High throughput, high spatially resolved MALDI-MSI comparative analysis of an Alzheimer’s disease mouse model with wild-type mice
Postery | 2022 | Shimadzu | ASMSInstrumentace
Detekce prostorové distribuce lipidů v mozku s vysokým rozlišením a propustností je klíčová pro pochopení neurodegenerativních onemocnění. Metoda MALDI-MSI nabízí vizualizaci molekulárních změn v rámci buněčných vrstev a napomáhá identifikaci biomarkerů Alzheimerovy choroby.
Cílem bylo vyvinout rutinní postup pro vysokorozlišovací (≤5 µm) a vysoce propustné MALDI-MSI bez výrazné ztráty citlivosti. Metoda byla aplikována na porovnání lipidomických profilů divokého typu (WT) a transgenního myšího modelu Alzheimerovy choroby (5xFAD) s jedinobuněčným rozlišením.
Vzorky
Matrix a depozice
MSI akvizice
Analýza dat
Bylo dosaženo vysokého prostorového rozlišení (5 µm) při zachování kvalitních spekter. Zvýšení rychlosti z 2 kHz na 20 kHz umožnilo zkrácení akvizičního času ze 2,3 h na 36 min s poklesem signálu pouze o 10–15 %. Porovnání lipidových iontů PC (34:1), PC (36:1) a PC (32:0) odhalilo ve 5xFAD modelu vyšší abundanci v oblastech caudate-putamen a corpus callosum oproti WT. Segmentační analýza potvrdila rozdíly mezi jednotlivými AD modely.
Metoda nabízí:
Další rozvoj může zahrnovat multimodální snímání kombinující proteomiku a metabolomiku, automatizované zpracování dat s umělou inteligencí a rozšíření aplikací na klinické vzorky pro časnou diagnostiku neurodegenerativních onemocnění.
Popsaný přístup propojuje vysoké prostorové rozlišení s vysokou propustností a citlivostí MALDI-MSI. Umožňuje detailní vizualizaci lipidů v mozku myšího modelu AD a divokého typu, což přispívá k lepšímu pochopení molekulární patologie a podporuje další výzkum biomarkerů.
MALDI, MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Detekce prostorové distribuce lipidů v mozku s vysokým rozlišením a propustností je klíčová pro pochopení neurodegenerativních onemocnění. Metoda MALDI-MSI nabízí vizualizaci molekulárních změn v rámci buněčných vrstev a napomáhá identifikaci biomarkerů Alzheimerovy choroby.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem bylo vyvinout rutinní postup pro vysokorozlišovací (≤5 µm) a vysoce propustné MALDI-MSI bez výrazné ztráty citlivosti. Metoda byla aplikována na porovnání lipidomických profilů divokého typu (WT) a transgenního myšího modelu Alzheimerovy choroby (5xFAD) s jedinobuněčným rozlišením.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky
- 10 µm řezy mozkových tkání z WT a několika AD modelů (5xFAD, ABCA7 HO, CLU h2kB KI HO)
- Uložení při –80 °C
Matrix a depozice
- 9-Aminoacridin, 0,9 µm vrstva vaporizovaná pomocí iMLayer
MSI akvizice
- AP-MALDI QTOF iMScope QT, Shimadzu
- Integrovaná širokoúhlá a mikroskopická kamera
- Laserové zaostření od 5 µm do 200 µm
- Frekvence laseru až 20 kHz, 150 střel/pixel
Analýza dat
- Software ImageReveal MS s PCA, PLS, segmentací a klasifikací
Hlavní výsledky a diskuse
Bylo dosaženo vysokého prostorového rozlišení (5 µm) při zachování kvalitních spekter. Zvýšení rychlosti z 2 kHz na 20 kHz umožnilo zkrácení akvizičního času ze 2,3 h na 36 min s poklesem signálu pouze o 10–15 %. Porovnání lipidových iontů PC (34:1), PC (36:1) a PC (32:0) odhalilo ve 5xFAD modelu vyšší abundanci v oblastech caudate-putamen a corpus callosum oproti WT. Segmentační analýza potvrdila rozdíly mezi jednotlivými AD modely.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda nabízí:
- Zrychlenou a vysoce citlivou analýzu lipidů v tkáňových řezech
- Možnost studia molekulárních změn na úrovni jednotlivých buněk
- Podporu přehledu o patologii AD a objev biomarkerů
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj může zahrnovat multimodální snímání kombinující proteomiku a metabolomiku, automatizované zpracování dat s umělou inteligencí a rozšíření aplikací na klinické vzorky pro časnou diagnostiku neurodegenerativních onemocnění.
