Agilent Mass Profiler Professional Software

Význam tématu

Mass spectrometrie dnes generuje obrovské objemy dat, jejichž manuální vyhodnocení je velmi náročné. Přesné statistické a chemometrické nástroje usnadňují hledání relevantních informací a významně zvyšují produktivitu laboratoří.

Cíle a přehled studie / článku

Popisuje softwarový balík Agilent Mass Profiler Professional (MPP), navržený pro komplexní zpracování a interpretaci dat z GC/MS, LC/MS, CE/MS a ICP-MS. Cílem je umožnit uživateli klasifikaci, srovnání a identifikaci vztahů mezi vzorky bez nutnosti pokročilých statistických znalostí.

Použitá metodika a instrumentace

Software nabízí řízené workflow s přednastavenými kroky pro import dat, filtraci, normalizaci a statistické testy. K dispozici jsou:

• PCA (unsupervised a supervised)
• Student t-test, ANOVA, Kruskal-Wallis, Friedman
• SAM, fold-change, volcano plot
• Shluková analýza: k-means, hierarchické, SOM
• Predikční modely: PLS-DA, SVM, decision tree, Naïve Bayes, neuronové sítě
• Integrovaný ID Browser pro vyhledávání ve spektrálních knihovnách (METLIN, NIST, MFG)

Použitá instrumentace

Balík je kompatibilní se všemi Agilent MS platformami: GC/MS, Triple Quadrupole GC/MS/MS, TOF a Q-TOF LC/MS, Triple Quadrupole LC/MS, ICP-MS.

Hlavní výsledky a diskuse

Ukázalo se, že MPP efektivně rozlišuje skupiny vzorků, odhaluje klíčové metabolity, vizualizuje časové trendy a podporuje tvorbu predikčních modelů. Rekurzivní analýza zvyšuje kvalitu selekce dat a interaktivní volcano ploty usnadňují volbu významných entit.

Přínosy a praktické využití metody

Software zkracuje dobu analýzy rozsáhlých datových sad, minimalizuje chyby obsluhy a umožňuje nasazení v metabolomice, forenzní analýze, toxikologii, potravinářství, environmentální analytice či ropném průmyslu.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se širší integrace s open-source prostředím R, propojení s bioinformatickými databázemi a využití strojového učení pro automatizovanou detekci vzorů a predikci biologických drah.

Závěr

Agilent Mass Profiler Professional představuje všestranné chemometrické řešení pro hromadnou analýzu MS dat, které efektivně transformuje komplexní spektra na podrobné chemické a biologické poznatky.