Precise Identification of Molecular Species of Phosphatidylethanolamine and Phosphatidylserine by Neutral Loss Survey with MS3 and Accurate Mass Measurement
Postery | | ShimadzuInstrumentace
Rozsáhlá charakterizace molekulárních forem fosfatidylethanolaminu a fosfatidylserinu je zásadní pro pochopení strukturálních a funkčních aspektů biologických membrán a metabolomiky lipidů.
Cílem studie bylo vyvinout a ověřit novou hmotnostně spektrometrickou metodu kombinující skenování neutrálních ztrát a MS3 s vysokou přesností měření hmotností pro spolehlivou identifikaci dvojic mastných kyselin v molekulárních druzích PE a PS v komplexní matrici lipidů.
Navržená metoda NL survey + MS3 s přesným měřením hmotností umožňuje spolehlivou a rychlou identifikaci molekulárních forem PE a PS bez časově náročné chromatografické separace a nabízí kvantitativní sledování změn lipidů v biologických vzorcích.
LC/TOF, LC/MS, LC/MS/MS, LC/IT
ZaměřeníLipidomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Rozsáhlá charakterizace molekulárních forem fosfatidylethanolaminu a fosfatidylserinu je zásadní pro pochopení strukturálních a funkčních aspektů biologických membrán a metabolomiky lipidů.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo vyvinout a ověřit novou hmotnostně spektrometrickou metodu kombinující skenování neutrálních ztrát a MS3 s vysokou přesností měření hmotností pro spolehlivou identifikaci dvojic mastných kyselin v molekulárních druzích PE a PS v komplexní matrici lipidů.
Použitá metodika a instrumentace
- Extrahováno Bligh a Dyer z mozku, jater a séra potkana
- Chromatografie na Si60 koloni (1×100 mm) s mobilní fází acetonitril/methanol obsahující 0,1 % amoniaku a 0,3 % octanu
- ESI-MS přístroj LCMS-IT-TOF (Shimadzu) spojený s LC-10AD a SIL-10AD autosamplerem
- Neutrál-loss survey pro ztrátu 141 u (PE) a 87 u (PS)
- MS3 analýza fragmentů [diglyceride-OH]+ pro PE a [phosphatidic acid-H]− pro PS
Hlavní výsledky a diskuse
- Celkem identifikováno 132 molekulárních druhů fosfolipidů v jaterním extraktu
- Odděleně rozlišeno 7 izobarických forem PS bez předchozí LC separace
- MS1 a MS3 hmotnostní přesnost pod 10 ppm bez interní kalibrace
- Rychlý analytický běh trvající pouze 30 min s vysokou selektivitou
- Kvantitativní potenciál detekce 1,3× nárůstu nebo 20 % poklesu koncentrace lipidů
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a cílená analýza jednotlivých tříd fosfolipidů
- Vhodné pro komplexní lipidomické studie a kontrolu kvality
- Možnost implementace na standardní IT-TOF instrumentaci
Budoucí trendy a možnosti využití
- Automatizace datové analýzy a integrace s bioinformatickými nástroji
- Rozšíření aplikace na další třídy lipidů a modifikované formy
- Použití stabilně značených interních standardů pro absolutní kvantifikaci
- Spojení s multidimenzionálními separačními technikami pro hlubší profilování lipidomu
Závěr
Navržená metoda NL survey + MS3 s přesným měřením hmotností umožňuje spolehlivou a rychlou identifikaci molekulárních forem PE a PS bez časově náročné chromatografické separace a nabízí kvantitativní sledování změn lipidů v biologických vzorcích.
Reference
- Ishida M., Yamaguchi S., Taniguchi J. et al. Precise Identification of Molecular Species of Phosphatidylethanolamine and Phosphatidylserine by Neutral Loss Survey with MS3 and Accurate Mass Measurement. Shimadzu Technical Report C146-E089, 2010.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Identification of Molecular Species of Phospholipids by combination of Neutral Loss Survey and MS3
|Shimadzu|Postery
C146-E084 Identification of Molecular Species of Phospholipids by combination of Neutral Loss Survey and MS3 Introduction: We established the system for analyses of molecular species of phospholipids with neutral loss survey of the head group-relating mass values and succeeding MS3…
Klíčová slova
acyl, acyldiacyl, diacylphospholipids, phospholipidsion, ioncchd, cchdfatty, fattyscanning, scanningchains, chainsnegative, negativelysodimepe, lysodimepemode, modesurvey, surveyions, ionshcoo, hcooclass
Identification of Phospholipid Molecular Species Using Neutral Loss Survey and MS3 Analysis
|Shimadzu|Aplikace
C146-E103 Identification of Phospholipid Molecular Species Using Neutral Loss Survey and MS 3 Analysis Technical Repor t vol.2 1 . Int roduct ion To elucidate the functions of phospholipids, it is important to conduct analysis not only of their classes…
Klíčová slova
candidates, candidatesphospholipid, phospholipidpossible, possiblechains, chainsacyl, acylfatty, fattyneutral, neutralreduction, reductionnumber, numberspecies, speciesethn, ethnclass, classdiradyl, diradylmolecular, molecularphosphorylethanolamine
Increased Throughput and Confidence for Lipidomics Profiling Using Comprehensive HCD MS2 and CID MS2/MS3 on a Tribrid Orbitrap Mass Spectrometer
2016|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
Reiko Kiyonami1, David A Peake1, Yasuto Yokoi2, and Ken Miller1 1 Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA, USA; 2Mitsui Knowledge Industry, Tokyo, Japan Key Words Orbitrap Fusion Lumos MS, high resolution, accurate mass, lipid profiling, intelligent scan functions, triglyceride (TG),…
Klíčová slova
lipid, lipidfusion, fusionlumos, lumosorbitrap, orbitrapion, ionspecies, speciescharacterization, characterizationhcd, hcdlipidomics, lipidomicsids, idsmsn, msnprofiling, profilingmolecular, molecularlipids, lipidsfatty
IMSC: Identification of Phospholipid Species Implicated in Dementia by Untargeted LC/HRMS and Data Dependent MS/MS
2016|Thermo Fisher Scientific|Postery
Results: Fatty acids comprising the molecular phospholipid species were unambiguously identified. ne Proteome Discoverer software is a node-based workflow engine and study management 55 platform for analysis of mass spectrometry-based proteomics datasets. The latest released version 2.1 fully supports isotopically-labeled…
Klíčová slova
hcd, hcdspecies, speciescid, cidlipid, lipidyes, yeshco, hcoandand, andandphospholipids, phospholipidsdementia, dementiappm, ppmidentification, identificationlipids, lipidsfigure, figurepcpc, pcpclipidsearch