Analysis of the Low-Abundance Plasma Biomarker Klotho in Less than Four Hours
Aplikace | 2016 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Biomarker Klotho je klíčovou molekulou ve výzkumu stárnutí a renálních onemocnění, avšak jeho nízké koncentrace v plasmatických vzorcích kladou vysoké nároky na citlivost analytických metod. Imunoafinitní obohacení spojené s masovou spektrometrií nabízí řešení pro důkladnou a přesnou kvantifikaci tohoto proteinu.
Cílem byla demonstrace rychlé kvantifikace nízkonásobných hladin Klotho v plazmě pomocí LC-MS/MS využitím Thermo Scientific SMART Digest ImmunoAffinity kitu, který integruje imunoafinitní zachycení a tryptickou digesci v jediném kroku.
Metoda dosáhla dolní hranice kvantifikace (LLOQ) 1,58 ng/mL v plazmě s opakovatelností CV 6,3 % pro peptid FSISWAR a 12,5 % pro LQDAYGGWANR bez použití izotopových standardů. Kalibrační křivky vykázaly vysokou linearitu (R²>0,97) napříč rozsahem 1,58–500 ng/mL. Celková doba přípravy vzorku se zkrátila na 3–4 hodiny oproti standardním protokolům trvajícím 15–24 hodin.
Strategie kombinující imunoafinitní obohacení a digesci lze rozšířit na multiplexní analýzy dalších nízkonásobných biomarkerů. Předpokládá se integrace plně automatizovaných workflow, vývoj specializovaných kitů pro různé typy vzorků a zlepšení termostability enzymů pro ještě rychlejší digesci.
Popsaná metoda představuje rychlý, citlivý a vysoce reprodukovatelný přístup k kvantifikaci biomarkeru Klotho v plazmě. Díky jednorázovému imunoafinitnímu a digestačnímu kroku je dosaženo významného zkrácení času přípravy a zvýšení analytické výkonnosti.
LC/MS, LC/IT
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Biomarker Klotho je klíčovou molekulou ve výzkumu stárnutí a renálních onemocnění, avšak jeho nízké koncentrace v plasmatických vzorcích kladou vysoké nároky na citlivost analytických metod. Imunoafinitní obohacení spojené s masovou spektrometrií nabízí řešení pro důkladnou a přesnou kvantifikaci tohoto proteinu.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem byla demonstrace rychlé kvantifikace nízkonásobných hladin Klotho v plazmě pomocí LC-MS/MS využitím Thermo Scientific SMART Digest ImmunoAffinity kitu, který integruje imunoafinitní zachycení a tryptickou digesci v jediném kroku.
Použitá metodika a instrumentace
- Antibody pre-treatment: Biotinylace anti-Klotho protilátky pomocí NHS-biotinu.
- Vzorky: Myší plasma obohacená rekombinantním Klotho v rozsahu 1,58–500 ng/mL.
- Imunoafinitní obohacení: Inkubace vzorku s biotinylovanou protilátkou a SMART Digest IA Streptavidin ne-magnetickými perlemi po dobu 2 h při RT, následováno sedmi promývacími kroky.
- Digesce: Přímá aktivace trypsinu na perličkách při 70 °C a 1400 RPM po dobu 90 min.
- UHPLC: Thermo Dionex UltiMate 3000 RSLC s kolonkou Accucore C18 (2,1×50 mm, 2,6 µm), gradient 0,1 % FA v H₂O/ACN, průtok 0,5 mL/min, injekce 5 µL.
- MS/MS: Thermo Velos Pro Ion Trap v pozitivním režimu, nastavení kapiláry 375 °C, heater 350 °C, sheat gas 60, aux gas 20, spray voltage 4 kV.
- Zpracování dat: Thermo Chromeleon SR2 pro akvizici, Xcalibur pro kontrolu MS.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda dosáhla dolní hranice kvantifikace (LLOQ) 1,58 ng/mL v plazmě s opakovatelností CV 6,3 % pro peptid FSISWAR a 12,5 % pro LQDAYGGWANR bez použití izotopových standardů. Kalibrační křivky vykázaly vysokou linearitu (R²>0,97) napříč rozsahem 1,58–500 ng/mL. Celková doba přípravy vzorku se zkrátila na 3–4 hodiny oproti standardním protokolům trvajícím 15–24 hodin.
Přínosy a praktické využití metody
- Výrazné zkrácení doby analýzy díky integraci zachycení a digesce.
