Analysis of Modification Site of Chemically Modified Antibody Using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer
Aplikace | 2019 | ShimadzuInstrumentace
Antibody–drug conjugáty (ADC) představují perspektivní třídu cílených protinádorových léčiv, která spojují vysokou specificitu protilátky s toxickou účinností nízkomolekulárního činidla. Klíčovým krokem ve vývoji a kontrole kvality ADC je přesné určení stupně a místa chemické modifikace proteinu. Kompaktní MALDImini-1 s digitálním iontovým pastí nabízí uživatelům rychlou a citlivou alternativu pro lokalizaci modifikačních pozic bez potřeby rozsáhlého laboratorního vybavení.
Cílem studie bylo demonstrovat schopnost přístroje MALDImini-1 pokročilé analýzy modifikačních míst na modelové protilátce uměle navázané nízkomolekulární fluorescenční skupině Me-fluorescein-ABNO. Pro srovnání byly zhotoveny dva vzorky: standardní lidská protilátka NISTmAb a její pseudo-ADC úprava na zbytku tryptofanu.
Pro detailní mapování míst modifikací byly aplikovány následující postupy a přístroje:
Srovnáním hmotnostních spekter modifikované a nemodifikované protilátky byly identifikovány čtyři ionty unikátní pro modifikovaný vzorek (m/z 2416,9; 2430,7; 2452,7; 2560,9). Doplňující MS/MS a MS3 analýzy dovolily přiřadit dva z těchto signálů k peptidům ze sekvence těžkého řetězce:
Compactní MALDImini-1 umožňuje:
Očekává se rozšíření aplikací MALDI-MSn v oblasti biokonjugací a detekce dalších posttranslačních modifikací. Další miniaturizace, automatizace připravy vzorků a integrace s vysoce výkonnými chromatografickými technikami umožní zvýšení propustnosti a hlubší charakterizaci komplexních biologických látek.
Studie potvrdila, že kompaktní MALDImini-1 DIT spektrometr poskytuje dostatečnou citlivost a selektivitu pro lokalizaci modifikačních míst na protilátkách. Metoda je vhodná pro rutinní QC ADC a pro výzkumné laboratoře se zájmem o detailní mapování biokonjugací.
MALDI, LC/MS, LC/IT
ZaměřeníFarmaceutická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Antibody–drug conjugáty (ADC) představují perspektivní třídu cílených protinádorových léčiv, která spojují vysokou specificitu protilátky s toxickou účinností nízkomolekulárního činidla. Klíčovým krokem ve vývoji a kontrole kvality ADC je přesné určení stupně a místa chemické modifikace proteinu. Kompaktní MALDImini-1 s digitálním iontovým pastí nabízí uživatelům rychlou a citlivou alternativu pro lokalizaci modifikačních pozic bez potřeby rozsáhlého laboratorního vybavení.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo demonstrovat schopnost přístroje MALDImini-1 pokročilé analýzy modifikačních míst na modelové protilátce uměle navázané nízkomolekulární fluorescenční skupině Me-fluorescein-ABNO. Pro srovnání byly zhotoveny dva vzorky: standardní lidská protilátka NISTmAb a její pseudo-ADC úprava na zbytku tryptofanu.
Použitá metodika a instrumentace
Pro detailní mapování míst modifikací byly aplikovány následující postupy a přístroje:
- Enzymatická štěpná digesce trypsinem obou vzorků.
- Desalting s použitím ZipTip μC18.
- MALDI-MS analýza na kompaktním MALDImini-1 digitálním iontovém pastním spektrometru.
- Matricová látka: 2,5-dihydroxybenzoová kyselina (DHB).
- Multistupňová MSn analýza (MS, MS/MS, MS3).
Hlavní výsledky a diskuse
Srovnáním hmotnostních spekter modifikované a nemodifikované protilátky byly identifikovány čtyři ionty unikátní pro modifikovaný vzorek (m/z 2416,9; 2430,7; 2452,7; 2560,9). Doplňující MS/MS a MS3 analýzy dovolily přiřadit dva z těchto signálů k peptidům ze sekvence těžkého řetězce:
- Peptid 278–291 (FNWYVDGVEVHNAK) s modifikací na Trp.
