Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR pronikají do detailů genové transkripce. Popsali dosud neznámý molekulární mechanismus, kterým může začínat přepis genetické informace z deoxyribonukleové kyseliny (DNA) do ribonukleové kyseliny (RNA). Zaměřili se na zvláštní molekuly nazývané alarmony, které se vyskytují v buňkách napříč organismy a jejichž hladina se často zvyšuje při buněčném stresu. Výsledky výzkumu zveřejnil prestižní vědecký časopis Nature Chemical Biology.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Hana Cahová, vedoucí vědecké skupiny Chemická biologie nukleových kyselin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>RNA molekuly mohou nést na jednom konci různé chemické modifikace, označované jako tzv. „čepičky“. U eukaryotních organismů, kam patří i lidské buňky, je nejznámější čepička, která se podílí na stabilitě RNA a regulaci jejího dalšího osudu. V posledních letech se však ukazuje, že existují i alternativní, nekanonické RNA čepičky, jejichž vznik a mechanismus připojení k RNA se zatím vymyká lidským znalostem. Mezi ně patří například tzv. alarmonové čepičky, tvořené molekulami dinukleosidpolyfosfátu, alarmonů, které chrání buněčnou RNA ve chvílích, kdy je buňka v ohrožení.Tým <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cahova.group.uochb.cz/cs">Dr. Hany Cahové</a> se ve své studii zaměřil na RNA polymerázu z bakterií a sledoval, jakým způsobem může tento enzym zahájit transkripci za využití dinukleosidpolyfosfátů (NpNs) místo běžných stavebních bloků RNA. Vědci vůbec poprvé popsali na atomární úrovni, jak může vznikat RNA s alarmonovou čepičkou přímo při zahájení přepisu genu. Navíc pozorovali, že se NpnNs vážou jiným typem párování, než je obvyklé.Na práci se zásadně podílely Valentina Serianni z týmu Hany Cahové, která prokázala schopnost dinukleosidpolyfosfátů zahajovat přepis genu, a Jana Škerlová, která se zaměřila na strukturální analýzu RNA polymerázy a na základě dat z kryogenní elektronové mikroskopie ukázala, jak se molekuly dinukleosidpolyfosfátů váží do aktivního místa RNA polymerázy, tedy do srdce enzymu, kde se genetická informace přepisuje. Jejich studie pomáhá odhalovat procesy, které provázejí přepis genetické informace z DNA do RNA.Hana Cahová k tomu dodává: „Popisujeme něco, co se v buňkách skutečně děje a co nyní dokážeme pozorovat přímo na úrovni jednotlivých molekul. Získáváme tak odpovědi na zásadní otázky týkající se buněčných procesů, například jak se buňky přizpůsobují stresu. Právě RNA totiž přenáší kaskádu informací, které stojí za jakoukoli buněčnou reakcí, např. na stav ohrožení způsobený nedostatkem živin či teplotním šokem.“<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Tomáš Kouba, vedoucí core facillity skupiny Kryogenní elektronová mikroskopie." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"><div>Klíčovou roli v projektu sehrála kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM), kterou vedl Dr. Tomáš Kouba, jeden z autorů článku. „Kryoelektronová mikroskopie umožňuje zmrazit biologické molekuly skoro v jejich přirozené formě a následné získat trojrozměrnou strukturu takových molekul. Díky tomu můžeme nahlédnout přímo do aktivního centra enzymů a sledovat jejich fungování až na atomární úrovni,“ vysvětluje Tomáš Kouba.ÚOCHB vloni otevřel nové <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cryoem.group.uochb.cz/cs">centrum cryo-EM</a>, které je v českém prostředí unikátní. Špičkové kryogenní elektronové mikroskopy našly zázemí ve speciálně navržené budově a umožňují studium biologických procesů s mimořádnou strukturální přesností.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg" alt="ÚOCHB: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Tato práce ukazuje, jak malé molekuly NpnN pomáhají bakteriím zahájit přepis genetické informace. Detailní zobrazení pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhaluje, jak se vážou na genetickou šablonu a fungují jako nekanonické „čepičky“ RNA." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1077"><blockquote><h4>Původní článek</h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41589-025-02134-5#citeas">Molekulární vhled do 5′ zakončení RNA pomocí NpnNs zprostředkovaného bakteriální RNA polymerázou</a></h4>Valentina M. Serianni, Jana Škerlová, Anna Knopp Dubánková, Anton Škríba, Hana Šváchová, Tereza Vučková, Anatolij Filimoněnko, Milan Fábry, Pavlína Řezáčová, Tomáš Kouba &amp; Hana Cahova&nbsp;Nat. Chem. Biol. 21 (2026)<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5">https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5</a><h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC-BY 4.0</a></h6></blockquote><h4>Abstrakt</h4>RNA zakončená dinukleosidovými polyfosfáty byla u bakterií i eukaryot objevena teprve nedávno. Pravděpodobný mechanismus tohoto specifického typu zakončení RNA spočívá v přímém začlenění dinukleosidových polyfosfátů RNA polymerázou jako nekanonických iniciačních nukleotidů. Dosud však nebylo známo, jakým způsobem se tyto sloučeniny vážou do aktivního místa RNA polymerázy během zahájení transkripce. V této práci jsme in vitro studovali iniciaci transkripce za použití série DNA templátů v kombinaci s dinukleosidovými polyfosfáty a modelovou RNA polymerázou z bakterie Thermus thermophilus. Zjistili jsme, že místo zahájení transkripce se může lišit v závislosti na kompatibilitě konkrétního templátu a použitého dinukleosidového polyfosfátu. Struktury iniciačních transkripčních komplexů s dinukleosidovými polyfosfáty získané pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhalily, že obě nukleové báze v molekule mohou párovat s DNA templátem. První kódovaný nukleotid se páruje kanonickým Watsonovým–Crickovým způsobem, zatímco druhá nukleová báze se váže nekanonicky prostřednictvím reverzního Watsonova–Crickova párování. Tato práce tak poskytuje strukturní vysvětlení mechanismu, kterým dinukleosidové polyfosfáty zahajují transkripci RNA.</div></div>

