Targeted Profiling of Lipid Mediators
Aplikace | | SCIEXInstrumentace
Lipidoví mediátoři patří mezi klíčové bioaktivní molekuly regulující zánětlivé a rezoluce zánětu procesy v organismu. Patří sem eikosanoidy odvozené z kyseliny arachidonové a specialisté pro-resolvující mediátory (SPM) získané z EPA a DHA. Porozumění jejich biosyntéze, signalizaci a přesná separace izobarických i epimerních forem je zásadní pro výzkum řady zánětlivých onemocnění a vyvíjení nových terapeutických strategií.
Tento whitepaper popisuje vývoj cílené multiplexní LC-MS/MS metody pro kvantifikaci a kvalitativní potvrdění 88 lipidových mediátorů a jejich 16 deuteriovaných interních standardů v jediném 20minutovém běhu. Cílem je dosáhnout vysoké citlivosti, specificity a průchodnosti (throughput) analýzy v biomedicínských vzorcích.
Vyvinutá LC-MS/MS metoda umožňuje komplexní sledování panelu pro- a pro-resolvujících lipidových mediátorů v klinických i experimentálních vzorcích. Poskytuje robustní nástroj pro:
Popsaná multiplexní LC-MS/MS metoda na platformě QTRAP 6500+ představuje robustní, citlivý a vysokopropustný přístup k cílenému profilování lipidových mediátorů. Umožňuje spolehlivou separaci izobarických a epimerních látek, kvantitativní i kvalitativní potvrzení identity a splňuje nároky moderního lipidomického výzkumu.
1. Funk CD. Prostaglandins and leukotrienes: advances in eicosanoid biology. Science. 2001;294:1871–1875.
2. Serhan CN, Levy BD. Resolvins in inflammation: emergence of the pro-resolving superfamily of mediators. J Clin Invest. 2018;128:2657–2669.
3. Ekroos K. Lipidomics; Technologies and Applications. Wiley-VCH; 2012.
4. Harizi H, Corcuff JB, Gualde N. Arachidonic Acid derived eicosanoids: roles in biology and immunopathology. Trends Mol Med. 2008;14:461–469.
5. Benjamim CF, Canetti C, Cunha FQ, Kunkel SL, Peters-Golden M. Opposing and hierarchical roles of leukotrienes in local innate immune versus vascular responses in a model of sepsis. J Immunol. 2005;174:1616–1620.
6. Harkewicz R, Dennis EA. Applications of mass spectrometry to lipids and membranes. Annu Rev Biochem. 2011;80:301–325.
7. Dennis EA, Norris PC. Eicosanoid storm in infection and inflammation. Nat Rev Immunol. 2015;15:511–523.
8. SCIEX Technical note RUO-MKT-02-8539-A. The Scheduled MRM™ Algorithm Pro.
9. SCIEX community method for lipid mediator quantitation on QTRAP and triple quadrupole systems.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QTRAP
ZaměřeníLipidomika
VýrobceSCIEX
Souhrn
Význam tématu
Lipidoví mediátoři patří mezi klíčové bioaktivní molekuly regulující zánětlivé a rezoluce zánětu procesy v organismu. Patří sem eikosanoidy odvozené z kyseliny arachidonové a specialisté pro-resolvující mediátory (SPM) získané z EPA a DHA. Porozumění jejich biosyntéze, signalizaci a přesná separace izobarických i epimerních forem je zásadní pro výzkum řady zánětlivých onemocnění a vyvíjení nových terapeutických strategií.
Cíle a přehled studie
Tento whitepaper popisuje vývoj cílené multiplexní LC-MS/MS metody pro kvantifikaci a kvalitativní potvrdění 88 lipidových mediátorů a jejich 16 deuteriovaných interních standardů v jediném 20minutovém běhu. Cílem je dosáhnout vysoké citlivosti, specificity a průchodnosti (throughput) analýzy v biomedicínských vzorcích.
Použitá metodika a instrumentace
- Chromatografie: ExionLC AD s fází Kinetex 2,6 µm Polar C18 (100 × 3,0 mm), gradient metanol/0,1 % kyseliny mravenčí, průtok 500 µL/min, doba separace 20,5 min.
- Hmotnostní spektrometrie: SCIEX QTRAP 6500+ s IonDrive Turbo V ESI, rychlé přepínání polarity (pozitivní/negativní ionty).
- Režim akvizice: Multiple Reaction Monitoring (MRM) se Scheduled MRM™ Algorithm Pro pro kvantifikaci; MRM spouštěné Enhanced Product Ion (EPI) skeny pro kvalitativní potvrzení.
- Software: MultiQuant™ pro výpočet kalibračních křivek, přesnost, opakovatelnost (CV) a lineární závislosti.
Hlavní výsledky a diskuse
- Výborná chromatografická separace izobarických i epimerních lipidů (např. PGE2/PGD2, LXA4/15-epi-LXA4, RvD1/17-epi-RvD1).
- Citlivost LLOQ v rozmezí 0,05–1 ng/mL, opakovatelnost CV < 30 %, linearita r2 > 0,997 pro reprezentativní mediátory.
- Rychlé přepínání polarity umožňuje simultánní detekci většiny lipidů v jediné injekci, čímž se zdvojnásobuje průchodnost analýz.
- MRM-EPI workflow přináší kvalitativní potvrzení identity i nízkokoncentrovaných látek díky bohatým fragmentačním spektrům.
