, Oshawě a Whitby
Ultrafiltrace a centrifugace pro izolaci pevných frakcí
Enzymatické štěpení na peptidy
Analýza peptidů a jejich sekvencí pomocí LC Q-TOF MS a mapování na známé proteinové sekvence včetně SARS-CoV-2
Použitá instrumentace
Agilent Certified Pre-Owned LC/Q-TOF MS – pro kvantitativní a kvalitativní analýzu virových proteinů
Agilent Certified Pre-Owned GC/MS – dříve zakoupený systém pro organické kontaminanty
Plánovaný nákup Agilent Certified Pre-Owned LC/QQQ MS pro další rozšíření kapacit analýzy
Hlavní výsledky a diskuse
Detekce zvýšené koncentrace virových proteinů v odpadních vodách přibližně 10 dní před nárůstem potvrzených případů COVID-19
Nalezení lidských proteinů potenciálně spojených s infekcí, naznačující možnost širšího biologického monitoringu
Potenciální zvýšení počtu analytických markerů pro citlivější a robustnější včasný varovný systém
Přínosy a praktické využití
Včasné varování před vlnami nákazy pro lepší přípravu zdravotních služeb
Možnost rozsáhlejšího monitoringu dalších patogenů pomocí obdobné metodiky
Ekonomická úspora při využití certifikovaných repasovaných přístrojů bez kompromisů na kvalitě dat
Budoucí trendy a možnosti využití
Integrace odpadních vod do rutinního zdravotního monitoringu
Rozšíření metody na další virové nebo bakteriální patogeny
Vylepšení analytických protokolů a automatizace zpracování vzorků pro vyšší průchodnost dat
Závěr
Ukázka úspěšného využití Agilent CPO programu při výzkumu SARS-CoV-2 v odpadních vodách potvrzuje hodnotu repasovaných přístrojů a inovativní metodiky pro včasné varovné systémy v oblasti veřejného zdraví.
Reference
Agilent Case Study: Ottawa Wastewater Success Story, Agilent Technologies, září 2021
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
To gain new biological insights - Virus research solutions
2022|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Go beyond To gain new biological insights Virus research solutions An urgent need for expanded virus research Harness the power of omics to accelerate virus research. Thermo Fisher Scientific’s proteomics, glycomics, lipidomics and metabolomics mass spectrometry workflows provide virus researchers…
Klíčová slova
thermo, thermovirus, virusscientific, scientificviral, viralneo, neosoftware, softwarevanquish, vanquishuhplc, uhplcdiscoverer, discovererinsights, insightsorbitrap, orbitrapproteome, proteometmt, tmtprotein, proteineasypep
An urgent need for expanded virus research
2020|Thermo Fisher Scientific|Technické články
WHITE PAPER 65880 An urgent need for expanded virus research The role of mass spectrometry in understanding virus structure and function If we needed any additional evidence that virus research is an important area to emphasize, the severe acute respiratory…
Klíčová slova
virus, virusviral, viralprotein, proteinhost, hostimmune, immuneinteractions, interactionsproteins, proteinsmhc, mhchdx, hdxglycosylation, glycosylationpeptides, peptidesvaccine, vaccinestructural, structuralmembrane, membranecell
Development of an Assay for the COVID-19 Drug Remdesivir- Toward Proper Remdesivir Use in Patients with Pre-Existing Conditions
2022|Shimadzu|Aplikace
Application Note No. 76 Development of an Assay for the COVID-19 Drug Remdesivir- Toward Proper Remdesivir Use in Patients with Pre-Existing Conditions‐ Atsushi Yonezawa 1, Eishi Imoto2, Yoshihiro Hayakawa2 Pharmaceutical Pharmaceuticals Abstract This article establishes a mass spectrometer-based analytical…
Klíčová slova
remdesivir, remdesivirpatients, patientsrenal, renaldysfunction, dysfunctionkyoto, kyotonucleoside, nucleosideother, otherapproval, approvalclinical, clinicalgranted, grantedimpaired, impairedhospital, hospitalpharmaceuticals, pharmaceuticalstrials, trialsdrug
A quick and robust mass spectrometry-based method for the detection of SARS-CoV-2
2021|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
TECHNICAL NOTE 000055 A quick and robust mass spectrometry-based method for the detection of SARS-CoV-2 Authors: Richard J. Gibson1, Stephanie N. Samra1, Kerry M. Hassell1, George A. Renney2, Bradley J. Hart1 1 Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA, US 2…
Klíčová slova
aynvtqafgr, aynvtqafgradetqalpqr, adetqalpqrgwifgttldsk, gwifgttldskkadetqalpqr, kadetqalpqrnpannaaivlqlpqgttlpk, npannaaivlqlpqgttlpkdgiiwvategalntpk, dgiiwvategalntpkretention, retentionintensity, intensityfmol, fmolpeptide, peptidetime, timeratio, ratioarea, areamin, minpeptides
