Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers
Aplikace | 2019 | ShimadzuInstrumentace
Analýza N-vázaných glykosidických řetězců na proteinech je zásadní pro pochopení biologických procesů a nemocí, neboť koncové sialické kyseliny a jejich vazebné izomery ovlivňují antigenitu, adhezi a virové interakce.
Tradiční HPLC selhává při rychlé identifikaci vazebních izomerů a konvenční MS trpí ztrátou labilních sialických zbytků.
SALSA (Sialic Acid Linkage Specific Alkylamidation) řeší tyto problémy chemickou modifikací, která stabilizuje sialové vazby a umožňuje jejich rozlišení podle hmotnostního posunu.
Studie se zaměřuje na krevní sérové N-glykany jako model.
Cílem bylo:
Uvolnění N-glykanů:
MS1 spektrometrie odhalila komplexní bi- a triantennární glykany.
Rozlišení vazeb izomerů bylo dosaženo díky hmotnostnímu rozdílu +28 Da (iPA) vs +41 Da (MA).
MS2 neutrální ztráty modifikovaných sialových zbytků potvrdily vazební typy u m/z 3117,1 (směs α2,3/α2,6) a 3145,2 (čistě α2,6).
MS3 fragmentace umožnila lokalizaci fragmentů na specifické větve a analýzu jádra glykosidu.
Rychlá a spolehlivá diferenciace vazebních izomerů sialových zbytků.
Zvýšení stability labilních glykanů během analýzy.
Možnost aplikace v biomarkerovém výzkumu, QC farmaceutických glykoproteinů a studiích virových glykoproteinů.
Rozšíření SALSA techniky na glykolipidy a jiné typy glykokonjugátů.
Integrace s kapalinovou chromatografií pro vysokokapacitní analýzu.
Automatizace derivatizačních kroků a rozvoj klinických aplikací.
Kombinace SALSA chemické modifikace a MSn analýzy na MALDImini-1 představuje účinné řešení pro strukturální analýzu glykosidů včetně vazeb sialových kyselin, přináší vyšší citlivost, stabilitu a selektivitu.
MALDI, LC/MS, LC/IT
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Analýza N-vázaných glykosidických řetězců na proteinech je zásadní pro pochopení biologických procesů a nemocí, neboť koncové sialické kyseliny a jejich vazebné izomery ovlivňují antigenitu, adhezi a virové interakce.
Tradiční HPLC selhává při rychlé identifikaci vazebních izomerů a konvenční MS trpí ztrátou labilních sialických zbytků.
SALSA (Sialic Acid Linkage Specific Alkylamidation) řeší tyto problémy chemickou modifikací, která stabilizuje sialové vazby a umožňuje jejich rozlišení podle hmotnostního posunu.
Cíle a přehled studie
Studie se zaměřuje na krevní sérové N-glykany jako model.
Cílem bylo:
- Uvolnit a chemicky modifikovat sialické zbytky pomocí SALSA.
- Označit redukční konec glykosidů fluorogenním činidlem 2-aminobenzamidem (2AB).
- Prokázat diferenciaci α2,3- a α2,6-sialylace pomocí MALDImini-1 MALDI-DIT MSn.
Použitá metodika a instrumentace
Uvolnění N-glykanů:
- Denaturace séra SDS a redukce DTT, přidání NP-40 a enzymu PNGaseF, inkubace 37 °C/18 h.
- Reakce s isopropylaminem (iPA) pro α2,6- a methylaminem (MA) pro α2,3-sialylaci (1 h, pokojová teplota).
- Stabilizace laktonové formy, očištění GL-Tip Amide.
- Redukující konce glykosidů značené 2-aminobenzamidem, odstranění přebytečného činidla.
- Nanesení vzorku a matrice CHCA+NaCl na MALDI kazetu.
- MALDImini-1 Compact MALDI-DIT Mass Spectrometer pro MSn analýzu.
Hlavní výsledky a diskuse
MS1 spektrometrie odhalila komplexní bi- a triantennární glykany.
Rozlišení vazeb izomerů bylo dosaženo díky hmotnostnímu rozdílu +28 Da (iPA) vs +41 Da (MA).
MS2 neutrální ztráty modifikovaných sialových zbytků potvrdily vazební typy u m/z 3117,1 (směs α2,3/α2,6) a 3145,2 (čistě α2,6).
