Leveraging the MS1 Dimension and Formula Prediction in Non-Targeted Analysis of PFAS using New FluoroMatch Algorithms: Assessing Confidence and Coverage
Postery | 2024 | Agilent Technologies | ASMSInstrumentace
Per- a polyfluoralkylové látky (PFAS) představují skupinu vysoce perzistentních chemikálií, které se hromadí v životním prostředí a organismech. Pro jejich detekci a identifikaci jsou klíčové pokročilé necílené analytické přístupy, jež umožňují objevovat známé i dosud neznámé sloučeniny bez předběžných standardů.
Cílem prezentované práce bylo otestovat nové algoritmy softwaru FluoroMatch pro komplexní necílenou analýzu PFAS v suchých krevních kapsech. Autoři sledovali úplné pokrytí pracovní postupem, včetně převodu dat, výběru nejintezivnějších iontů v MS1, filtrace ve vazbě na blank vzorky a následné predikce sumární formule.
Automatizovaný workflow zvyšuje rychlost a konzistenci necílených analýz PFAS. Predikce sumární formule poskytuje dodatečnou vrstvu důvěry pro slabé signály či sloučeniny bez kvalitního MS/MS. Interaktivní grafické prostředí usnadňuje interpretaci rozsáhlých dat a spolupráci mezi laboratořemi.
FluoroMatch Flow nabízí komplexní a automatizovaný přístup k necílené analýze PFAS s vysokou spolehlivostí včetně predikce sumární formule. Metoda poskytuje širší pokrytí neznámých látek, zvyšuje důvěru při identifikaci a přispívá k rychlejšímu risk assessmentu PFAS v reálných vzorcích.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníŽivotní prostředí
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Per- a polyfluoralkylové látky (PFAS) představují skupinu vysoce perzistentních chemikálií, které se hromadí v životním prostředí a organismech. Pro jejich detekci a identifikaci jsou klíčové pokročilé necílené analytické přístupy, jež umožňují objevovat známé i dosud neznámé sloučeniny bez předběžných standardů.
Cíle a přehled studie
Cílem prezentované práce bylo otestovat nové algoritmy softwaru FluoroMatch pro komplexní necílenou analýzu PFAS v suchých krevních kapsech. Autoři sledovali úplné pokrytí pracovní postupem, včetně převodu dat, výběru nejintezivnějších iontů v MS1, filtrace ve vazbě na blank vzorky a následné predikce sumární formule.
Použitá metodika
- Extrakce PFAS ze vzorků zasušené kapky krve na papírové kartě a příslušné blank karty.
- Sběr dat v režimech full-scan MS, DDA a IE-DDA pro MS/MS fragmentaci.
- Automatizované zpracování v MZMine 4 a Profinder pro detekci hladin a filtraci blank.
- Detekce homologních řad a hromadná anotace tříd PFAS na základě mass defect a retenčního času.
- Predikce sumární formule z nejintenzivnějšího MS1 signálu s další filtrací dle atomových poměrů a nitrogen rule.
Použitá instrumentace
- Hmotnostní spektrometr Agilent 6546 LC/Q-TOF.
- Likvidní chromatografické oddělování s vysokým rozlišením (LC-HRMS).
- Režimy MS/MS, Data Dependent Acquisition (DDA) a in-source IE-DDA.
Hlavní výsledky a diskuse
- Z původních 112 detekovaných PFAS po blank filtraci zůstalo 18 sloučenin.
- FluoroMatch identifikoval 13 PFAS, které unikly cílenému QqQ screeningovému přístupu.
- Predikce sumární formule dosáhla 34 % správných přiřazení na prvním místě a 66 % v top-10 návrzích.
- Při hledání homologních řad byla úspěšnost 100 % díky využití nejběžnějších CF2 motivů.
- Interaktivní vizualizace (Kendrickovy hmotnostní defekty, chromatogramy, tabulky kandidátů) usnadňuje ověření a sdílení výsledků.
Přínosy a praktické využití metody
Automatizovaný workflow zvyšuje rychlost a konzistenci necílených analýz PFAS. Predikce sumární formule poskytuje dodatečnou vrstvu důvěry pro slabé signály či sloučeniny bez kvalitního MS/MS. Interaktivní grafické prostředí usnadňuje interpretaci rozsáhlých dat a spolupráci mezi laboratořemi.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření algoritmů na další perzistentní organické znečišťující látky.