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

V týdnu od 9. února na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.<blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars">👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</a></h4></blockquote><blockquote>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi s více než 5 000 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</blockquote><h5>1. SelectScience: High-throughput stability screening strategies for antibody formulation</h5><ul><li>Út, 10. 2. 2026 17:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5807">Registrace</a></li></ul>Webinář představuje využití vysokokapacitních technik DLS/SLS a rychlého DSC screeningu pro urychlení hodnocení stability vysoce koncentrovaných protilátkových formulací.<h5>2. Phenomenex: Big Scale, Big Wins: Prep Chromatography Explained</h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 10:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5793">Registrace</a></li></ul>Praktický přehled přenosu analytických metod do preparativní HPLC, včetně limitů preparativních kolon a klíčových aspektů farmaceutických aplikací.<h5>3. ALS Czech Republic: PFAS in Food &amp; Food Contact Material</h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 15:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5816">Registrace</a></li></ul>Webinář přináší přehled regulací EU a USA, analytických výzev a osvědčených strategií testování PFAS v potravinách a materiálech pro styk s potravinami.<h5>4. New Food magazine: The Science of Next-Gen Ingredients: Fermentation, Formulation and Function</h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 16:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5720">Registrace</a></li></ul>Pohled na fermentační inovace nové generace a jejich roli při vývoji funkčních potravinářských ingrediencí se zlepšenou chutí, funkčností a stabilitou.<h5>5. SCIEX: Accurate Mass Fundamentals – Interpreting and Applying Your Data</h5><ul><li>St, 11. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5772">Registrace</a></li></ul>Třetí díl série zaměřený na interpretaci přesné hmotnosti, potvrzení identity sloučenin a řešení problematických HRMS výsledků v praxi.<h5>6. Agilent Technologies: Process Analytical Techniques: Online HPLC for Real Time Monitoring and Control of Bioprocesses</h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 06:30 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5834">Registrace</a></li></ul>Webinář ukazuje využití online PAT HPLC pro téměř reálné monitorování kritických kvalitativních atributů v bioprocesní výrobě.<h5>7. Thermo Fisher Scientific: Introducing the Orbitrap Excedion Pro Hybrid MS</h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 11:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5889">Registrace</a></li></ul>Představení nové generace Orbitrap MS s rozšířeným hmotnostním rozsahem, ETD/EThcD fragmentací a robustními workflow pro charakterizaci proteinů.<h5>8. Waters Corporation: Planning Your NuGenesis Upgrade: Insights and Best Practices for a Smooth Transition</h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5833">Registrace</a></li></ul>Doporučení pro upgrade softwaru NuGenesis, přechod na Windows 11 a využití nových dashboardů pro přehled dat v reálném čase.<h5>9. Thermo Fisher Scientific: Comprehensive Analytical Strategies for Peptides Therapeutics and GLP-1 Agonist</h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 19:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5814">Registrace</a></li></ul>Komplexní přehled analytických strategií pro peptidová terapeutika a GLP-1 agonisty, zahrnující vývoj metod, kontrolu kvality a LC-MS workflow.<h5>10. Agilent Technologies: Moving from R&amp;D and Limited QC on a UV-Vis-NIR Instrument to Large Scale QC Using an Autosampler</h5><ul><li>Čt, 12. 2. 2026 20:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/2104">Registrace</a></li></ul>Webinář se zaměřuje na rozšíření UV-Vis-NIR analýzy z výzkumu do rutinní kontroly kvality pomocí autosampleru.<h5>11. Agilent Technologies: LC Method Transfer: Hidden Challenges &amp; Absolute Solution</h5><ul><li>Pá, 13. 2. 2026 06:30 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5787">Registrace</a></li></ul>Detailní rozbor skrytých úskalí přenosu LC metod mezi systémy a strategií, jak zajistit robustní a reprodukovatelné výsledky.<h5>12. Altium International (HPST): Příprava vzorků pro analýzu vitamínů rozpustných v tucích – tipy a aplikace</h5><ul><li>Pá, 13. 2. 2026 10:00 CET</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/5891">Registrace</a></li></ul>Praktické tipy pro přípravu vzorků vitamínů rozpustných v tucích v komplexních lipidových matricích se zaměřením na kvalitu a spolehlivost dat.

