Monolithic Column for Improved 4D-Lipidomics Analysis
Postery | 2025 | Bruker | ASMSInstrumentace
Velkoplošné lipidomické studie využívající LC-MS/MS umožňují identifikaci a kvantifikaci širokého spektra lipidů a jejich propojení s fyziologickými procesy či chorobami. Tradiční analytické a nanoLC metody však často narážejí na zředění vzorku a vysoké tlakové ztráty při použití viskózních fází. Monolitické chromatografické kolony s vysoce porézní strukturou nabízejí řešení prostřednictvím snížené zpětné tlakové ztráty a vyšší průchodnosti mobilní fáze, což umožňuje vyšší propustnost a rychlejší separace lipidů.
Tento výzkum se zaměřil na komplexní srovnání metod přípravy vzorku (MTBE vs IPA extrakce), složení mobilních fází a typů kolon (částicové vs monolitické) v rámci analytického i nanoprůtoku. Cílem bylo optimalizovat workflow pro 4D-lipidomiku, maximalizovat počet anotovaných lipidů a zvýšit propustnost analýzy.
Pro extrakci lipidů byly porovnány dvě metody:
Lipidomické analýzy proběhly na systému Bruker timsTOF HT spojeném s:
Testovány byly tyto kolony:
Mobilní fáze obsahovaly směsi vody, isopropanolu a acetonitrilu s kyselinou octovou, fosforečnou a octanem amonným. Data byla zpracována v DataAnalysis 6.2 a MetaboScape 2025b s rule-based a MS/MS spectral library anotací.
IPA extrakce se ukázala jako rychlejší a jednodušeji proveditelná alternativa k MTBE, přičemž zachovala srovnatelnou výtěžnost lipidů a zvýšila počet anotací o 6,75 %. Monolitické kolony výrazně snížily zpětný tlak i při viskózních mobilních fázích, umožnily vyšší průtoky (analytický režim až 400 µl/min, nanoLC 1,85 µl/min) a zkrátily dobu běhu na 15 minut. Počty anotovaných lipidů byly o ~17 % vyšší při použití modifikovaných mobilních fází s monolitickou kolonou ve srovnání s klasickými kolonami.
Očekává se další vývoj monolitických materiálů se zacílením na různé polaritní rozsahy lipidů a optimalizaci mobilních fází pro maximální selektivitu. Integrace s dalšími modulačními technikami (ion mobility, SWATH-MS) může nabídnout ještě detailnější 4D-profilování lipidů v rámci klinických a průmyslových aplikací.
Monolitické chromatografické kolony v kombinaci s IPA extrakcí a optimalizovanými mobilními fázemi představují efektivní řešení pro vysokopropustnou 4D-lipidomiku. Nabízejí snížené tlakové ztráty, zkrácené doby analýzy a širší pokrytí lipidového spektra, což přispívá k lepší reproducibilitě a hloubce dat.
Studie byla provedena výhradně pro výzkumné účely; autoři jsou zaměstnanci společnosti Bruker Scientific LLC.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS, Iontová mobilita, Spotřební materiál, LC kolony
ZaměřeníLipidomika
VýrobceBruker
Souhrn
Význam tématu
Velkoplošné lipidomické studie využívající LC-MS/MS umožňují identifikaci a kvantifikaci širokého spektra lipidů a jejich propojení s fyziologickými procesy či chorobami. Tradiční analytické a nanoLC metody však často narážejí na zředění vzorku a vysoké tlakové ztráty při použití viskózních fází. Monolitické chromatografické kolony s vysoce porézní strukturou nabízejí řešení prostřednictvím snížené zpětné tlakové ztráty a vyšší průchodnosti mobilní fáze, což umožňuje vyšší propustnost a rychlejší separace lipidů.
Cíle a přehled studie / článku
Tento výzkum se zaměřil na komplexní srovnání metod přípravy vzorku (MTBE vs IPA extrakce), složení mobilních fází a typů kolon (částicové vs monolitické) v rámci analytického i nanoprůtoku. Cílem bylo optimalizovat workflow pro 4D-lipidomiku, maximalizovat počet anotovaných lipidů a zvýšit propustnost analýzy.
Použitá metodika a instrumentace
Pro extrakci lipidů byly porovnány dvě metody:
- MTBE extrakce: vícestupňové oddělení organické fáze, odpaření a rekonstituce.
- IPA extrakce: přímé smíchání plazmy s isopropanolem, odstředění a přímá injekce.
Lipidomické analýzy proběhly na systému Bruker timsTOF HT spojeném s:
- Agilent 1290 Infinity II UHPLC s VIP-HESI zdrojem (analytický režim).
- Bruker nanoElute 2 s CaptiveSpray zdrojem (nanoLC režim).
Testovány byly tyto kolony:
- Částicové: YMC C18 (2,1×100 mm, 1,9 µm), Bruker Bio-LP C18, Waters Acquity BEH C18.
