Eliška Zgarbová je absolventkou Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého, kde vystudovala Biotechnologie a genové inženýrství a následně se v doktorském studiu věnovala molekulární a buněčné biologii, zejména výzkumu Aryl uhlovodíkového receptoru (AhR). Během studia získala řadu prestižních ocenění – stala se vítězkou Studentské vědecké soutěže O cenu děkana (2023), uspěla ve vědecké soutěži FameLab (3. místo, 2024) a obdržela také Cenu Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy pro vynikající studenty. Dnes působí jako postdoktorandka na Lékařské fakultě Masarykovy univerzity a v ICRC FNUSA, kde se zaměřuje na výzkum nádorových onemocnění a střevních zánětů s využitím 3D modelů organoidů.Elišku Zgarbovou představujeme při příležitosti veletrhu pracovních příležitostí Okno do praxe, které se konalo včera na přírodovědecké fakultě.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Pr_F_UPOL_Ota_Blahousek_Eliska_Zgarbova_Nebojte_se_mejte_velke_cile_a_vystupte_ze_sve_komfortni_zony_a165d96f37.jpg" alt="PřF UPOL/Ota Blahoušek: Eliška Zgarbová: Nebojte se, mějte velké cíle a vystupte ze své komfortní zóny " srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Pr_F_UPOL_Ota_Blahousek_Eliska_Zgarbova_Nebojte_se_mejte_velke_cile_a_vystupte_ze_sve_komfortni_zony_a165d96f37.jpg 208w," sizes="100vw" width="1280" height="960"><h5 style="text-align:justify;">Kde v&nbsp;současnosti pracujete a jaká je Vaše pracovní pozice?</h5>Po absolvování doktorského studia na Univerzitě Palackého v&nbsp;Olomouci jsem se přesunula do Brna, kde pracuji na pozici Postdoctoral Researcher ve Výzkumné skupině Michala Masaříka na Lékařské fakultě Masarykovy Univerzity a v&nbsp;Mezinárodním centru klinického výzkumu (ICRC FNUSA).Ve své práci se věnuji dvěma hlavním směrům – a to konkrétně výzkumu nádorových onemocnění a výzkumu střevních zánětů. Obě tyto vědní oblasti spolu mohou velmi úzce souviset. Například chronický zánět je považován za významný rizikový faktor pro vznik prekanceróz, což jsou tkáňové změny, které mají zvýšenou tendenci se přeměnit až v&nbsp;samotný nádor. Ve svém výzkumu se zaměřuji na využití 3D laboratorních modelů, tzv. organoidů, které nám umožňují velmi věrně modelovat konkrétní onemocnění přímo v naší&nbsp;laboratoři. Na Univerzitě Palackého však nadále působím jako Ambasadorka Nadačního fondu UP.<h5 style="text-align:justify;">Jak jste tuto pracovní pozici získala?</h5>V&nbsp;závěru svého Ph.D. studia jsem samozřejmě začala uvažovat nad otázkou „Co bude dál“. Věděla jsem, že výzkumnému směru, ke kterému mě dovedla má studia na Univerzitě Palackého, bych se chtěla věnovat i v&nbsp;budoucnu. A proto jsem začala hledat laboratoře a výzkumné týmy, které se právě těmto oblastem věnují (ať už výzkumu rakoviny nebo střevním zánětům). Velmi mě svou prací zaujala právě výzkumná skupina pana profesora Michala Masaříka.Při přípravě obhajoby disertační práce je důležitým krokem také výběr oponentů. Tuto roli by měl zastávat odborník s dlouhodobými zkušenostmi v dané oblasti. Svého školitele, docenta Radima Vrzala, jsem proto požádala, zda by bylo možné oslovit profesora Michala Masaříka jako jednoho z oponentů. Tato možnost byla následně projednána s vedením katedry i členy oborové rady a byla schválena. Profesor Masařík se tak stal jedním z oponentů mé disertační práce. Je přitom důležité dodat, že jsme se před obhajobou osobně neznali a profesor netušil, kdo jsem.Po úspěšném složení státní doktorské zkoušky a obhajobě disertační práce za mnou pan profesor Masařík přišel se slovy: „Moc Vám gratuluji! A co máte v&nbsp;plánu dál?“&nbsp; A ze mě vypadlo: „No, to je super, že se ptáte…“ Má obhajoba probíhala v&nbsp;říjnu roku 2024. V&nbsp;listopadu jsme se panem profesorem domluvili na osobním setkání na LF MUNI, následně proběhly ještě další 2 schůzky a v&nbsp;lednu roku 2025 jsem nastupovala na Masarykovu univerzitu a ICRC FNUSA jako nový člen jeho týmu.Podotýkám, že jsem si mimo jiné poslala i několik životopisů do jiných výzkumných skupin a tato varianta nebyla jediná, na kterou bych spoléhala. Mým velkým přáním však bylo pokusit dostat zaměstnání právě v&nbsp;této výzkumní skupině. Byl to samozřejmě obrovský risk a tehdy jsem byla přesvědčená, že šance, že se to povede, je opravdu velmi malá. Bylo opravdu obrovské štěstí, že pan profesor měl ve svém týmu zrovna volnou kapacitu. Zpětně, když to sepisuji, tak mi to přijde jako naprosto neuvěřitelný příběh.<h5 style="text-align:justify;">&nbsp;Jaké byly Vaše první zkušenosti při nástupu?</h5>Celý proces nástupu do nového zaměstnání hodnotím velmi pozitivně – jak z pohledu HR a organizace nástupního procesu, tak z hlediska přijetí mě jako nového člena týmu. Velmi si vážím důvěry, kterou mi pan profesor projevil, a příležitosti navázat na své dosavadní projekty a dále je rozvíjet. Díky dlouhodobé spolupráci s předními lékařskými pracovišti, jako jsou Fakultní nemocnice Motol a Na Homolce, Masarykův onkologický ústav, Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně či Fakultní nemocnice Brno, mám možnost pracovat se vzorky reálných pacientů. Můj výzkum se tak přirozeně posouvá od základního směrem ke klinickému. Zkušenosti jsou tedy od prvního dne až do toho dnešního velmi pozitivní.<h5 style="text-align:justify;">Co považujete za největší přínos studia pro Váš profesní start?</h5>Nejvíce si cením toho, jak komplexně dokáže Univerzita Palackého své absolventy připravit na budoucí profesní dráhu. Moje Alma mater mi poskytla řadu neocenitelných zkušeností, které dnes v pracovním životě využívám prakticky denně.Zvlášť bych chtěla vyzdvihnout důraz na praktickou připravenost. Už od bakalářského studia byla výuka silně orientovaná na praxi, díky čemuž jsem si osvojila řadu molekulárně-biologických metod nejen teoreticky, ale především prakticky. Součástí studia byla také častá prezentace výsledků, jak před spolužáky, tak před širším odborným publikem včetně zahraničních pracovníků, a tedy v angličtině. Tehdy jsem tuto zkušenost možná nedokázala plně docenit, dnes ale vím, že mi zásadně pomohla rozvinout prezentační dovednosti i schopnost pracovat se stresem.Velmi si také vážím přístupu pana docenta Vrzala, který nás od počátku vnímal jako součást vědeckého týmu a systematicky nás vedl k samostatnosti. Motivoval nás k tomu, abychom byli schopni v budoucnu nejen realizovat vlastní výzkum, ale také vést vlastní tým.Mé původní pracoviště – Katedra buněčné biologie a genetiky – stejně jako Přírodovědecká fakulta UP a celá univerzita mě podpořily i v mnoha dalších oblastech. Ať už šlo o možnost absolvovat zahraniční stáž v Los Angeles, podporu studentského projektu Nadačním fondem UP, motivaci věnovat se popularizaci vědy prostřednictvím platformy Talentovaný Palacký, účast v intenzivním kurzu Leadership Matters!, příležitost sdílet svou vědeckou cestu ve fakultním podcastu nebo nominaci na Cenu ministra školství pro vynikající studenty.<h5 style="text-align:justify;">Co byste doporučila studentům, kteří se poprvé ucházejí o práci?</h5>Nebojte se, mějte velké cíle a vystupte ze své komfortní zóny. Je také potřeba investovat velké množství času do vytvoření životopisu a motivačního dopisu a nebrat to na lehkou váhu. Nebojte se kontaktovat přímo vedoucího dané výzkumné skupiny nebo pracoviště, ve kterém byste chtěli pracovat. A to i přes to, že jste zrovna nikde v&nbsp;online prostředí nenašli, že by měli volné kapacity. Take a leap of faith.

