IN SEARCH OF THE PERFECT NOTCH: A NOVEL APPROACH TO THE OPTIMIZATION OF DIPOLE EXCITATION WAVEFORMS IN QUADRUPOLE MASS FILTERS
Postery | 2023 | Waters | ASMSInstrumentace
Optimalizace selektivního potlačení vybrané m/z oblasti („notch“) v kvadrupólových hmotnostních filtrech umožňuje cílenou fragmentaci jednoho prekurzoru při zachování citlivosti a specificity v tandemové hmotnostní spektrometrii.
V praxi to otevírá možnosti pro paralelní analýzu více látek s minimálním navzájemným rušením a pro pokročilé režimy Data Independent Acquisition.
Cílem práce je navrhnout a ověřit novou metodu pro tvorbu ostrých notche pomocí superpozice N sinusových dipólových excitací s optimalizovanými amplitudami a fázemi.
Výsledný přístup využívá Markov Chain Monte Carlo (MCMC) s prvky simulovaného žíhání k nalezení mnoha ekvivalentních řešení pro požadovanou notch m/z oblast.
Modelování bylo provedeno v C++ na zjednodušeném 2D kvadrupólu (r₀=5,3 mm, délka 130 mm, RF 300 V při 830 kHz) s dipólovými excitacemi o proměnných parametrech.
Pro ověření výsledků byla použita SIMIONTM simulace, která zachycuje reálnější fyziku iontů.
Optimalizace pomocí MCMC vedla k vysoce kvalitním notch profilům v simulovaných datech i v SIMIONTM modelu, zejména pro m/z 200–400 Th.
Bylo prokázáno, že existuje mnoho parametrických konfigurací dosažitelné kvality a že výsledná vlna působí efektivní potlačení bez významných artefaktů.
Metoda umožňuje flexibilní návrh přenosových profilů, včetně více ostře ohraničených notch oblastí a variabilních regionů částečné propustnosti.
Potenciální aplikace zahrnují vylepšení citlivosti a specificity v režimech DIA i v selektivní fragmentaci prekurzorů.
Další práce by se mohla zaměřit na limity ostrosti hrany notch profilu, optimalizaci délky záznamu vlny a apodizaci začátku a konce vlny.
Možné je také zúžení parametrového prostoru fixací fází či amplitud nebo aplikace adaptivnějších algoritmů optimalizace.
Popsaná MCMC optimalizace dipólových excitací představuje univerzální nástroj pro tvorbu cílených přenosových profilů v kvadrupólových filtrech.
Simulace potvrdily shodu teoretického návrhu s chováním reálného systému a ukázaly vysokou variabilitu použitelných řešení.
LC/MS
ZaměřeníOstatní
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Optimalizace selektivního potlačení vybrané m/z oblasti („notch“) v kvadrupólových hmotnostních filtrech umožňuje cílenou fragmentaci jednoho prekurzoru při zachování citlivosti a specificity v tandemové hmotnostní spektrometrii.
V praxi to otevírá možnosti pro paralelní analýzu více látek s minimálním navzájemným rušením a pro pokročilé režimy Data Independent Acquisition.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem práce je navrhnout a ověřit novou metodu pro tvorbu ostrých notche pomocí superpozice N sinusových dipólových excitací s optimalizovanými amplitudami a fázemi.
Výsledný přístup využívá Markov Chain Monte Carlo (MCMC) s prvky simulovaného žíhání k nalezení mnoha ekvivalentních řešení pro požadovanou notch m/z oblast.
Použitá metodika a instrumentace
Modelování bylo provedeno v C++ na zjednodušeném 2D kvadrupólu (r₀=5,3 mm, délka 130 mm, RF 300 V při 830 kHz) s dipólovými excitacemi o proměnných parametrech.
Pro ověření výsledků byla použita SIMIONTM simulace, která zachycuje reálnější fyziku iontů.
Hlavní výsledky a diskuse
Optimalizace pomocí MCMC vedla k vysoce kvalitním notch profilům v simulovaných datech i v SIMIONTM modelu, zejména pro m/z 200–400 Th.
Bylo prokázáno, že existuje mnoho parametrických konfigurací dosažitelné kvality a že výsledná vlna působí efektivní potlačení bez významných artefaktů.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda umožňuje flexibilní návrh přenosových profilů, včetně více ostře ohraničených notch oblastí a variabilních regionů částečné propustnosti.
Potenciální aplikace zahrnují vylepšení citlivosti a specificity v režimech DIA i v selektivní fragmentaci prekurzorů.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další práce by se mohla zaměřit na limity ostrosti hrany notch profilu, optimalizaci délky záznamu vlny a apodizaci začátku a konce vlny.