Webináře LabRulezLCMS týden 07/2026

<h3><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.isc2026.org/">O ISC 2026</a></h3><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.labrulez.com/companies/314">Mezinárodní sympozium o chromatografii (International Symposium on Chromatography, ISC)</a> představuje nejstarší konferenční sérii v oblasti separačních věd. Sympozia ISC jsou pořádána od roku 1956 v každém sudém roce. ISC patří mezi nejvýznamnější světová setkání zaměřená na diskusi všech forem chromatografie a separačních metod, s širokým pokrytím technik a aplikací.Hlavním zaměřením sympozia bude přínos chromatografie a separačních věd pro potřeby farmaceutického, environmentálního, potravinářského a zdravotnického průmyslu, stejně jako pro vědu a medicínu. Program sympozia bude tyto oblasti reflektovat a upozorní na nové výzvy i vznikající příležitosti ve vývoji, aplikaci a marketingu separačních a detekčních systémů a metod.Nedílnou součástí vědeckého programu přednášek a posterových sekcí bude mezinárodní výstava a firemní semináře zaměřené na instrumentaci a služby v oblasti chromatografie, separačních věd a hmotnostní spektrometrie. ISC 2026 nabídne ideální platformu pro vědeckou výměnu a networking účastníků z akademické sféry, průmyslu i státních výzkumných institucí.<h3>Klíčová data sympozia ISC 2026</h3>6.–10. září 2026<ul><li>15. ledna 2026 – Zahájení registrace za zvýhodněnou cenu (early-bird) a podávání abstraktů</li><li>11. března 2026 – Uzávěrka podávání abstraktů (ústní prezentace)</li><li>21. dubna 2026 – Odeslání rozhodnutí o přijetí (ústní prezentace)</li><li>15. května 2026 – Uzávěrka registrace a platby za zvýhodněnou cenu &amp; registrace autorů (ústní prezentace)</li><li>1. června 2026 – Zveřejnění předběžného detailního programu</li><li>1. června 2026 – Uzávěrka podávání abstraktů (postery)</li><li>16. června 2026 – Odeslání rozhodnutí o přijetí (postery)<ul><li>Autoři, kteří podají abstrakt s preferencí posteru do 5. května 2026, budou o výsledku informováni do 12. května 2026 a budou mít možnost využít zvýhodněnou registraci do 15. května 2026.</li></ul></li><li>30. června 2026 – Uzávěrka registrace autorů (postery)</li><li>30. července 2026 – Uzávěrka podávání abstraktů (pozdní postery – late-breaking)<ul><li>bez možnosti soutěžit o cenu za nejlepší poster</li></ul></li><li>11. srpna 2026 – Odeslání rozhodnutí o přijetí (pozdní postery)</li><li>18. srpna 2026 – Uzávěrka registrace autorů (pozdní postery)</li><li>25. srpna 2026 – Uzávěrka pozdní registrace a platby</li><li>6.–10. září 2026 – Konání sympozia</li></ul><h3>Registrace</h3><blockquote>👉 <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.czech-in.org/cmPortalV15/Account/Login?ReturnUrl=%2FcmPortalV15%2FPortal%2FISC26%2Fnormal">Zaregistrujte se na ISC 2026</a></blockquote><h3>Podávání abstraktů</h3><blockquote><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.czech-in.org/cmPortalV15/Account/Login?ReturnUrl=%2FcmPortalV15%2FPortal%2FISC26%2Fnormal">👉 Nahrajte svůj abstrakt zde</a></blockquote><h3>VĚDECKÝ PROGRAM - KRÁTKÉ KURZY</h3><h4>SC 3 – Interpretace hmotnostních spekter: základní úvod pro chromatografisty</h4>🗓️ Neděle, 6. září 2026 🕗 8:30–11:45Hmotnostní spektrometrie se stala nepostradatelným nástrojem moderní kapalinové chromatografie, přesto však mnoho chromatografistů absolvuje pouze omezené formální vzdělání v oblasti interpretace hmotnostních spekter. Tento úvodní krátký kurz nabízí praktického průvodce porozuměním a interpretací hmotnostních spekter získaných pomocí ionizačních technik za atmosférického tlaku, které jsou spojeny s LC: ionizace elektrosprejem (ESI), chemická ionizace za atmosférického tlaku (APCI) a fotoionizace za atmosférického tlaku (APPI).Kurz začíná vysvětlením, jaké dodatečné informace přináší hmotnostní spektrometrie oproti samotnému chromatogramu, a objasněním, na které analytické otázky dokáže – a na které naopak nedokáže – hmotnostní spektrometrie odpovědět. Účastníci získají stručné zopakování základních principů hmotnostní spektrometrie spolu s úvodem do klíčové terminologie.Následně jsou diskutovány principy a praktické důsledky jednotlivých ionizačních metod, se zvláštním důrazem na to, jak fyzikální podstata ionizace, chromatografické podmínky a přísady v mobilní fázi ovlivňují podobu výsledných spekter. Na tomto základě kurz rozvíjí praktické dovednosti potřebné pro interpretaci LC-ESI spekter: identifikaci molekulárního iontu, určení nábojového stavu, rozpoznání běžných aduktů, odlišení artefaktů vznikajících přímo ve zdroji a využití izotopových vzorů k podpoře hypotéz o elementárním složení.Účastníci se dále seznámí s tím, jak fragmentace MS/MS poskytuje strukturální informace, a osvojí si jednoduchá praktická pravidla pro interpretaci neutrálních ztrát a fragmentačního chování jednotlivých tříd látek. Kurz je zakončen integračním cvičením, které kombinuje chromatografická data, full-scan spektra a MS/MS informace pro komplexní interpretaci naměřených výsledků.Na konci kurzu budou účastníci vybaveni základními dovednostmi potřebnými pro efektivní interpretaci LC-MS spekter a pro praktické využití hmotnostně spektrometrického uvažování v rutinní chromatografické analýze.<h4>Lektoři</h4><h5>Josef Cvačka</h5><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/articles?search=Josef+Cva%C4%8Dka">Josef Cvačka</a> je vedoucím Skupiny hmotnostní spektrometrie na Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR a docentem na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy v Praze. Jeho výzkum se zaměřuje na strukturní analýzu bioaktivních organických sloučenin pomocí pokročilých hmotnostně spektrometrických technik. Vyvíjí metody pro určování polohy dvojných vazeb a methylových větvení v lipidech a usiluje o objevování nových tříd lipidů v biologických vzorcích. Jeho laboratoř se rovněž věnuje vývoji nových iontových zdrojů pro MS a HPLC/MS. Působí jako pedagog a školitel studentů na Univerzitě Karlově a je zakladatelem <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/articles?search=%C4%8Cesk%C3%A9+muzeum+hmotnostn%C3%AD+spektrometrie">Českého muzea hmotnostní spektrometrie</a>.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Josef_Cvacka_5cc8a0d1d4.jpg" alt="ISC 2026: Josef Cvačka" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Josef_Cvacka_5cc8a0d1d4.jpg 156w," sizes="100vw" width="510" height="510">

