LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Rapid Phospholipid Characterization Using a Novel Intelligent Workflow on a Tribrid Orbitrap Mass Spectrometer

Postery | 2015 | Thermo Fisher Scientific | ASMSInstrumentace
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Zaměření
Lipidomika
Výrobce
Thermo Fisher Scientific

Souhrn

Význam tématu


Profilování fosfolipidů je klíčové pro biochemický výzkum, klinickou diagnostiku a kontrolu kvality v potravinářství či farmacii. Rychlá a cílená analýza lipidů umožňuje sledovat změny lipidového složení buněk, identifikovat biomarkery onemocnění a optimalizovat výrobní procesy.

Cíle a přehled studie


Hlavním cílem bylo navrhnout inteligentní a komplexní LC/MSn workflow na platformě Tribrid Orbitrap Fusion Lumos, které v jediném běhu zajistí vysokou průchodnost, identifikaci širokého spektra fosfolipidů a současně kvalitní kvantifikaci.

Použitá instrumentace


  • HPLC: Thermo Scientific™ Dionex™ UltiMate™ 3000 RSLC
  • Kolona: Accucore™ C18 (2,1×150 mm, 2,6 µm) při 45 °C, průtok 260 µL/min
  • Mobilní fáze A: acetonitril/voda 60:40, B: IPA/acetonitril 90:10 (10 mM formiát amonný, 0,1 % kyseliny mravenčí)
  • MS: Thermo Scientific™ Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer
  • Software: Thermo Scientific™ LipidSearch™ 4.1

Metodika


Vzorek bovinního srdce byl připraven jako lipidový extrakt (2,5 mg/mL), naředěný na 500 ng/µL v IPA/MeOH (1:1), inokulace 2 µL.
LC gradient trval 28 min:
  • 0–18 min: rozdělený režim datově dependentního sběru HCD MS2 v pozitivním a negativním módu (střídání polarity)
  • 0–18 min: doplňkově po detekci iontu m/z 184,0733 (typický pro PC) spouštěno produktově dependentní CID MS2
  • 18–28 min: pozitivní HCD MS2 (Top Speed 1 s cyklus) a produktově dependentní CID MS3 na tři nejsilnější fragmenty při neutralních ztrátách mastných kyselin (Top Speed 2 s cyklus)

Hlavní výsledky a diskuse


Inteligentní workflow porovnané se třemi standardními přístupy (pouze pozitivní, střídané poz./neg., samostatné běhy) identifikovalo nejvíce lipidových molekul ve jediném běhu. Výsledky:
  • Kompletní profilování fosfolipidů a triglyceridů s vysokou citlivostí díky kombinaci HCD MS2 a CID MS3
  • Bez ztráty citlivosti při zkrácených časech injekce (<1 s) díky jasnějšímu zdroji a segmentovanému kvadrupólu
  • Porovnání počtu identifikovaných lipidů: inteligentní workflow ~793 vs. smíšené pozitiv./neg. ~762 vs. samostatné běhy ~633–585

Přínosy a praktické využití metody


Metoda umožňuje dvounásobné zvýšení průchodnosti analýz a zároveň udržuje nebo zlepšuje důvěryhodnost identifikací molekulových lipidů. Využití nalezne v lipidomice, biomarkerové diagnostice, QA/QC v potravinách a farmacii či ve výzkumu metabolických onemocnění.

Budoucí trendy a možnosti využití


  • Automatizace a integrace s umělou inteligencí pro chytré rozpoznání lipidových vzorců
  • Miniaturizace a rychlé screeningové platformy pro klinické či environmentální vzorky
  • Rozšíření knihoven fragmentů pro nové lipidové třídy (glykolipidy, sulfolipidy)
  • Aplikace v personalizované medicíně a sledování léčebných zásahů

Závěr


Navržené inteligentní LC/MSn workflow na Orbitrap Fusion Lumos poskytuje ve srovnání se standardními režimy nejvyšší počet identifikací a současně udržuje vysokou kvalitu dat. Metoda otevírá cestu k rychlé a spolehlivé analýze lipidů v jediném běhu s dvojnásobnou průchodností.

Reference


  • Kiyonami R., Peake D.A., Yokoi Y., Miller K.: Rapid Phospholipid Characterization Using a Novel Intelligent Workflow on a Tribrid Orbitrap Mass Spectrometer. Poster Note 64451, Thermo Fisher Scientific & Mitsui Knowledge Industry, 2015.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Increased Throughput and Confidence for Lipidomics Profiling Using Comprehensive HCD MS2 and CID MS2/MS3 on a Tribrid Orbitrap Mass Spectrometer
Reiko Kiyonami1, David A Peake1, Yasuto Yokoi2, and Ken Miller1 1 Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA, USA; 2Mitsui Knowledge Industry, Tokyo, Japan Key Words Orbitrap Fusion Lumos MS, high resolution, accurate mass, lipid profiling, intelligent scan functions, triglyceride (TG),…
Klíčová slova
lipid, lipidfusion, fusionlumos, lumosorbitrap, orbitrapion, ionspecies, speciescharacterization, characterizationhcd, hcdlipidomics, lipidomicsmsn, msnids, idsprofiling, profilingmolecular, molecularlipids, lipidsfatty
IMSC: Identification of Phospholipid Species Implicated in Dementia by Untargeted LC/HRMS and Data Dependent MS/MS
Results: Fatty acids comprising the molecular phospholipid species were unambiguously identified. ne Proteome Discoverer software is a node-based workflow engine and study management 55 platform for analysis of mass spectrometry-based proteomics datasets. The latest released version 2.1 fully supports isotopically-labeled…
Klíčová slova
hcd, hcdspecies, speciescid, cidlipid, lipidyes, yeshco, hcophospholipids, phospholipidsandand, andanddementia, dementiappm, ppmidentification, identificationlipids, lipidsfigure, figurepcpc, pcpclipidsearch
Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer
Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer
2017|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
The Most Powerful Instrument DESIGNED TO ADVANCE YOUR SCIENTIFIC PURSUITS Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer PUSHING NEW FRONTIERS IN SCIENCE Breakthroughs in science rely on great scientists making rapid progress answering challenging questions. “How does lipid metabolism…
Klíčová slova
lumos, lumosfusion, fusionorbitrap, orbitraphco, hcoetd, etdddms, ddmstribrid, tribridhcd, hcdethcd, ethcdpeptides, peptidesintact, intactglycopeptide, glycopeptidehigh, highscientific, scientificdia
General workflow for untargeted plasma lipidomics on Orbitrap mass spectrometers
Technical note | 002661 Metabolomics General workflow for untargeted plasma lipidomics on Orbitrap mass spectrometers Authors Introduction to lipidomics Rahul Deshpande, Ciara Myer, Susan Bird Lipids play a key role in cell, tissue, and organ physiology as key components of…
Klíčová slova
orbitrap, orbitrapmass, masstribrid, tribridspectrometer, spectrometerlipidomics, lipidomicsfragmentation, fragmentationlipid, lipidannotation, annotationexploris, explorisacquirex, acquirexnegative, negativeworkflow, workflowexclusion, exclusionabundance, abundanceconfident
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.