Možné je také zúžení parametrového prostoru fixací fází či amplitud nebo aplikace adaptivnějších algoritmů optimalizace.
Závěr
Popsaná MCMC optimalizace dipólových excitací představuje univerzální nástroj pro tvorbu cílených přenosových profilů v kvadrupólových filtrech.
Simulace potvrdily shodu teoretického návrhu s chováním reálného systému a ukázaly vysokou variabilitu použitelných řešení.
Reference
- SIMION. Adaptas Solutions LLC. online resource, https://simion.com
- Richardson K.; Green M.; Hughes C. Comparison Of Product Ion Specificity In LC-MS-Data Independent Acquisition (DIA) Data Between MSe And MSe With M/Z Selective Intensity Encoding. Proceedings of ASMS 2022.
- Comisarow M. B.; Marshall A. G. Chem. Phys. Lett. 1974, 25, 282–283.
- Chen L. et al. Anal. Chem. 1987, 59, 449–454.
- Feynman R. P.; Leighton B. L.; Sands M. L. The Feynman Lectures On Physics; online edition.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
SIMULATION OF A QUADRUPOLE MASS FILTER EMPLOYING A DIGITAL WAVEFORM AND DISCONTINUOUS ION INTRODUCTION TO OBTAIN HIGH RESOLUTION AND TRANSMISSION
2019|Waters|Postery
SIMULATION OF A QUADRUPOLE MASS FILTER EMPLOYING A DIGITAL WAVEFORM AND DISCONTINUOUS ION INTRODUCTION TO OBTAIN HIGH RESOLUTION AND TRANSMISSION David Langridge1, Martin Green1, Benjamin Jeffrey2, Robert Appleby2 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK; 2University of Manchester, Manchester, UK INTRODUCTION Generally…
Klíčová slova
acceptance, acceptancewaveform, waveforminverse, inversepositional, positionalquadrupole, quadrupolejitter, jittersimion, simiondiscontinuous, discontinuousresolution, resolutioneffect, effectphase, phaseions, ionsamplitude, amplitudesimulation, simulationtiming
COMPARISON OF PRODUCT ION SPECIFICITY IN LC-MS DATA INDEPENDENT ACQUISITION (DIA) BETWEEN MSE AND MSE WITH M/Z SELECTIVE INTENSITY ENCODING
2022|Waters|Postery
COMPARISON OF PRODUCT ION SPECIFICITY IN LC-MS DATA INDEPENDENT ACQUISITION (DIA) E E BETWEEN MS AND MS WITH M/Z SELECTIVE INTENSITY ENCODING Keith Richardson, Martin Green, Christopher Hughes Waters Corporation, Altrincham Road, Wilmslow, UK OVERVIEW PURPOSE: Investigation of specificity of…
Klíčová slova
mse, mseencoding, encodingdecoded, decodeddata, dataexperiment, experimentnotch, notchmgf, mgfdataset, datasetspecificity, specificityenergy, energyfrom, frombins, binsmascot, mascotunfiltered, unfilteredintensity
Improved performance of linear ion trap mass spectrometer with added octopole and dodecapole fields
2018|Shimadzu|Postery
PO-CON1799E Improved performance of linear ion trap mass spectrometer with added octopole and dodecapole fields ASMS 2018 ThP-515 Junichi Taniguchi, Osamu Furuhashi Shimadzu Corporation. 1, Nishinokyo-Kuwabaracho Nakagyo-ku, Kyoto 604–8511, Japan Improved performance of linear ion trap mass spectrometer with added…
Klíčová slova
dodecapole, dodecapoletrap, trapoctopole, octopolefields, fieldsmultipole, multipolelinear, linearion, ionimproved, improvedmass, massadded, addedspectrometer, spectrometerfrequency, frequencyside, sideresonance, resonanceperformance
IMSC: Orbitrap Mass Spectrometry: from Dream to Mainstream
2009|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Lunch talk at 18th IMSC Bremen Orbitrap Mass Spectrometry: from Dream to Mainstream Orbitrap is… …awarded… Dr. Alexander Makarov Thermo Fisher Scientific …produced… …commercialized… September 2, 2009 …developed… Irkutsk …in Bremen! Long time ago… A.Pekaln “If you really want to…
Klíčová slova
orbitrap, orbitrapions, ionsoatof, oatoftrap, trapion, ionmass, massoscillations, oscillationstof, toffrequency, frequencyvoltage, voltageltq, ltqfield, fieldresolving, resolvingpartof, partoficr