A Refined LC/MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome
Aplikace | 2023 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Metabolity žlučových kyselin produkované střevní mikrobiotou představují klíčový modulátor hostitelské fyziologie i energetického metabolismu. Přesný profil žlučových kyselin a jejich izomerů má význam pro studium střevní rezonance, patofyziologie jaterních onemocnění i výzkum léčiv. Cílené stanovení těchto látek vyžaduje robustní, citlivou a selektivní analytickou metodu s minimálními nároky na složitou přípravu vzorku.
Cílem studie bylo vyvinout a validovat LC/MS/MS metodu pro detekci a kvantifikaci 26 primárních, sekundárních a konjugovaných žlučových kyselin. Metoda kombinuje chromatografii s unikátním mobilním fázovým systémem na bázi acetonu a vody a selektivní detekci na trojitém kvadrupólu s dynamickou akvizicí MRM (dMRM). Důraz byl kladen na rozlišení strukturálních izomerů, potlačení lipidových interferencí a dlouhodobou stabilitu analýzy.
Metoda nabízí rychlou přípravu vzorku bez složitého SPE, vysokou selektivitu díky více MRM přechodům, robustnost v dlouhodobém provozu a snadnou přenositelnost na podobné LC/TQ systémy. Je vhodná pro farmaceutický výzkum, metabolomiku, QA/QC a studie interakcí host-mikrobiota.
Vyvinutá LC/MS/MS metoda umožňuje selektivní, citlivé a reprodukovatelné profilování širokého spektra žlučových kyselin v komplexních biologických matricích. Jednoduchá příprava vzorku, vysoká robustnost a flexibilita akvizičních parametrů ji předurčují k použití v moderní metabolomice a farmakologii.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Metabolity žlučových kyselin produkované střevní mikrobiotou představují klíčový modulátor hostitelské fyziologie i energetického metabolismu. Přesný profil žlučových kyselin a jejich izomerů má význam pro studium střevní rezonance, patofyziologie jaterních onemocnění i výzkum léčiv. Cílené stanovení těchto látek vyžaduje robustní, citlivou a selektivní analytickou metodu s minimálními nároky na složitou přípravu vzorku.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo vyvinout a validovat LC/MS/MS metodu pro detekci a kvantifikaci 26 primárních, sekundárních a konjugovaných žlučových kyselin. Metoda kombinuje chromatografii s unikátním mobilním fázovým systémem na bázi acetonu a vody a selektivní detekci na trojitém kvadrupólu s dynamickou akvizicí MRM (dMRM). Důraz byl kladen na rozlišení strukturálních izomerů, potlačení lipidových interferencí a dlouhodobou stabilitu analýzy.
Použitá metodika a instrumentace
- Příprava vzorku: proteinová srážka metanolem, homogenizace mlýnskými kuličkami, dvojí centrifugace a ředění do 50/50 metanol / voda.
- Chromatografie: Agilent 1290 Infinity II LC se sloupci Poroshell 120 EC-C18 (2,1×150 mm, 2,7 µm) a Fast Guard (2,1×5 mm), teplota 45 °C, gradient 32–100 % acetonu v mobilní fázi B, průtok až 1 000 µl/min.
- Hmotnostní spektrometrie: Agilent 6470 Triple Quadrupole LC/MS s Agilent Jet Stream, režim pozitivního a negativního iontování, dynamická MRM pro 84 přechodů, Q1/Q2 rozlišení 0,7 amu.
- Softwarové prostředí: Agilent MassHunter Quantitative Analysis v10.2 pro kvantifikaci a Agilent MPP v15.1 s modulem Pathway Architect pro vizualizaci dat.
Hlavní výsledky a diskuse
- Chromatografické rozlišení: 24/26 cílených látek s bazálním oddělením izomerů, selektivní eluce lipidů (PC, TAG) při vysokém procentu acetonu a zvýšeném průtoku.
- Robustnost: stabilní chromatografické topy po více než 200 injekcích, střední CV ploch MRM ~2,7 % a CV retenčních časů <0,2 %.
- Sensitivita: limity kvantifikace (LLOQ) v řádu 0,5–20 nM, koeficienty determinace R2 > 0,99, dynamický rozsah až 4,3 dekády.