- Vysoká citlivost a reprodukovatelnost bez nutnosti redukce a alkylace.
- Kompatibilita s automatizovanými pracovními stanicemi a vysoký objem vzorků.
Budoucí trendy a možnosti využití
Strategie kombinující imunoafinitní obohacení a digesci lze rozšířit na multiplexní analýzy dalších nízkonásobných biomarkerů. Předpokládá se integrace plně automatizovaných workflow, vývoj specializovaných kitů pro různé typy vzorků a zlepšení termostability enzymů pro ještě rychlejší digesci.
Závěr
Popsaná metoda představuje rychlý, citlivý a vysoce reprodukovatelný přístup k kvantifikaci biomarkeru Klotho v plazmě. Díky jednorázovému imunoafinitnímu a digestačnímu kroku je dosaženo významného zkrácení času přípravy a zvýšení analytické výkonnosti.
Reference
- Rodriguez T. Identifying significant biological markers in Klotho gene variants across wide ranging taxonomy. Journal of Molecular Biology Research. 2015;5(1):11.
- Rotondi S, Pasquali M, Tartablione L et al. Soluble α-Klotho serum levels in chronic kidney disease. International Journal of Endocrinology. 2015;872193.
- Massó A, Sánchez A, Gimenez-Llort L et al. Secreted and Transmembrane α-Klotho Isoforms have different spatiotemporal profiles in the brain during aging and Alzheimer’s disease progression. PLoS ONE. 2015;10(11):e0143623.
- Lim K, Groen A, Molostvov G et al. α-Klotho expression in human tissues. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 2015;100(10):e1308–1318.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
SMART Digest ImmunoAffinity (IA) Kit User Manual
2016|Thermo Fisher Scientific|Manuály
SMART Digest ImmunoAffinity (IA) Kit User Manual Version 1 XX21549-EN 0816S Revision A • August 2016 SMART Digest ImmunoAffinity (IA) Kits Delivering Fast, Simple and Highly Reproducible Immunocapture and Digestion of Proteins The Thermo Scientific™ SMART Digest™ ImmunoAffinity (IA) Kits…
Klíčová slova
digest, digestsmart, smartdigestion, digestioncapture, captureimmunoaffinity, immunoaffinityprotein, proteinkit, kitvacuum, vacuumsolaµ, solaµbead, beadbeads, beadsmagnetic, magneticbiotinylated, biotinylatedpractical, practicalconsiderations
SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity Kits
2020|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity Kits Smarter protein preparation SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity kits Smarter protein preparation The Thermo Scientific™ SMART Digest™ and the SMART Digest ImmunoAffinity (IA) kits are designed for biomarker and bio-therapeutic characterization and…
Klíčová slova
digest, digestsmart, smartkit, kitdigestion, digestionkits, kitsfair, fairplate, platecollection, collectiontrypsin, trypsinbead, beadchymotrypsin, chymotrypsinprotein, proteinimmunoaffinity, immunoaffinitysolaµ, solaµstreptavidin
Overview of SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity Kits
2020|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Protein digestion for peptide mapping and quantitation Overview of SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity Kits SMART Digest and SMART Digest ImmunoAffinity kits Thermo Scientific™ SMART Digest™ and the SMART Digest™ ImmunoAffinity (IA) kits are designed for biomarker and bio-therapeutic…
Klíčová slova
digest, digestsmart, smartkit, kitkits, kitsplate, platedigestion, digestioncollection, collectiontrypsin, trypsinchymotrypsin, chymotrypsinkingfisher, kingfisherquantitation, quantitationsolaµ, solaµpeptide, peptideimmunoaffinity, immunoaffinityproteinase
Rapid quantitation of therapeutic antibodies in animal plasma
2017|Thermo Fisher Scientific|Aplikace
APPLICATION NOTE 21692 Rapid quantitation of therapeutic antibodies in animal plasma Application benefits Author Xin Zhang , John O’Grady , Kevin Meyer2 1 Thermo Fisher Scientific, Sunnyvale, CA, USA 2 Perfinity Biosciences Inc., West Lafayette, IN, USA • Rapid sample…
Klíčová slova
igg, iggdigest, digestsmart, smarthuman, humandigestion, digestionprotein, proteinkits, kitsanti, antiimmunoaffinity, immunoaffinityreputable, reputableimmunocapture, immunocapturebead, beadstreptavidin, streptavidinsupplier, suppliercapture