LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
Pragolab
Jsme jedním z lídrů na českém a slovenském trhu v oblasti laboratorních zařízení a svým zákazníkům přinášíme špičkové přístroje z oboru analytické chemie a fyzikálních měření více než 25 let.
Tagy
Článek
Aplikace
Video
Logo of LinkedIn

Purifikace oligonukleotidů pomocí semipreparativní kapalinové chromatografie s reverzní fází

Út, 21.3.2023
| Originální článek z: Pragolab/Ivana Eliášová
Získejte přehledný návod pro purifikaci syntetických oligonukleotidů a následnou analýzu pomocí semipreparativní kapalinové chromatografie na reverzní fázi (RP-LC).
Video placeholder
  • Foto: Pixabay/Mahmoud Ahmed: Purifikace oligonukleotidů pomocí semipreparativní kapalinové chromatografie s reverzní fází
  • Video: Chromatography & Mass Spectrometry Solutions: Thermo Scientific Vanquish Analytical Purification LC System

Podívejte se na bezproblémovou integraci systému Vanquish Analytical Purification LC do workflow přečištování a analýzy oligonukleotidů.

Hlavní benefity aplikace

  • Začlenění platformy Thermo Scientific Vanquish LC do výrobního workflow přední farmaceutické společnosti v oboru, Eurofins Genomics Europe Pharma and Diagnostic Products & Services Synthesis GmbH, Ebersberg, Německo, k purifikaci oligonukleotidů definovaných zákazníkem na reverzní fázi.

  • Zdůraznění flexibility UHPLC a HPLC systémů Thermo Scientific Vanquish, které mohou pracovat nejen za analytických podmínek UHPLC, ale pokrývají také aplikace semipreparativní LC purifikace pomocí integrovaného sběrače frakcí Thermo Scientific Vanquish Fraction Collector.

  • Vysoce přesná izolace cílových syntetických produktů pomocí Thermo Scientific Vanquish Analytical Purification LC system.

Pragolab: Thermo Scientific Vanquish analytické purifikační LC systémy

V posledních několika letech vzrostl zájem o oligonukleotidy v oblasti biochemického výzkumu a diagnostiky a jako o léčiva, proto bylo vynaloženo velké úsilí na optimalizaci a automatizaci jejich syntézy.

Syntéza oligonukleotidů zahrnuje velké množství jednotlivých reakcí, což nevyhnutelně vede k akumulaci nečistot, jako jsou zkrácené sekvence. Proto je purifikace požadovaných oligonukleotidů klíčovým krokem.

💡 Článek: Analytické purifikační LC systémy Vanquish

Od 70. let 20. století se k analýze a čištění syntetických oligonukleotidů používá několik chromatografických přístupů. V posledních letech došlo k významnému vývoji z hlediska výkonu přístrojů a stacionární fáze. Pokud je požadována vysoká čistota produktů, padá volba na metodu HPLC. Mezi separační techniky běžně používané pro separaci nukleových kyselin patří RP-HPLC (reverzní fáze-HPLC).

Pragolab: Analytické purifikační LC systémy Vanquish

Rostoucí význam oligonukleotidů jako terapeutických látek zvyšuje úroveň kontroly kvality. V těchto protokolech je vyžadována chromatografická analýza API (active pharmaceutical ingredients), aby byla zajištěna detekce kontaminantů na úrovni koncentrace až do stopových množství ve vztahu k léčivu.

Tato práce demonstruje purifikaci oligonukleotudů pomocí semipreparativní kapalinové chromatografie na reverzní fázi.

Cílem je:

  • rozlišit vedlejší produkty syntézy DNA
  • izolovat a zachytit cílové oligonukleotidy
  • určit účinnost purifikace prostřednictvím zpětné analýzy shromážděných frakcí

To vše na LC systému Vanquish Analytical Purification, což usnadňuje integrovaný Vanquish Fraction Collector.

Konfigurace systému Vanquish Flex Analytical Purification LC:
  • Vanquish System Base Horizon/Flex (P/N VF-S01-A)
  • Vanquish Binary Pump F (P/N VF-P10-A-01)
  • Vanquish Split Sampler FT (P/N VF-A10-A)
  • 1000 μL sample loop (P/N 6850.1980)
  • Vanquish Column Compartment H with active pre-heater (P/N VH-C10-A-02)
  • Vanquish Diode Array Detector FG (P/N VF-D11-A-01)
  • Semi-Micro Biocompatible Flow Cell (P/N 6083.0550)
  • Integral Vanquish Fraction Collector (P/N VF-F20-A-01)
  • Delay capillary for peak-based fractionation, 0.25 × 1500 mm, MP35N, Viper (P/N 6706.1110)
  • Needle capillary, 0.18 × 415 mm, partially PEEK-shielded MP35N, Viper (P/N 6706.1010)
  • Flush buffer loop, 50 μL, PEEK, Viper (P/N 6706.1070)

Pragolab: Vzorek oligonukleotidu AT647-BHQ2. (A) Přehled frakcionace. (B) Re-analýza všech odebraných frakcí. (C) Potvrzení, že píky nečistot v černé záznamu jsou zamýšlenou purifikací eliminovány.