 Eliška Zgarbová: Nebojte se, mějte velké cíle a vystupte ze své komfortní zóny 

Soutěž o nejlepší práci mladých autorů v oboru spektroskopie byla i letos nedílnou součástí lednového zasedání Hlavního výboru <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/companies/7">Spektroskopické společnosti</a>. Letošní ročník hostila tradičně <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/companies/15">Univerzita Pardubice</a> a do soutěže bylo přihlášeno dvacet soutěžících, z toho sedm v kategorii A a třináct v kategorii B. Počet přihlášených prací tak znovu potvrdil, že tato soutěž zůstává pro mladé autory atraktivní a stabilně vyhledávanou příležitostí k odborné prezentaci.&nbsp;Nad průběhem soutěže dohlížela čestná předsedkyně doc. Ing. Anna Krejčová, Ph.D. Samotný program pak dobře ukázal šíři současného spektroskopického výzkumu, přičemž jednotlivé směry a metody byly zastoupeny poměrně vyrovnaně. Soutěžní blok navíc nepředstavoval pouze přehled jednotlivých výsledků, ale poskytl i přehled o rozmanitosti metodických přístupů a aplikací současné spektroskopie.V kategorii A, zaměřené na diplomové práce, porota udělila první místo Ing. Janě Knytlové z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/companies/11">Vysoké školy chemicko-technologické v Praze</a> za práci na téma „Ambientní hmotnostní spektrometrie pro analýzu selektivních modulátorů androgenního receptoru“. Druhé místo získal Filip Jozefov z <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/companies/62">Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR</a> za práci „Predikce molekul z vícestupňové hmotnostní spektrometrie pomocí grafových neuronových sítí a AI modelu DreaMS“ a třetí místo pak Mgr. Lucie Březinová z Ústavu analytické chemie AV ČR za práci „Začlenění stříbrných nanostruktur do kapilárního prostředí pro detekci povrchem zesílenou Ramanovu spektrometrii“.V kategorii B publikovaných prací obsadil první místo Dr. rer. nat. Marius Constantin Chirita Mihaila z Matematicko-fyzikální fakulty Univerzity Karlovy v Praze za práci „Light-based Aberration Correction in Electron Optics for Advanced Spectroscopic Applications“. Na druhém místě se umístila Mgr. Markéta Bosáková, Ph.D. z Ústavu chemie <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/companies/12">Masarykovy univerzity</a> za práci „Acoustic spectroscopy of laser-induced plasma“ a třetí místo obsadil Mgr. et Mgr. Vít Pavelka, Ph.D. z Ústavu analytické chemie AV ČR za práci „Povrchem zesílená Ramanova spektroskopie snadno a spolehlivě“.Soutěž opět potvrdila svou roli důležité platformy pro prezentaci kvalitních prací mladých autorů a pro odbornou diskusi napříč spektroskopickými obory. Poděkování patří všem soutěžícím za předložené práce, hodnotitelům za pečlivé posouzení příspěvků a oceněným autorům náleží blahopřání k dosaženým výsledkům.<h3>Kategorie A - 2. místo</h3><h4>Predikce molekul z vícestupňové hmotnostní spektrometrie pomocí grafových neuronových sítí a AI modelu DreaMS</h4><ul><li>Mgr. Filip Jozefov (Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, Skupina Tomáše Pluskala)</li><li>E-mail: filip.jozefov@uochb.cas.cz</li></ul>Metabolomika je vědní disciplína zaměřená na identifikaci a kvantifikaci malých molekul, které řídí biologické systémy. Přesto zůstává značná část těchto molekul dosud neznámá. Hlavní technologií pro strukturální identifikaci metabolitů ve velkém měřítku je tandemová hmotnostní spektrometrie (MS2). Interpretace jejích spekter je však často nejednoznačná a neúplná, a proto většina dat zůstává bez anotace, tzv. dark metabolome tak zůstává z velké části neprozkoumaný. I když strojové učení v posledních letech významně pokročilo, současné modely obvykle pracují pouze s jedním stupněm fragmentace (MS2), což omezuje jejich schopnost zachytit detailnější informace o molekulární struktuře.