Using Agilent MassHunter to Perform NIST MSMS Search
Prezentace | 2024 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
Massová spektrometrie doplněná o vyhledávání fragmentačních spekter v knihovnách představuje nejmodernější přístup k rychlé a spolehlivé identifikaci neznámých sloučenin v chemické analýze. Díky kombinaci přesné hmotnostní měření a databázových algoritmů lze dosáhnout vysoké selektivity i citlivosti, což je nezbytné v oblasti environmentální analýzy, potravinové kontroly či farmaceutického výzkumu.
Cílem dokumentu je představit přehled postupu vyhledávání MSMS spekter pomocí softwaru Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 (2023). Autor demonstruje konfiguraci parametrů, import spekter a třídění výsledků na modelové sadě pesticidů. Studie slouží jako rychlá orientační příručka k efektivnímu nastavení workflow.
Analýzu provádí systém Agilent Time-of-Flight (TOF) v pozitivním iontovém režimu s tandemovou fragmentací. Software MassHunter Qualitative Analysis zajišťuje extrakci iontových chromatogramů a průměrování spekter při kolizních energiích 10, 20 a 40 V. Pro identifikaci se využívá NIST MSMS Search v.3.0 s možnostmi Identity MS/MS a Similarity/Hybrid Search, která dokáže zachytit příbuzné struktury i v případě chybějícího standardu v knihovně.
Ukázkové spektra směsi pesticidů (např. imazalil, diazinon, atrazin, malathion) byla úspěšně porovnána s referenčními daty. Klíčovým krokem je správné nastavení tolerance prekurzorového m/z a filtrace nízko intenzních iontů, čímž se zvyšuje kvalita shody. Hybridní vyhledávání odhalilo strukturálně podobné látky i bez přímého záznamu v databázi. Řazení výsledků dle plného spektra (Full Spectrum Score) a rev-doterance impurit (Impurity Tolerant) umožňuje lepší odlišení pravděpodobných kandidátů.
V následujících letech se očekává rozšíření umělé inteligence pro predikci fragmentačních vzorců a integrace globálních knihoven s otevřenými zdroji, jako jsou MONA spektrální knihovny. Rovněž se rozvíjí interoperabilita mezi různými softwarovými platformami a cloudovými databázemi pro sdílení dat v reálném čase.
Přehled použití Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 poskytuje systematický postup pro efektivní identifikaci neznámých látek. Klíčové jsou správná volba parametrů, filtrace šumu a uložení konfigurací pro opakované použití. Kombinace identity a hybridního vyhledávání maximalizuje možnost detekce jak známých, tak strukturálně příbuzných analytů.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, LC/TOF, Software
ZaměřeníVýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Massová spektrometrie doplněná o vyhledávání fragmentačních spekter v knihovnách představuje nejmodernější přístup k rychlé a spolehlivé identifikaci neznámých sloučenin v chemické analýze. Díky kombinaci přesné hmotnostní měření a databázových algoritmů lze dosáhnout vysoké selektivity i citlivosti, což je nezbytné v oblasti environmentální analýzy, potravinové kontroly či farmaceutického výzkumu.
Cíle a přehled studie
Cílem dokumentu je představit přehled postupu vyhledávání MSMS spekter pomocí softwaru Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 (2023). Autor demonstruje konfiguraci parametrů, import spekter a třídění výsledků na modelové sadě pesticidů. Studie slouží jako rychlá orientační příručka k efektivnímu nastavení workflow.
Použitá metodika a instrumentace
Analýzu provádí systém Agilent Time-of-Flight (TOF) v pozitivním iontovém režimu s tandemovou fragmentací. Software MassHunter Qualitative Analysis zajišťuje extrakci iontových chromatogramů a průměrování spekter při kolizních energiích 10, 20 a 40 V. Pro identifikaci se využívá NIST MSMS Search v.3.0 s možnostmi Identity MS/MS a Similarity/Hybrid Search, která dokáže zachytit příbuzné struktury i v případě chybějícího standardu v knihovně.