Veškeré podrobnosti naleznete v přiložené aplikaci, nebo nás neváhejte kontaktovat na [email protected].

Přehled nejnovější literatury Thermo Fisher Scientific z oblasti analýzy oligonukleotidů v knihovně LabRulezLCMS

  • ASMS: Streamlining workflow from characterization to monitoring of therapeutic oligonucleotides impurities across IPRP-LC-HRAM-MS platforms (Postery | 2022)

  • Comprehensive oligonucleotide analysis (Ostatní | 2022)

  • High-throughput analysis of oligonucleotides using a single quadrupole mass spectrometer for quality control (Aplikace | 2022)

  • ISC: High-throughput analysis of oligonucleotides using a single quadrupole mass spectrometer for quality control (Postery | 2022)

  • HPLC: High-throughput analysis of oligonucleotides using a single quadrupole mass spectrometer for quality control (Postery | 2022)

  • Characterization of mRNA 5’ capping products using an LC-HRAM-MS/MS analytical platform and Thermo Scientific BioPharma Finder software solution (Aplikace | 2022)

  • mRNA direct sequence mapping using automated partial digestion with magnetic nuclease and LC-HRMS (Aplikace | 2022)

  • ASMS: Characterization of mRNA vaccine 5’ and 3’ end products using BioPharma Finder 5.0 (Postery | 2022)

  • ISC: Oligonucleotide sequencing by LC-MS/MS (Prezentace | 2022)

  • Characterization of in vitro-transcribed (IVT) mRNA poly(A) tail by LC-HRAM-MS and BioPharma Finder 5.0 software (Aplikace | 2022)

  • BioLC columns and accessories (Chromatography consumables catalog) (Brožury a specifikace | 2022)

  • ISC: Ensuring precise isolation of macromolecules by hyphenating UHPLC separation power with exact fractionation for analytical and semi-preparative LC purification (Postery | 2022)

  • Characterization of lipid nanoparticle (LNP) composition using UHPLC-CAD (Aplikace | 2022)

  • BioPharma workflow solutions (Brožury a specifikace | 2022)

  • ISC: 1D/2D-UHPLC-MS System and its use in the Field of Drug Metabolism and Pharmacokinetics (Postery | 2022)

  • Metabolomics: Differentiating sugar phosphate isomers using high resolution mass spectrometry coupled with MSn, collision induced dissociation, and ultraviolet photodissociation (Postery | 2022)

  • ASMS: Differentiating Isomers using High Resolution Mass Spectrometry Coupled with MSn, Collision Induced Dissociation, and Ultraviolet Photodissociation (Postery | 2022)

  • Low-flow columns and accessories (Ostatní | 2022)

Pragolab
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved LC/MS Performance to Determine Polar Nitrosamines Using the Agilent 1260 Infinity II Hybrid Multisampler

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

SQ Detector 2

Brožury a specifikace
| 2024 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Ostatní

Halogens and sulfur in solid samples according to EN 17813

Aplikace
| 2024 | Metrohm
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Metrohm
Zaměření
Životní prostředí

Determination of carbohydrates in peanuts by HPAE-PAD

Aplikace
| 2024 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Targeted PFAS Analysis in Industrial Wastewater Using the Agilent 6475 Triple Quadrupole LC/MS System

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články


Článek | Produkt

Thermo Scientific Stellar - revoluční hmotnostní spektrometr

Thermo Scientific Stellar MS - jedinečné propojení kvadrupólu, iontově koncentračního multipólu a dvojtlaké lineární iontové pasti přináší dosud nevídanou rychlost a přesnost analýz.
Pragolab
more

Článek | Produkt

Přístroje pro extrakci na pevné fázi (SPE)

Extrakce na pevné fázi (SPE) může být použita jak pro čištění, tak i pro zakoncentrování vzorků. Volba přístroje pro SPE významně ovlivňuje kvalitu a spolehlivost analytických výsledků.
Altium International
more

Článek | Zdraví

Patogenní mikroorganismy a Listeria monocytogenes

Patogenní (choroboplodné) mikroorganismy způsobují onemocnění lidí, zvířat nebo rostlin. Změny v Nařízení (ES) č. 2073/2005 platné od 1. 1. 2026.
ALS Czech Republic
more

Článek | Věda a výzkum

Vyvíjíme novou chemii pro pochopení biologie

Čerstvý držitel start-up grantu Athanasios Markos a jeho vývoj chemických nástrojů, které umožní studovat biomolekuly, ale také cíleně ovlivňovat biologické procesy přímo v živých systémech.
Nadace Experientia
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved LC/MS Performance to Determine Polar Nitrosamines Using the Agilent 1260 Infinity II Hybrid Multisampler

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

SQ Detector 2

Brožury a specifikace
| 2024 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Ostatní

Halogens and sulfur in solid samples according to EN 17813

Aplikace
| 2024 | Metrohm
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Metrohm
Zaměření
Životní prostředí

Determination of carbohydrates in peanuts by HPAE-PAD

Aplikace
| 2024 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Targeted PFAS Analysis in Industrial Wastewater Using the Agilent 6475 Triple Quadrupole LC/MS System