&nbsp;V této práci navrhujeme nový směr: využití vícestupňových fragmentačních dat (multi-stage MSn), při nichž dochází k postupnému štěpení již fragmentovaných molekul. Tento přístup umožňuje získat detailnější pohled na molekulární strukturu a tím zpřesnit anotaci. Na rozdíl od konvenční hmotnostní spektrometrie, která molekulu fragmentuje pouze jednou (MS2), metoda MSn fragmentuje produkty předchozích štěpení, čímž vytváří hierarchický fragmentační strom namísto jednoho spektra. Klíčové je, že MSn je plně kompatibilní se stávajícími MS2 pracovními postupy, rozšiřuje je, nikoli nahrazuje. V minulosti se MSn data využívala jen výjimečně kvůli složitosti akvizice a veřejné knihovny hmotnostních spekter prakticky neobsahovaly data nad rámec MS2 (Brungs C. et al., Nat. Methods 2025).&nbsp;Za účelem prozkoumání tohoto přístupu jsme vyvinuli první neuronové modely trénované přímo na MSn spektrech. Tyto modely kombinují pokročilé grafové neuronové sítě a velký AI model pro hmotnostní spektrometrii DreaMS (Bushuiev R. et al., Nat. Biotechnol. 2025). Modely jsme otestovali ve dvou klíčových úlohách: (1) zpětné vyhledávání molekulární struktury z množiny kandidátů a (2) de novo generování struktur.&nbsp;Naše výsledky ukazují, že vícestupňová fragmentace zvyšuje přesnost vyhledávání až desetkrát oproti konvenčním MS2 metodám. Navíc hlubší úrovně MSn poskytují výrazně bohatší a informativnější reprezentace hmotnostních spekter, což potvrzuje analýza pomocí centered kernel alignment (Kornblith S. et al., ICML 2019).&nbsp;Pro podporu dalšího výzkumu a srovnatelnosti metod jsme vytvořili MassSpecGymMSn, první otevřený benchmark pro molekulární anotaci založenou na MSn datech. Tento benchmark poskytuje jednotný rámec pro férové a reprodukovatelné porovnávání různých přístupů a zahrnuje 16 476 fragmentačních stromů (až do úrovně MS5) a více než dva miliony anotovaných hmotnostních spekter, včetně nástrojů pro předzpracování.&nbsp;Tato práce již byla prezentována na několika mezinárodních konferencích, včetně ICMB/ECCB 2025 (Liverpool, UK), kde získala cestovní grant, a <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/events/771">konference Metabolomics Society 2025</a> (Praha). Autor rovněž přednesl přednášku na EPFL Summer School (Lausanne, Švýcarsko).&nbsp;Projekt byl dále podpořen grantem MISTI, který umožnil pokračování spolupráce v laboratoři Dr. Connora Coleyho na MIT. Získal rovněž doktorandské stipendium a fellowship od společnosti Enveda Therapeutics (Boulder, USA).&nbsp;V současnosti rozšiřujeme naši datovou sadu více než pětinásobně a aplikujeme vyvinuté modely na reálné případové studie. Tyto aktivity představují klíčový krok v našem úsilí, které ve spolupráci s mezinárodními partnery směřuje k rozšíření dosahu a dopadu výzkumu. Naše práce tak posouvá hranice moderní metabolomiky založené na datech a umělé inteligenci a má potenciál urychlit vývoj léčiv, objasnit biosyntetické dráhy a podpořit pokrok v diagnostice.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/SSJMM_Filip_Jozefov_Obr_1_a_Uspesnost_modelu_napric_stupni_fragmentace_b_Rozlozeni_monoisotopickych_hmot_napric_spektralnimi_knihovnami_c_Zacleneni_vyvinutych_nastroju_do_vyzkumneho_procesu_2de84bb38f.jpg" alt="Filip Jozefov: Obr. 1. (a) Úspěšnost modelu napříč stupni fragmentace. Graf ukazuje, jak se přesnost modelu zlepšuje při trénování na hlubších fragmentačních stromech. Nejlepších výsledků je dosaženo při použití AI modelu DreaMS pro reprezentaci hmotnostních spekter a dat až do úrovně MS4, kdy top-20 hit rate dosahuje 45 %, což představuje přibližně čtyřnásobné zlepšení oproti modelu trénovanému pouze na MS2. (b) Rozložení monoisotopických hmot napříč spektrálními knihovnami. Žlutá část histogramu představuje veřejně dostupné molekuly, tmavě modrá část molekuly přidané v rámci této práce a světle modrá oblast molekuly aktuálně měřené. Červený obrys zvýrazňuje sloučeniny naměřené ve skupině Tomáše Pluskala na ÚOCHB. (c) Začlenění vyvinutých nástrojů do výzkumného procesu. Schéma ukazuje, jak nástroje vyvinuté v rámci této práce přispívají k vědeckým objevům. AI model PhantoMS zpracovává MSn data a predikuje nejpravděpodobnější molekulární struktury, které lze následně experimentálně ověřit při identifikaci bioaktivních sloučenin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_SSJMM_Filip_Jozefov_Obr_1_a_Uspesnost_modelu_napric_stupni_fragmentace_b_Rozlozeni_monoisotopickych_hmot_napric_spektralnimi_knihovnami_c_Zacleneni_vyvinutych_nastroju_do_vyzkumneho_procesu_2de84bb38f.jpg 245w," sizes="100vw" width="1600" height="851">

