EVALUATION OF AQUEOUS-ACETONITRILE BASED MOBILE PHASE FOR UNTARGETED ANALYSIS OF POLAR METABOLOME AND LIPIDOME
Postery | 2023 | Waters | ASMSInstrumentace
Komplexní analýza lipidomu a metabolomu z biologických vzorků je zásadní pro pochopení biochemických procesů v buňkách a tkáních. Odlišné chemické vlastnosti lipidů a polárních metabolitů vyžadují optimalizované chromatografické podmínky. Vývoj univerzální mobilní fáze na bázi vody a acetonitrilu zjednodušuje workflow, snižuje spotřebu rozpouštědel a zkracuje dobu analýzy.
Cílem studie bylo navrhnout jednu generickou mobilní fázi na bázi vody a acetonitrilu, kterou lze použít pro nekcílovou LC-MS analýzu lipidů i polárních metabolitů z biofluidů. Autoři porovnali nově navržený ACN/water mobilní fázi se zlatým standardem na bázi isopropylalkoholu (IPA) a otestovali různé chromatografické kolonky (CSH Phenyl-Hexyl, CSH C18, CORTECS C8, BEH Amide).
Vzorky plazmy byly připraveny srážením proteinů pomocí předchlazeného IPA (ratio 1:4), centrifugovány při 10 300 g a 4 °C, supernatant ředěn IPA/ACN (50/50) a importován do UPLC vialek.
Chromatografie probíhala na systému ACQUITY Premier UPLC s těmito kolonkami:
Detekce byla prováděna na hmotnostním spektrometru SYNAPT XS (TOF MS, ES+ a ES-).
Studie prokázala, že mobilní fáze na bázi vody a acetonitrilu s vhodnou kolonkou dokáže efektivně oddělit jak lipidy, tak polární metabolity. Nejlepší výsledky přinesla CSH Phenyl-Hexyl kolona při 70 °C. Metoda nabízí vysokou reproductibilitu, nízké carry-over a značné úspory v rutině laboratorních analýz.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika, Lipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Komplexní analýza lipidomu a metabolomu z biologických vzorků je zásadní pro pochopení biochemických procesů v buňkách a tkáních. Odlišné chemické vlastnosti lipidů a polárních metabolitů vyžadují optimalizované chromatografické podmínky. Vývoj univerzální mobilní fáze na bázi vody a acetonitrilu zjednodušuje workflow, snižuje spotřebu rozpouštědel a zkracuje dobu analýzy.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo navrhnout jednu generickou mobilní fázi na bázi vody a acetonitrilu, kterou lze použít pro nekcílovou LC-MS analýzu lipidů i polárních metabolitů z biofluidů. Autoři porovnali nově navržený ACN/water mobilní fázi se zlatým standardem na bázi isopropylalkoholu (IPA) a otestovali různé chromatografické kolonky (CSH Phenyl-Hexyl, CSH C18, CORTECS C8, BEH Amide).
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky plazmy byly připraveny srážením proteinů pomocí předchlazeného IPA (ratio 1:4), centrifugovány při 10 300 g a 4 °C, supernatant ředěn IPA/ACN (50/50) a importován do UPLC vialek.
Chromatografie probíhala na systému ACQUITY Premier UPLC s těmito kolonkami:
- CSH Phenyl-Hexyl (2,1×150 mm, 1,7 µm) při 70 °C, průtok 0,6 mL/min
- CSH C18 (2,1×100 mm, 1,7 µm) při 55 °C, průtok 0,4 mL/min
- CORTECS C8 (2,1×100 mm, 2,7 µm) při 40 °C, průtok 0,6 mL/min
- BEH Amide (2,1×100 mm, 1,7 µm) pro HILIC analýzu při 40 °C, průtok 0,6 mL/min
Detekce byla prováděna na hmotnostním spektrometru SYNAPT XS (TOF MS, ES+ a ES-).
Hlavní výsledky a diskuse
- Univerzální ACN/water mobilní fáze umožnila bezproblémové přepínání mezi lipidomy a metabolomy pouze výměnou kolonky.
- CSH Phenyl-Hexyl kolona (2,1×150 mm) zajistila kompletní eluování neutrálních lipidů (triacylglyceroly, cholesterolestery) během 10 min s výborným rozlišením.
