A Refined LC-MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome
Postery | 2018 | Agilent Technologies | ASMSInstrumentace
V posledních letech se sekundární žlučové kyseliny ukazují jako klíčoví regulátoři hostitelské fyziologie vyvolaní střevní mikrobiotou. Přesné stanovení jejich profilu napomáhá pochopení interakcí mikrobiomu, metabolismu a onemocnění.
Cílem bylo vyvinout cílenou LC-MS/MS metodu schopnou kvantifikace 26 žlučových kyselin s minimální přípravou vzorku, včetně důrazu na separaci strukturálních izomerů a odolnost vůči lipidovým matricím.
Analytická instrumentace:
Vzorky byly extrahovány metanolem z kašovitých pelotek stolice, cecal obsahů myší a proteinově precipitovány z NIST SRM 1950 plazmy.
Optimalizace MRM přechodů pro 26 sloučenin zlepšila selektivitu oproti SIM režimu a omezila maticové interference. Použití acetonu v mobilní fázi umožnilo plné eluování fosfolipidů a triacylglycerolů, což zajistilo stabilní retence po 200 injekcích (RT CV do 0.15%). Detekční limity se pohybovaly v rozmezí 0.5–20 nM, kalibrační křivky dosahovaly R2 > 0.99. Aplikace na konvenční vs gnotobiotické myši prokázala drastické snížení sekundárních žlučových kyselin u gnotobiotických modelů.
Metoda nabízí:
Možnosti dalšího rozvoje zahrnují rozšíření na lidské klinické vzorky, integraci dalších mikrobiálně derivovaných metabolitů, využití v metabolomických studiích a propojení s bioinformatickými nástroji pro mapování metabolických cest.
Vyvinutý cílený LC-MS/MS protokol poskytuje vyvážené řešení vysoké citlivosti, selektivity a robustnosti pro analýzu žlučových kyselin a představuje efektivní nástroj pro studium mikrobiálně modulovaného metabolismu.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
V posledních letech se sekundární žlučové kyseliny ukazují jako klíčoví regulátoři hostitelské fyziologie vyvolaní střevní mikrobiotou. Přesné stanovení jejich profilu napomáhá pochopení interakcí mikrobiomu, metabolismu a onemocnění.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo vyvinout cílenou LC-MS/MS metodu schopnou kvantifikace 26 žlučových kyselin s minimální přípravou vzorku, včetně důrazu na separaci strukturálních izomerů a odolnost vůči lipidovým matricím.
Použitá metodika a instrumentace
Analytická instrumentace:
- UHPLC Agilent 1290 Infinity II s kolonkou Poroshell EC-C18 (2.1×150 mm, 2.7 μm) při 45 °C
- Mobilní fáze A: voda s 0.1% kyseliny mravenčí a 20 mM octanu amonného; B: aceton s 0.1% kyseliny mravenčí
- Gradient od 32% do 98% B v čase 0–25.1 min a čištění až do 32.1 min; průtok 0.2–0.4 ml/min
- MS Agilent 6470 Triple Quadrupole, ESI Jet Stream, režim dMRM s pozitivním i negativním módem, cyklový čas 750 ms
Vzorky byly extrahovány metanolem z kašovitých pelotek stolice, cecal obsahů myší a proteinově precipitovány z NIST SRM 1950 plazmy.
Hlavní výsledky a diskuse
Optimalizace MRM přechodů pro 26 sloučenin zlepšila selektivitu oproti SIM režimu a omezila maticové interference. Použití acetonu v mobilní fázi umožnilo plné eluování fosfolipidů a triacylglycerolů, což zajistilo stabilní retence po 200 injekcích (RT CV do 0.15%). Detekční limity se pohybovaly v rozmezí 0.5–20 nM, kalibrační křivky dosahovaly R2 > 0.99. Aplikace na konvenční vs gnotobiotické myši prokázala drastické snížení sekundárních žlučových kyselin u gnotobiotických modelů.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda nabízí:
- Vysokou selektivitu a citlivost v biologických matricích
- Výraznou robustnost díky unikátnímu mobilnímu systému
- Minimální přípravu vzorků
- Rychlé průtokové časy vhodné pro vysokou propustnost
Budoucí trendy a možnosti využití
Možnosti dalšího rozvoje zahrnují rozšíření na lidské klinické vzorky, integraci dalších mikrobiálně derivovaných metabolitů, využití v metabolomických studiích a propojení s bioinformatickými nástroji pro mapování metabolických cest.
Závěr
Vyvinutý cílený LC-MS/MS protokol poskytuje vyvážené řešení vysoké citlivosti, selektivity a robustnosti pro analýzu žlučových kyselin a představuje efektivní nástroj pro studium mikrobiálně modulovaného metabolismu.
Reference
- Devlin A.S., Fischbach M.A. Nature Chem Biol. 2015 Sep;11(9):685-90
- Wegner K. et al. Anal Bioanal Chem. 2017 Feb;409(5):1231-1245
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
A Refined LC/MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome
2023|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Metabolomics A Refined LC/MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome Authors Introduction Mark Sartain Agilent Technologies, Inc. Santa Clara, California, USA Secondary bile acids are the most abundant and variable microbiota-derived metabolites shown to affect host…
Klíčová slova
bile, bilepos, posacid, acidmuricholic, muricholicmrm, mrmconjugated, conjugatedmca, mcasecondary, secondaryprimary, primarycarboxymethyl, carboxymethylamide, amidebeta, betaalpha, alphatauro, tauroghdca
Tools to Understand the Gut Microbiome: A Refined LC-MS/MS Method to Profile Bacteria-derived Bile Acids
2017|Agilent Technologies|Postery
Tools to Understand the Gut Microbiome: A Refined LC-MS/MS Method to Profile Bacteria-derived Bile Acids 1Agilent Technologies, Inc., Santa Clara, CA, USA 2Department Experimental Secondary bile acids represent the most abundant and variable microbiota-derived metabolites and have been shown to…
Klíčová slova
mca, mcabile, bilelca, lcacecal, cecalghdca, ghdcamobile, mobilegca, gcagnotobiotic, gnotobioticphase, phasemrm, mrmtudca, tudcafecal, fecalacetone, acetonedmrm, dmrmconventionallyraised
Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples
2025|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Life Science Research Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples Authors Abstract Pietro Morlacchi Agilent Technologies, Inc. Bile acids (BAs) are crucial molecules involved in the digestion and absorption of dietary lipids and…
Klíčová slova
avanti, avantiacid, acidisosciences, isosciencesmca, mcabile, bilelca, lcamuricholic, muricholicresponses, responsesyes, yessulfate, sulfaterelative, relativecdca, cdcalinear, linearcayman, caymanbas
Refined LC/Q-TOF Methodology for Identification and Profiling of Bile Acids Produced from the Gut Microbiome
2022|Agilent Technologies|Postery
Refined LC/Q-TOF Methodology for Identification and Profiling of Bile Acids Produced from the Gut Microbiome ThP 328 Ruben J.F. 1Donald Introduction 1 Ramos , 2 Mark Sartain , 2 Daniel Cuthbertson , and Justin B. and Catherine C. Marron Cancer…
Klíčová slova
fecal, fecalplasma, plasmagcdca, gcdcacdca, cdcatcdca, tcdcagca, gcabile, biletca, tcaglca, glcamca, mcatlca, tlcagudca, gudcagdca, gdcatudca, tudcatdca