Výsledky soutěže o nejlepší práci mladých autorů v oboru spektroskopie 2025 - 2. místo v Kategorii A

V týdnu od 27. dubna na Vás čekají v oblasti kapalné fáze a především HPLC a LC/MS následující webináře.<blockquote><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.lcms.cz/webinars">👉 DETAILY A REGISTRACE V SEKCI WEBINÁŘE</a></h4></blockquote><blockquote>👉 Vyhledávejte a filtrujte v největší globální databázi s více než 5 500 GC, HPLC, MS a spektroskopickými webináři.</blockquote><h5>1. Separation Science: Analytical Excellence Week 2026: Part 1- Understanding Pharmacopoeia and ACS Compliance</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 09:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6130">Registrace</a></li></ul>Zjistěte, jak zajistit shodu s farmakopeí a ACS normami a jaký vliv mají správně zvolené reagencie na kvalitu analytických výsledků.<h5>2. Agilent Technologies: PFAS &amp; Our Planet: Environmental Monitoring</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 11:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6140">Registrace</a></li></ul>Přehled regulací PFAS a LC-MS/MS workflow pro jejich stanovení ve vodě, půdě i ovzduší.<h5>3. Restek Corporation: Air Sampling Media Selection and Analysis</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 14:30 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6160">Registrace</a></li></ul>Jak vybrat správná sorpční média a optimalizovat odběr vzorků vzduchu pro spolehlivou analýzu.<h5>4. Tosoh Bioscience: Tosoh Tuesday - What is MALS &amp; When is it Useful?</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 15:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6145">Registrace</a></li></ul>Základy MALS detekce a její využití v SEC-MALS pro charakterizaci polymerů a biomolekul.<h5>5. Technology Networks: Mass Spectrometry in Drug Discovery: Covalent and Non-Covalent Screening Applications</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 17:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6114">Registrace</a></li></ul>MS strategie pro screening vazebných interakcí v rané fázi vývoje léčiv.<h5>6. Thermo Fisher Scientific: From Sample to Structure: Crosslinking MS Made Practical - Part 1</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 17:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6115">Registrace</a></li></ul>Úvod do XL-MS pro mapování proteinových interakcí a strukturálních vztahů.<h5>7. SelectScience: Why researchers turn to reversed phase chromatography when purifying GLP-1</h5><ul><li>Út, 28.4.2026 17:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6117">Registrace</a></li></ul>Význam RP chromatografie při čištění GLP-1 peptidů v biofarmaceutickém vývoji.<h5>8. Phenomenex: Fundamentals First Bio Series – SEC for Biologics</h5><ul><li>St, 29.4.2026 10:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6149">Registrace</a></li></ul>Základy SEC pro biologika včetně výběru kolon a řešení problémů v praxi.<h5>9. SCIEX: Extending the power of LC-MS/MS: advanced workflows with QTRAP®</h5><ul><li>St, 29.4.2026 10:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6147">Registrace</a></li></ul>Pokročilé LC-MS/MS workflow s QTRAP® a MS³ pro vyšší citlivost a selektivitu.<h5>10. ANAMET: Současná legislativa pro stanovení PFAS</h5><ul><li>St, 29.4.2026 10:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6122">Registrace</a></li></ul>Přehled aktuálních evropských požadavků na PFAS a jejich analytické stanovení.<h5>11. Metrohm: The Basics of Titration explained</h5><ul><li>St, 29.4.2026 15:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6129">Registrace</a></li></ul>Základní principy titrace a jejich praktické využití v laboratorní praxi.<h5>12. Separation Science: Analytical Excellence Week 2026: Part 2 - Benefits of PFAS-Tested Consumables</h5><ul><li>Čt, 30.4.2026 09:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6131">Registrace</a></li></ul>Význam spotřebního materiálu testovaného na PFAS pro spolehlivou analýzu.<h5>13. Evosep Biosystems: Next-Gen HCP Analysis in Biopharma</h5><ul><li>Čt, 30.4.2026 16:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6151">Registrace</a></li></ul>Moderní LC-MS přístupy pro analýzu host cell proteins s vysokou propustností.<h5>14. Bruker: Bridging Molecules and Genes: Integrating MALDI Imaging and Spatial Transcriptomics on a Single Tissue Section</h5><ul><li>Čt, 30.4.2026 16:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6132">Registrace</a></li></ul>Multimodální analýza tkání kombinující MALDI imaging a prostorovou transkriptomiku.<h5>15. Thermo Fisher Scientific: From Sample to Structure: Crosslinking MS Made Practical - Part 2</h5><ul><li>Čt, 30.4.2026 17:00 CEST</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/webinar/6116">Registrace</a></li></ul>Pokročilé aplikace XL-MS pro detailní studium biomolekulárních interakcí.

