The Analysis of Human Haemoglobin Variants using Mass Spectrometry
Příručky | 2021 | WatersInstrumentace
Analýza lidských variant hemoglobinu (Hb) má zásadní význam pro diagnostiku a sledování hemoglobinopatií, jako jsou srpkovitá anémie či talasémie. Přesná identifikace mutací globinových řetězců (α, β, δ, γ) umožňuje včasné stanovení rizika závažných onemocnění, cílenou genetickou konzultaci a volbu léčby.
Hlavním cílem publikace je představit metodiku rychlé a robustní identifikace variant Hb pomocí hmotnostní spektrometrie s elektrosprejem (ESI-MS) a tandemovou MS (ESI-MS/MS). Studie shrnuje pět klíčových kroků od standardního nálezu varianty klasickými technikami (ce-HPLC, IEF) až po potvrzení mutace na úrovni peptidů.
Popisovaná ESI-MS/ESI-MS/MS metodika přináší rychlý, citlivý a vysoce přesný nástroj pro identifikaci lidských hemoglobinových variant. Kombinace intaktní analýzy řetězců, selektivní trypsinizace a sekvenace peptidů umožňuje díky minimální přípravě vzorků vysoce efektivní rozlišení stovek mutací i hybridů. Tento přístup vhodně doplňuje klasické chromatografické a elektroforetické techniky a otevírá nové možnosti pro klinickou diagnostiku a výzkum.
LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Analýza lidských variant hemoglobinu (Hb) má zásadní význam pro diagnostiku a sledování hemoglobinopatií, jako jsou srpkovitá anémie či talasémie. Přesná identifikace mutací globinových řetězců (α, β, δ, γ) umožňuje včasné stanovení rizika závažných onemocnění, cílenou genetickou konzultaci a volbu léčby.
Cíle a přehled studie
Hlavním cílem publikace je představit metodiku rychlé a robustní identifikace variant Hb pomocí hmotnostní spektrometrie s elektrosprejem (ESI-MS) a tandemovou MS (ESI-MS/MS). Studie shrnuje pět klíčových kroků od standardního nálezu varianty klasickými technikami (ce-HPLC, IEF) až po potvrzení mutace na úrovni peptidů.
Použitá metodika a instrumentace
- Vzorky krve jsou 500× ředěny v 50% vodno-acetonitrilovém pufru s 0,2% kyselinou mravenčí.
- Odstranění solí pomocí kat-iontového pryskyřice (Bio-Rad AG50W-X8).
- ESI-MS analýza čistých α- a β-řetězců na trojpólovém hmotovém analyzátoru (VG/Micromass Quattro Ultima).
- In-silico kalibrace m/z škály interními α-řetězci; dekonvoluce MaxEnt.
- Rychlá 30minutová trypsinizace na pH 8 bez chromatografie; přímá ESI-MS analýza směsi peptidů.
- Tandemová MS pro sekvenování peptidů s mutací a identifikaci hybridních Hb.
Hlavní výsledky a diskuse
- Intaktní analýza řetězců dosahuje přesnosti lepší než ±0,05 Da, umožňuje detekci variant s posunem hmoty o 1 Da až od abundance 10 % v heterozygotech.
- Desalting zlepšuje rozlišení δ-řetězce (Hb A₂) a snižuje interference Na/K aduktů.
- α/β řetězce s posunem hmoty <6 Da jsou přiřazeny kombinací m/z odchylky β-řetězce a polarity změny z ce-HPLC.
- Tryptické peptidy (αT1–αT14, βT1–βT15) identifikují polohu mutace ve 2×15 polích, přičemž ~50 % mutací je rozpoznáno přímo díky unikátním hmotnostem peptidů.
- Zbývajících ~50 % mutací vyžaduje ESI-MS/MS sekvenaci mutačního peptidu, což dokumentují příklady více než dvaceti známých mutací i hybridů.
- Metoda efektivně odhalí hybridní formy Hb (Lepore, Kenya, P-Nilotic) bez potřeby genotypování.
Přínosy a praktické využití metody
- Doba analýzy: <2 h od příjmu vzorku po zprávu; vysoká propustnost pro klinické laboratoře.
- Univerzální postup bez nutnosti specifických protilátek, odlišných sond nebo PCR.