- Integrace s umělou inteligencí pro pokročilou klasifikaci struktur.
- Validace workflow v různých maticích (voda, půda, biota) a multi-laboratorní studie.
Závěr
FluoroMatch Flow nabízí komplexní a automatizovaný přístup k necílené analýze PFAS s vysokou spolehlivostí včetně predikce sumární formule. Metoda poskytuje širší pokrytí neznámých látek, zvyšuje důvěru při identifikaci a přispívá k rychlejšímu risk assessmentu PFAS v reálných vzorcích.
Reference
- Lin EZ, Koelmel J, Rennie EE, et al. DOI: 10.1007/s00216-021-03392-7
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
De Novo PFAS Annotation and Classification Using Highly Accurate Formula Prediction and Kaufmann Algorithms Embedded in FluoroMatchSuite
2025|Agilent Technologies|Postery
Poster Reprint ASMS 2025 Poster number WP 113 De Novo PFAS Annotation and Classification Using Highly Accurate Formula Prediction and Kaufmann Algorithms Embedded in FluoroMatch Suite Jeremy Koelmel1; Michael Kummer2; David Schiessel2; Olivier Chevallier3; David Godri4; Christian Klein3; Emma E…
Klíčová slova
homologous, homologousvoting, votingfalse, falseformula, formulanist, nistseries, seriesprediction, predictionkaufmann, kaufmannannotation, annotationfluoromatch, fluoromatchvisualizations, visualizationsabc, abcrate, ratepicking, pickingfeatures
Non-Target PFAS Analysis in Dried Blood Spots Using the Agilent 6546 LC/Q-TOF with Profinder and FluoroMatch
2024|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note PFAS Non-Target PFAS Analysis in Dried Blood Spots Using the Agilent 6546 LC/Q-TOF with Profinder and FluoroMatch Authors Jeremy Koelmel, Elizabeth Lin, Paul Stelben, and Krystal Pollitt Yale University Emily Parry, Emma Rennie, and James Pyke Agilent Technologies,…
Klíčová slova
fluoromatch, fluoromatchpfas, pfasperfluoro, perfluoroprofinder, profindermodular, modulardried, driedseries, seriesblood, bloodfalse, falsespot, spotperfluoroalkyl, perfluoroalkylsulfonic, sulfonicacid, acidacids, acidssuite
FluoroMatch 3.0 – Automated PFAS Non-Targeted Analysis and Visualizations Applied to Mammalian Biofluids
2023|Agilent Technologies|Postery
FluoroMatch 3.0 – Automated PFAS Non-Targeted Analysis and Visualizations Applied to Mammalian Biofluids Michael Kummer1; Nandarani Abril1; Emily Parry2; Sheng Liu3; Carrie A McDonough4; David Dukes5; David Godri6; Elizabeth Z. Lin3; Emma E Rennie2; Jeremy Koelmel3; Krystal J Godri Pollitt3…
Klíčová slova
fluoromatch, fluoromatchlibraries, librariesbiotransformation, biotransformationpicking, pickingdda, ddavisualizations, visualizationsworkflow, workflowbiotransformed, biotransformedmzannotation, mzannotationuncommonly, uncommonlypfas, pfashrms, hrmscomptox, comptoxmzmine, mzmineblood
Non-targeted analysis, interactive visualization, and online sharing of interactive LC-HRMS/MS data of polymers using a comprehensive software PolyMatch Suite
2024|Agilent Technologies|Postery
Non-targeted analysis, interactive visualization, and online sharing of interactive LC-HRMS/MS data of polymers using a comprehensive software PolyMatch Suite Introduction Jeremy Koelmel [1]; David A Weil [2]; Emma E. Rennie* [2]; Paul Stelben [1]; Nicholas Oranzi [3]; Michael Kummer [4];…
Klíčová slova
polymatch, polymatchdda, ddaabc, abchrms, hrmslibraries, librariespicking, pickingannotations, annotationsdata, datainteractive, interactiveweblink, weblinkannotation, annotationexist, existevidence, evidenceplots, plotsown