Screening Metabolomics of Extracellular Vesicles using the Xevo™ MRT Mass Spectrometer
Technické články | 2024 | WatersInstrumentace
Studium metabolomiky extracelulárních vezikúl je klíčové pro pochopení buněčné komunikace a detekci biomarkerů v biomedicíně. Vysoké rozlišení a přesnost hmotnostní spektrometrie umožňují odhalit drobné změny v profilu malých molekul, které by jinak zůstaly skryty.
Cílem bylo porovnat metabolické složení extracelulárních vezikúl (EV) a matrice navázaných vezikúl (MBV) z osteoblastů MC3T3 pod osteogenními podmínkami. Studie demonstruje schopnost platformy Xevo MRT MS v kombinaci s HILIC chromatografií rychle a spolehlivě profileovat vzorky.
Dodržena byla workflow:
Analýza ukázala jasné oddělení EV a MBV v PCA plotu a identifikaci významných látek pomocí vulkanického diagramu. Díky rozlišení ~70 000 FWHM bylo možné rozlišit izobarické sloučeniny. Mezi klíčově odlišené třídy patřily:
Workflow kombinuje rychlou chromatografii a vysoce citlivou spektrometrii pro účely:
Očekává se rozšíření aplikací v omické integraci (proteomika, lipidomika), zdokonalení algoritmů pro automatickou identifikaci a využití umělé inteligence pro hlubší interpretaci dat. Zvýšené rozlišení a hmotnostní přesnost otevírají cestu k monitoringu ultra-sledovaných metabolitů v reálném čase.
Studie prokázala, že kombinace Xevo MRT MS a HILIC chromatografie poskytuje rychlý a spolehlivý přístup k profilování malých molekul v extracelulárních vezikulách. MARS software podporuje efektivní statistickou analýzu a přesnou identifikaci sloučenin, čímž představuje silné nástroje pro metabolomickou výzkumnou i aplikovanou praxi.
Žádné externí literární zdroje neuvedeny.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Studium metabolomiky extracelulárních vezikúl je klíčové pro pochopení buněčné komunikace a detekci biomarkerů v biomedicíně. Vysoké rozlišení a přesnost hmotnostní spektrometrie umožňují odhalit drobné změny v profilu malých molekul, které by jinak zůstaly skryty.
Cíle a přehled studie
Cílem bylo porovnat metabolické složení extracelulárních vezikúl (EV) a matrice navázaných vezikúl (MBV) z osteoblastů MC3T3 pod osteogenními podmínkami. Studie demonstruje schopnost platformy Xevo MRT MS v kombinaci s HILIC chromatografií rychle a spolehlivě profileovat vzorky.
Použitá metodika a instrumentace
Dodržena byla workflow:
- Příprava vzorků EV, MBV a QC standardu (NIST moč).
- Chromatografická separace na ACQUITY Premier systému s BEH Amide kolonkou a čtyřminutovým HILIC gradientem (99→50 % organické fáze).
- Detekce na Xevo MRT MS s rozlišením až 100 000 FWHM a sub-ppm hmotnostní přesností.
- Řízení a vizualizace dat pomocí waters_connect Platform a MSToolkit; statistická analýza v MARS software.
Hlavní výsledky a diskuse
Analýza ukázala jasné oddělení EV a MBV v PCA plotu a identifikaci významných látek pomocí vulkanického diagramu. Díky rozlišení ~70 000 FWHM bylo možné rozlišit izobarické sloučeniny. Mezi klíčově odlišené třídy patřily:
- Glycerofosfolipidy
- Fatty Acyls
- Glycerolipidy
- Karboxylové kyseliny
Přínosy a praktické využití metody
Workflow kombinuje rychlou chromatografii a vysoce citlivou spektrometrii pro účely:
- Objevování nových biomarkerů.
- Porovnávací studia vzorků v biomedicínském výzkumu.
