Improving the annotation of bile acids in fecal samples using a Liquid Chromatography-Ion Mobility-High Resolution Mass Spectrometry method
Postery | 2023 | Bruker | ASMSInstrumentace
Žlučové kyseliny jsou klíčovými metabolity odvozenými od cholesterolu a podílejí se na trávení tuků, regulaci metabolismu i patofyziologii onemocnění, jako je diabetes či rakovina tlustého střeva. Jejich přesná identifikace a kvantifikace v komplexních biologických vzorcích představuje analytickou výzvu z důvodu jejich podobné struktury, izobarických a izomerických forem.
Práce představuje vývoj a optimalizaci čtyřrozměrné chromatograficko-hmotnostní metody (UHPLC-TIMS-HRMS) pro zvýšení spolehlivosti anotace 32 žlučových kyselin ve vzorcích stolice a séra. Studie se skládá ze dvou částí:
Vzorky byly extrahovány směsí H2O:isopropanol:acetonitril (2:1:1, v/v/v) a do roamingu vstupovaly lyofilizované a vodné extrakty stolice a sérová plazma. Chromatografie probíhala na kolonce Waters Acquity BEH C8 (100×2,1 mm, 1,7 µm) s gradientní elucí dle upraveného protokolu Sarafian et al. (solvent A: acetonitril:H2O 10:90 + 10 mM formiátu, pH 4,2; B: acetonitril:2-propanol 50:50).
Metoda umožnila separaci většiny analyzovaných žlučových kyselin i izobarických párů díky synergii LC a iontové mobility (TIMS). Pro 32 standardních kyselin byly stanoveny experimentální m/z, retenční časy a CCS hodnoty s RSD <0,3 %. Při aplikaci na biologické vzorky bylo v aquefikovaném a lyofilizovaném materiálu detekováno 12 až 14 kyselin, v séru 7 kyselin. Srovnání CCS hodnot s databází DTCCS Compendium i měřeními v nezávislých laboratořích prokázalo shodu v rámci ±1,7 % a reprodukovatelnost mezi pracovišti.
Nově vyvinutá UHPLC-TIMS-HRMS metoda zvyšuje jistotu anotace žlučových kyselin v komplexních matricích, poskytuje orthogonální rozlišení izomerů a umožňuje robustní mezi-laboratorní srovnání. Metoda je vhodná pro metabolomické studie, klinickou diagnostiku i farmakokinetické profily žlučových kyselin.
Prezentovaná metoda UHPLC-TIMS-HRMS pro analýzu žlučových kyselin ve stolici a séru přináší vyšší specifičnost, reprodukovatelnost a možnost mezi-laboratorního srovnání. Tím se otevírá nový prostor pro spolehlivé profilování těchto biomarkerů v různých oblastech biomedicínského výzkumu.
Iontová mobilita, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceBruker
Souhrn
Význam tématu
Žlučové kyseliny jsou klíčovými metabolity odvozenými od cholesterolu a podílejí se na trávení tuků, regulaci metabolismu i patofyziologii onemocnění, jako je diabetes či rakovina tlustého střeva. Jejich přesná identifikace a kvantifikace v komplexních biologických vzorcích představuje analytickou výzvu z důvodu jejich podobné struktury, izobarických a izomerických forem.
Cíle a přehled studie
Práce představuje vývoj a optimalizaci čtyřrozměrné chromatograficko-hmotnostní metody (UHPLC-TIMS-HRMS) pro zvýšení spolehlivosti anotace 32 žlučových kyselin ve vzorcích stolice a séra. Studie se skládá ze dvou částí:
- Vývoj a validace analytické metody pro standardní směs 32 žlučových kyselin.
- Aplikace metody na profilování žlučových kyselin v lyofilizované stolici, vodných extraktech stolice a lidském séru.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky byly extrahovány směsí H2O:isopropanol:acetonitril (2:1:1, v/v/v) a do roamingu vstupovaly lyofilizované a vodné extrakty stolice a sérová plazma. Chromatografie probíhala na kolonce Waters Acquity BEH C8 (100×2,1 mm, 1,7 µm) s gradientní elucí dle upraveného protokolu Sarafian et al. (solvent A: acetonitril:H2O 10:90 + 10 mM formiátu, pH 4,2; B: acetonitril:2-propanol 50:50).
Použitá instrumentace
- TIMS-TOF (Bruker Daltonics) s ESI zdrojem pro negativní ionizaci.
