HIGH THROUGHPUT PLASMA PROFILING OF HUMAN LIVER DISEASE SAMPLES USING RAPID CHROMATOGRAPHY AND A MULTI- REFLECTING TIME-OF-FLIGHT MASS SPECTROMETER
Postery | 2024 | Waters | ASMSInstrumentace
Metabolomika hraje zásadní roli při odhalování biochemických změn spojených s onemocněním jater, zejména akutně na chronickém selhání jater (ACLF) a akutním jaterním selhání (ALF). Mapování metabolitů a lipidů umožňuje identifikovat rané biomarkery pro diagnostiku a vývoj nových terapeutik.
Cílem studie bylo porovnat metody rychlé chromatografie (RAMMP) a vakuově izolovaných kolon (VJC) v kombinaci s vysoce resolučním multireflektujícím TOF hmotnostním spektrometrem (SELECT SERIES MRT) pro analýzu plazmy pacientů ve skupinách: zdraví, cirhóza, ACLF a ALF. Studie se zaměřila na robustnost, propustnost a přesnost anotace metabolitů a lipidů.
Vzorky plazmy podstoupily dvoustupňovou extrakci: proteinovou precipitaci pro lipidy a akronitrilové srážení pro malé molekuly.
Rapidní chromatografické přístupy v kombinaci s vysoce přesným MRT TOF spektrometrem zajišťují vysokou propustnost a reprodukovatelnost analýzy rozsáhlých kohort.
Metodika umožňuje robustní detekci a kvantifikaci potenciálních biomarkerů pro včasnou diagnostiku onemocnění jater a podporuje farmaceutický výzkum.
Integrace iontové mobility a další zrychlené separační techniky může dále zvýšit selektivitu a propustnost. Rozvoj automatizované přípravy vzorků a pokročilých datových analýz (umělá inteligence, strojové učení) umožní robustnější biomarker screening a personalizovanou medicínu.
Studie prokázala, že rychlé chromatografické metody (RAMMP i VJC) v kombinaci s multireflektujícím TOF spektrometrem poskytují spolehlivá, vysoce přesná a propustná řešení pro metabolomické profilování plazmy. VJC technologie přináší lepší tvar píků a vyšší rozlišení, aniž by zásadně změnila statistické rozložení dat.
LC/HRMS, LC/MS/MS, LC/MS, LC/TOF
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika hraje zásadní roli při odhalování biochemických změn spojených s onemocněním jater, zejména akutně na chronickém selhání jater (ACLF) a akutním jaterním selhání (ALF). Mapování metabolitů a lipidů umožňuje identifikovat rané biomarkery pro diagnostiku a vývoj nových terapeutik.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem studie bylo porovnat metody rychlé chromatografie (RAMMP) a vakuově izolovaných kolon (VJC) v kombinaci s vysoce resolučním multireflektujícím TOF hmotnostním spektrometrem (SELECT SERIES MRT) pro analýzu plazmy pacientů ve skupinách: zdraví, cirhóza, ACLF a ALF. Studie se zaměřila na robustnost, propustnost a přesnost anotace metabolitů a lipidů.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky plazmy podstoupily dvoustupňovou extrakci: proteinovou precipitaci pro lipidy a akronitrilové srážení pro malé molekuly.
- Chromatografie HILIC: ACQUITY BEH amide, 1,0 × 50 mm, mobilní fáze voda/acetonitril s amonnou formou.
- Chromatografie RP lipidů: ACQUITY BEH C8, mobilní fáze voda/isopropanol/acetonitril s amonným acetátem.
- VJC kolon: stejné rozměry, vakuově izolované pro zvýšení separační účinnosti.
- MS detekce: SELECT SERIES MRT TOF, rozlišení 170–200 000 FWHM při 30 Hz, režimy DIA MSE v pozitivní i negativní ESI, lockmass leucine enkephalin.
- Software: MassLynx v.4.2, MARS a Lipostar2 pro výběr stop, normalizaci, vyhledání v databázi a stat. analýzu.
Hlavní výsledky a diskuse
- QC vzorky se v PCA dobře shlukovaly a potvrdily stabilitu metod po 168 injekcích bez významné driftu.
- OPLS-DA rozlišila zdravé a nemocné skupiny, identifikovala významné lipidy (LPC, PC, SM) s hmotnostní přesností 0,1–0,3 ppm.
- VJC poskytla ostřejší chromatografické píky, vyšší počet skenů na pík a lepší rozlišení sousedních složek než klasická RAMMP metoda.
- Rozložení skupin v PCA pro RAMMP a VJC bylo podobné, což ukazuje na srovnatelnou kvalitu dat, přičemž VJC minimalizovala šířku píků.
Přínosy a praktické využití metody
Rapidní chromatografické přístupy v kombinaci s vysoce přesným MRT TOF spektrometrem zajišťují vysokou propustnost a reprodukovatelnost analýzy rozsáhlých kohort.