ISC 2026 – Krátký kurz 3: Interpretace hmotnostních spekter: základní úvod pro chromatografisty

Webináře

Věda a výzkum

Video

Článek

Nejbližší akce

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

The International Symposium on Chromatography (ISC) represents the oldest conference series focussing on separation science. ISC symposia have been organised since 1956 in each even year. ISC is internationally recognised as one of the premier meeting series for discussion of all modes of chromatography and separation science with a broad coverage of techniques and applications.

International Symposium on Chromatography - (ISC)

Agilent Technologies

Bruker

Thermo Fisher Scientific

Wiley

SCIEX

Evosep Biosystems

Waters Corporation

ADCs represent complex biologics combing a targeting antibody molecule with a cytotoxic warhead via a linker system. The design of the linker systems is crucial to ensure the warhead is only released at the target site, whilst enabling conjugation to an active site on the protein.
Mass spectrometry can be utilized in various modalities to monitor loss of payloads when incubated in plasma providing a rapid measurement of relative stability.
This webinar will detail how mass spectrometry is used in ADC development and how the X500B QTOF system represents a versatile platform for measurement of intact, reduced, and digested proteins.
Attend this webinar to:
<ul>
<li>Understand how LC-MS can be used to study the stability of an ADC in plasma</li>
<li>Find out how LC-MS can be used to calculate the antibody drug ratio of an intact ADC</li>
<li>Discover how LC-MS has been used to study the payload release of an ADC</li>
</ul>
<blockquote>
Presenter: Chris Nortcliffe (Mass Spectrometry Manager | Sterling Pharma Solutions | UK)
</blockquote>
<blockquote>
Dr Christopher Nortcliffe is the mass spectrometry manager in the UK at Sterling Pharma Solutions, a CDMO pharmaceutical partner company. He has a background in protein and DNA analysis, obtaining his PhD from the University of Manchester on studying noncovalent interactions by mass spectrometry in 2016. After Manchester, Christopher worked for SCIEX as a specialist in LC-MS analysis of biologics before moving to Sterling Pharma Solutions, where he manages the LC-MS service and is an expert in the LC-MS analysis of biotherapeutics and ADCs.
</blockquote>

SCIEX: Use of mass spectrometry to assess plasma stability of Antibody Drug Conjugates

Use of mass spectrometry to assess plasma stability of Antibody Drug Conjugates

How mass spectrometry is used in ADC development and how the X500B QTOF system represents a versatile platform.

Use of mass spectrometry to assess plasma stability of ADCs

Unlock new perspectives with our accurate mass 101 webinar series.
Accelerate your workflows and expand your knowledge around accurate mass with these informative webinars.
In this webinar series, SCIEX applications scientists will explain the benefits of using accurate mass, sample analysis, instrument operation and data processing in real-time.
Get the inside scoop and register today!
<h3>Accurate mass 101: non-targeted analysis</h3>
Join us for this webinar to see how to discover the unknown using non-targeted analysis. We will showcase workflows and strategies to drive success with suspect screening and non-target identification. Discover the ability to identify peaks of interest and confidently identify unknown compounds.