- Biologická aplikace: rozdíly v koncentracích žlučových kyselin u konvenčních versus germ-free myší demonstrovaly přítomnost primárních a sekundárních kyselin jen u normální mikrobioty. Vizualizace pomocí Pathway Architect ukázala cestu 7α-dehydroxylace.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda nabízí rychlou přípravu vzorku bez složitého SPE, vysokou selektivitu díky více MRM přechodům, robustnost v dlouhodobém provozu a snadnou přenositelnost na podobné LC/TQ systémy. Je vhodná pro farmaceutický výzkum, metabolomiku, QA/QC a studie interakcí host-mikrobiota.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Zařazení izotopově značených interních standardů pro absolutní kvantifikaci a kompenzaci ionizačních útlumů.
- Optimalizace přípravy vzorků pomocí MWCO filtrací či alternativních precipitací ke zlepšení čistoty extraktů.
- Rozšíření kroků automatizace a miniaturizace pro vysokokapacitní screening.
- Integrace této metody s rozsáhlejšími lipidomickými a proteomickými pracovními postupy.
Závěr
Vyvinutá LC/MS/MS metoda umožňuje selektivní, citlivé a reprodukovatelné profilování širokého spektra žlučových kyselin v komplexních biologických matricích. Jednoduchá příprava vzorku, vysoká robustnost a flexibilita akvizičních parametrů ji předurčují k použití v moderní metabolomice a farmakologii.
Reference
- Devlin A. S., Fischbach M. A. A Biosynthetic Pathway for a Prominent Class of Microbiota-Derived Bile Acids. Nature Chemical Biology 2015, 11, 685–690.
- Wegner K. et al. Rapid Analysis of Bile Acids in Different Biological Matrices Using LC-ESI-MS/MS for the Investigation of Bile Acid Transformation by Mammalian Gut Bacteria. Analytical and Bioanalytical Chemistry 2017, 409, 1231–1245.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples
2025|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Life Science Research Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples Authors Abstract Pietro Morlacchi Agilent Technologies, Inc. Bile acids (BAs) are crucial molecules involved in the digestion and absorption of dietary lipids and…
Klíčová slova
avanti, avantiacid, acidisosciences, isosciencesmca, mcabile, bilelca, lcamuricholic, muricholicresponses, responsesyes, yessulfate, sulfaterelative, relativecdca, cdcalinear, linearcayman, caymanbas
A Refined LC-MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome
2018|Agilent Technologies|Postery
Poster Reprint ASMS 2018 WP-557 A Refined LC-MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome Mark J. Sartain1, Ariel R. Brumbaugh2, and Michael A. Fischbach2 1Agilent Technologies, Santa Clara, CA 2Department of Bioengineering, Stanford University, CA Introduction Secondary bile…
Klíčová slova
mca, mcabile, bilelca, lcaghdca, ghdcagca, gcahdca, hdcaudca, udcagudca, gudcagcdca, gcdcagdca, gdcacdca, cdcatudca, tudcadca, dcagnotobiotic, gnotobioticbeta
Fast Profiling of 39 Bile Acids in Plasma, Urine and Feces, by Automated Extraction and LCMS-8060NX
2021|Shimadzu|Aplikace
Liquid Chromatography Mass Spectrometry Application News Fast Profiling of 39 Bile Acids in Plasma, Urine and Feces, by Automated Extraction and LCMS-8060NX. Aurore Jaffuel 1, Akihiro Kunisawa 1, Jun Watanabe 1,1 Shimadzu Corporation. User Benefits Ready to use method…
Klíčová slova
acid, acidallocdca, allocdcaapoca, apocaghca, ghcanorca, norcanorudca, norudcaomca, omcatomca, tomcadhlca, dhlcaallolca, allolcabmca, bmcadhca, dhcatbmca, tbmcatamca, tamcaamca
Refined LC/Q-TOF Methodology for Identification and Profiling of Bile Acids Produced from the Gut Microbiome
2022|Agilent Technologies|Postery
Refined LC/Q-TOF Methodology for Identification and Profiling of Bile Acids Produced from the Gut Microbiome ThP 328 Ruben J.F. 1Donald Introduction 1 Ramos , 2 Mark Sartain , 2 Daniel Cuthbertson , and Justin B. and Catherine C. Marron Cancer…
Klíčová slova
fecal, fecalplasma, plasmagcdca, gcdcacdca, cdcatcdca, tcdcagca, gcabile, biletca, tcaglca, glcamca, mcatlca, tlcagudca, gudcagdca, gdcatudca, tudcatdca