- Monolitické: Kyoto Monotech C8 (1,0×150 mm, 11 nm), C18 nano (75 µm×150 mm, 1,5 µm).
Mobilní fáze obsahovaly směsi vody, isopropanolu a acetonitrilu s kyselinou octovou, fosforečnou a octanem amonným. Data byla zpracována v DataAnalysis 6.2 a MetaboScape 2025b s rule-based a MS/MS spectral library anotací.
Hlavní výsledky a diskuse
IPA extrakce se ukázala jako rychlejší a jednodušeji proveditelná alternativa k MTBE, přičemž zachovala srovnatelnou výtěžnost lipidů a zvýšila počet anotací o 6,75 %. Monolitické kolony výrazně snížily zpětný tlak i při viskózních mobilních fázích, umožnily vyšší průtoky (analytický režim až 400 µl/min, nanoLC 1,85 µl/min) a zkrátily dobu běhu na 15 minut. Počty anotovaných lipidů byly o ~17 % vyšší při použití modifikovaných mobilních fází s monolitickou kolonou ve srovnání s klasickými kolonami.
Přínosy a praktické využití metody
- Efektivní a rychlá příprava vzorku pomocí IPA extrakce.
- Vyšší propustnost a zkrácené časy analýzy díky monolitickým kolonám.
- Rozšířený počet detekovaných lipidů pro hlubší biomarkerové studie a QA/QC.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další vývoj monolitických materiálů se zacílením na různé polaritní rozsahy lipidů a optimalizaci mobilních fází pro maximální selektivitu. Integrace s dalšími modulačními technikami (ion mobility, SWATH-MS) může nabídnout ještě detailnější 4D-profilování lipidů v rámci klinických a průmyslových aplikací.
Závěr
Monolitické chromatografické kolony v kombinaci s IPA extrakcí a optimalizovanými mobilními fázemi představují efektivní řešení pro vysokopropustnou 4D-lipidomiku. Nabízejí snížené tlakové ztráty, zkrácené doby analýzy a širší pokrytí lipidového spektra, což přispívá k lepší reproducibilitě a hloubce dat.
Reference
Studie byla provedena výhradně pro výzkumné účely; autoři jsou zaměstnanci společnosti Bruker Scientific LLC.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
4D-Lipidomics™ workflow for increased throughput
2021|Bruker|Aplikace
4D-Lipidomics™ workflow for increased throughput Lipid profiling from complex lipid extracts can be a challenging and time consuming task. The high complexity of samples and co-elution of isobaric or isomeric compounds complicate the confident annotation of lipids. The presented 4D-Lipidomics…
Klíčová slova
ccs, ccsannotation, annotationlipid, lipidannotations, annotationslipids, lipidstimstof, timstofaware, awarebased, basedcoverage, coveragevalues, valuescan, candeep, deepmobility, mobilityrule, ruleannotated
4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023 MP459 4D Analysis of Lipid Nanoparticles (LNP) using Elute-timsTOF Pro 2 with VIP-HESI source Intens. 3. LNP_E5_18_...: +MS, 6.3min, 1/K₀=0.971, #3486-3537 x10 5 4 3 369.3515 2 2Bruker Daltonik GmbH, Fahrenheitstraße 4, 28359 Bremen, Germany 3Bruker Scientific LLC,…
Klíčová slova
vip, viphesi, hesilnp, lnpmobility, mobilityesi, esidry, drytims, timsparameter, parametertemp, tempccs, ccscholesterol, cholesteroloffset, offsetlipids, lipidsprob, probformic
Bruker Product Overview - Life Science Mass Spectrometry
2020|Bruker|Brožury a specifikace
Product Overview Life Science Mass Spectrometry Innovation with Integrity Mass Spectrometry Empowering Science with Innovation and Integrity As one of the world’s leading analytical instrumentation companies, Bruker offers a broad spectrum of advanced solutions in all fields of research and…
Klíčová slova
maldi, malditof, tofbruker, brukerrapiflex, rapiflexpasef, pasefevoq, evoqspectrometry, spectrometryscimax, scimaxmass, masstimstof, timstofmrms, mrmsproteomics, proteomicsmetaboscape, metaboscapelrf, lrfseries
Investigating the increased lifespan in C. elegans daf-2 mutants by 4D-Lipidomics
2019|Bruker|Aplikace
Investigating the increased lifespan in C. elegans daf-2 mutants by 4D-Lipidomics The small nematode Caenorhabditis elegans is one of the premier biomedical model organisms and employed in many aspects of basic and applied science Introduction Typical application areas for C.…
Klíčová slova
ccs, ccslipid, lipidcharacteristic, characteristicnegative, negativevalues, valuespasef, paseflipids, lipidsmetaboscape, metaboscapetimstof, timstoflipidblast, lipidblastccspredict, ccspredictpositive, positivespectra, spectrawild, wildassignment