Webináře LabRulezLCMS týden 18/2026

Webináře

Osobnosti

Věda a výzkum

Článek

je dobrovolná organizace vědeckých, vědecko-pedagogických a odborných pracovníků oboru spektroskopie, příp. právnických osob, zabývajících se vědeckou a aplikační činností v tomto oboru, sdružených ke společné činnosti. SSJMM byl založena roku 1949.

Spektroskopická společnost Jana Marka Marci

Vše ze světa analytické chemie na jednom místě. Propojujeme lidi při řešení jejich problémů. U nás naleznete všechny potřebné informace snadno, rychle a přehledně. Přestaňte hledat a začněte nacházet.

LabRulez

Univerzita Palackého v Olomouci je vysoká škola s dlouhou tradicí. Byla založena již v 16. století a je tak nejstarší vysokou školou na Moravě a druhou nejstarší v České republice. V současnosti představuje moderní vzdělávací instituci se širokou nabídkou studijních oborů a bohatou vědeckou činností.

Univerzita Palackého v Olomouci

nature research

Agilent Technologies

Phenomenex

Thermo Fisher Scientific

Restek Corporation

SelectScience

Shimadzu Corporation

SCIEX

Waters Corporation

Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) are a group of synthetic chemicals that have gathered significant attention due to their persistence in the environment and their potential health impacts. The European Union (EU) Directive 2020/2184 for specifying the quality of water intended for human consumption mandates stringent monitoring and control of PFAS levels to ensure public safety. This analysis focuses on the methodologies and regulatory frameworks established by the directive for the detection and quantification of 20 PFAS in drinking water.This webinar also examines the challenges and implications of PFAS testing for water suppliers and regulatory bodies detailing best practices for sustained analytical performance. &nbsp; Key aspects include the implementation of liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS), the establishment of maximum allowable concentrations, and the periodic review of PFAS limits based on emerging scientific evidence. &nbsp; We describe the use of PFAS free LC kits and enhancements to standard LC configurations to minimize contamination delivering accurate and precise results at the lowest mandated concentration levels.<div><blockquote>Presenter:&nbsp; Marcus Chadha (EMEA LC-MS Field Application Specialists Manager, Agilent Technologies)Marcus has worked for Agilent for seven years where he first worked as an LC/MS Field Application Specialist then for the last two years he became the EMEA Applications Specialist Manager. In his roles he has collaborated with our Environmental and Food customers, developed new methods and trained out LC/QQQ and LC/QTOF workflows to new and existing customers.He now coordinates these activities using his team of GC/MS and LC/MS application specialists. Marcus is also responsible for the market specialisation activities for the environmental market across Europe.</blockquote></div>

Agilent Technologies: Watertight Analytical Workflows to Meet EU Directive 2020-2184

PFAS Analysis According to the European Union (EU) Directive 2020/2184

PFAS testing for water suppliers and regulatory bodies. Key aspects include LC-MS/MS, establishment of maximum allowable concentrations, review of PFAS limits.

PFAS Analysis According to the EU Directive 

<h4>Key Learning Points</h4><ul><li>Understand recovery and reproducibility in the context of Solid Phase Extraction</li><li>Discover the causes of commonly encountered Solid Phase Extraction problems</li><li>Learn how to successfully troubleshoot a Solid Phase Extraction problem quickly and efficiently</li></ul><h4>Who Should Attend</h4><ul><li>Any scientist who is interested in improving their SPE extraction method recovery and reproducibility.</li></ul><blockquote>Speaker: Kevin Zhao (Sr. Technical Specialist, Phenomenex)Kevin Zhao has 5 years of experience in biochemistry research, 4 years of Protein/Cancer research with the CSULA-City of Hope Cancer Collaborative, and over 12 years with Phenomenex. Mr. Zhao is a member of a global Technical Support Team, providing problem-solving, troubleshooting, and application assistance for customers worldwide in the fields of chromatography (liquid and gas) and sample preparation. The industries he supports include pharmaceuticals, biopharmaceuticals, clinical research and toxicology, food safety, environmental analysis, fuels, and specialty chemicals.Mr. Zhao received his B.S. in Biology from California State Polytechnic University, Pomona, his M.S. in Biochemistry from California State University, Los Angeles, and an MBA from the University of the Incarnate Word.</blockquote>

Phenomenex: SPE Troubleshooting: Unlock Maximum Recovery with Expert Tips!

SPE Troubleshooting: Unlock Maximum Recovery with Expert Tips!

Learn how to successfully troubleshoot a Solid Phase Extraction problem quickly and efficiently

