Unravelling Tissue Complexity in Samples of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry
Postery | 2020 | ShimadzuInstrumentace
Chronické zánětlivé onemocnění střev, zejména ulcerózní kolitida a Crohnova choroba, představuje závažný klinický problém s nejasnou příčinou a omezenými léčebnými možnostmi. Precizní mapování lipidových profilů v jednotlivých buněčných populacích střevní sliznice může zvýšit přesnost diagnostiky a umožnit cílenou terapii. Imaging hmotnostní spektrometrie (MSI) s vysokým prostorovým rozlišením je ideální nástroj pro odhalení heterogenity tkáně a identifikaci biomarkerů na subcelulární úrovni.
Cílem studie bylo využít MALDI-MSI s prostorovým rozlišením 10 µm k analýze endoskopických biopsií vzorků lidského tlustého střeva od pacientů s IBD a od zdravých kontrol. Studie sledovala:
Pro přípravu vzorků byly biopsie rychle zmraženy a sériově krájeny na 10 µm řezy. Na plošnou vrstvu byla pomocí sublimace nanesena matrice 1,5-diaminonaphthalene (DAN) pro detekci negativních iontů. Snímkování probíhalo na přístroji Shimadzu MALDI-7090 MALDI-TOF-TOF s průměrem laserového bodu 10 µm a rozsahu m/z 200–1200. Data byla zpracována korelačně založeným algoritmem segmentace a PCA analýzou pro klasifikaci lipidových podpisů.
Data prokázala schopnost rozlišit různé tkáňové komponenty a buněčné populace:
Vysoké prostorové rozlišení MSI umožňuje:
Rozvoj technologií a analýzy dat povede k:
Studie prokázala, že MALDI-MSI s 10 µm rozlišením dokáže detailně mapovat lipidovou heterogenitu lidské střevní sliznice a rozlišit různé buněčné složky i patologické stavy. Tento přístup otevírá nové možnosti v molekulární diagnostice IBD a vývoji personalizovaných léčebných strategií.
V textu nebyly uvedeny žádné specifické literární citace.
MALDI, MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Chronické zánětlivé onemocnění střev, zejména ulcerózní kolitida a Crohnova choroba, představuje závažný klinický problém s nejasnou příčinou a omezenými léčebnými možnostmi. Precizní mapování lipidových profilů v jednotlivých buněčných populacích střevní sliznice může zvýšit přesnost diagnostiky a umožnit cílenou terapii. Imaging hmotnostní spektrometrie (MSI) s vysokým prostorovým rozlišením je ideální nástroj pro odhalení heterogenity tkáně a identifikaci biomarkerů na subcelulární úrovni.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo využít MALDI-MSI s prostorovým rozlišením 10 µm k analýze endoskopických biopsií vzorků lidského tlustého střeva od pacientů s IBD a od zdravých kontrol. Studie sledovala:
- porovnání lipidových vzorců mezi lamina propria a epitelem (krypty),
- rozdíly mezi vzorky ulcerózní kolitidy, Crohnovy choroby a zdravých kontrol,
- vliv infiltrace imunitních buněk na lipidovou distribuci.
Použitá metodika a instrumentace
Pro přípravu vzorků byly biopsie rychle zmraženy a sériově krájeny na 10 µm řezy. Na plošnou vrstvu byla pomocí sublimace nanesena matrice 1,5-diaminonaphthalene (DAN) pro detekci negativních iontů. Snímkování probíhalo na přístroji Shimadzu MALDI-7090 MALDI-TOF-TOF s průměrem laserového bodu 10 µm a rozsahu m/z 200–1200. Data byla zpracována korelačně založeným algoritmem segmentace a PCA analýzou pro klasifikaci lipidových podpisů.
Hlavní výsledky a diskuse
Data prokázala schopnost rozlišit různé tkáňové komponenty a buněčné populace:
- Ion m/z 861,550 byl lokalizován výlučně v kryptách, zatímco m/z 885,550 v lamina propria.
- Segmentace odhalila jasné oddělení epitelu (krypty) a vlastního stroma.
- PCA ukázala výrazné rozdíly lipidových profilů mezi pacienty s UC, CD a kontrolami, ale i mezi jednotlivými buněčnými typy (kolonocyty, perikryptální buňky, lymfocyty, makrofágy).
- Byl pozorován gradient změn lipidové kompozice od spodiny krypt ke špičce epitelu a významný vliv infiltračních buněk.
Přínosy a praktické využití metody
Vysoké prostorové rozlišení MSI umožňuje:
- identifikovat buněčně specifické lipidové biomarkery,
- zlepšit histopatologickou interpretaci biopsií,
- podpořit personalizovanou medicínu tím, že odliší typ a závažnost zánětu,
- poskytnout podklady pro vývoj nových léčiv a monitorování terapeutické odpovědi.
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozvoj technologií a analýzy dat povede k:
- kombinaci MSI s dalšími molekulárními zobrazovacími metodami (např. imunofluorescence, Ramanova spektroskopie),
- implementaci automatizované segmentace a strojového učení pro rychlejší interpretaci výsledků,
- rozšíření spektrálního rozsahu a zlepšení citlivosti pro detekci menších biomolekul,
- překlopení metody do klinické rutiny pro diagnostiku a prognózu IBD.
Závěr
Studie prokázala, že MALDI-MSI s 10 µm rozlišením dokáže detailně mapovat lipidovou heterogenitu lidské střevní sliznice a rozlišit různé buněčné složky i patologické stavy. Tento přístup otevírá nové možnosti v molekulární diagnostice IBD a vývoji personalizovaných léčebných strategií.
Reference
V textu nebyly uvedeny žádné specifické literární citace.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Identification of Lipid Biomarkers of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry
2017|Shimadzu|Postery
PO-CON1759E Identification of Lipid Biomarkers of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry ASMS 2017 ThP-484 Ekta Patel1*, Simona Salivo1, Roberto Fernández2, Joan Bestard-Escalas3, Jone Garate2, Albert Maimó-Barceló3, Daniel H. López3, Sam Khorrami3,4, Daniel Ginard3,4, Gwendolyn Barceló-Coblijn3, and José…
Klíčová slova
bowel, bowelimaging, imagingdisease, diseaseinflammatory, inflammatorybiomarkers, biomarkerslipid, lipidrois, roislamina, laminapropria, propriaibd, ibdidentification, identificationhuman, humanspectrometry, spectrometrycrc, crcmass
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs
2020|Bruker|Aplikace
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs While phospholipids play key roles in lung physiology and pathology, the complex composition and function of the lipidome in the lungs is poorly understood. We applied MALDI mass…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuelungs, lungsimages, imagesmaldi, maldiphospholipids, phospholipidsdistributions, distributionslung, lungwere, wereion, ionnegative, negativepositive, positivescils, scilsspatial, spatialbruker
Bruker MRMS Applications Handbook
2020|Bruker|Příručky
MRMS Applications Handbook Cutting-Edge Research in MALDI Imaging, Metabolomics/Phenomics, Native MS and Petroleomics Innovation with Integrity MRMS Dear Mass Spec Customer, Thank you for your interest in Bruker's scimaX® and solariX-series instruments. Powered by MRMS (Magnetic Resonance Mass Spectrometry), this…
Klíčová slova
maldi, maldiimaging, imagingmrms, mrmsbruker, brukermass, masssolarix, solarixmolecular, molecularwere, werespectrometry, spectrometrytissue, tissuedaltonics, daltonicsreserves, reservescontinually, continuallymetabolites, metabolitesicr