- Hydrofobnější fáze CSH C18 a CORTECS C8 vykazovaly neúplné eluování neutrálních lipidů s ACN/water MP.
- Polární metabolity analyzované na BEH Amide koloně vykázaly srovnatelnou účinnost separace v obou ionizačních režimech.
- Žádné významné carry-over lipidů nebylo pozorováno ani při blank injekci.
Přínosy a praktické využití metody
- Jedna mobilní fáze pro lipidomiku i metabolomiku šetří čas i finanční prostředky.
- Jednodušší správa a příprava rozpouštědel v laboratoři.
- Flexibilní přechod mezi analytickými režimy bez změny solventní sady.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Adaptace metody na další biologické matrice (moč, tkáně, cerebrospinální mok).
- Automatizované platformy pro vysokopropustné zpracování vzorků.
- Vývoj cílených stacionárních fází pro specifické třídy látek.
- Integrace LC-MS dat s pokročilými algoritmy strojového učení pro hlubší biologické interpretace.
Závěr
Studie prokázala, že mobilní fáze na bázi vody a acetonitrilu s vhodnou kolonkou dokáže efektivně oddělit jak lipidy, tak polární metabolity. Nejlepší výsledky přinesla CSH Phenyl-Hexyl kolona při 70 °C. Metoda nabízí vysokou reproductibilitu, nízké carry-over a značné úspory v rutině laboratorních analýz.
Reference
- Isaac G., Munjoma N., Gethings L.A., Mullin L., Plumb R.S. A Robust and Reproducible Reversed-Phase Lipid Profiling Method for Large Sample Sets. Waters Application Note 720006959en; červenec 2020.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Application of UPC2 in Extractables Analysis
2012|Waters|Aplikace
Application of UPC 2 in Extractables Analysis v Baiba Cabovska, Michael D. Jones, and Andrew Aubin Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT I O N B E N E F I T S 2…
Klíčová slova
uvitex, uvitextic, ticminutes, minutestinuvin, tinuvinldpe, ldpeeva, evahdpe, hdpepolar, polarbht, bhtpvc, pvcrowave, rowavehdp, hdpacquity, acquityextractable, extractablesqd
ionkey/MS - APPLICATION COMPENDIUM
2016|Waters|Příručky
[ ion key / MS ] APPLICATION COMPENDIUM Dear Colleague, The 2014 introduction of the ionKey/MS System was a turning point for LC-MS. The promise of increased levels of sensitivity from smaller sample sizes was finally a reality. We were…
Klíčová slova
ionkey, ionkeyikey, ikeyuplc, uplcsystem, systemplasma, plasmasensitivity, sensitivityion, ionhuman, humanusing, usingmobility, mobilityarea, areaseparation, separationassay, assaydevice, devicequantification
Waters Application Notes - ProteinWorks
2016|Waters|Příručky
Waters Application Notes ProteinWorks OUR SCIENTISTS Erin E. Chambers As a principal scientist, Erin has been working almost exclusively on peptide and protein bioanalysis for the last seven years, while managing small and large molecule bioanalysis and clinical research applications…
Klíčová slova
proteinworks, proteinworksdigest, digestexpress, expressarea, areapeptide, peptidekit, kitgeneric, generictrastuzumab, trastuzumabplasma, plasmaftfsldtsk, ftfsldtskdigestion, digestionmurine, murineantibody, antibodyprotein, proteindstyslsstltlsk
PRACTICAL CONSIDERATIONS FOR PROTEIN BIOANALYSIS 
2015|Waters|Postery
PRACTICAL CONSIDERATIONS FOR PROTEIN BIOANALYSIS Mary E. Lame, Erin E. Chambers, Kelly Doering, and Russell Mortishire-Smith Waters Corporation This work aims to provide practical method development guidance and comparative data on the above topics for those endeavoring to develop LC/MS…
Klíčová slova
peptide, peptidepeptides, peptidesplasma, plasmaprotein, proteinarea, areageneric, genericalbumin, albuminhuman, humantype, typedigestion, digestionmean, meanantibody, antibodydilltqspailsvspger, dilltqspailsvspgersignature, signaturevvsvltvlhqdwlngk