SPE Troubleshooting: Unlock Maximum Recovery with Expert

<div><div><h3>Oligos, Oligos, Oligos!</h3>Oligonucleotide therapeutics and reagents are everywhere. They are helping the world address previously untreatable diseases, and they are also being used in new ways to sensitively quantify and sequence important translational research samples. Whether it be a CRISPR guide RNA, lipid conjugated anti-sense oligonucleotide, or a specially modified assay probe, these molecules must be tested to ensure they have the right sequence, pinpoint-specific modifications, conjugate moieties and purities. &nbsp;And when dosed as a therapeutic, they need to be carefully quantified to confirm pharmacokinetic models. &nbsp;Join the Waters Chromatography and LC-MS Team and their collaborators from MRIGlobal, Regeneron, and Acuitas Therapeutics in this special episodic, 3 week webinar series to learn more about the science of oligos and the power of LC-based approaches to analyze them.&nbsp;<h3>EPISODE 2</h3><h4>Part 1: Bioanalytical Protocols for Challenging Human Plasma and Brain Tissue Samples: Enhancing Recovery of Oligonucleotides Across Diverse Matrix Types</h4>Developing bioanalytical sample preparation and LC-MS analytical methods for oligonucleotides, in support of ADME/DMPK research, poses significant challenges due to their structural diversity, low circulating concentration, and the complexity of the various biological matrices (e.g., plasma, urine and organ tissues). &nbsp;<blockquote>Presenter: Mary Trudeau (Consulting Scientist, Cell and Gene Therapy Consumables, Waters Corporation)Following a successful career in pharma with Pfizer, Mary joined Waters in 2011. She is responsible for developing and optimizing analytical methods and workflows in support of large molecule bioanalytical ADME/DMPK. Her most recent focus has been developing robust sample prep and LC-MS workflows for oligonucleotides.</blockquote><h4>Part 2: Progressing Mass Spectrometry to Bioanalysis of siRNA therapeutics</h4>The COVID-19 pandemic has catalyzed a surge in the development of oligonucleotide therapeutics, driven by their potential to treat diseases once considered incurable. The success of mRNA vaccines has further fueled interest, leading to a proliferation of diverse oligonucleotide-based therapeutic modalities. Each of these new modalities demands rigorous analytical characterization, akin to the established methods for protein and peptide-based drugs. However, standardized methods for these novel oligonucleotide therapies are still in their infancy.<blockquote>Presenter: Sam Sarni (Senior Scientist, Analytical Chemistry Group, Regeneron Pharmaceuticals)Sam Sarni earned her Ph.D. in Biochemistry from The Ohio State University and a B.Sc. in Chemistry from Southern Oregon University. Dr. Sarni specializes in developing LC-MS based analytical methods to support novel therapeutics and monoclonal antibody-based proteins. Her current research focus is on siRNA bioanalysis, where she performs LC-MS data analysis to elucidate the quality attributes of siRNA. Dr. Sarni leads R&amp;D activities to deepen the understanding of siRNA therapeutics</blockquote></div></div>

Newest Oligo BioAnalysis Methods

Join Waters Chromatography, LC-MS Team & collaborators for a 3-week webinar series on oligos science & LC-based analysis.

<h3>Boost your method development capabilities</h3>Creating a reliable and successful method can be challenging at times, especially if you’re dealing with complex matrices. Finding the right balance can take time. Samples need to be properly prepared and figuring out the right parameters for speed and sensitivity involves trial-and-error, which can be time-consuming.We want to help make method development a whole lot easier for you. In our Build an LC-MS/MS method with me webinar series, we will guide you through the steps to create a successful method. These 45-minute sessions are led by an application chemist who will focus on building a method that can be used for detecting illicit drugs in seafood using real data collected in our lab.<h4>Part 2: The path to perfect peaks: Sample preparation and chromatography for complex matrices</h4>In this session you will:<ul><li>Master LC gradient building and how to obtain optimal peak symmetry using scan methods paired with LC methods</li><li>Explore sample preparation of drugs of abuse in food matrices and understand suppression versus extraction recovery analytes</li><li>Learn how to handle different matrices and matrix effects</li><li>Refine an LC-MS/MS method in real samples for sensitivity, accuracy and precision</li></ul><blockquote>Presenter: Diana Tran (Applications Manager, SCIEX)</blockquote>

SCIEX: Build an LC-MS/MS method with me: A 3-part educational webinar series

The path to perfect peaks: Sample preparation and chromatography for complex matrices

Master LC gradient building and how to obtain optimal peak symmetry using scan methods paired with LC methods

Sample preparation and chromatography for complex matrices

Development of a new HPLC method has long been standardised within laboratories; you grab a C18 column, run a few test injections, and hopefully you get retention and separation of your analytes. Whilst C18 is a great stationary phase, and is heavily relied upon globally, this webinar offers a new approach to a "generic" stationary phase.We'll discuss the retention profile of a variety of C18 columns (because not every C18 is equivalent), and consider the differences between a number of modifications allowed within the L1 class with USP. We'll then contrast this against a Biphenyl phase, looking at the various ways this ligand can retain target molecules to reframe your approach to method development, with some tips along the way to ensure you get the most from the phase. We'll also look at some practical examples of the chromatography differences between C18 and biphenyl phases, and discuss why these differences occur.This webinar will cover:<ul><li>An overview of the retention mechanisms at play with various C18 column types</li><li>A discussion how biphenyl columns retain, where they differ from C18, and how to benefit from these differences</li><li>The best practices for successful utilization of biphenyl columns in LC methods</li><li>Examples of biphenyl chromatography in applied solutions, with contrast against C18 in the same application</li></ul>

Restek Corporation: Why Biphenyl is the new C18

Why Biphenyl is the new C18

We'll discuss the retention profile of a variety of C18 columns (because not every C18 is equivalent), and consider the differences between them

Mucin-domain glycoproteins, a class of densely O-glycosylated extracellular proteins, play key roles in a host of biological functions. These proteins are integral in numerous diseases, including cancer, cystic fibrosis, and inflammatory bowel disease.However, their dense O-glycosylation remains enigmatic both in glycoproteomic landscape and structural dynamics, primarily due to the challenges associated with studying mucin domains.This webcast will present advances in the mass spectrometric analysis of mucins, including the characterization of mucinases, enrichment techniques, and complete mucinomic mapping of translationally relevant mucin proteins.Learn:<ul><li>Mass spectrometry based glycoproteomics solutions</li><li>Difficulties and limitations involved in O-glycosylation analysis &nbsp;</li><li>Insights into the biological relevance of mucin-domain glycoproteins</li></ul><blockquote>Presenter: Stacy Malaker (Assistant Professor, Yale University)Stacy Malaker is an Assistant Professor in the Department of Chemistry at Yale University. Her laboratory is focused on establishing methods and technology to study mucins, a class of densely O-glycosylated extracellular proteins, by MS. Additionally, the laboratory studies mucins in a biological context, since these proteins play integral, yet poorly understood, roles in numerous diseases. Dr. Malaker received her PhD in Chemistry from the University of Virginia in the laboratory of Professor Donald Hunt. She continued to investigate the role of aberrant glycosylation in cancer as an NIH postdoctoral fellow in Professor Carolyn Bertozzi’s laboratory at Stanford University before starting at Yale.Moderator: Moderator: Nikki Forrester (Freelance science, writer and editor)Nikki Forrester is a science journalist who covers biology, natural history, climate, and the culture of academic research. She earned a PhD. in ecology and evolutionary biology in 2019.</blockquote>