SCIEX: Accurate mass 101: non-targeted analysis

Accurate mass 101: non-targeted analysis

SCIEX applications scientists will explain the benefits of using accurate mass, sample analysis, instrument operation and data processing in real-time.

As an analytical scientist, you need robust, flexible, and easy solutions to help you characterize and understand your oligonucleotides faster.
Have a closer look at the Waters’ solution:
Exceptional LC-MS performance to maximize sample analysis and comprehensive informatics capabilities, specifically designed for biopharmaceutical analytical laboratories that need to be able to make more confident and more efficient analytical decisions.
Join our 30 Min live session, directly from the Waters Wilmslow Demo Lab:
<ul>
<li>Find out how Waters solutions can help you to know more about your oligonucleotides – quicker and easier than ever!
</li>
<li>Learn about the benefits of a flexible system and gain insight into this exciting solution and how it can help your lab overcome analytical challenges.
</li>
<li>Discover the Waters solution for extended Oligonucleotide analyses, including a preview of the INTACT Mass app and the CONFIRM Sequence app in waters_connect
</li>
</ul>
Waters MS Systems - including ACQUITY Premier LC-System, MaxPeak Premier Columns, and waters_connect Software - are a workflow-based solution: It is easy to implement and operate and will improve decision-making and time to results in your laboratory.
Join Dr. Jo-Anne Riley for this live demo. She will show you how easy it is to set up and operate the Xevo G3 QTof system and introduce you to our INTACT Mass and CONFIRM Sequence workflows from samples to results.

Waters Corporation: Oligonucleotide Analyses using LC-MS: A Live Demo

Oligonucleotide Analyses using LC-MS: A Live Demo

Find out how Waters solutions can help you to know more about your oligonucleotides – quicker and easier than ever!

Unleash the power of DIA and enable the exploration of complex biological systems with unprecedented depth and precision for large-scale quantitative protein analysis combined with short methods on the Evosep One.
<h3>Global proteomics with Evosep and DIA-PASEF</h3>
Recent progress in liquid chromatography and mass spectrometry, as well as sample preparation and search algorithms for spectra deconvolution and identification, plays an important role in bringing proteomics to the forefront of drug discovery and development. Nanoflow liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry is one of the most essential elements in a proteomics workflow. The four dimensional ion detection achieved with the latest generation of Bruker’s trapped ion mobility spectrometers led to superior speed and sensitivity. Evosep One liquid chromatography platform offers speed and robustness while maintaining, even exceeding previously achieved performance level with high-performing nano LC systems. We share here some results only possible with this combination of LC-MS and dia-PASEF.
<blockquote>
Presenter: Anh Reynolds (Scientist, Bristol Myers Squibb)
</blockquote>
<h3>Extending sensitivity limits with Evosep and Slice-PASEF</h3>
Sensitivity improvements in LC-MS proteomics have recently led to exciting new applications, such as comprehensive proteomic profiling of single cells or 2-dimensional proteomics of tissue slices. In this talk, I will describe Slice-PASEF, a new acquisition technology for timsTOF instruments, which, in combination with the DIA-NN data analysis software, provides a fold-change signal boost. When paired with the Evosep system, Slice-PASEF allows to achieve high sensitivity in robust high-throughput workflows, paving a way for accessible sensitive proteomics on a large scale.
<blockquote>
Presenter: Vladim Demichev (Group Leader, Quantitative ProteomicS, Charité – Universitätsmedizin Berlin)
</blockquote>

Pixabay/sethink: Revolutionizing proteomics with Evosep-DIA

Revolutionizing proteomics with Evosep-DIA

Global proteomics with Evosep and DIA-PASEF & Extending sensitivity limits with Evosep and Slice-PASEF.

