Performing Peptide Bioanalysis Using High Resolution Mass Spectrometry with Target Enhancement MRM Acquisition
Aplikace | 2016 | WatersInstrumentace
Rostoucí význam biologické léčby zvyšuje poptávku po rychlé a citlivé kvantifikaci peptidů v biomedicínských a farmaceutických aplikacích.
Vysoké rozlišení hmotnostní spektrometrie (HRMS) s cílenou akvizicí Tof MRM nabízí kombinaci selektivity, citlivosti a možnosti rychlého přepnutí na charakterizační režim pro řešení matrice.
Cílem studie bylo ověřit využití režimu Tof MRM s target enhancement na platformě ionKey/Xevo G2-XS QTof pro kvantifikaci standardní směsi peptidů MSQC1.
Studie zahrnovala výběr signaturních peptidů, optimalizaci přechodů a ověření lineárního rozsahu a citlivosti při sériových ředěních.
Akvizice probíhala v prostředí softwaru MassLynx, kde byl aktivován režim Tof MRM a importovány .mrm soubory s definovanými přechody a časovými okny.
Byly testovány čtyři typy přechodů (tři fragmentační a jeden tuneless precursor>precursor) pro čtyři vybrané peptidy.
Sledování probíhalo na ionKey mikrofluidickém separátoru spojeném s Xevo G2-XS QTof. Data byly zpracovány v modulu TargetLynx pro kvantifikaci a vyhodnocení kalibračních křivek.
Sestavení scouting experimentu ukázalo, že přechod precursor>precursor poskytuje nejlepší citlivost pro všechny testované peptidy.
Při sériových ředěních od 1:64 do 1:4096 byl dosažen lineární rozsah s R2 = 0,99 a vysokým poměrem signál/šum.
U stabilně označených peptidů byl rovněž potvrzen lineární rozsah bez saturace signálu při horních koncentracích.
Jedna platforma umožňuje jak identifikaci signaturních peptidů, tak rychlou a citlivou kvantifikaci.
Ve srovnání s tandemovými kvadrupóly režim Tof MRM redukuje komplexitu nastavení a zároveň zachovává vysokou selektivitu.
Metoda je vhodná pro rutinní testování QC standardů, biomarkerovou analýzu i vývoj farmaceutických bioanalytických postupů.
Další směřování zahrnuje rozšíření režimu Tof MRM na analýzu větších intact molekul a multiparalelní sledování většího počtu peptidů.
Integrace automatizovaných pracovních postupů a pokročilých bioinformatických nástrojů umožní zrychlení vývoje metod a seřizování kalibrací.
Vývoj nových mikrofluidických modulů a miniaturizace hmotnostních spektrometrů může posunout citlivost a propustnost na vyšší úroveň.
Režim Tof MRM s target enhancement na ionKey/Xevo G2-XS QTof poskytuje robustní, vysoce citlivou a lineární kvantifikaci peptidů.
Metoda spojuje výhody vysokého rozlišení a cílené akvizice v jednom přístroji, což zjednodušuje workflow a zvyšuje efektivitu bioanalytických aplikací.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníProteomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Rostoucí význam biologické léčby zvyšuje poptávku po rychlé a citlivé kvantifikaci peptidů v biomedicínských a farmaceutických aplikacích.
Vysoké rozlišení hmotnostní spektrometrie (HRMS) s cílenou akvizicí Tof MRM nabízí kombinaci selektivity, citlivosti a možnosti rychlého přepnutí na charakterizační režim pro řešení matrice.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo ověřit využití režimu Tof MRM s target enhancement na platformě ionKey/Xevo G2-XS QTof pro kvantifikaci standardní směsi peptidů MSQC1.
Studie zahrnovala výběr signaturních peptidů, optimalizaci přechodů a ověření lineárního rozsahu a citlivosti při sériových ředěních.
Použitá metodika a instrumentace
Akvizice probíhala v prostředí softwaru MassLynx, kde byl aktivován režim Tof MRM a importovány .mrm soubory s definovanými přechody a časovými okny.
Byly testovány čtyři typy přechodů (tři fragmentační a jeden tuneless precursor>precursor) pro čtyři vybrané peptidy.
Sledování probíhalo na ionKey mikrofluidickém separátoru spojeném s Xevo G2-XS QTof. Data byly zpracovány v modulu TargetLynx pro kvantifikaci a vyhodnocení kalibračních křivek.
