LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Streamlined PFAS Annotation and Visualization with FluoroMatch Flow and Visualizer

Postery | 2022 | Agilent Technologies | RAFAInstrumentace
Software, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
Zaměření
Potraviny a zemědělství
Výrobce
Agilent Technologies

Souhrn

Význam tématu


Per- a polyfluorované alkylové látky (PFAS) představují v potravinářském průmyslu i v environmentální ochraně zásadní analytickou výzvu. Jejich široké použití v obalech a jiné potravinářské technologii vede k migraci do potravin, avšak velká část organofluorovaných sloučenin zůstává neidentifikována. Efektivní screening a důvěryhodná identifikace PFAS ve složitých matricích je klíčová pro posouzení expozice a rizika.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem předkládané práce bylo vyvinout a předvést otevřenou softwarovou sadu FluoroMatch Flow pro automatizovanou anotaci PFAS ze surových dat z vysokorozlišené hmotnostní spektrometrie a nástroj FluoroMatch Visualizer pro interaktivní vizualizaci výsledků. Oba nástroje mají usnadnit detekci, klasifikaci a hodnocení důvěryhodnosti PFAS v potravinářských kontaktních materiálech.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky: 23 různých potravinářských obalů (deli papír, mikrotenové sáčky, pečicí podložky apod.) byly extrahovány v EPA 1633 diluentu za pomoci vícenásobného víření, sonikace a macerace. K analýze se odebíraly alikvoty s interními standardy pro kvantifikaci.

Instrumentace:
  • UHPLC Agilent 1290 Infinity II
  • Q-TOF spektrometrie Agilent 6545 LC/Q-TOF v negativním režimu electrospray ionizace

Datová analýza:
  • FluoroMatch Flow využívá msConvert pro převod dat, MZmine 2.26 pro výběr chromatografických stop a blank feature filtering
  • Anotace na základě přesné hmotnosti prekurzorů a fragmentů, retence a in-silico fragmentačních knihoven
  • Hodnocení důvěryhodnosti podle Schymanského škály
  • FluoroMatch Visualizer postavený na Power BI Desktop pro interaktivní grafy (m/z vs. retenční čas, normalizovaný defekt hmotnosti, MS/MS spektra)

Hlavní výsledky a diskuse


Bylo vytvořeno in-silico fragmentační knihovny více než 7000 PFAS rozdělených do 72 podtříd. V testovaných reálných vzorcích FluoroMatch pokryl přibližně 71 % PFAS s pozorovanými fragmenty a 56 % PFAS detekovaných podle normalizovaného defektu hmotnosti CF2, zbytek tvořily pravděpodobné falešné negativity. Vizualizér umožnil snadnou identifikaci homogenních řad a odchylek pomocí interaktivního filtrování podle skóre a charakteristických fragmentů.

Přínosy a praktické využití metody


Automatizovaný workflow zkracuje čas potřebný k nontargetovanému a suspect screening kompozitních vzorků. Otevřená licence umožňuje institucionální nasazení a úpravy. Laboratoře zaměřené na kvalitu potravin, environmentální monitoring i výzkum získávají nástroj pro komplexní hodnocení PFAS.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Rozšíření in-silico fragmentačních knihoven experimentálním mapováním dalších PFAS
  • Integrace nových podtříd vznikajících náhradních chemikálií
  • Zvýšení pokrytí a snížení falešných negativ prostřednictvím pokročilejších MS metod
  • Budování komunitních databází a sdílených šablon v Visualizeru

Závěr


Suite FluoroMatch představuje první otevřené řešení pro automatizovanou anotaci a vizualizaci PFAS v chromatograficko-hromadných datech. Kombinace nástrojů Flow a Visualizer výrazně zjednodušuje interpretaci složitých nontargetovaných dat a podporuje kvalitativní i kvantitativní screening PFAS v potravinářských materiálech.