MS3 fragmentace umožnila lokalizaci fragmentů na specifické větve a analýzu jádra glykosidu.
Přínosy a praktické využití metody
Rychlá a spolehlivá diferenciace vazebních izomerů sialových zbytků.
Zvýšení stability labilních glykanů během analýzy.
Možnost aplikace v biomarkerovém výzkumu, QC farmaceutických glykoproteinů a studiích virových glykoproteinů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozšíření SALSA techniky na glykolipidy a jiné typy glykokonjugátů.
Integrace s kapalinovou chromatografií pro vysokokapacitní analýzu.
Automatizace derivatizačních kroků a rozvoj klinických aplikací.
Závěr
Kombinace SALSA chemické modifikace a MSn analýzy na MALDImini-1 představuje účinné řešení pro strukturální analýzu glykosidů včetně vazeb sialových kyselin, přináší vyšší citlivost, stabilitu a selektivitu.
Reference
- Nishikaze T, et al. Differentiation of Sialyl Linkage Isomers by One-Pot Sialic Acid Derivatization for Mass Spectrometry-Based Glycan Profiling. Anal Chem 2017;89:2353–2360.
- Hanamatsu H, et al. Sialic Acid Linkage Specific Derivatization of Glycosphingolipid Glycans by Ring-Opening Aminolysis of Lactones. Anal Chem 2018;90(22):13193–13199.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E071 Application News MALDI-TOF Mass Spectrometry Analysis of N-Linked Glycan using MALDImini™-1 Compact MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer: Structural No. B101 Analysis and Identification of Sialyl Linkage Isomers N-linked glycosylation to proteins plays an important role in various biological…
Klíčová slova
sialic, sialiclinkage, linkagealkylamidation, alkylamidationsalsa, salsaacid, acidderivative, derivativemaldi, malditypes, typesglycan, glycansialyl, sialyllinked, linkednonreducing, nonreducingstructural, structuralneutralizes, neutralizesterminals
SialoCapper-ID Kit : A Novel Derivatization Tool for Glycan Analysis by Mass Spectrometry
2021|Shimadzu|Aplikace
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit Application News SialoCapper-ID Kit : A Novel Derivatization Tool for Glycan Analysis by Mass Spectrometry T. Nishikaze, M. Inuzuka User Benefits Sialic acid linkage types scan be discriminated using…
Klíčová slova
sialocapper, sialocapperglycan, glycansialic, sialickit, kitglycans, glycansacid, acidderivatized, derivatizedlinkage, linkagesalsa, salsareaction, reactionlabeled, labeledblotglyco, blotglycoderivatization, derivatizationmass, masslabeling
Analysis of Serum N-Glycans of Gene-KO Mouse Using MALDI-7090 and SialoCapper-ID Kit
2021|Shimadzu|Aplikace
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit MALDI-TOF Mass Spectrometer: MALDI-7090 Application News Analysis of Serum N-Glycans of Gene-KO Mouse Using MALDI-7090 and SialoCapper-ID Kit M. Inuzuka, T. Nishikaze User Benefits Sialic acid linkage isomer can…
Klíčová slova
sialic, sialicglycan, glycanlinkage, linkageblotglyco, blotglycosialocapper, sialocapperacid, acidkit, kitderivatization, derivatizationsialyltransferase, sialyltransferaseglycoproteins, glycoproteinssalsa, salsaderivative, derivativeglycans, glycansreleased, releasedserum
Sialic Acid Linkage Isomer Discrimination of N-glycans derived from Rat Cochlea using SialoCapper-ID Kit
2021|Shimadzu|Aplikace
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit MALDI-TOF Mass Spectrometer: MALDI-8020 Application News Sialic Acid Linkage Isomer Discrimination of N-glycans derived from Rat Cochlea using SialoCapper-ID Kit M. Inuzuka, T. Nishikaze User Benefits The sialic acid…
Klíčová slova
sialic, sialiclinkage, linkagesialocapper, sialocapperglycans, glycansacid, acidderivatization, derivatizationkit, kitglycan, glycantype, typesalsa, salsadiscriminated, discriminatedderivative, derivativeisomer, isomerfractionation, fractionationdiscrimination