- Software: Compass HyStar v6.0, Compass Data Analysis v5.3, MetaboScape® v6.0.2.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila separaci většiny analyzovaných žlučových kyselin i izobarických párů díky synergii LC a iontové mobility (TIMS). Pro 32 standardních kyselin byly stanoveny experimentální m/z, retenční časy a CCS hodnoty s RSD <0,3 %. Při aplikaci na biologické vzorky bylo v aquefikovaném a lyofilizovaném materiálu detekováno 12 až 14 kyselin, v séru 7 kyselin. Srovnání CCS hodnot s databází DTCCS Compendium i měřeními v nezávislých laboratořích prokázalo shodu v rámci ±1,7 % a reprodukovatelnost mezi pracovišti.
Přínosy a praktické využití metody
Nově vyvinutá UHPLC-TIMS-HRMS metoda zvyšuje jistotu anotace žlučových kyselin v komplexních matricích, poskytuje orthogonální rozlišení izomerů a umožňuje robustní mezi-laboratorní srovnání. Metoda je vhodná pro metabolomické studie, klinickou diagnostiku i farmakokinetické profily žlučových kyselin.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace s kvantifikací pomocí internal standardů pro absolutní koncentrace.
- Rozšíření knihovny CCS hodnot o další metabolity a steroidy.
- Automatizace zpracování dat v softwarových platformách s podporou umělé inteligence.
- Využití TIMS-HRMS v klinických studiích pro monitoring terapie onemocnění trávicího traktu.
Závěr
Prezentovaná metoda UHPLC-TIMS-HRMS pro analýzu žlučových kyselin ve stolici a séru přináší vyšší specifičnost, reprodukovatelnost a možnost mezi-laboratorního srovnání. Tím se otevírá nový prostor pro spolehlivé profilování těchto biomarkerů v různých oblastech biomedicínského výzkumu.
Reference
- 10.1007/s00216-019-01869-0
- 10.1021/jasms.0c00015
- 10.1194/jlr.R001941-JLR200
- 10.1021/acs.analchem.5b01556
- 10.1039/c8sc04396e
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS
2023|Bruker|Postery
ASMS 2023, THP 385 Profiling and quantitation of bile acids in human biofluids by LC-TIMS-MS Results Aiko Barsch1; Surendar Tadi², Xuejun Peng³, Narayanaganesh Balasubramanian², Elena Checkmeneva4, Katie E. Chappell4, Niels Goedecke1, Matthew R. Lewis1 1Bruker Daltonics GmbH & Co. KG,…
Klíčová slova
acid, acidtims, timsbile, bilemetaboscape, metaboscapeglycocholic, glycocholicallolithocholic, allolithocholicccs, ccsannotated, annotatedglycoursodeoxycholic, glycoursodeoxycholiclithocholic, lithocholicglycodeoxycholic, glycodeoxycholictaurocholic, taurocholicprofiling, profilingannotation, annotationreference
Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples
2025|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Life Science Research Deciphering the Microbiome: Targeted LC/MS/MS Analysis of Bile Acids in Biological Samples Authors Abstract Pietro Morlacchi Agilent Technologies, Inc. Bile acids (BAs) are crucial molecules involved in the digestion and absorption of dietary lipids and…
Klíčová slova
avanti, avantiacid, acidisosciences, isosciencesmca, mcabile, bilelca, lcamuricholic, muricholicresponses, responsesyes, yessulfate, sulfaterelative, relativecdca, cdcalinear, linearcayman, caymanbas
A novel fast and simple quantification method for bile acids in human serum by LC-MS/MS
2017|Shimadzu|Postery
PO-CON1781E A novel fast and simple quantification method for bile acids in human serum by LC-MS/MS MSACL 2017 Aurore JAFFUEl, Sara SAMBISSA, Alban HUTEAU, SHIMADZU France, le Luzard 2, Bd Allende, 77186 Noisiel, FRANCE. A novel fast and simple quantification…
Klíčová slova
acid, acidbile, bileserum, serummuricholic, muricholictaurohyocholic, taurohyocholicnovel, novelquantification, quantificationglycohyodeoxycholic, glycohyodeoxycholicacids, acidshuman, humanbas, bassimple, simplefast, fastenterohepatic, enterohepatictauroalphamuricholic
A Refined LC/MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome
2023|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Metabolomics A Refined LC/MS/MS Method Targeting Bile Acids from the Gut Microbiome Authors Introduction Mark Sartain Agilent Technologies, Inc. Santa Clara, California, USA Secondary bile acids are the most abundant and variable microbiota-derived metabolites shown to affect host…
Klíčová slova
bile, bilepos, posacid, acidmuricholic, muricholicmrm, mrmconjugated, conjugatedmca, mcasecondary, secondaryprimary, primarycarboxymethyl, carboxymethylamide, amidebeta, betaalpha, alphatauro, tauroghdca