Použitá instrumentace


  • UHPLC Agilent 1290 Infinity II
  • Agilent 6545 quadrupol-time-of-flight (Q-TOF) spektrometr
  • Software: msConvert, MZmine 2.26, FluoroMatch Flow, FluoroMatch Visualizer (Power BI Desktop)

Reference


  • U.S. Environmental Protection Agency. Comptox Chemicals Dashboard: Master List of PFAS Substances (Version2). 2021.
  • Koelmel J.P. et al. Toward Comprehensive Per- and Polyfluoroalkyl Substances Annotation Using FluoroMatch Software and Intelligent High-Resolution Tandem Mass Spectrometry Acquisition. Analytical Chemistry, 2020, 92(16):11186-11194.
  • Koelmel J.P. et al. Interactive Software for Visualization of Non-Targeted Mass Spectrometry Data – FluoroMatch Visualizer. ChemRxiv, 2022.
  • Coggan T.L. et al. Single analytical method for the determination of 50 legacy and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in aqueous matrices. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2019, 411:3507-3520.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
SETAC: FluoroMatch Flow and Visualizer are New Tools for Streamlined PFAS Annotation and Visualization
FluoroMatch Flow and Visualizer are New Tools for Streamlined PFAS Annotation and Visualization Jeremy P. Koelmel1, Paul Stelben1, Krystal J. Pollitt1, Stephan Baumann2, Emma Rennie2, Marcus Chadha3, Carrie A. McDonough4 1Yale School of Public Health, 60 College St., New Haven,…
Klíčová slova
acid, acidfluoromatch, fluoromatchvisualizer, visualizerpfas, pfasphosphinic, phosphinictridecafluorohexyl, tridecafluorohexylsilico, silicoheptadecafluorooctyl, heptadecafluorooctylscoring, scoringafff, afffannotation, annotationsystematic, systematicvendor, vendorfiles, filesbis
Non-Target PFAS Analysis in Dried Blood Spots Using the Agilent 6546 LC/Q-TOF with Profinder and FluoroMatch
Application Note PFAS Non-Target PFAS Analysis in Dried Blood Spots Using the Agilent 6546 LC/Q-TOF with Profinder and FluoroMatch Authors Jeremy Koelmel, Elizabeth Lin, Paul Stelben, and Krystal Pollitt Yale University Emily Parry, Emma Rennie, and James Pyke Agilent Technologies,…
Klíčová slova
fluoromatch, fluoromatchpfas, pfasperfluoro, perfluoroprofinder, profindermodular, modulardried, driedseries, seriesblood, bloodfalse, falsespot, spotperfluoroalkyl, perfluoroalkylsulfonic, sulfonicacid, acidacids, acidssuite
Comprehensive non-targeted workflow for confident identification of perfluoroalkyl substances (PFAS)
Application note | 003883 Environmental Comprehensive non-targeted workflow for confident identification of perfluoroalkyl substances (PFAS) Richard Cochran1, Sarah Choyke2, Application benefits Collin Meyers2, Ralf Tautenhahn3 • High-resolution accurate-mass (HRAM) data acquired using the Thermo Scientific™ Orbitrap Exploris™ mass spectrometer platform…
Klíčová slova
pfas, pfasannotation, annotationspectral, spectralmass, massdatabase, databasefluoromatch, fluoromatchworkflow, workflowdiscoverer, discovererduke, dukemzcloud, mzcloudconfidence, confidenceafff, affftargeted, targetedhomologous, homologouscompound
FluoroMatch 3.0 – Automated PFAS Non-Targeted Analysis and Visualizations Applied to Mammalian Biofluids
FluoroMatch 3.0 – Automated PFAS Non-Targeted Analysis and Visualizations Applied to Mammalian Biofluids Michael Kummer1; Nandarani Abril1; Emily Parry2; Sheng Liu3; Carrie A McDonough4; David Dukes5; David Godri6; Elizabeth Z. Lin3; Emma E Rennie2; Jeremy Koelmel3; Krystal J Godri Pollitt3…
Klíčová slova
fluoromatch, fluoromatchlibraries, librariesbiotransformation, biotransformationpicking, pickingdda, ddavisualizations, visualizationsworkflow, workflowbiotransformed, biotransformedmzannotation, mzannotationuncommonly, uncommonlypfas, pfashrms, hrmsmzmine, mzminecomptox, comptoxvisualizer
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.