Compound Discoverer 1.0 Data Review Quick Start

Význam tématu

Ucelená a interaktivní revize hmotnostních chromatogramů a spekter je klíčová pro spolehlivou identifikaci sloučenin a metabolitů, zajištění kvality dat a podporu rozhodování ve farmaceutickém, environmentálním či potravinářském výzkumu.

Cíle a přehled článku

Tento rychlý úvod popisuje postupy pro otevření a prohlížení výsledkových souborů Compound Discoverer™ 1.0 (.cdResult) bez nutnosti aktivní licence. Obsahuje popis práce s grafickými okny (Chromatogram View, Mass Spectrum View), přehled hlavních tabulek, nastavení vlastních vysvětlení (Custom Explanations) a výpočet FISh Coverage Score pro vyhodnocení fragmentačních dat.

Použitá metodika a instrumentace

Průběh analýzy je realizován softwarem Thermo Fisher Scientific Compound Discoverer 1.0 pracujícím s následujícími výpočetními uzly:

• Unknown Detector a Expected Finder – detekce a přiřazení iontů
• Peak Consolidator – konsolidace chromatografických stop
• Pattern Tracer, Analog Tracer, FISh Tracer – generování specifických stop (XIC, BPC, TIC, UV-Vis/PDA, DDF/AIF)
• FISh Scoring – hodnocení pokrytí fragmentačních dat

Instrumentace zahrnuje hmotnostní spektrometr Thermo Scientific s možností DDA (DDF/AIF) a doplňkové detektory UV-Vis či PDA.

Hlavní výsledky a diskuse

Revizní prostředí nabízí tři hlavní pohledy: Chromatogram View, Mass Spectrum View a sadu až deseti master tabulek (Consolidated Peaks, Expected/Unknown Compound Hits, Specialized Traces, FISh Trace Fragments atd.). Uživatel může:

• integrovat chromatografické špičky ručně nebo automaticky
• overlay chromatogramy a vytvářet mirror ploty
• prohlížet fragmentační spektra s barevným kódováním centriodů a predikovaných fragmentů
• nastavovat a ukládat datové filtry pro opakované použití
• přiřazovat vlastní strukturální vysvětlení a znovu spouštět FISh scoring

Tímto způsobem lze detailně vyhodnotit shodu isotopového vzoru, iontové konflikty a přítomnost signálů v kontrolních vzorcích.

Přínosy a praktické využití metody

Tento postup zrychluje a zkvalitňuje revizi LC-MS dat díky jednotnému rozhraní pro chromatogramy i spektra a pokročilým nástrojům pro analýzu fragmentací. Výhody:

• Rychlá identifikace a potvrzení známých i neznámých sloučenin
• Transparentní řízení kvality dat a detekce iontových konfliktů
• Možnost integrace vlastních struktur a opakovaného skórování fragmentů

Uplatnění nachází v metabolitových studiích, paliativní analýze neznámých látek a QA/QC kontrolách.

Budoucí trendy a možnosti využití

Vývoj se bude soustředit na integraci umělé inteligence a strojového učení pro automatickou anotaci fragmentačních dat, propojení s cloudovými spektrálními knihovnami a rozšíření podpory vícenásobné fragmentace (MSn). Otevřená rozhraní API umožní pokročilé vizualizace a customizované reporty pro specifické laboratorní workflow.

Závěr

Compound Discoverer 1.0 poskytuje robustní a přehlednou platformu pro komplexní revizi LC-MS dat. Popisované nástroje a postupy usnadňují integraci chromatografických špiček, interpretaci spekter a podrobnou kontrolu kvality výsledků.

Reference

• Compound Discoverer 1.0 Data Review Quick Start; Thermo Fisher Scientific Inc., P/N XCALI-97708, revize A, 2014.