- Možnost identifikovat „tiché“ varianty neodhalené konvenčními elektroforetickými metodami.
- Kvalifikovaná kalibrace a kvalitní kontrolní standardy zajišťují reprodukovatelnost.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Automatizace přípravy vzorků a vysokorozlišovací MS (Orbitrap, TOF) pro vyšší citlivost a rozlišení izotopů.
- Multiplexní workflow pro simultánní sledování přes 50 mutací a modifikací (glykované, glutathionylace).
- Integrace s bioinformatickými databázemi (HbVar) a AI-návrhmi pro predikci nových variant.
- Využití ve screeningových programech v oblastech s vysokou prevalencí hemoglobinopatií.
Závěr
Popisovaná ESI-MS/ESI-MS/MS metodika přináší rychlý, citlivý a vysoce přesný nástroj pro identifikaci lidských hemoglobinových variant. Kombinace intaktní analýzy řetězců, selektivní trypsinizace a sekvenace peptidů umožňuje díky minimální přípravě vzorků vysoce efektivní rozlišení stovek mutací i hybridů. Tento přístup vhodně doplňuje klasické chromatografické a elektroforetické techniky a otevírá nové možnosti pro klinickou diagnostiku a výzkum.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Application Solutions for Biopharmaceuticals - A Focus on Protein Therapeutics
2012|Waters|Příručky
ApplicAtion SolutionS for BiophArmAceuticAlS A Focus on Protein Therapeutics Introduction: Key Challenges in Biopharmaceutical Characterization .............................................................................................5 7 PROTEIN mass aNalysIs comprehensive and routine characterization of proteins and peptides by lc/mS and lc/mS e ...............................................................9 characterization of an igG1 monoclonal Antibody…
Klíčová slova
uplc, uplcpeptide, peptideprotein, proteinwaters, watersacquity, acquityglycan, glycanantibody, antibodymass, massglycans, glycanspeptides, peptidessystem, systemanalysis, analysismapping, mappingintact, intactbiopharmalynx
Enhancing detection of hemoglobin variants in clinical research using dried blood spot and high-resolution accurate mass (HRAM) Orbitrap mass spectrometry
2024|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Technical note | 003155 Clinical Enhancing detection of hemoglobin variants in clinical research using dried blood spot and high-resolution accurate mass (HRAM) Orbitrap mass spectrometry Authors Application benefits Yvonne E. Song, Jingshu Guo, • Direct protein extraction from dried blood…
Klíčová slova
beta, betahemoglobin, hemoglobinprosightpd, prosightpdprotein, proteinorbitrap, orbitrapnormal, normalblood, bloodhemoglobinopathy, hemoglobinopathychains, chainsarb, arbdried, driedtracefinder, tracefinderspots, spotsvariants, variantsmass
Amino Acid Analysis - Application Notebook
2018|Waters|Příručky
[ APPLICATION NOTEBOOK ] Amino Acid Analysis Application Notebook [ CONTENTS ] [ INTRODUCTION ] Waters UPLC Amino Acid Analysis Solution................................................................................9 UPLC Amino Acid Analysis Solution............................................................................................... 11 Enhancement of the UPLC Amino Acid Analysis Solution with Flexible Detector Options......................................................................................................... 15…
Klíčová slova
amino, aminoacid, aciduplc, uplcasp, aspala, alalys, lysleu, leutyr, tyrgly, glyarg, argser, serthr, thrglu, gluile, ileval
IMSC: Differentiation of isobaric residues in SPITC-derivatized tryptic peptides using MS/MS technique in a novel Curved Field Reflectron.
2012|Shimadzu|Postery
PO-CON1208E Differentiation of isobaric residues in SPITC-derivatized tryptic peptides using MS/MS technique in a novel Curved Field Reflectron. IMSC 2012 PMo-098 1 Yuzo Yamazaki, 1Keisuke Shima, 2Diana Kalinina, 2 Matthew Openshaw, 2Omar Belgacem, 2 Andrew Bowdler, 2Ian Brookhouse 1 Global…
Klíčová slova
spitc, spitcxle, xlederivatized, derivatizeddifferentiation, differentiationtryptic, trypticisobaric, isobaricresidues, residuespeptides, peptidescooh, coohpsd, psdtechnique, techniquecid, cidile, ileleu, leupeptide