Cell line development scientists and upstream bioprocess engineers aim at optimizing biotherapeutics production processes to maximize drug product quality, yield, and manufacturing efficiency. Currently, information on critical process and product attributes required for informed decision making is often insufficient and not readily available. This has a negative impact on the process robustness, throughput, and outcome.
Direct measurement of cell culture media and product quality attributes (PQAs) has recently been offered thanks to the Waters BioAccord™ LC-MS system with dedicated workflows for process analytics of biopharmaceuticals. The BioAccord™ LC-MS can be directly coupled to multi parallel bioreactor systems, like the Sartorius Ambr® 15 or 250 HT platforms, for accelerated process development. 
With this integrated solution, process engineers have direct access to the information they need to be in control: drug substance quality and yield can be maximized, process and product related impurities minimized, and more robust processes can be developed, thereby de-risking batch failure. This ultimately results in accelerated drug product development and manufacturing release from months or weeks to days, saving time and resources but more importantly enable faster delivery of safer treatments to patients. 
Please join us as Magnus Wetterhall will present how Waters BioAccord™ LC-MS system offer enhanced capabilities for direct measurements of critical process and product quality attributes in cell line and process development and thereby enabling you to make more informed decisions with your own high-quality data. 
<blockquote>
Presenter: Magnus Wetterhall, Ph.D. (Global Marketing Manager – Bioprocessing, Waters Corporation)
</blockquote>
<blockquote>
Magnus Wetterhall has more than 25 years’ experience in upstream &amp; downstream bioprocessing, advanced mass spectrometry, biomarker discovery, protein characterization, working at start-ups, large biotech companies as well as academics. Magnus earned his M.Sc. and Ph.D. degree in analytical chemistry at Uppsala University, Sweden. He has published over 40 scientific papers and 50 posters in the areas of mass spectrometry, biomolecule characterization and bioseparations, and has been an invited presenter at national and international conferences on these topics. He is currently the Global Marketing Manager at Waters Corporation – Bioprocessing, where he is dedicated to deliver analytical solutions to advance upstream and downstream bioprocess.
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Terence Teo (BioPharma/BMR Market Development Manager, APAC, Waters Corporation)
</blockquote>
<blockquote>
Terence Teo has more than 15 years of experience in bioprocessing, specializing in downstream processing R&amp;D during the early phase of his career before moving to business development roles in GE Life Sciences (now Cytiva), Pall Biotech and most recently, Waters Corporation. Terence is motivated in supporting regional customers in APAC with technologies enabling continuous bioprocessing. He is currently working actively in Waters to drive the use of LC-MS analytical solutions to support near real-time CQA measurement in bioprocess applications, as well as use of LC-MS in multi-attribute method (MAM) and emerging drug modalities such as mRNA and viral vectors. Terence earned his M.Eng degree in Chemical and Biomolecular Engineering at National University of Singapore (NUS).
</blockquote>

Waters Corporation: Accelerating Upstream Bioprocess Development Through Data Driven Decisions

Accelerating Upstream Bioprocess Development Through Data Driven Decisions

We will present how Waters BioAccord™ LC-MS system offer enhanced capabilities for direct measurements of critical process and product quality attributes.

Accelerating Upstream Bioprocess Development

Dear user and other PaSER interested customers,
You are hereby invited to our 2nd Virtual PaSER Workshop. A lot of new possibilities has been introduced since last time – including, but not limited to PaSER Novor for de novo sequencing of dda-PASEF® data on the PaSER Box as well as TIMS DIA-NN 2.0 -which will be demonstrated during this Workshop. Data virtualization has been a requested feature – and this is now possible with Mass Dynamics for PaSER. Not limited to above – stay tuned for even more approaching features, we will discuss as well.
<h3>The tentative agenda looks like this:</h3>
<h5>1:00 – 1:15 pm: Introduction</h5>
<ul>
<li>Willy Bjørklund</li>
</ul>
<h5>1:15 – 1: 35pm: New Applications on the timsTOF Platform</h5>
<ul>
<li>Lars Kristensen (Field Application Specialist)</li>
</ul>
<h5>1:35 – 1:55 pm: PaSER as a bioinformatic platform - what’s new and what’s coming</h5>
<ul>
<li>Jonathan Krieger (Software R&amp;D Department)</li>
</ul>
<h5>5 minute break</h5>
<h5>2:00 – 2:20 pm: Live Demo/workshop of PaSER</h5>
<ul>
<li>Tharan Srikumar (Software R&amp;D Department)</li>
</ul>
<h5>2:20 – 2:50 pm: Mass Dynamics</h5>
<ul>
<li>Mark Condina and Giuseppe Infusini</li>
</ul>
<h5>2:50 – 3:10 pm: Questions and discussions</h5>
<h5>3:10 – 3:15 pm: Conclusion</h5>
<ul>
<li>Willy Bjørklund</li>
</ul>
We aim for a lively interaction so take the timing as an indication. Please feel free to share with colleagues or others you think could benefit from attending this workshop. Looking forward to “meet”

Bruker Virtual PaSER Workshop

Dear user and other PaSER interested customers, You are hereby invited to our 2nd Virtual PaSER Workshop. 

This webinar will focus on untargeted LC/MS Omics solutions that will provide the biological insights needed to produce meaningful results. An emphasis will be spent on an End-to-End HILIC metabolomics workflow for our LC/Q-TOF platform.
This includes automate sample preparation for cells and plasma, a Bio LC that is fit for purpose for metal sensitive analysis, robust and transferable HILIC chromatography, the 6546 LC/Q-TOF data independent analysis of samples, with an ID workflow that includes a new HILIC PCDL with 500 core metabolism analytes with spectra and retention time annotation.
For unknowns not found in Agilent PCDLs, SIRIUS/CSI:FingerID which uses AI predict structure from spectra and conducts online identification search will be demonstrated. A complementary targeted multi-omics workflow will be briefly mentioned before sharing the new Ion Mobility and ExD technologies for high end LC/MS Omics investigations.
<blockquote>
Presenter: Karen E. Yannell (Omics Workflow Specialist, Agilent Technologies)
</blockquote>
<blockquote>
Karen E. Yannell is an Omics Workflow Specialist at Agilent Technologies. She is an expert in small molecule high throughput analysis by triple quadrupole (TQ) and quadrupole time-of-flight (Q-TOF) mass spectrometry for applied markets. Her recent work has focused on developing targeted metabolomics methods and routine Q-TOF workflows for both expert and non-expert users alike. Previously, Karen worked on forensic, metabolomics, and biomarker discovery applications with ambient ionization sources. She received her PhD in Analytical Chemistry from Purdue University where studied under the advisement of Prof. R. Graham Cooks. 
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Dr. Martin Graf-Utzmann (Editor, Wiley Analytical Science, Moderator)
</blockquote>
<blockquote>
Dr. Martin Graf-Utzmann has a Ph.D. in Theoretical Chemistry and is an editor for Wiley Analytical Science. His interests are mainly Laboratory Automation, Digitalization, and Lab Equipment.
</blockquote>