Thermo Fisher Scientific: Mucinomics as the next frontier of mass spectrometry

Mucinomics as the next frontier of mass spectrometry

This webcast will present advances in the mass spectrometric analysis of mucins

<h4>PFAS in Focus</h4>Welcome to the PFAS in Focus, a comprehensive and exclusive 10-parts webinar series sponsored by Shimadzu, covering the basics and beyond about the analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in the environment. In these five webinars, our experts will demonstrate the suitability of various analytical techniques, such as LCMS, GCMS, CIC, and QTOF, for PFAS testing.Join our experts, live or on-demand after the original air date, to demystify the challenges of PFAS analysis and gain the insights you need to:<ul><li>Manage PFAS contamination in your laboratory.</li><li>Master standardized methods for PFAS testing.</li><li>Discover new analytical workflows to maximize the performance of your instruments (LC-MS/MS, GCMS, CIC, QTOF) for PFAS analysis.</li></ul><h5>Who should attend:</h5><ul><li>Environmental industry professionals and academics currently working on PFAS analysis or looking to establish the application in their labs.</li><li>Representatives from drinking and wastewater utilities.</li><li>LC–MS users from any field interested in expanding their applications to include PFAS testing.</li></ul><h4>Part 02: Leveraging GC-MS and CIC as Complementary Techniques to LC-MS for a Comprehensive PFAS Solution</h4>The demand for per and polyfluoroalkyl substances (PFAS) analysis is growing. To date, there are several standardized PFAS methods. Most of these methods are based on Liquid Chromatography/Mass Spectrometry (LC/MS) techniques. However, LC/MS is not suitable to analyze all PFAS compounds because of the diverse physicochemical properties of chemicals within the PFAS family. Gas Chromatography/Mass Spectrometry GC/MS as a complementary technique can address volatile PFAS compounds that are challenging to be analyzed by LC/MS.&nbsp;In this webinar, a Head-Space Solid Phase Microextraction-Triple Quadrupole Gas Chromatography/Mass Spectrometry (HS-SPME GC/MS/MS) analytical method is used to analyze volatile PFAS in water. In addition, we will discuss Adsorbable Organic Fluoride (AOF) analysis by Combustion Ion Chromatography (CIC). This method provides information on the total amount of PFAS that may not be targeted by other selective chromatography methods.We will host a Q&amp;A session after the presentation to address any questions or comments.<blockquote>Presenter: Andy Sandy (GCMS Application Scientist, Shimadzu Scientific Instruments)Andy Sandy is a Gas chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) Applications Scientist at Shimadzu Scientific Instruments, USA. In 2016, he joined the company. At Shimadzu he is a part of a dynamic application group, which is responsible for developing applications that provide solutions to complex analytical issues. Prior to working at Shimadzu, he completed a post-doctoral study at University of Illinois at Chicago, where he focused on developing environmental analytical methods for identifying and measuring emerging contaminant in the environment.Presenter:&nbsp;Andriy Savka (Shimadzu Scientific Instruments)Andriy is an accomplished Product Specialist in the HPLC product group at Shimadzu Scientific Instruments, specializing in Ion Chromatography and other HPLC applications. He developed his chromatography expertise through roles in the pharmaceutical industry and Shimadzu's service team. In his current role within the HPLC group at headquarters, he works on various IC projects providing technical support for customers and developing IC applications for environmental, chemical, and other markets. He combines his technical and scientific background with his emerging business acumen to align product development with market needs, thereby enhancing customer satisfaction. Andriy holds a bachelor’s degree in chemistry from Saint Joseph's University and is currently pursuing an MBA at the University of Maryland Global Campus, with anticipated graduation in March 2025.Presenter:&nbsp;Alan Owens (GC &amp; GCMS Product Manager, Shimadzu Scientific Instruments)Alan Owens is the GC and GCMS Product Manager at Shimadzu Scientific Instruments. Alan received his B.S. degree in Biology and Chemistry from Hampden-Sydney college. He then joined Shimadzu as a GCMS Product Specialist at the corporate headquarters in Columbia, MD. Before his time with Shimadzu, he comes from a flavor and fragrance background with expertise in advanced sample introduction techniques such as SPME and Dynamic headspace. He has since expanded into all sample introduction techniques specifically tailored towards Pyrolysis with a heavy influence of plastics and polymers.</blockquote>

Leveraging GC-MS and CIC as Complementary Techniques to LC-MS for a Comprehensive PFAS Solution

In this webinar, a HS-SPME GC/MS/MS analytical method is used to analyze volatile PFAS in water. 

