LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Label-Free Analysis by HPLC with Charged Aerosol Detection of Glycans Separated by Charge, Size and Isomeric Structure

Postery | 2016 | Thermo Fisher Scientific | PittconInstrumentace
HPLC
Zaměření
Proteomika
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Souhrn

Význam tématu


N-glykanové struktury u glykoproteinů hrají klíčovou roli v jejich biologické aktivitě a mohou sloužit jako biomarkery onemocnění nebo ovlivňovat účinnost bioterapeutik. Precizní a rychlá analýza glykanového profilu je proto zásadní pro výzkum i rutinní kontrolu kvality biopharmaceutik.

Cíle a přehled studie


Cílem bylo vyvinout jednoduchou a rychlou metodu kvantitativního profilování N-glykanů bez nutnosti chemického značení. Metoda kombinuje enzymatické uvolnění glykanů (PNGase-F) s mixed-mode UHPLC separací a přímou detekcí nabitými aerosolovými částicemi (CAD), přičemž je zachována kompatibilita s hmotovou spektrometrií pro další šetrnou charakterizaci.

Použitá metodika a instrumentace


UHPLC separace:
  • Zařízení: Thermo Scientific Vanquish UHPLC s Charged Aerosol Detector H
  • Kolóna: GlycanPac AXR-1 (1,9 µm, 2,1 × 100 mm), teplota 30 °C
  • Mobilní fáze A: voda; B: 100 mM amonný formiát pH 4,4; průtok 0,4 mL/min; gradient 4→39 % B (1 mM/min)
  • Injekce 2 µL; odpařovací teplota CAD 50 °C; datová frekvence 10 Hz; filtr 5 s
Enzymatická příprava:
  • PNGase-F digest s QA-Bio deglykozylací sadou
  • Denaturace 100 °C, inkubace 18 h při 37 °C
  • Odsátí supernatantu a přímá injekce do UHPLC

Hlavní výsledky a diskuse


  • Optimální gradientní sklon 1 mM/min poskytuje nejlepší rozlišení
  • Zařazení 5 % organického rozpouštědla mírně zlepšilo S/N, nebylo však nezbytné
  • Evaporační teplota 50 °C je kompromisem mezi citlivostí a stabilitou signálu
  • Detekční limity pod 10 ng/µL (0,6–8,8 pmol/µL); dynamický rozsah > 100×
  • Retenční časy RSD < 0,1 %; plocha špiček RSD < 3 %
  • Přímá detekce glykanů z fetuinu a alfa-kyselého glykoproteinu bez interference reagencií

Přínosy a praktické využití metody


  • Eliminace časově náročného značení šetří náklady i čas
  • Vysoká citlivost a linearita vyhovují potřebám QC laboratoří
  • Kompatibilita s MS umožňuje multifázovou analýzu ze stejného vzorku
  • Univerzální detekční princip pro všechny nevolatilní analyty

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Integrace UHPLC-CAD s high-resolution MS pro detailní strukturální analýzu
  • Automatizace vzorkování a vysokopropustné platformy pro vysoce efektivní screening
  • Rozšíření aplikací na široké spektrum glykoproteinů v biomedicíně a regulované výrobě
  • Využití strojového učení pro rychlé vyhodnocování glykanových profilů

Závěr


Vyvinutá label-free UHPLC-CAD metoda je robustní, přesná a rychlá. Nabízí uniformní odezvu, vysokou citlivost a přesnost retence i plochy špiček, ideální pro QC bioterapeutik i výzkumné účely. Eliminace derivatizace zjednodušuje workflow a zachovává kompatibilitu s dalšími analytickými technikami.

Reference


  1. Varki A Biological Roles of Oligosaccharides All of the Theories Are Correct Glycobiology 1993 3 97-130
  2. Spencer D Freeke J Barattini V A HILIC Method for the Analysis of Bovine Fetuin Glycans Thermo Scientific Application Note 2072 2013
  3. Hurum D Basumallick L Rohrer J Evaluating protein glycosylation in limited-quantity samples by HPAE-PAD Thermo Scientific Application Note 1050 2013
  4. Udayanath A Saba J Viner R Liu X Rao S Agroskin Y Huhmer A Pohl C Integrated LC/MS Workflow for the Analysis of Labeled and Native N-Glycans from Proteins Using a Novel Mixed-Mode Column and a Q Exactive Mass Spectrometer Thermo Scientific Application Note 595 2014
  5. Aich U Saba J Liu X Thayer J Pohl C Separation of 2AB-labeled N-linked glycans from bovine fetuin on a novel ultra-high resolution mixed-mode column Thermo Scientific Application Note 20908 2014

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Label-Free Analysis by UHPLC with Charged Aerosol Detection of Glycans Separated by Charge, Size, and Isomeric Structure
Dave Thomas and Ian Acworth Thermo Fisher Scientific, Chelmsford, MA Ap plica t ion Note 1 1 27 Label-Free Analysis by UHPLC with Charged Aerosol Detection of Glycans Separated by Charge, Size, and Isomeric Structure Key Words Glycan Quantitation, Glycan…
Klíčová slova
glycans, glycansglycan, glycanfetuin, fetuinoligostandard, oligostandardnative, nativealditols, alditolsseparated, separatedaerosol, aerosolbovine, bovinepngase, pngaseprotein, proteincharged, chargeduhplc, uhplcdisialylated, disialylatedlabeling
Label-Free Profiling of O-linked Glycans by HPLC with Charged Aerosol Detection
O-linked glycans are released from proteins by reductive β-elimination. The released glycans are separated by ultra high performance liquid chromatography (UHPLC) on a new UHPLC platform that integrates the charged aerosol detector into the system for increased performance and ease…
Klíčová slova
linked, linkedglycans, glycansaerosol, aerosolcharged, chargedglycan, glycanreleased, releasedreductive, reductiveglycanpac, glycanpacpools, poolsdetection, detectionµlµl, µlµlfigure, figureseparated, separateduhplc, uhplcscientific
Improved profiling of sialylated N-linked glycans by ion chromatography-Orbitrap mass spectrometry
APPLICATION NOTE 73063 Improved profiling of sialylated N-linked glycans by ion chromatography-Orbitrap mass spectrometry Authors Sachin Patil and Jeff Rohrer Thermo Fisher Scientific, Sunnyvale, CA Keywords HPAE-PAD, glycoprotein, sialylated glycans, Q Exactive, HPAE-MS, HRAM, CarboPac PA200 column Goal To describe…
Klíčová slova
glycan, glycanglycans, glycanshpae, hpaexcalibur, xcaliburpad, padsialylated, sialylatedthermo, thermoorbitrap, orbitrapscientific, scientificelution, elutionresolution, resolutionlinked, linkedconditions, conditionsexactive, exactivesodium
Charge Profiling of 2AB-labelled N-linked Glycans
Charge Profiling of 2AB-labelled N-linked Glycans
2016|Agilent Technologies|Aplikace
Charge Profiling of 2AB-labelled N-linked Glycans The Agilent 1260 Infinity Bio-inert Quaternary LC with Fluorescence Detection Application Note Biologics and Biosimilars Author Abstract Sonja Schneider Agilent Technologies, Inc. Waldbronn, Germany This Application Note describes the analysis of charged N-linked glycans…
Klíčová slova
glycans, glycansprofile, profilesialylated, sialylatedsialic, sialicglycan, glycanbio, bioinert, inertcharge, chargeglycolylneuraminic, glycolylneuraminicacid, acidattached, attachedfive, fivefetuin, fetuinzero, zeromonosaccharide
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.