Wiley Analytical Science: Jump Start Your LC/Q-TOF Omics Investigation with Reliable Workflows

Jump Start Your LC/Q-TOF Omics Investigation with Reliable Workflows

This webinar will focus on untargeted LC/MS Omics solutions that will provide the biological insights needed to produce meaningful results.

Your LC/Q-TOF Omics Investigation with Reliable Workflows

This year we invite you to ignite your mind to Be Curious about what Ion chromatography (IC) can do with its versatility in many detections across the IC application spectrum to improve your workflows and solve challenges.
During this three day virtual event, learn from a panel of experts how the latest IC applications are helping colleagues achieve breakthroughs, and walk away with valuable information on how advancements in IC can increase laboratory analytical capabilities. 
Although each day is convenient for a specific region, you can attend any session on any day. All sessions and workshops will be available for on-demand viewing after the event concludes.
<h3>Day 1 Agenda | April 18 | North and South America</h3>
Discover IC column development, and where it’s headed with mass spectrometry, as they can be an integral detection for carbohydrate profiling and environmental metabolites characterization. Learn how standalone IC can solve industrial samples and degradation products with comprehensive IC information, all at once.
<h5>11:30 EDT: Opening Plenary: The Past, Present, and Future of IC Column Development</h5>
<ul>
<li>Alexandra Zatirakha (Thermo Fisher Scientific, IC/SP R&amp;D, Sunnyvale)</li>
</ul>
<h5>12:30 EDT: Characterizing Carbohydrate Degradation Products from Bacteroides Thetaiotaomicron to Understand Bacterial Dextran Utilization in the Gut</h5>
<ul>
<li>Neil Rumachik (Thermo Fisher Scientific, IC/SP R&amp;D, Sunnyvale)</li>
<li>Fiona Cuskin (Newcastle University, UK)</li>
</ul>
<h5>1:30 PM EDT: Toward Comprehensive Chemical Characterization of Metabolomic Using Orbitrap Fusion Tribrid Mass Spectrometer Coupled with Ion and Liquid Chromatography Techniques: Dissolved Organic Matter as an Example</h5>
<ul>
<li>Hussain Abdulla (Department of Physical and Environmental Sciences, Texas A&amp;M University-Corpus Christi)</li>
</ul>
<h5>2:30 PM EDT: The Use of Ion Chromatography in the Monitoring of Degradation Products from the Electrochemical Treatment Of Organic Compounds</h5>
<ul>
<li>Emily Tossi (Federal University of Rio Grande do Norte)</li>
</ul>
<h5>3:30 PM EDT: Ion Chromatography as a Tool for Industrial Problem Solving</h5>
<ul>
<li>Isaac Negrete and Stephen Fosdick (Dow)</li>
</ul>
<h5>4:30 PM EDT: Workshop: Everything, Everywhere, All at Once IC!</h5>
<ul>
<li>Kelly Femrite (IC/SP Product Support, Sunnyvale)</li>
<li>Carl Fisher (IC/SP Product Marketing, Sunnyvale)</li>
<li>Criss Corchard-Keeler (Service Marketing Manager, CMD/MOL Thermo Fisher Scientific)</li>
</ul>