Použitá instrumentace
- iKey HSS T3 mikrofluidický separátor (ionKey/MS)
- Xevo G2-XS QTof hmotnostní spektrometr
- MassLynx (akvizice Tof MRM) a TargetLynx (kvantifikace)
Hlavní výsledky a diskuse
Sestavení scouting experimentu ukázalo, že přechod precursor>precursor poskytuje nejlepší citlivost pro všechny testované peptidy.
Při sériových ředěních od 1:64 do 1:4096 byl dosažen lineární rozsah s R2 = 0,99 a vysokým poměrem signál/šum.
U stabilně označených peptidů byl rovněž potvrzen lineární rozsah bez saturace signálu při horních koncentracích.
Přínosy a praktické využití metody
Jedna platforma umožňuje jak identifikaci signaturních peptidů, tak rychlou a citlivou kvantifikaci.
Ve srovnání s tandemovými kvadrupóly režim Tof MRM redukuje komplexitu nastavení a zároveň zachovává vysokou selektivitu.
Metoda je vhodná pro rutinní testování QC standardů, biomarkerovou analýzu i vývoj farmaceutických bioanalytických postupů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další směřování zahrnuje rozšíření režimu Tof MRM na analýzu větších intact molekul a multiparalelní sledování většího počtu peptidů.
Integrace automatizovaných pracovních postupů a pokročilých bioinformatických nástrojů umožní zrychlení vývoje metod a seřizování kalibrací.
Vývoj nových mikrofluidických modulů a miniaturizace hmotnostních spektrometrů může posunout citlivost a propustnost na vyšší úroveň.
Závěr
Režim Tof MRM s target enhancement na ionKey/Xevo G2-XS QTof poskytuje robustní, vysoce citlivou a lineární kvantifikaci peptidů.
Metoda spojuje výhody vysokého rozlišení a cílené akvizice v jednom přístroji, což zjednodušuje workflow a zvyšuje efektivitu bioanalytických aplikací.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
High-Throughput LC-MS MRM Disease Protein Marker Verification Using the ionKey/MS System
2016|Waters|Aplikace
High-Throughput LC-MS MRM Disease Protein Marker Verification Using the ionKey/MS System Chris Hughes, Lee Gethings, Hans Vissers, and Jim Langridge Waters Corporation, Manchester, United Kingdom A P P L I C AT I O N B E N E F…
Klíčová slova
ionkey, ionkeyhroughput, hroughputmarker, markermrm, mrmprotein, proteinverification, verificationdisease, diseaseanhydrase, anhydrasecyclophilin, cyclophilincarbonic, carboniccatalase, catalasesystem, systemnanoacquity, nanoacquitypeptide, peptideuplc
PEPTIDE AND PROTEIN BIOANALYSIS
2016|Waters|Příručky
[ APPLICATION NOTEBOOK ] PEPTIDE AND PROTEIN BIOANALYSIS [ OUR SCIENTISTS ] Yun Alelyunas, PhD Before coming to Waters in 2012, Yun Alelyunas was a principal scientist and team leader at AstraZeneca for 20 years where she was involved in…
Klíčová slova
ionkey, ionkeypeptide, peptideplasma, plasmaquantification, quantificationhuman, humanarea, areaxevo, xevoinsulin, insulinuplc, uplcprotein, proteinmrm, mrmproteinworks, proteinworkspeptides, peptidesantibody, antibodyusing
[ APPLICATION NOTE ] Application of High- and Low-resolution Mass Spectrometers Combined with Nanoscale LC and Microfluidic LC Platforms for the Quantitative Analysis of Peptide Biomarkers in Human Serum Billy J. Molloy, Chris J. Hughes, Johannes P.C. Vissers, and James…
Klíčová slova
microfluidic, microfluidicnanoscale, nanoscaleplatforms, platformslgplveqgr, lgplveqgrionkey, ionkeyspectrometers, spectrometerscombined, combinedapplication, applicationedc, edcxevo, xevomrm, mrmlow, lowpeptides, peptidesnote, notemass
ionkey/MS - APPLICATION COMPENDIUM
2016|Waters|Příručky
[ ion key / MS ] APPLICATION COMPENDIUM Dear Colleague, The 2014 introduction of the ionKey/MS System was a turning point for LC-MS. The promise of increased levels of sensitivity from smaller sample sizes was finally a reality. We were…
Klíčová slova
ionkey, ionkeyikey, ikeyuplc, uplcsystem, systemplasma, plasmasensitivity, sensitivityion, ionhuman, humanusing, usingmobility, mobilityarea, areaseparation, separationassay, assaydevice, devicequantification