Identification of Lipid Biomarkers of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry
Postery | 2017 | ShimadzuInstrumentace
Inflammatorní střevní onemocnění (IBD), kam patří ulcerózní kolitida a Crohnova choroba, představují chronické a recidivující zánětlivé stavy neznámé příčiny. Včasná a přesná diagnostika konkrétního typu onemocnění je klíčová pro volbu optimální terapie a minimalizaci nežádoucích účinků.
Cílem studie bylo identifikovat lipidové biomarkery IBD v endoskopických biopsiích imiazní hmotnostní spektrometrií (MSI) s prostorovým rozlišením 10 µm. Porovnávali se tři skupiny vzorků: IBD, dědičný kolorektální karcinom (CRC-H) a zdravé kontrolní vzorky.
Pro mapaování lipidů byla zvolena negativní ionizace s matricí 1,5-diaminonaphtalene (1,5-DAN) nanesenou sublimací v různých časech (8, 10 a 12 min). Hlavní instrumentace:
Optimalizace sublimace matice odhalila, že 10minutová aplikace 1,5-DAN poskytla nejlepší signál-šum a definici tkáňových struktur. MSI umožnila rozlišit epitel, lamina propria a muscularis mucosae podle specifických lipidových profilů. Region-of-interest (ROI) analýza prokázala:
Rozdíly mezi skupinami byly patrné zejména v lamina propria vzorků IBD oproti CRC-H a kontrolám.
Vysoké prostorové rozlišení a přímá MSI analýza umožňují lokalizované biomarkerové profily přímo na tkáňových řezech bez časově náročného značení. Metoda nabízí nástroj pro odhalení molekul v různých vrstevnatých strukturách střevní sliznice, což usnadňuje přesnější diagnostiku a diferenciaci zánětlivých a neoplastických změn.
Studie potvrdila, že imaging mass spectrometry při použití optimalizovaného protokolu a 1,5-DAN matrix dokáže odhalit jedinečné lipidové profily v jednotlivých vrstvách střevní sliznice. Identifikace specifických lipidových markerů poskytuje perspektivu pro přesnější diagnostiku a monitorování IBD.
MALDI, LC/TOF, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníLipidomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Inflammatorní střevní onemocnění (IBD), kam patří ulcerózní kolitida a Crohnova choroba, představují chronické a recidivující zánětlivé stavy neznámé příčiny. Včasná a přesná diagnostika konkrétního typu onemocnění je klíčová pro volbu optimální terapie a minimalizaci nežádoucích účinků.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo identifikovat lipidové biomarkery IBD v endoskopických biopsiích imiazní hmotnostní spektrometrií (MSI) s prostorovým rozlišením 10 µm. Porovnávali se tři skupiny vzorků: IBD, dědičný kolorektální karcinom (CRC-H) a zdravé kontrolní vzorky.
Použitá metodika a instrumentace
Pro mapaování lipidů byla zvolena negativní ionizace s matricí 1,5-diaminonaphtalene (1,5-DAN) nanesenou sublimací v různých časech (8, 10 a 12 min). Hlavní instrumentace:
- MALDI-7090 TOF-TOF (Shimadzu): 355 nm UV laser, až 2 kHz opakovací frekvence, průměr laserové skvrny 10 µm
- Prostorové rozlišení snímkování: 10 µm, m/z rozsah 200–2000 Da
- Softwarové zpracování: IonViewTM (Kratos Analytical)
Hlavní výsledky a diskuse
Optimalizace sublimace matice odhalila, že 10minutová aplikace 1,5-DAN poskytla nejlepší signál-šum a definici tkáňových struktur. MSI umožnila rozlišit epitel, lamina propria a muscularis mucosae podle specifických lipidových profilů. Region-of-interest (ROI) analýza prokázala:
- PI 16:0/18:1 (m/z 835,5) a PI 36:2 (m/z 861,5) dominantní v colonocytech
- PI 18:0/20:4 (m/z 885,5) zesílený v lamina propria a souvisí s úlohou arachidonové kyseliny ve zánětu
Rozdíly mezi skupinami byly patrné zejména v lamina propria vzorků IBD oproti CRC-H a kontrolám.
Přínosy a praktické využití metody
Vysoké prostorové rozlišení a přímá MSI analýza umožňují lokalizované biomarkerové profily přímo na tkáňových řezech bez časově náročného značení. Metoda nabízí nástroj pro odhalení molekul v různých vrstevnatých strukturách střevní sliznice, což usnadňuje přesnější diagnostiku a diferenciaci zánětlivých a neoplastických změn.
Budoucí trendy a možnosti využití
- MS/MS analýza přímo na tkáni pro strukturovou identifikaci klíčových lipidů
- Statistické modelování pro vytvoření diagnostických panelů lipidových biomarkerů
- Rozšíření aplikace na další zánětlivé a onkologické onemocnění trávicího traktu
- Integrace s histopatologií a dalšími zobrazovacími metodami pro multimodální diagnostiku
Závěr
Studie potvrdila, že imaging mass spectrometry při použití optimalizovaného protokolu a 1,5-DAN matrix dokáže odhalit jedinečné lipidové profily v jednotlivých vrstvách střevní sliznice. Identifikace specifických lipidových markerů poskytuje perspektivu pro přesnější diagnostiku a monitorování IBD.
Reference
- Garate et al. Lipid profiling of human colon tissues by MSI, 2015
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Unravelling Tissue Complexity in Samples of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry
2020|Shimadzu|Postery
TP 217 Unravelling Tissue Complexity in Samples of Human Inflammatory Bowel Disease Using Imaging Mass Spectrometry Simona Salivo1, Lucia Martín-Saiz2, Albert Maimó-Barceló3, Javier Martín2, Juan J. Gutiérrez2, Joan Bestard-Escalas3, Daniel H. López3, Sam Khorrami3,4, Marcelo García4, Tom K. Abban1, Matthew…
Klíčová slova
crypts, cryptslamina, laminapropria, propriaulcerative, ulcerativecolitis, colitismaldi, maldicolonocytes, colonocytesmucosae, mucosaemuscularis, muscularisinfiltrating, infiltratingimage, imageinflammatory, inflammatorylipid, lipidepithelium, epitheliumcrohn
Identification of proteins and lipids found in varying abundances in pre-and post-operative cancer patients using a MALDI-TOF-MSMS approach
2021|Shimadzu|Postery
FP-676 Identification of proteins and lipids found in varying abundances in pre- and post-operative cancer patients using a MALDI-TOF-MSMS approach Michael D. Nairn1; Simona Salivo1; Emanuele Barborini2,3; Gerald Stübiger4, 5 Manchester, United Kingdom; 2Tethis, Milan, Italy; 3Luxembourg Institute of Science…
Klíčová slova
crc, crcibd, ibdnanochip, nanochipmaldi, maldipre, preenriched, enrichedintens, intensplasma, plasmapost, postvesicles, vesiclesextracellular, extracellularultracentrifuged, ultracentrifugedcontrols, controlsblood, bloodbiopsy
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs
2020|Bruker|Aplikace
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs While phospholipids play key roles in lung physiology and pathology, the complex composition and function of the lipidome in the lungs is poorly understood. We applied MALDI mass…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuelungs, lungsimages, imagesmaldi, maldiphospholipids, phospholipidsdistributions, distributionslung, lungwere, wereion, ionnegative, negativepositive, positivescils, scilsspatial, spatialbruker