Přínosy a praktické využití metody
Vyvinutá LC-MS/MS metoda umožňuje komplexní sledování panelu pro- a pro-resolvujících lipidových mediátorů v klinických i experimentálních vzorcích. Poskytuje robustní nástroj pro:
- Studium zánětlivých drah a rezoluce zánětu.
- Vyhodnocení farmakologických účinků inhibitorů nebo aktivátorů lipoxygenáz a cyklooxygenáz.
- Metabolomické a lipidomické přístupy v translaci biomedicínských dat.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření panelu analyzovaných mediátorů a interních standardů.
- Integrace s vysokoprocesním automatizovaným vzorkovým přípravám.
- Využití umělé inteligence a strojového učení pro interpretaci komplexních lipidomických dat.
- Personalizovaná medicína založená na lipidových profilech pacientů.
Závěr
Popsaná multiplexní LC-MS/MS metoda na platformě QTRAP 6500+ představuje robustní, citlivý a vysokopropustný přístup k cílenému profilování lipidových mediátorů. Umožňuje spolehlivou separaci izobarických a epimerních látek, kvantitativní i kvalitativní potvrzení identity a splňuje nároky moderního lipidomického výzkumu.
Reference
1. Funk CD. Prostaglandins and leukotrienes: advances in eicosanoid biology. Science. 2001;294:1871–1875.
2. Serhan CN, Levy BD. Resolvins in inflammation: emergence of the pro-resolving superfamily of mediators. J Clin Invest. 2018;128:2657–2669.
3. Ekroos K. Lipidomics; Technologies and Applications. Wiley-VCH; 2012.
4. Harizi H, Corcuff JB, Gualde N. Arachidonic Acid derived eicosanoids: roles in biology and immunopathology. Trends Mol Med. 2008;14:461–469.
5. Benjamim CF, Canetti C, Cunha FQ, Kunkel SL, Peters-Golden M. Opposing and hierarchical roles of leukotrienes in local innate immune versus vascular responses in a model of sepsis. J Immunol. 2005;174:1616–1620.
6. Harkewicz R, Dennis EA. Applications of mass spectrometry to lipids and membranes. Annu Rev Biochem. 2011;80:301–325.
7. Dennis EA, Norris PC. Eicosanoid storm in infection and inflammation. Nat Rev Immunol. 2015;15:511–523.
8. SCIEX Technical note RUO-MKT-02-8539-A. The Scheduled MRM™ Algorithm Pro.
9. SCIEX community method for lipid mediator quantitation on QTRAP and triple quadrupole systems.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Comprehensive Monitoring Method for Analyzing 158 Lipid Mediator Species Using the Ultra-Fast LCMS-8050
2014|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-LM-E073 Application News C102 No. Liquid Chromatography Mass Spectrometry Comprehensive Monitoring Method for Analyzing 158 Lipid Mediator Species Using the Ultra-Fast LCMS-8050 Lipid mediator is a generic term for bioactive lipids, which are produced in the body and play a…
Klíčová slova
dha, dhaepa, epadgla, dglatetranor, tetranorpaf, pafbrain, braincategory, categoryflowrate, flowrateazelaoyl, azelaoylethanolamide, ethanolamideaea, aeamediator, mediatormetabolites, metaboliteseda, edamediators
A Method of Simultaneous Analysis for 196 Lipid Mediators and Related Compounds Using Triple Quadrupole LC/MS/MS 
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-LM-E152 Application News No. Liquid Chromatograph Mass Spectrometry A Method of Simultaneous Analysis for 196 Lipid Mediators and Related Compounds Using Triple Quadrupole LC/MS/MS C182 Introduction Table 1 lists these compounds, which include 100 arachidonic acid metabolites (including arachidonic…
Klíčová slova
dha, dhadgla, dglaepa, epaistd, istdtetranor, tetranorretention, retentionmediators, mediatorscorrecting, correctingcat, catpredicted, predictededa, edaethanolamide, ethanolamideala, alalipid, lipidtool
Targeted Lipidomics of Oxylipins (Oxygenated Fatty Acids)
2015|Waters|Aplikace
Targeted Lipidomics of Oxylipins (Oxygenated Fatty Acids) Katrin Strassburg,1,2 Billy Joe Molloy,5 Claude Mallet,3 André Duesterloh,4 Igor Bendik,4 Thomas Hankemeier,1,2 James Langridge,5 Rob J. Vreeken,1,2 Giuseppe Astarita 3 Analytical Biosciences, LACDR, Leiden University, Leiden, The Netherlands; 2 Netherlands Metabolomics Centre,…
Klíčová slova
lox, loxprostanoid, prostanoidcox, coxoxylipins, oxylipinsleukotriene, leukotrienediol, diolistd, istdoxygenated, oxygenateddgla, dglaalcohol, alcohollipidomics, lipidomicsepa, epadha, dhaepoxide, epoxidehydroxyperoxide
Selection Guide Metabolite Analysis - Metabolomics Product Portfolio
2019|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E280D Selection Guide Metabolite Analysis Metabolomics Product Portfolio Expanding Metabolomics Metabolomics refers to an array of techniques used to comprehensively detect and analyze various metabolites formed in vivo during biological activity. The qualitative and quantitative changes in metabolites reflect the…
Klíčová slova
acid, acidsba, sbametabolites, metabolitesdatabase, databasepackage, packageacids, acidsmetabolomics, metabolomicsphospholipid, phospholipidanalysis, analysisamino, aminomediators, mediatorsmonophosphate, monophosphatecooh, coohmrm, mrmlcms