- Peptid 305–320 (WSVLTVLHQDWLNGK) rovněž s modifikací na Trp.
Přínosy a praktické využití metody
Compactní MALDImini-1 umožňuje:
- Rychlou identifikaci lokalizovaných modifikací pro QC a vývoj ADC.
- Šetření vzorku i spotřebu činidel díky citlivému měření v malém objemu.
- Rozšíření analytických kapacit laboratoří s omezeným prostorem.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření aplikací MALDI-MSn v oblasti biokonjugací a detekce dalších posttranslačních modifikací. Další miniaturizace, automatizace připravy vzorků a integrace s vysoce výkonnými chromatografickými technikami umožní zvýšení propustnosti a hlubší charakterizaci komplexních biologických látek.
Závěr
Studie potvrdila, že kompaktní MALDImini-1 DIT spektrometr poskytuje dostatečnou citlivost a selektivitu pro lokalizaci modifikačních míst na protilátkách. Metoda je vhodná pro rutinní QC ADC a pro výzkumné laboratoře se zájmem o detailní mapování biokonjugací.
Reference
- Yohei Seki, Takashi Ishiyama, Daisuke Sasaki, Junpei Abe, Youhei Sohma, Kounosuke Oisaki, Motomu Kanai. Transition Metal-Free Tryptophan-Selective Bioconjugation of Proteins. J. Am. Chem. Soc. 2016;138(34):10798–10801.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
MSn Analyses for Tryptophan-Conjugated ADC Mimic by Miniature MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer (MALDI-DIT-MS)
2019|Shimadzu|Postery
PO-CON1858E MSn Analyses for Tryptophan-Conjugated ADC Mimic by Miniature MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer (MALDI-DIT-MS) ASMS 2019 ThP409 Hideharu Shichi1, Shuichi Nakaya1, Katsuya Maruyama2, Kosuke Hosoi1, Takashi Nishikaze1, Koichi Kojima1, Kei Kodera1, Sadanori Sekiya1, Shinichi Iwamoto1, Kounosuke Oisaki2, Motomu…
Klíčová slova
maldi, maldidit, dittryptophan, tryptophanminiature, miniaturemimic, mimicconjugated, conjugatedadc, adcmsn, msndigital, digitalabno, abnofluorescein, fluoresceintrap, trapanalyses, analysesspectrometer, spectrometerunmodified
Analysis of Glycopeptides Using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E070 Application News No. B100 MALDI Mass Spectrometer Analysis of Glycopeptides Using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer Glycans, which are one post-translational modification of proteins, are molecules with high structural heterogeneity which are formed by complex bonding…
Klíčová slova
eeqynstyr, eeqynstyrglycopeptides, glycopeptidesglycan, glycanglycopeptide, glycopeptidemaldi, maldibinding, bindingspectrometer, spectrometersignals, signalsantibody, antibodycommercial, commercialglycoprotein, glycoproteinwave, wavebonding, bondingcompact, compactsites
Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E071 Application News MALDI-TOF Mass Spectrometry Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural No. B101 Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers N-linked glycosylation to proteins plays an important role in various biological…
Klíčová slova
sialic, sialiclinkage, linkagealkylamidation, alkylamidationsalsa, salsaacid, acidderivative, derivativeglycan, glycanmaldi, malditypes, typessialyl, sialyllinked, linkednonreducing, nonreducingstructural, structuralneutralizes, neutralizesnews
Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E071 Application News MALDI-TOF Mass Spectrometry Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural No. B101 Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers N-linked glycosylation to proteins plays an important role in various biological…
Klíčová slova
sialic, sialiclinkage, linkagealkylamidation, alkylamidationsalsa, salsaacid, acidderivative, derivativemaldi, malditypes, typesglycan, glycansialyl, sialyllinked, linkednonreducing, nonreducingstructural, structuralneutralizes, neutralizesterminals