Pořadatel
Evosep Biosystems
Evosep vyvíjí nová řešení, díky nimž bude klinická proteomika 100krát robustnější a 10krát rychlejší. Náš návrh stavíme na dlouholetých zkušenostech s výzkumem a vývojem nano-UHPLC a podporou aplikací, přičemž kriticky přehodnocujeme nezbytné systémové architektury pro úspěšnou separaci vzorků před hmotnostní spektrometrickou analýzou.
Tagy
Příprava vzorků
LC/MS
LC/MS/MS
LC/TOF
Iontová Mobilita
LC/HRMS
OMICS
Logo of LinkedIn

Single Cell Proteomics

ZÁZNAM | Proběhlo St, 16.11.2022
Proteomika jedné buňky je oblast s rychlým rozvojem, kterou umožnila významná technologická zlepšení v posledních letech a představuje klíčový příspěvek k zodpovězení základních biologických otázek.
Přejít na webinář
Bruker: Single Cell Proteomics

Bruker: Single Cell Proteomics

Single cell proteomics is a field in rapid development, enabled by significant technological improvements over the last years and it presents a key contribution to answer fundamental biological questions about heterogeneity within complex systems.

Gaining biological insights with an automated single-cell proteomics workflow
  • Presenter: Marvin Thielert, PHD (Student at Research Department Proteomics and Signal Tranduction, Max Planck Institute of Biochemistry)

Single-cell proteomics aims to characterize biological function and heterogeneity at the level of proteins in an unbiased manner. Despite recent technological advances, it still lacks behind in proteomic depth, throughput and reproducibility. We therefore developed a single-cell proteomics workflow using miniaturized sample preparation, low-flow chromatography and dia-PASEF. We show that MS raw signal intensity correlates with the cell cycle stage and that single cells have a stable core proteome upon their cell cycle. Additionally, we implemented automation on a pipetting robot to improve robustness including downstream loading of peptide packages on Evotips. We enhanced the chromatographic reproducibility by using the ionOpticks column together with the 40 samples per day method and applied this to Deep Visual Proteomics.

The ProteoChip – increasing the throughput for label-free single-cell proteomics sample preparation
  • Presenter: Claudia Ctortecka (Postdoc at Broad Institute of MIT and Harvard)

Despite advances in sample-preparation and instrumentation the characterization of large but low-input cohorts is still challenged by throughput and reproducibility. We have therefore adapted our label-free proteoCHIP design to directly interface with the Evosep One for single-cell sample preparation and chromatographic separation without error-prone manual handling. This reproducibly increases identifications on average by >30% and in conjunction with the IonOpticks Aurora column we further reduce chromatographic separation time by 50%. Even though this improved throughput yields 30% lower peptide identifications in discovery mode we preserve a comparable dynamic range across extensive sample cohorts.

Evosep Biosystems
 

Mohlo by Vás zajímat

Developing an ion chromatography system

Technické články
| 2024 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Iontová chromatografie
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Ostatní

MDF-Based Workflow for Non-Targeted Screening for Per- and Polyfluoroalkyl Substances

Aplikace
| 2024 | Shimadzu
Instrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Životní prostředí, Klinická analýza, Potraviny a zemědělství

Detection and Characterization of Drug Metabolites in Biofluids Using Survey Scan MS/MS Functionality on Waters™ Tandem Quadrupole Mass Spectrometers

Aplikace
| 2024 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Non-Target PFAS Analysis in Dried Blood Spots Using the Agilent 6546 LC/Q-TOF with Profinder and FluoroMatch

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/HRMS, LC/MS/MS, LC/TOF
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Klinická analýza

Application Robustness of the 6495D Triple Quadrupole LC/MS System for Nonstop Pesticide Analysis in Black Tea Matrix

Aplikace
| 2024 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.