LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Screening Metabolomics of Extracellular Vesicles using the Xevo™ MRT Mass Spectrometer

Technické články | 2024 | WatersInstrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
Zaměření
Metabolomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu


Studium metabolomiky extracelulárních vezikúl je klíčové pro pochopení buněčné komunikace a detekci biomarkerů v biomedicíně. Vysoké rozlišení a přesnost hmotnostní spektrometrie umožňují odhalit drobné změny v profilu malých molekul, které by jinak zůstaly skryty.

Cíle a přehled studie


Cílem bylo porovnat metabolické složení extracelulárních vezikúl (EV) a matrice navázaných vezikúl (MBV) z osteoblastů MC3T3 pod osteogenními podmínkami. Studie demonstruje schopnost platformy Xevo MRT MS v kombinaci s HILIC chromatografií rychle a spolehlivě profileovat vzorky.

Použitá metodika a instrumentace


Dodržena byla workflow:
  • Příprava vzorků EV, MBV a QC standardu (NIST moč).
  • Chromatografická separace na ACQUITY Premier systému s BEH Amide kolonkou a čtyřminutovým HILIC gradientem (99→50 % organické fáze).
  • Detekce na Xevo MRT MS s rozlišením až 100 000 FWHM a sub-ppm hmotnostní přesností.
  • Řízení a vizualizace dat pomocí waters_connect Platform a MSToolkit; statistická analýza v MARS software.

Hlavní výsledky a diskuse


Analýza ukázala jasné oddělení EV a MBV v PCA plotu a identifikaci významných látek pomocí vulkanického diagramu. Díky rozlišení ~70 000 FWHM bylo možné rozlišit izobarické sloučeniny. Mezi klíčově odlišené třídy patřily:
  • Glycerofosfolipidy
  • Fatty Acyls
  • Glycerolipidy
  • Karboxylové kyseliny

Přínosy a praktické využití metody


Workflow kombinuje rychlou chromatografii a vysoce citlivou spektrometrii pro účely:
  • Objevování nových biomarkerů.
  • Porovnávací studia vzorků v biomedicínském výzkumu.
  • Průmyslovou a klinickou metabolomickou analýzu.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekává se rozšíření aplikací v omické integraci (proteomika, lipidomika), zdokonalení algoritmů pro automatickou identifikaci a využití umělé inteligence pro hlubší interpretaci dat. Zvýšené rozlišení a hmotnostní přesnost otevírají cestu k monitoringu ultra-sledovaných metabolitů v reálném čase.

Závěr


Studie prokázala, že kombinace Xevo MRT MS a HILIC chromatografie poskytuje rychlý a spolehlivý přístup k profilování malých molekul v extracelulárních vezikulách. MARS software podporuje efektivní statistickou analýzu a přesnou identifikaci sloučenin, čímž představuje silné nástroje pro metabolomickou výzkumnou i aplikovanou praxi.

Reference


Žádné externí literární zdroje neuvedeny.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
METABOLOMIC PROFILING OF OSTEOBLAST EXTRACELLULAR VESICLES AND MATRIX BOUND VESICLES USING A PROTOTYPE BENCHTOP MULTI REFLECTING TIME-OF-FLIGHT (MRT) MASS SPECTROMETER
METABOLOMIC PROFILING OF OSTEOBLAST EXTRACELLULAR VESICLES AND MATRIX BOUND VESICLES USING A PROTOTYPE BENCHTOP MULTI REFLECTING TIME-OF-FLIGHT (MRT) MASS SPECTROMETER Authors Affiliations Lisa Reid2, Stephen Griffin2, Alicia Keenan1, Lee A. Gethings2, Liam M. Heaney1, Aveen Jalal1, Genevieve Anghileri1, Owen G.…
Klíčová slova
evs, evsmbvs, mbvsmrt, mrtextracellular, extracellularvesicles, vesiclesmbv, mbvmars, marsputatively, putativelybetween, betweenacyls, acylsdataset, datasetstatistically, statisticallybound, boundsignificant, significantdifferential
Metabolomics Workflow using a Xevo™ MRT Mass Spectrometer
Application Note Metabolomics Workflow using a Xevo™ MRT Mass Spectrometer Lisa Reid, Matthew E. Daly, Lee A. Gethings, Jayne Kirk Waters Corporation Abstract We demonstrate the acquisition and data processing to identify and pathway profile a typical metabolomic study acquired…
Klíčová slova
mrt, mrtxevo, xevometabolomics, metabolomicssmoker, smokerworkflow, workflowspectrometer, spectrometerurine, urinemass, massusing, usingsmokers, smokerspremier, premiernon, nonacquity, acquityunsupervised, unsupervisedbiomarkers
Screening Metabolomics of Human Urine Using a Waters™ High Resolution QTof Mass Spectrometer and MARS Data Processing Software
Application Note Screening Metabolomics of Human Urine Using a Waters™ High Resolution QTof Mass Spectrometer and MARS Data Processing Software Lisa Reid, Lee A. Gethings, Nyasha Munjoma, Stefano Bonciarelli Waters Corporation, Molecular Discovery Ltd Abstract Describing the combination of HILIC…
Klíčová slova
mars, marsmetabolomics, metabolomicsurine, urineqtof, qtofprocessing, processinghuman, humanscreening, screeningwaters, watersdata, dataspectrometer, spectrometerresolution, resolutionsoftware, softwaremass, masshigh, highusing
Connected Solutions for Metabolomic and Lipidomic Studies on the Xevo MRT Mass Spectrometer
TM Connected Solutions for Metabolomic and Lipidomic Studies on the Xevo MRT Mass Spectrometer Make meaningful scientific discoveries more efficient through dedicated workflows combining column chemistries, separations, and informatics. The field of metabolic and lipidomic profiling faces many challenges Comparing…
Klíčová slova
mzml, mzmlmrt, mrtlipidomic, lipidomicdata, dataanalytica, analyticaknowledge, knowledgexevo, xevoformat, formatcommercial, commercialmetabolomic, metabolomicbiopathway, biopathwayconvert, convertinterpretation, interpretationmetabolic, metabolicprotocols
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.