LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Analysis of Serum N-Glycans of Gene-KO Mouse Using MALDI-7090 and SialoCapper-ID Kit

Aplikace | 2021 | ShimadzuInstrumentace
MALDI, LC/TOF, LC/MS
Zaměření
Klinická analýza
Výrobce
Shimadzu

Souhrn

Význam tématu


Proteinová glykosylace se podílí na řadě biologických procesů, přičemž sialové kyseliny na konci glykanů ovlivňují imunitní reakce, virovou infekci a nádorové procesy. Rozlišení izomerů dle vazby sialových kyselin je klíčové pro pochopení biologických mechanismů i pro diagnostiku.

Cíle a přehled studie / článku


Cílem studie bylo demonstrovat schopnost nového Sialic Acid Stabilizing kitu (SialoCapper™-ID Kit) v kombinaci s BlotGlyco® upravit a analyzovat N-glykany séra myší se záměrně vyřazenými geny pro sialyltransferasy. Analýza byla prováděna prostřednictvím MALDI-TOF-MS (MALDI-7090) bez nutnosti chromatografické separace nebo enzymatické hydrolýzy.

Použitá metodika a instrumentace


  • Uvolnění N-glykanů: Denaturace glykoproteinů z myšího séra SDS, redukce DTT, štěpení PNGase F.
  • Solid-phase derivatizace: Pomocí BlotGlyco® a SALSA protokolu v rámci SialoCapper-ID kitu byla prováděna vazebně specifická alkylamidace α2,3- a α2,6-sialových kyselin.
  • Štěpení a označení: Sialylované glykany byly označeny 2-aminobenzoovou kyselinou (2-AA) a vyčištěny pomocí HILIC-SPE čipu.
  • Hmotnostní spektrometrie: Analýza na MALDI-7090 v negativním reflektronovém módu s matricí DHB a následné MS2 pomocí vysoké energie CID s ASDF funkcí.

Hlavní výsledky a diskuse


  • MS1 spektrometrie odhalila rozdíl 28 Da mezi izomery α2,3- a α2,6-sialylace. Vzory m/z 2080–3114 odpovídají diantennárním strukturám s diferencovaným počtem i typem sialových zbytků.
  • Ve vzorcích ST6Gal1-KO a DKO chyběly signály α2,6-sialylace, což potvrzuje roli ST6Gal1 v její biosyntéze.
  • MS2 analýza piku m/z 2749 z DKO ukázala ztrátu 348 Da, potvrzující přítomnost α2,6-derivované NeuGc, implicující alternativní enzymatickou aktivitu mimo ST6Gal1/2.

Přínosy a praktické využití metody


  • Rychlé a citlivé rozlišení sialových vazeb přímo hmotnostní spektrometrií bez LC nebo enzymatického kroku.
  • Možnost provést purifikaci a derivatizaci glykanů v jednom kroku díky BlotGlyco® kuličkám.
  • Využití MS2 dává spolehlivou verifikaci neočekávaných struktur.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Rozšíření na klinické a diagnostické aplikace při analýze glykokonjugátů.
  • Vývoj dalších derivatizačních sad pro jiné druhy glykosidických vazeb.
  • Integrace s kvantitativními technikami pro detailní profilování glykanačních změn v patologiích.

Závěr


Kombinace SialoCapper-ID kitu a BlotGlyco® s MALDI-7090 umožňuje efektivní a selektivní rozlišení sialových vazeb na glycanech bez komplikovaných separačních či enzymatických kroků. Přístup slibuje aplikace v glykoproteomice a dalších oblastech analytické chemie.

Reference


  1. Ohmi Y. et al. Majority of alpha2,6-sialylated glycans in the adult mouse brain exist in O-glycans: SALSA-MS analysis for knockout mice of alpha2,6-sialyltransferase genes. Glycobiology, in press (2020).
  2. Nishikaze T. et al. Differentiation of Sialyl Linkage Isomers by One-Pot Sialic Acid Derivatization for Mass Spectrometry-Based Glycan Profiling. Anal. Chem. 89, 2353–2360 (2017).
  3. Hanamatsu H. et al. Sialic Acid Linkage Specific Derivatization of Glycosphingolipid Glycans by Ring-Opening Aminolysis of Lactones. Anal. Chem. 90, 13193–13199 (2018).

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
SialoCapper-ID Kit : A Novel Derivatization Tool for Glycan Analysis by Mass Spectrometry
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit Application News SialoCapper-ID Kit : A Novel Derivatization Tool for Glycan Analysis by Mass Spectrometry T. Nishikaze, M. Inuzuka User Benefits  Sialic acid linkage types scan be discriminated using…
Klíčová slova
sialocapper, sialocapperglycan, glycansialic, sialickit, kitglycans, glycansacid, acidderivatized, derivatizedlinkage, linkagesalsa, salsareaction, reactionlabeled, labeledblotglyco, blotglycoderivatization, derivatizationmass, masslabeling
N-Glycan Analysis of ACE2 as SARS-CoV-2 Receptor
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit MALDI-TOF Mass Spectrometer: MALDI-8020 Application News N-Glycan Analysis of ACE2 as SARS-CoV-2 Receptor ~ Discrimination of Sialic Acid Linkage Isomer using SialoCapper-ID Kit ~ M. Inuzuka, T. Nishikaze User Benefits…
Klíčová slova
sialic, sialicglycan, glycansialocapper, sialocapperlinkage, linkageacid, acidisomer, isomersalsa, salsaderivative, derivativederivatized, derivatizedsialylated, sialylatedderivatization, derivatizationkit, kitglycans, glycanslabeling, labelingsupporting
Sialic Acid Linkage Isomer Discrimination of N-glycans derived from Rat Cochlea using SialoCapper-ID Kit
Sialic Acid Stabilizing Kit for Linkage Isomer Discrimination: SialoCapper™-ID Kit MALDI-TOF Mass Spectrometer: MALDI-8020 Application News Sialic Acid Linkage Isomer Discrimination of N-glycans derived from Rat Cochlea using SialoCapper-ID Kit M. Inuzuka, T. Nishikaze User Benefits  The sialic acid…
Klíčová slova
sialic, sialiclinkage, linkagesialocapper, sialocapperglycans, glycansacid, acidderivatization, derivatizationkit, kitglycan, glycantype, typesalsa, salsadiscriminated, discriminatedderivative, derivativeisomer, isomerfractionation, fractionationdiscrimination
N Glycan profiling in plasma proteins of semi supercentenarians using sialic acid linkage specific derivatization and negative ion MALDI TOF MS
ASMS 2022, 2022, WP-198 WP 198 i plasma i supercentenarians t i i g sialic i ti ti and d negative i MALDI N-Glycan p fili g in pl p t i off semi semi-supercentenarians p linkage-specific p ifi dderivatization…
Klíčová slova
sscs, sscsssc, sscglycan, glycansupercentenarians, supercentenarianslinkage, linkageifi, ifisialic, sialicblotglyco, blotglycosialocapper, sialocapperoff, offmaldi, maldispecific, specificith, ithnegative, negativeglycans
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.