Build Consistency into Your Lab’s Workflow

Význam tématu

Automatizovaná elektroforéza se stala nedílnou součástí moderních molekulárně biologických a biofarmaceutických laboratoří. Spolehlivá a objektivní kontrola kvality nukleových kyselin a proteinů podporuje reprodukovatelnost experimentů, zrychluje vývoj metod, zajišťuje bezchybnost diagnostických a výzkumných aplikací a optimalizuje náklady na analýzu vzorků.

Cíle a přehled studie / článku

Dokument představuje portfolio automatizovaných elektroforézních systémů Agilent, jejich spotřební materiál, softwarové nástroje a servisní služby. Cílem je ukázat, jak lze díky těmto řešením nastavit harmonizovaný pracovní postup pro hodnocení integrity, koncentrace a velikosti fragmentů DNA, RNA a proteinů napříč různými typy vzorků a požadavky na propustnost vzorků.

Použitá metodika a instrumentace

Portfolio zahrnuje:

• TapeStation Systems (4150, 4200) pro rychlou analýzu DNA a RNA pomocí ScreenTape.
• Fragment Analyzer Systems (5200, 5300, 5400) a Femto Pulse System pro detailní fragmentovací analýzu nukleových kyselin.
• ProteoAnalyzer System pro kvantitativní a kvalitativní analýzu proteinových vzorků bez potřeby SDS-PAGE gelů.
• ZAG DNA Analyzer System pro kapilární elektroforézu dsDNA.
• Oligo Pro II System pro vysokorozlišovací hodnocení čistoty oligonukleotidů.

Dále jsou k dispozici specifické kity a reagencie optimalizované pro každou aplikaci a intuitivní software pro ovládání přístrojů a zpracování dat.

Hlavní výsledky a diskuse

Nasazení automatizované elektroforézy přináší objektivní metriky integrity a koncentrace:

• RNA: RINe a RQN pro hodnocení celistvosti.
• FFPE RNA: DV200 pro odhad podílu dlouhých fragmentů.
• gDNA/FFPE DNA: DIN a GQN pro kvalitativní skóre DNA.
• cfDNA: procentuální podíl cfDNA ve vzorku.

Flexibilita systému umožňuje přizpůsobit propustnost (ultra-nízká až ultra-vysoká) a typ analýzy podle potřeb laboratoře. Diskutována je rovněž úspora času díky walk-away provozu a minimalizaci manipulace se vzorkem.

Přínosy a praktické využití metody

Automatizované elektroforézní systémy zlepšují validitu a reprodukovatelnost QC procesů, zkracují dobu analýzy, snižují riziko chyb lidského faktoru a umožňují lepší kontrolu nákladů. Vhodné jsou pro nároční NGS workflow, diagnostické laboratoře, vývoj vakcín a QA/QC v biotechnologickém průmyslu.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se další integrace s laboratorními informačními systémy, rozšíření aplikací o multi-omic analýzy, zvýšení automatizace ve vzorkovací přípravě a využití umělé inteligence pro pokročilou interpretaci elektroforetických dat. Roste poptávka po vyšší propustnosti a online monitoringu kvality vzorků v reálném čase.

Závěr

Agilent portfolio automatizovaných elektroforézních systémů nabízí komplexní řešení pro robustní a objektivní hodnocení kvality nukleových kyselin a proteinů. Díky široké škále instrumentace, kitů, softwaru a služeb mohou laboratoře standardizovat své workflow, zvyšovat efektivitu a zajistit vysokou kvalitu výsledků.

Reference

Nejsou uvedeny.