Závěr
Popsaný přístup propojuje vysoké prostorové rozlišení s vysokou propustností a citlivostí MALDI-MSI. Umožňuje detailní vizualizaci lipidů v mozku myšího modelu AD a divokého typu, což přispívá k lepšímu pochopení molekulární patologie a podporuje další výzkum biomarkerů.
Reference
- Hossen MA, Kawauchi S, Kurzyniec S, Boutaghou MN, Green K, Grun F. High throughput, high spatially resolved MALDI-MSI comparative analysis of an Alzheimer’s disease mouse model with wild-type mice. ASMS 2022, WP-292.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Mass Imaging Analysis of Organoids on iMScope QT
2025|Shimadzu|Aplikace
Imaging Mass Microscope, Matrix Vapor Deposition System, Automatic Sprayer for MALDI Imaging, Mass Spectrometry Imaging Data Analysis Software Application News Mass Imaging Analysis of Organoids on iMScope QT Naatasha Isahak1, Zaimie Teng1, Edwin Ting1, Yumi Unno2, Eiichi Matsuo2, Ojima Noriyuki2,…
Klíčová slova
organoid, organoidimaging, imagingorganoids, organoidslaser, laserspatial, spatialimscope, imscopematrix, matriximlayer, imlayerinquiry, inquirylung, lungaero, aeromass, masshuman, humantissues, tissuesimagereveal
MS Imaging of Natural Toxin Colchicine in Autumn Crocus Bulb Using iMScope QT
2024|Shimadzu|Aplikace
Imaging Mass Microscope iMScopeTM QT Application News MS Imaging of Natural Toxin Colchicine in Autumn Crocus Bulb Using iMScope QT Kaoru Nakagawa and Tetsuo Iida User Benefits iMScope QT has a maximum laser repetition rate of 20 kHz for…
Klíčová slova
demecolcin, demecolcincolchicine, colchicinecrocus, crocusautumn, autumnimage, imagebulb, bulbimaging, imaginglaser, laserimscopetm, imscopetmdistributed, distributedmicroscope, microscopeimscope, imscopeuniformly, uniformlyoptical, opticalsections
Spatial information analysis using a desktop size MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer based on MS imaging information
2021|Shimadzu|Postery
Spatial information analysis using a desktop size MALDI Digital Ion Trap Mass Spectrometer based on MS imaging information Kosuke Hosoi1. 1 SHIMADZU Corporation, MS Business Unit, Kyoto, Japan. MS images using iMScope QT 1. Introduction m/z 734.57 m/z 760.59 m/z…
Klíčová slova
imscope, imscopedesktop, desktopmsi, msiimaging, imaginglongitudinally, longitudinallytissue, tissueclose, closeinformation, informationsectioned, sectionedfield, fieldwidely, widelyposition, positionimaged, imagedpractically, practicallypreceding
CCS-aware SpatialOMx® enables highly confident and automatic lipid annotations with regiospecific context
2021|Bruker|Aplikace
Intensity (arb. unit) 132% 0% 100% PS 38:1 m/z 816.5747 ± 0.0122 1/K0 1.433 ± 0.01 Intensity (arb. unit) Mobility [1/K0] 136% 0% 100% PE 20:1_22:6 m/z 816.5517 ± 0.0122 1/K0 1.404 ± 0.01 m/z 1 mm CCS-aware SpatialOMx® enables…
Klíčová slova
ccs, ccsmaldi, maldispatialomx, spatialomximaging, imagingaware, awareannotation, annotationmobility, mobilityannotated, annotatedtims, timsannotations, annotationspasef, pasefbucket, bucketlipid, lipidsegmentation, segmentationlipids