- Průmyslovou a klinickou metabolomickou analýzu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření aplikací v omické integraci (proteomika, lipidomika), zdokonalení algoritmů pro automatickou identifikaci a využití umělé inteligence pro hlubší interpretaci dat. Zvýšené rozlišení a hmotnostní přesnost otevírají cestu k monitoringu ultra-sledovaných metabolitů v reálném čase.
Závěr
Studie prokázala, že kombinace Xevo MRT MS a HILIC chromatografie poskytuje rychlý a spolehlivý přístup k profilování malých molekul v extracelulárních vezikulách. MARS software podporuje efektivní statistickou analýzu a přesnou identifikaci sloučenin, čímž představuje silné nástroje pro metabolomickou výzkumnou i aplikovanou praxi.
Reference
Žádné externí literární zdroje neuvedeny.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
METABOLOMIC PROFILING OF OSTEOBLAST EXTRACELLULAR VESICLES AND MATRIX BOUND VESICLES USING A PROTOTYPE BENCHTOP MULTI REFLECTING TIME-OF-FLIGHT (MRT) MASS SPECTROMETER
2024|Waters|Postery
METABOLOMIC PROFILING OF OSTEOBLAST EXTRACELLULAR VESICLES AND MATRIX BOUND VESICLES USING A PROTOTYPE BENCHTOP MULTI REFLECTING TIME-OF-FLIGHT (MRT) MASS SPECTROMETER Authors Affiliations Lisa Reid2, Stephen Griffin2, Alicia Keenan1, Lee A. Gethings2, Liam M. Heaney1, Aveen Jalal1, Genevieve Anghileri1, Owen G.…
Klíčová slova
evs, evsmbvs, mbvsmrt, mrtextracellular, extracellularvesicles, vesiclesmbv, mbvmars, marsputatively, putativelybetween, betweenacyls, acylsdataset, datasetstatistically, statisticallybound, boundsignificant, significantdifferential
Metabolomics Workflow using a Xevo™ MRT Mass Spectrometer
2024|Waters|Aplikace
Application Note Metabolomics Workflow using a Xevo™ MRT Mass Spectrometer Lisa Reid, Matthew E. Daly, Lee A. Gethings, Jayne Kirk Waters Corporation Abstract We demonstrate the acquisition and data processing to identify and pathway profile a typical metabolomic study acquired…
Klíčová slova
mrt, mrtxevo, xevometabolomics, metabolomicssmoker, smokerworkflow, workflowspectrometer, spectrometerurine, urinemass, massusing, usingsmokers, smokerspremier, premiernon, nonacquity, acquityunsupervised, unsupervisedbiomarkers
Screening Metabolomics of Human Urine Using a Waters™ High Resolution QTof Mass Spectrometer and MARS Data Processing Software
2024|Waters|Aplikace
Application Note Screening Metabolomics of Human Urine Using a Waters™ High Resolution QTof Mass Spectrometer and MARS Data Processing Software Lisa Reid, Lee A. Gethings, Nyasha Munjoma, Stefano Bonciarelli Waters Corporation, Molecular Discovery Ltd Abstract Describing the combination of HILIC…
Klíčová slova
mars, marsmetabolomics, metabolomicsurine, urineqtof, qtofprocessing, processinghuman, humanscreening, screeningwaters, watersdata, dataspectrometer, spectrometerresolution, resolutionsoftware, softwaremass, masshigh, highusing
Connected Solutions for Metabolomic and Lipidomic Studies on the Xevo MRT Mass Spectrometer
2024|Waters|Ostatní
TM Connected Solutions for Metabolomic and Lipidomic Studies on the Xevo MRT Mass Spectrometer Make meaningful scientific discoveries more efficient through dedicated workflows combining column chemistries, separations, and informatics. The field of metabolic and lipidomic profiling faces many challenges Comparing…
Klíčová slova
mzml, mzmlmrt, mrtlipidomic, lipidomicdata, dataanalytica, analyticaknowledge, knowledgexevo, xevoformat, formatcommercial, commercialmetabolomic, metabolomicbiopathway, biopathwayconvert, convertinterpretation, interpretationmetabolic, metabolicprotocols