MassHunter Mass Profiler Software - Quick Start Guide

Význam tématu

Analytické porovnání hmotnostních dat získaných z LC/MS, GC/MS či LC/IM-MS experimentů je klíčové pro detekci rozdílů mezi vzorky, objev biomarkerů nebo sledování kvality surovin a produktů. Agilent MassHunter Mass Profiler nabízí integrované řešení pro extrakci, zarovnání a statistické vyhodnocení molekulárních rysů („features“) až po jejich identifikaci a export pro další analýzu.

Cíle a přehled studie / článku

Hlavním cílem této příručky je představit rychlý návod k instalaci, základnímu používání a hlavním funkcím softwaru Mass Profiler B.08.00. Text provází uživatele od založení projektu přes extrakci a porovnání rysů dvou vzorků či skupin až po identifikaci sloučenin a export dat pro pokročilé statistické nebo cílené MS/MS analýzy.

Použitá metodika a instrumentace

Software využívá dvě klíčové metody extrakce rysů:

• MFE (Molecular Feature Extraction) pro LC/MS a GC/MS data – kombinuje izotopy a adukty do jednoho rysu.
• IMFE (Ion Mobility Feature Extraction) pro LC/IM-MS – rysy jsou založeny na izotopických klastrech zachovávajících rozdílné drift times aduktů.

Zarovnání mezi soubory probíhá podle m/z, retenčního času a drift time. Statistické algoritmy zahrnují Studentův t-test a PCA (Principal Component Analysis). Identifikace rysů probíhá přes MassHunter ID Browser (molekulární formule, přesná hmotnost, vlastní databáze). Výstupy lze exportovat ve formátech CEF, CSV, TXT nebo XLS pro další zpracování (Mass Profiler Professional, MPP nebo jiné nástroje).

Hlavní výsledky a diskuse

V B.08.00 verzi byly zavedeny následující zlepšení:

• Volba zobrazení pouze identifikovaných rysů a filtrování podle odezvy nabízejí přehlednější výstupy.
• Rozšířená podpora EI-GC/MS i IM-data (export drift times a CCS hodnot).
• Kalibrace kvality extrakčního algoritmu IMFE dle standardů MFE.
• Zlepšené seskupování izotopů a separace aduktů při IM-analýze.
• Možnost exportu samostatných CEF souborů pro každý vzorek nebo souhrnné výstupy s abundancemi v jednotlivých vzorcích.

Grafické prostředí nabízí interaktivní Feature Table, Feature Plot a Feature Details, které usnadňují průzkum rysů, identifikaci odlehlých hodnot a vizualizaci rozdílů mezi skupinami.

Přínosy a praktické využití metody

Mass Profiler podporuje široké aplikační oblasti:

• Metabolomika, biomarkerová discovery, farmaceutická analýza nečistot
• Forenzní a environmentální monitoring, analýza pesticidů
• Klasifikace vzorků párovou PCA, vytváření cílených MS/MS inkluzních listů
• Integrace do workflow Agilent (Qualitative Analysis, Profinder, MPP)

Nástroj minimalizuje falešné pozitivy a negativy, zrychluje porovnání velkých datových sad a usnadňuje export do dalších chemometrických softwarů.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekávané směry vývoje:

• Pokročilé strojové učení a umělá inteligence pro automatické rozpoznávání rysů a přediktivní modelování
• Cloudové a distribuované výpočty pro zpracování velmi rozsáhlých datových sad
• Rozšíření databází pro přesnější hmotnostní a aduktové identifikace
• Vylepšená integrace s dalšími instrumenty (iontová past, FT-MS) a multi-omics analýzy
• Online vizualizace v reálném čase a automatizované reporty kvality

Závěr

Agilent MassHunter Mass Profiler B.08.00 představuje komplexní a intuitivní nástroj pro extrakci, zarovnání, vizualizaci a statistické vyhodnocení hmotnostních dat z LC/MS, GC/MS a LC/IM-MS. Díky širokým možnostem exportu a integraci s dalšími aplikacemi výrazně zkracuje dobu analýzy a zvyšuje spolehlivost výsledků.

Reference

• Agilent G3297AA MassHunter Mass Profiler Software – Quick Start Guide, Revision B.08.00
• MassHunter Mass Profiler Familiarization Guide
• Agilent MassHunter ID Browser User Manual