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články


Článek | Produkt

Thermo Scientific Stellar - revoluční hmotnostní spektrometr

Thermo Scientific Stellar MS - jedinečné propojení kvadrupólu, iontově koncentračního multipólu a dvojtlaké lineární iontové pasti přináší dosud nevídanou rychlost a přesnost analýz.
Pragolab
more

Článek | Produkt

Přístroje pro extrakci na pevné fázi (SPE)

Extrakce na pevné fázi (SPE) může být použita jak pro čištění, tak i pro zakoncentrování vzorků. Volba přístroje pro SPE významně ovlivňuje kvalitu a spolehlivost analytických výsledků.
Altium International
more

Článek | Zdraví

Patogenní mikroorganismy a Listeria monocytogenes

Patogenní (choroboplodné) mikroorganismy způsobují onemocnění lidí, zvířat nebo rostlin. Změny v Nařízení (ES) č. 2073/2005 platné od 1. 1. 2026.
ALS Czech Republic
more

Článek | Věda a výzkum

Vyvíjíme novou chemii pro pochopení biologie

Čerstvý držitel start-up grantu Athanasios Markos a jeho vývoj chemických nástrojů, které umožní studovat biomolekuly, ale také cíleně ovlivňovat biologické procesy přímo v živých systémech.
Nadace Experientia
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved LC/MS Performance to Determine Polar Nitrosamines Using the Agilent 1260 Infinity II Hybrid Multisampler

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

SQ Detector 2

Brožury a specifikace
| 2024 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Ostatní

Halogens and sulfur in solid samples according to EN 17813

Aplikace
| 2024 | Metrohm
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Metrohm
Zaměření
Životní prostředí

Determination of carbohydrates in peanuts by HPAE-PAD

Aplikace
| 2024 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Targeted PFAS Analysis in Industrial Wastewater Using the Agilent 6475 Triple Quadrupole LC/MS System

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články


Článek | Produkt

Thermo Scientific Stellar - revoluční hmotnostní spektrometr

Thermo Scientific Stellar MS - jedinečné propojení kvadrupólu, iontově koncentračního multipólu a dvojtlaké lineární iontové pasti přináší dosud nevídanou rychlost a přesnost analýz.
Pragolab
more

Článek | Produkt

Přístroje pro extrakci na pevné fázi (SPE)

Extrakce na pevné fázi (SPE) může být použita jak pro čištění, tak i pro zakoncentrování vzorků. Volba přístroje pro SPE významně ovlivňuje kvalitu a spolehlivost analytických výsledků.
Altium International
more

Článek | Zdraví

Patogenní mikroorganismy a Listeria monocytogenes

Patogenní (choroboplodné) mikroorganismy způsobují onemocnění lidí, zvířat nebo rostlin. Změny v Nařízení (ES) č. 2073/2005 platné od 1. 1. 2026.
ALS Czech Republic
more

Článek | Věda a výzkum

Vyvíjíme novou chemii pro pochopení biologie

Čerstvý držitel start-up grantu Athanasios Markos a jeho vývoj chemických nástrojů, které umožní studovat biomolekuly, ale také cíleně ovlivňovat biologické procesy přímo v živých systémech.
Nadace Experientia
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Improved LC/MS Performance to Determine Polar Nitrosamines Using the Agilent 1260 Infinity II Hybrid Multisampler

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

SQ Detector 2

Brožury a specifikace
| 2024 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Ostatní

Halogens and sulfur in solid samples according to EN 17813

Aplikace
| 2024 | Metrohm
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Metrohm
Zaměření
Životní prostředí

Determination of carbohydrates in peanuts by HPAE-PAD

Aplikace
| 2024 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Targeted PFAS Analysis in Industrial Wastewater Using the Agilent 6475 Triple Quadrupole LC/MS System

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články


Článek | Produkt

Thermo Scientific Stellar - revoluční hmotnostní spektrometr

Thermo Scientific Stellar MS - jedinečné propojení kvadrupólu, iontově koncentračního multipólu a dvojtlaké lineární iontové pasti přináší dosud nevídanou rychlost a přesnost analýz.
Pragolab
more

Článek | Produkt

Přístroje pro extrakci na pevné fázi (SPE)

Extrakce na pevné fázi (SPE) může být použita jak pro čištění, tak i pro zakoncentrování vzorků. Volba přístroje pro SPE významně ovlivňuje kvalitu a spolehlivost analytických výsledků.
Altium International
more

Článek | Zdraví

Patogenní mikroorganismy a Listeria monocytogenes

Patogenní (choroboplodné) mikroorganismy způsobují onemocnění lidí, zvířat nebo rostlin. Změny v Nařízení (ES) č. 2073/2005 platné od 1. 1. 2026.
ALS Czech Republic
more

Článek | Věda a výzkum

Vyvíjíme novou chemii pro pochopení biologie

Čerstvý držitel start-up grantu Athanasios Markos a jeho vývoj chemických nástrojů, které umožní studovat biomolekuly, ale také cíleně ovlivňovat biologické procesy přímo v živých systémech.
Nadace Experientia
more
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.