Metodika umožňuje robustní detekci a kvantifikaci potenciálních biomarkerů pro včasnou diagnostiku onemocnění jater a podporuje farmaceutický výzkum.
Budoucí trendy a možnosti využití
Integrace iontové mobility a další zrychlené separační techniky může dále zvýšit selektivitu a propustnost. Rozvoj automatizované přípravy vzorků a pokročilých datových analýz (umělá inteligence, strojové učení) umožní robustnější biomarker screening a personalizovanou medicínu.
Závěr
Studie prokázala, že rychlé chromatografické metody (RAMMP i VJC) v kombinaci s multireflektujícím TOF spektrometrem poskytují spolehlivá, vysoce přesná a propustná řešení pro metabolomické profilování plazmy. VJC technologie přináší lepší tvar píků a vyšší rozlišení, aniž by zásadně změnila statistické rozložení dat.
Reference
- Liu G. et al. Metabolomics profiles in acute-on-chronic liver failure. Front Pharmacol, 2022.
- King A. M. et al. Rapid profiling method for polar analytes in urine. Metabolomics, 2019.
- King A. M. et al. Rapid lipid profiling in human plasma. J Chromatogr A, 2020.
- Plumb R. S. et al. High-throughput profiling using VJC. Anal Chem, 2021.
- Plumb R. S. et al. UHPLC-MS-based lipidomics with vacuum jacketed columns. J Proteome Res, 2022.
- Cooper-Shepherd D. A. et al. Hybrid quadrupole-multireflecting TOF system. J Am Soc Mass Spectrom, 2023.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
EMPLOYING BALLISTIC GRADIENTS, VACUUM JACKETED COLUMNS AND A NOVEL MRT TO INCREASE LIPIDOMIC THROUGHPUT WHILST MAINTAINING HIGHLY CONFIDENT IDENTIFICATIONS
2024|Waters|Postery
EMPLOYING BALLISTIC GRADIENTS, VACUUM JACKETED COLUMNS AND A NOVEL MRT TO INCREASE LIPIDOMIC THROUGHPUT WHILST MAINTAINING HIGHLY CONFIDENT IDENTIFICATIONS Matthew E. Daly1, Nyasha Munjoma1, Rob S. Plumb2, Jason Hill2, Nick Tomczyk1, Lee A. Gethings1, Richard Lock1 1 Waters Corporation, Wilmslow,…
Klíčová slova
vjc, vjcmrt, mrthealthy, healthypeak, peakxevo, xevopls, plspatients, patientscancer, cancerusing, usinglipids, lipidsscanning, scanningcontrols, controlsfeatures, featuresmicrobore, microboreconsumption
Employing ballistic gradients, vacuum jacketed columns and prototype benchtop multi reflecting time-of-flight (MRT) to increase lipidomic throughput whilst maintaining highly confident identifications
2024|Waters|Technické články
[ PRODUCT SOLUTION ] Employing ballistic gradients, vacuum jacketed columns and prototype benchtop multi reflecting time-of-flight (MRT) to increase lipidomic throughput whilst maintaining highly confident identifications Authors: Matthew E. Daly 1, Nyasha Munjoma1, Rob S. Plumb2 , Jason Hill2 ,…
Klíčová slova
vjc, vjcmrt, mrthealthy, healthycancer, cancerscanning, scanningincrease, increasejacketed, jacketedpatients, patientspeak, peakgridless, gridlessprofiling, profilingchromatographic, chromatographicminute, minutemirrors, mirrorscontrols
Rapid Microbore Metabolic Profiling (RAMMP) with Ion Mobility for the Lipidomic Investigation of Plasma from Breast Cancer Patients
2018|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTE ] Rapid Microbore Metabolic Profiling (RAMMP) with Ion Mobility for the Lipidomic Investigation of Plasma from Breast Cancer Patients Adam M. King,1 Lee A. Gethings,1 and Robert S. Plumb 2 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK; 2 Waters…
Klíčová slova
rammp, rammplipidomic, lipidomicmicrobore, microboremetabolic, metabolicprofiling, profilinglipid, lipidbreast, breastmobility, mobilityinvestigation, investigationpatients, patientscancer, cancerrapid, rapidplasma, plasmauplc, uplcprogenesis
Improved Metabolite Structural Elucidation as a Result of Enhanced Resolution and Mass Accuracy Provided by the Select Series MRT
2022|Waters|Aplikace
Application Note Improved Metabolite Structural Elucidation as a Result of Enhanced Resolution and Mass Accuracy Provided by the Select Series™ MRT Adam King, Lee A. Gethings, Robert S. Plumb Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain…
Klíčová slova
mrt, mrtelucidation, elucidationselect, selectmetabolite, metaboliteseries, seriesstructural, structuralresolution, resolutionenhanced, enhancedmass, massaccuracy, accuracyimproved, improvedresult, resultprovided, providedflight, flighttof