Agilent’s NEW MassHunter Profinder - The Most Advanced Batch Feature Extraction Software for Metabolomics
Prezentace | 2013 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Software pro metabolomiku umožňuje efektivní a přesnou detekci metabolitů z hmotnostních dat, klíčové pro biologický výzkum, vývoj léků i klinické studie.
Článek prezentuje Agilent MassHunter Profinder, nástroj pro hromadnou extrakci vlastností z LC/MS dat v metabolomice. Popisuje jeho možnosti, pracovní postup a výhody oproti dosavadním řešením.
Software nabízí tři hlavní algoritmy extrakce vlastností:
Podporovaná instrumentace:
Profinder výrazně zkracuje dobu zpracování díky jedné jednotné proceduře pro nekteré i cílené přístupy. Rekurzivní algoritmy snižují falešné pozitivní a negativní detekce. Komponentně orientované centrum zlepšuje kvalitu manuální kontroly a filtrace výsledků.
Software nabízí:
Očekává se podpora dalších typů dat (GC/MS), rozšíření automatizovaných filtrů kvality, hlubší propojení s databázemi metabolit a integrace pokročilých vizualizačních nástrojů pro pathway analýzu.
Agilent MassHunter Profinder představuje komplexní a bezplatné řešení pro extrakci metabolitů z LC/MS dat, které díky rekurzivním algoritmům a intuitivnímu prostředí usnadňuje workflow metabolomické analýzy.
Software
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Software pro metabolomiku umožňuje efektivní a přesnou detekci metabolitů z hmotnostních dat, klíčové pro biologický výzkum, vývoj léků i klinické studie.
Cíle a přehled studie / článku
Článek prezentuje Agilent MassHunter Profinder, nástroj pro hromadnou extrakci vlastností z LC/MS dat v metabolomice. Popisuje jeho možnosti, pracovní postup a výhody oproti dosavadním řešením.
Použitá metodika a instrumentace
Software nabízí tři hlavní algoritmy extrakce vlastností:
- Batch Molecular Feature Extraction (MFE + rMFE) – identifikace shluků koelujících iontů a jejich rekurzivní vyhledávání
- Batch Recursive Feature Extraction (MFE + rMFE + Find by Ion) – kombinace rekurzivní extrakce a vyhledávání podle iontů pro redukci chybějících dat
- Batch Targeted Feature Extraction (Find by Formula) – cílené vyhledávání na základě vzorců, s možností manuální úpravy
Podporovaná instrumentace:
- Agilent LC/TOF
- Agilent LC/Q-TOF
- Budoucí rozšíření pro GC/MS
Hlavní výsledky a diskuse
Profinder výrazně zkracuje dobu zpracování díky jedné jednotné proceduře pro nekteré i cílené přístupy. Rekurzivní algoritmy snižují falešné pozitivní a negativní detekce. Komponentně orientované centrum zlepšuje kvalitu manuální kontroly a filtrace výsledků.
Přínosy a praktické využití metody
Software nabízí:
- Rychlou integraci dat bez konverze formátů
- Vysoce kvalitní shodu a zarovnání píků napříč vzorky
- Možnost manuální verifikace a editace výsledků
- Integraci do komplexního workflow včetně následné analýzy v Mass Profiler Professional a vizualizace cest
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se podpora dalších typů dat (GC/MS), rozšíření automatizovaných filtrů kvality, hlubší propojení s databázemi metabolit a integrace pokročilých vizualizačních nástrojů pro pathway analýzu.
Závěr
Agilent MassHunter Profinder představuje komplexní a bezplatné řešení pro extrakci metabolitů z LC/MS dat, které díky rekurzivním algoritmům a intuitivnímu prostředí usnadňuje workflow metabolomické analýzy.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
MassHunter Profinder: Batch Processing Software for High Quality Feature Extraction of Mass Spectrometry Data
2014|Agilent Technologies|Technické články
MassHunter Profinder: Batch Processing Software for High Quality Feature Extraction of Mass Spectrometry Data Technical Overview Introduction LC/MS metabolomics workflows typically involve the following steps: (1) data acquisition using high resolution accurate mass LC/MS, (2) feature extraction from raw data,…
Klíčová slova
feature, featurerecursive, recursivebatch, batchextraction, extractionprofinder, profinderfrequency, frequencygroups, groupsabundances, abundancesimproves, improvesbins, binscyclosporin, cyclosporintargeted, targetedmetabolomics, metabolomicsacross, acrossfiles
MassHunter Profinder Software - Quick Start Guide
2017|Agilent Technologies|Manuály
MassHunter Profinder Software Quick Start Guide For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. Getting Started 11 User Interface 12 Basic Profinder Workflow 22 Add sample files to your project 24 Align chromatograms 28 Edit and run your…
Klíčová slova
profinder, profinderfeature, featureisotopologue, isotopologueguide, guideextraction, extractionquick, quickstart, startyour, yourclick, clickbatch, batchworkflow, workflowproject, projectrecursive, recursiveyou, youfile
Accelerate Your Research with Advanced Omics Solutions
2018|Agilent Technologies|OstatníPrezentace
Accelerate Your Research with Advanced Omics Solutions Christine Miller Omics Market Manager ASMS 2018 ASMS 2018 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. Biology Is Integrated Multi-omics increases biological understanding DNA RNA Protein Metabolite • Master program…
Klíčová slova
pathway, pathwayatp, atpproteomics, proteomicsagilent, agilentomics, omicsarchitect, architectskyline, skylinepcdl, pcdlmpp, mppanalysis, analysispathways, pathwaysprofiler, profilermetabolomics, metabolomicsflux, fluxtof
Agilent MassHunter Profinder Software
2016|Agilent Technologies|Brožury a specifikace
Agilent MassHunter Profinder Software ATTAIN SUPERIOR FEATURE EXTRACTION ACHIEVE HIGHER QUALITY RESULTS Agilent MassHunter Profinder software provides targeted and untargeted molecular feature extraction (MFE) for batches of mass-spec data—not just one file at a time—and is designed to accelerate your…
Klíčová slova
profinder, profinderfeature, featureagilent, agilentmfe, mfealgorithm, algorithmprofiling, profilingmasshunter, masshunterdata, datamulticore, multicorefinding, findingalgorithms, algorithmsmultithreaded, multithreadedworkflow, workflowbiologist, biologistfiles
