Qualitative Analysis of Phytochemicals by High-resolution Mass Spectrometry -Analysis for Prenylnaringenin-
Aplikace | 2022 | ShimadzuInstrumentace
Bioprodukce prenylnaringeninu představuje moderní přístup k výrobě vysoce bioaktivních flavonoidů s protirakovinnými, antidiabetickými a protizánětlivými účinky. Díky složitosti struktury těchto přírodních sloučenin je klíčové využití metabolického inženýrství mikroorganismů a citlivé analytické techniky k rychlé identifikaci a optimalizaci produkčních kmenů. Vysoce rozlišená hmotnostní spektrometrie (HRMS) umožňuje spolehlivě rozlišit izomerní formy a vyloučit rušivé příměsi, což podporuje vývoj udržitelné bioekonomiky zaměřené na nízkou uhlíkovou stopu.
Předložená práce si klade za cíl:
Vysoké rozlišení Q-TOF MS dovoluje rychle vytřídit nechtěné příměsi a rozlišit strukturální izomery přímo v hrubých extraktech. To výrazně zkracuje dobu optimalizace produktivních kmenů a usnadňuje vývoj biofarmaceutik, nutraceutik a průmyslově významných bioaktivních sloučenin.
Metoda metabolického inženýrství spojena s vysoce rozlišenou Q-TOF masovou spektrometrií představuje efektivní platformu pro rychlý screening a potvrzení struktury bioaktivních prenylnaringeninů. Tento přístup významně podporuje vývoj udržitelných bio-produktů pro zdravotnictví i průmysl.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Bioprodukce prenylnaringeninu představuje moderní přístup k výrobě vysoce bioaktivních flavonoidů s protirakovinnými, antidiabetickými a protizánětlivými účinky. Díky složitosti struktury těchto přírodních sloučenin je klíčové využití metabolického inženýrství mikroorganismů a citlivé analytické techniky k rychlé identifikaci a optimalizaci produkčních kmenů. Vysoce rozlišená hmotnostní spektrometrie (HRMS) umožňuje spolehlivě rozlišit izomerní formy a vyloučit rušivé příměsi, což podporuje vývoj udržitelné bioekonomiky zaměřené na nízkou uhlíkovou stopu.
Cíle a přehled studie / článku
Předložená práce si klade za cíl:
- Navrhnout metabolickou cestu v Saccharomyces cerevisiae pro tvorbu prenylnaringeninu.
- Transformovat kvasinkový kmen geny pro biosyntézu naringeninu z Arabidopsis thaliana.
- Provesti screening a identifikaci přepřenylačních enzymů z různých rostlinných a mikrobiálních zdrojů.
- Uplatnit vysoké rozlišení LCMS-9030 Q-TOF MS pro rychlou analýzu produktů a potvrzení struktury sloučenin.
Použitá metodika a instrumentace
- Metabolické inženýrství:
V kvasince byly exprimovány šestice genů (AtPAL1, AtC4H, AtCPR1, At4CL3, AtCHS3, AtCHI1) pro biosyntézu naringeninu z fenylalaninu. Dále bylo testováno 11 genů prenyltransferas z rostlin a mikrobů. - Chromatografie a masová spektrometrie:
Nexera X2 s kolonou COSMOSIL 5C18-MSII, gradient acetonitrilu a kyseliny octové, průtok 0,2 mL/min, T=30 °C.
LCMS-9030 (Q-TOF) s ESI, rozsah m/z 70–1000, MS/MS scan na prekurzor m/z 339,1, kolizní energie 35 ± 17 V, přesnost m/z vynucená až ±5 ppm.
Hlavní výsledky a diskuse
- Extrahovaný ion chromatogram (XIC) m/z 339,124 ±0,002 odhalil jediný vrchol kerovního prenylnaringeninu při retenčním čase 19,5 min.
- Produktové iontové spektrum odhalilo fragmenty odpovídající přepřenyleným strukturám (m/z 219,0656; 176,0110; 119,0500) s chybou pod 0,001 Da.
- Porovnání s referenčními standardy 6- a 8-prenylnaringeninu potvrdilo, že analyzovaná sloučenina je 8-prenylnaringenin.
- Analogickým přístupem se podařilo vyrobit kmen produkující 3′-prenylnaringenin pomocí enzymu z Neosartorya fischeri.
Přínosy a praktické využití metody
Vysoké rozlišení Q-TOF MS dovoluje rychle vytřídit nechtěné příměsi a rozlišit strukturální izomery přímo v hrubých extraktech. To výrazně zkracuje dobu optimalizace produktivních kmenů a usnadňuje vývoj biofarmaceutik, nutraceutik a průmyslově významných bioaktivních sloučenin.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Rozšíření palety prenyltransferas pro tvorbu dalších izomerů a derivátů flavonoidů.