Thermo Fisher Scientific: IC Symposium 2023

IC Symposium 2023 - Day 1

Join us for the 2023 Global IC Symposium! North and South America

This year we invite you to ignite your mind to Be Curious about what Ion chromatography (IC) can do with its versatility in many detections across the IC application spectrum to improve your workflows and solve challenges.
During this three day virtual event, learn from a panel of experts how the latest IC applications are helping colleagues achieve breakthroughs, and walk away with valuable information on how advancements in IC can increase laboratory analytical capabilities. 
Although each day is convenient for a specific region, you can attend any session on any day. All sessions and workshops will be available for on-demand viewing after the event concludes.
<h3>Day 3 Agenda | April 20 | Asia Pacific</h3>
Expand the world of electrochemistry applications and IC hyphenation with high-resolution mass spectrometry and understand how Inductively Coupled Plasma Spectrometry can speciate isotopes while simplifying Pharmacopeia QC analysis and keeping your IC in top-notch condition.
<h5>11:00 AM SGT: Opening Plenary: Electrochemical Detection and Its Application in Ion Chromatography</h5>
<ul>
<li>Yan Liu (Thermo Fisher Scientific, IC/SP R&amp;D, Sunnyvale)</li>
</ul>
<h5>12:00 PM SGT: Application of Anion Chromatography Coupled High-Resolution Mass Spectrometry to Increase Cellular Metabolite Coverage</h5>
<ul>
<li>Vinzenz Hofferek (McConville Lab, Department of Biochemistry and Pharmacology)</li>
</ul>
<h5>1:00 PM SGT: Analysis of Anhydrosugars and Xylooligosaccharides by Ion Chromatography with Electrospray Lithium Cationisation-Triple Quadrupole Tandem Mass Spectrometry</h5>
<ul>
<li>Dr. Estrella Sanz Rodriguez (Natural Products Analysis, Australian Centre for Research on Separation Science (ACROSS), University of Tasmania)</li>
</ul>
<h5>2:00 PM SGT: You Gotta Keep ‘Em Separated: Novel IC Applications for Subsequent Isotopic Analyses by Rapid and/or Hyphenated Techniques</h5>
<ul>
<li>Dr. Brandon Mahan (College of Science and Engineering, James Cook University)</li>
<li>Grace Manestar (IsoTropics PhD Candidate)</li>
</ul>
<h5>3:00 PM SGT: Use of Ion Chromatography in Pharmaceutical Quality Control</h5>
<ul>
<li>Catherine Frankis and Stella Planou (Reading Scientific Services Ltd., Reading Science Centre, Whiteknights Campus)</li>
</ul>
<h5>4:00 PM SGT: Tips on Keeping Your Ion Chromatography in Top-Notch Condition</h5>
<ul>
<li>Ryan Ong (Thermo Fisher Scientific, IC/SP Application Sales Support, Singapore)</li>
</ul>

IC Symposium 2023 - Day 3

Join us for the 2023 Global IC Symposium! Day 3 | Asia Pacific.

<ul>
<li>Wait what?! Who knew!? There are so many things that a mass spec can do.
</li>
<li>I&#39;ve used it for years, yes this may be true.
</li>
<li>I&#39;ve processed some samples, more than a few.
</li>
<li>But between me and you, I had no idea all the things it could do!
</li>
<li>From sample prep to separation, you just won&#39;t believe…
</li>
<li>All of the tips and tricks we have up our sleeve.
</li>
<li>So, take a few minutes, about 15 should do.
</li>
<li>And learn all the things your mass spec can do.
</li>
</ul>
An easy to follow guide detailing how to set MS scan parameters for an LCMS experiment will be presented. Scan speeds for reproducible quantitation, chromatographic resolution, retention time definition, proper threshold adjustment for optimum datafile size, and how this can result in faster processing times will all be discussed.
<blockquote>
Presenter: Rebecca Glaskin, Ph.D. (LC/MS Application Scientist, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Rebecca Glaskin is an LC/MS Application Scientist at Agilent with a focus on BioPharma applications supporting the LC-Q/TOF and IM-QTOF platforms. Prior to joining Agilent, Rebecca received her Ph.D. in analytical chemistry from Indiana University in the lab of Professor David Clemmer. While there she designed and constructed home-built instruments, pushing the limits of the mobility resolution that can be obtained with a circular drift tube for the separation of biomolecules (peptides, proteins, carbohydrates, and metabolites). While there, she also studied hydrogen/deuterium exchange of proteins in the gas-phase as a function of time and pressure. Rebecca then went to Boston University as a Postdoctoral Associate in the lab of Professor Catherine Costello to develop a database containing collision cross section values for glycans, peptides, and glycopeptides utilizing Agilent Technologies 6560 IM-QTOF. This database can be used to determine how the collision cross section is altered with the addition of individual saccharide units. The trendlines obtained from this database will be used to predict collision cross sections for glycopeptides based on the conformation and structure of the specific glycoform.
</blockquote>
<blockquote>
Presenter: Jim Lau, PhD (HRAMS LC/MS Application Engineer, Agilent Technologies, Inc.)
</blockquote>
<blockquote>
Jim Lau received his Ph.D. From the University of Colorado. There he worked in the laboratories of Peter Albersheim and Robert Shapiro. This work involved the structure elucidation of plant natural products and, in particular, elucidating the structures of oligosaccharides derived from plant cell wall polysaccharides. This work was done in the early days of LCMS and made use of DLI-LCMS and (at the time) recently invented Thermospray-LCMS.
</blockquote>
<blockquote>
After the completion of his Ph.D., Jim joined Hewlett-Packard to work on LCMS ionization techniques with Paul Goodley during the early days of Electrospray-LCMS. He then moved to work on field applications and collaborations with Hewlett-Packard’s LCMS customers. More than 30 years later, Jim continues to work with Agilent’s customers in High Resolution Accurate Mass applications of LCMS. While involved in many areas of HRAMS LCMS, his recent work has focused on the area of Screening/Qual&amp;Quant of small molecules and on the high throughput confirmation of oligonucleotide synthesis.
</blockquote>

Agilent Technologies: How to set MS Scan Parameters for your LCMS Experiment

How to set MS Scan Parameters for your LCMS Experiment

An easy to follow guide detailing how to set MS scan parameters for an LCMS experiment will be presented.

LCMS webináře se zaměřením na LC/HRMS - strana 37