Hlavní výsledky a diskuse
Ukázkové spektra směsi pesticidů (např. imazalil, diazinon, atrazin, malathion) byla úspěšně porovnána s referenčními daty. Klíčovým krokem je správné nastavení tolerance prekurzorového m/z a filtrace nízko intenzních iontů, čímž se zvyšuje kvalita shody. Hybridní vyhledávání odhalilo strukturálně podobné látky i bez přímého záznamu v databázi. Řazení výsledků dle plného spektra (Full Spectrum Score) a rev-doterance impurit (Impurity Tolerant) umožňuje lepší odlišení pravděpodobných kandidátů.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá a automatizovaná identifikace složitých vzorků bez nutnosti standardů
- Vysoká selektivita díky přesné hmotnostní analýze a filtračním algoritmům
- Možnost sdílení uložených konfigurací mezi uživateli pro zajištění konzistence výsledků
Budoucí trendy a možnosti využití
V následujících letech se očekává rozšíření umělé inteligence pro predikci fragmentačních vzorců a integrace globálních knihoven s otevřenými zdroji, jako jsou MONA spektrální knihovny. Rovněž se rozvíjí interoperabilita mezi různými softwarovými platformami a cloudovými databázemi pro sdílení dat v reálném čase.
Závěr
Přehled použití Agilent MassHunter ve spojení s NIST MSMS Search v.3.0 poskytuje systematický postup pro efektivní identifikaci neznámých látek. Klíčové jsou správná volba parametrů, filtrace šumu a uložení konfigurací pro opakované použití. Kombinace identity a hybridního vyhledávání maximalizuje možnost detekce jak známých, tak strukturálně příbuzných analytů.
Reference
- James Little. Mass Spec Interpretation Services. Sept. 14, 2024.
- Little J. Using Agilent MassHunter to Perform NIST MSMS Search. littlemsandsailing.com, 2024.
- MassHunter Qualitative Analysis Training Videos EP01–EP03. YouTube.
- NIST MSMS Full Course: LCMS Unknown Identification with NIST Search. littlemsandsailing.com, 2020.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
LCMS Unknown Identification with NIST Search Using MSMS Libraries
2024|Agilent Technologies|Prezentace
James Little Mass Spec Interpretation Services Sept. 9, 2024 https://littlemsandsailing.com/2024/10/using-agilent-masshunter-to-perform-nist-msms-search/ https://littlemsandsailing.com/ Overview of Process ➢ Just an overview of process ➢ For Details, see complete training at websites below MassHunter YouTube Training Videos MassHunter Qualitative Analysis Training Video EP01-Basic Navigation…
Klíčová slova
msms, msmssearch, searchspectrum, spectrumnist, nistlibraries, librariesprecursor, precursorsettings, settingsions, ionsunknown, unknownsearches, searchesimported, importedtab, tabpenalize, penalizespectra, spectraselected
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications (NIST Search Type Demonstration)
2024|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications NIST Search Type Demonstration James Little Mass Spec Interpretation Services https://littlemsandsailing.com/ 11/06/2025 Thermo Freestyle NIST MSMS Search Thermo Orbitrap MSMS ➢ More information in my “Advanced Course…
Klíčová slova
msms, msmssearch, searchnist, nistspectrum, spectrumprecursor, precursorsearches, searchessettings, settingsfreestyle, freestyleselected, selectedimported, importedcompound, compoundcourse, coursetab, tabspectra, spectratolerance
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications (Setting Up NIST Search and Freestyle Parameters)
2024|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Data Processing Using Thermo Freestyle Software with NIST MSMS Search for Compound Identifications Setting Up NIST Search and Freestyle Parameters James Little Mass Spec Interpretation Services https://littlemsandsailing.com/ 11/06/2025 Thermo Freestyle NIST MSMS Search Thermo Orbitrap MSMS ➢ Screenshots shown in…
Klíčová slova
search, searchnist, nistmsms, msmsfreestyle, freestylesearches, searcheslibrary, librarytab, tabspectrum, spectrumbutton, buttonsettings, settingsprecursor, precursorhit, hitbox, boxspectra, spectrascreenshots
LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part II: NIST Search Software and Libraries
2020|Wiley|Prezentace
LCMS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part II: NIST Search Software and Libraries Updated 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS,…
Klíčová slova
search, searchmsms, msmslibraries, librariesnist, nistsearches, searchesspectra, spectralmb, lmbdepressed, depressedsettings, settingslibrary, libraryhybrid, hybridresults, resultstab, tabpresearch, presearchsearched