- Integrace online HRMS monitoringu bioreaktorů pro kontinuální výrobu a rychlou zpětnou vazbu.
- Automatizace a využití pokročilých datových analýz (strojové učení) pro předpověď optimálních cest.
Závěr
Metoda metabolického inženýrství spojena s vysoce rozlišenou Q-TOF masovou spektrometrií představuje efektivní platformu pro rychlý screening a potvrzení struktury bioaktivních prenylnaringeninů. Tento přístup významně podporuje vývoj udržitelných bio-produktů pro zdravotnictví i průmysl.
Reference
- Cui L. et al.: Isoprenylated flavonoids from the stem bark of Erythrina abyssinica, J. Nat. Prod., 70, 1039–1042 (2007).
- Wang S. et al.: Hop extract and 6-prenylnaringenin induce P450 1A1 catalyzed estrogen 2-hydroxylation, Chem. Res. Toxicol., 29, 1142–1150 (2016).
- Isogai S. et al.: Synthetic production of prenylated naringenins in yeast using promiscuous microbial prenyltransferases, Metab Eng Comm, in press (2021).
- Nikolic D. et al.: Metabolism of 8-prenylnaringenin by human liver microsomes, Drug Metab. Dispos., 32, 272–279 (2004).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Targeted Proteomic Analysis of Central Metabolic Enzymes Using Nano-LC-Triple Quadrupole Mass Spectrometry
2023|Shimadzu|Aplikace
Application Note No. 88 Targeted Proteomic Analysis of Central Metabolic Enzymes Using Nano-LC-Triple Quadrupole Mass Spectrometry Fumio Matsuda1,2,3, Takafumi Iwakura1, Taisuke Seike1 and Yutaka Umakoshi4 Life Science Life Sciences Central metabolic pathways also play a role in the ability of…
Klíčová slova
central, centralenzymes, enzymesmetabolic, metabolicexpression, expressionnano, nanotargeted, targetedcerevisiae, cerevisiaeproteomics, proteomicsmrm, mrmmass, massstarkeyi, starkeyimetabolism, metabolismpathways, pathwayslipomyces, lipomycestrypsin
Using Targeted Proteomics with an Ultra- Fast Triple Quadrupole Mass Spectrometer to Confirm Protein Overexpression
2023|Shimadzu|Aplikace
Application Note No. 87 Using Targeted Proteomics with an UltraFast Triple Quadrupole Mass Spectrometer to Confirm Protein Overexpression Fumio Matsuda1,2,3 and Yutaka Umakoshi4 Life Science Life Sciences Abstract 1. Introduction Protein overexpression is an experimental approach that is utilized…
Klíčová slova
pgk, pgkoverexpression, overexpressiontrypsin, trypsinprotein, proteinpeptides, peptidesoverexpress, overexpressmrm, mrmdigested, digestedskyline, skylineproteomics, proteomicsmicroorganisms, microorganismstriple, tripletransitions, transitionsexpression, expressionselectively
Magnetic Resonance Mass Spectrometry (MRMS) discriminates yeast mutants through metabolomics
2021|Bruker|Aplikace
Magnetic Resonance Mass Spectrometry (MRMS) discriminates yeast mutants through metabolomics An untargeted metabolomics approach based on the MRMS aXelerate® workflow was employed to examine changes in methylglyoxal catabolism using Saccharomyces cerevisiae as a model system. This approach allowed for subtle…
Klíčová slova
methylglyoxal, methylglyoxalglyoxalase, glyoxalasemrms, mrmsglutathione, glutathionemutants, mutantsphenotypically, phenotypicallystrains, strainsmetabolomics, metabolomicsgene, genecerevisiae, cerevisiaesaccharomyces, saccharomycesmass, masswere, werepathway, pathwayuntargeted
Selection Guide Metabolite Analysis - Metabolomics Product Portfolio
2019|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E280D Selection Guide Metabolite Analysis Metabolomics Product Portfolio Expanding Metabolomics Metabolomics refers to an array of techniques used to comprehensively detect and analyze various metabolites formed in vivo during biological activity. The qualitative and quantitative changes in metabolites reflect the…
Klíčová slova
acid, acidsba, sbametabolites, metabolitesdatabase, databasepackage, packageacids, acidsmetabolomics, metabolomicsphospholipid, phospholipidanalysis, analysisamino, aminomediators, mediatorsmonophosphate, monophosphatecooh, coohmrm, mrmlcms