GC-MS and CIC as Complementary Techniques to LC-MS for PFAS

<div><div id="inner_content_body_text" data-content-id="394785">Modern pharmaceutical business drivers are continually pushing companies to reduce the time it takes to get a product or service to market, reduce risk and cost, and improve product quality. Throughout the drug development process, analytical methods are developed at various stages, and typically the samples vary in complexity throughout those stages. Due to the inherent nature of this process, redundant efforts may take place across an organization, resulting in a very costly and time-consuming process.If we can streamline the process of developing methods, products can conceivably be brought to market faster. Additionally, if we develop chromatographic methods that are both faster and information-rich, it will be more cost-effective and, in turn, improve the bottom line.In this presentation, you will discover tips and tricks for HPLC method development. Learn how automated scouting of columns and solvents, method development software, and more can be used to develop methods for your HPLC analyses efficiently.<blockquote>Presenter: Dr. Frank Steiner (Senior Manager, Product Applications &amp; Scientific Advisor, Thermo Fisher Scientific)Frank Steiner is Senior Manager of Product Applications and Science Advisor in the HPLC Product Marketing team and he coordinates HPLC based scientific collaborations in his role as scientific advisor. Frank joined Dionex Corporation in 2005, now a part of Thermo Fisher Scientific, and had been manager in various HPLC marketing functions, where he played a significant role in developing and launching the Vanquish UHPLC systems. Frank received his PhD degree in chemistry in 1995 from Saarland University in Saarbruecken, Germany where he became assistant professor in 1997 and associate professor in 2003, after his postdoc at the nuclear research center in Saclay France in 1996. Frank published more than 30 publications in peer reviewed journals on HPLC, CE, and CEC, as well as more than 10 text book chapters on HPLC method development and optimization.</blockquote></div></div>

Thermo Fisher Scientific: Mastering LC Method Development: Essential Tips for Increased Productivity

Mastering LC Method Development: Essential Tips for Increased Productivity

In this presentation, you will discover tips and tricks for HPLC method development. 

Mastering LC Method Development: Essential Tips

Laboratories often face significant challenges when determining the properties of fats and oils, such as long extraction times and inaccurate composition analysis. While Soxhlet extraction is widely used for determining extractable matter across various sample matrices, it can complicate quality control, labeling, product development, and regulatory compliance.In this educational webinar, Corey Letizio from VELP Scientifica will present practical solutions to help laboratories overcome these hurdles across the environmental, agricultural, and chemical sectors. Top tips and guidance on how to improve accuracy and efficiency by streamlining fat and oil extractions will also be presented.<h5>Key learning objectives:</h5><ul><li>Find out how to ensure the accuracy and reproducibility of the fat and extraction process</li><li>Understand the safety measures that need to be in place when working with solvents</li><li>Learn how to optimize extraction conditions while maintaining the reliability of results</li><li>Explore the instruments and accessories needed for an efficient extraction</li><li>Find out how to comply with regulatory standards and guidelines</li></ul><h5>Who should attend?</h5><ul><li>Professionals in food &amp; feed, environmental, agricultural, and chemical sectors, including contract laboratories, wastewater associations, and industrial dischargers.</li><li>Professionals in quality control labs across industries like pulp and paper, plastics, textiles, oil &amp; gas, as well as state labs, universities, and research entities.</li></ul><h5>Certificate of attendance</h5>All webinar participants can request a certificate of attendance, including a learning outcomes summary, for continuing education purposes.<blockquote>Presenter: Corey Letizio (National sales manager, Velp Scientifica)Corey Letizio attended Viterbo University in Wisconsin, USA where he graduated with a marketing degree. Letizio’s growing sales experience over the past seven years has led him into his current role as national sales manager for Velp Scientifica. He has been heavily involved in the analytical instrumentation field, which has provided him with extensive knowledge in the dairy, grain, feed, and general food and agricultural industries.Moderator: &nbsp;Olivia Long (Editorial Team, SelectScience)</blockquote>

SelectScience: Maximize efficiency in fat and oil extraction for quality control and compliance

Maximize efficiency in fat and oil extraction for quality control and compliance

In this educational webinar, Corey Letizio from VELP Scientifica will present practical solutions to help laboratories overcome these hurdles.

Maximize efficiency in fat and oil extraction

Join us for a session focused on integrated lab automation tailored specifically for Agilent users. In this talk, Chaz Childers, Applications Scientist at Biosero, will dive into the practical applications of Biosero’s Green Button Go (GBG) software. In his talk, Chaz will explore how GBG seamlessly integrates hardware and software, optimizing your workflow.&nbsp;To illustrate a fully automated system, Chaz will discuss a recent system that harnessed the Agilent Prep system as its core. We'll also delve into the automated liquid handler’s role, custom-designed labware considerations, and strategic software integrations—all orchestrated through GBG. By the end of this session, you’ll gain insights into the adaptability and efficiency of automated systems powered by GBG and how it can drive greater integration with your Agilent devices.<blockquote>Presenter: Chazman Childers (Field Applications Scientist, Biosero)Chaz Childers is an Applications Scientist at Biosero where he optimizes automation processes for laboratories around the world. He began his career as a researcher at Harvard Medical School, conducting research on atherosclerosis using chemoinformatics. Chaz transitioned from the bench to supporting scientists in the lab at Opentrons, where he led the Applications Engineering team. He has also provided freelance automation consulting services through Childers.IO, assisting various startups, including one that developed the world’s first single-molecule protein sequencer. Chaz now uses his scientific and lab automation expertise to partner with scientists who are deploying Green Button Go and integrated workcells to accelerate research.&nbsp;</blockquote>

Agilent Technologies: Green Button Go in Action: Case Study of an Agilent-GBG Integrated Workflow

Green Button Go in Action: Case Study of an Agilent-GBG Integrated Workflow

Join us for a session focused on integrated lab automation tailored specifically for Agilent users.

Mohlo by Vás zajímat

Webináře LabRulezLCMS týden 18/2026

Eliška Zgarbová: Nebojte se, mějte velké cíle a vystupte ze své komfortní zóny

Výsledky soutěže o nejlepší práci mladých autorů v oboru spektroskopie 2025 - 2. místo v Kategorii A