Development of an Analytical Tool Using Metabolic Maps Corresponding to 196 Eicosanoids and Related Fatty Acid Metabolites
Aplikace | 2021 | ShimadzuInstrumentace
Analýza eikosanoidů a příbuzných mastných kyselin představuje klíčový nástroj pro pochopení zánětlivých procesů, systémové regulace lipidových mediatorů a vyhledávání biomarkerů. Rozšíření počtu sledovaných metabolitů zhruba na 196 cílů umožňuje komplexní mapování metabolických drah a identifikaci enzymových přeměn v biologických vzorcích.
Studie přináší vývoj analytického nástroje založeného na metodickém balíčku LC/MS/MS Method Package Lipid Mediator Ver. 3, který umožňuje kvantifikovat 196 eikosanoidů a souvisejících mastných kyselin. Hlavním cílem bylo demonstrovat praktické využití mapy metabolitů pro lidskou plazmu a sérum a usnadnit interpretaci účasti specifických enzymů v přeměnách mastných kyselin.
Pro separaci a kvantifikaci byly využity následující přístroje a podmínky:
Vzorky plazmy (EDTA, heparin) a séra byly preparovány vysrážením metanolem s vnitřními standardy, SPE extrakcí, zaschnutím a rekonstitucí v metanolu. Každý vzorek byl analyzován v triplikátu.
Komplexní analýzou bylo v lidské plazmě detekováno 67 z 196 cílů (68 včetně TXB2 v séru) a v séru 44 cílů. Klíčové poznatky:
Metabolické mapy vizualizují kvantitativní profily a umožňují snadno přiřadit enzymové dráhy odpovědné za tvorbu jednotlivých metabolitů.
Nový analytický nástroj:
Pro uživatele se stává přehledným prostředkem pro identifikaci klíčových enzymů a intervenčních bodů v eikosanoidním metabolismu.
Očekávané směry rozvoje:
Vyvinutý analytický nástroj založený na LCMS-8060 NX a mapě 196 lipidových metabolitů nabízí robustní řešení pro komplexní studie eikosanoidů. Demonstrace na lidské plazmě a séru potvrdila schopnost rychlé a spolehlivé kvantifikace, usnadnila interpretaci metabolických drah a poskytla podporu pro další biomarkerový výzkum.
1. Yamada M. et al., J. Chromatogr. B, 995, 74–84 (2015).
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Analýza eikosanoidů a příbuzných mastných kyselin představuje klíčový nástroj pro pochopení zánětlivých procesů, systémové regulace lipidových mediatorů a vyhledávání biomarkerů. Rozšíření počtu sledovaných metabolitů zhruba na 196 cílů umožňuje komplexní mapování metabolických drah a identifikaci enzymových přeměn v biologických vzorcích.
Cíle a přehled studie
Studie přináší vývoj analytického nástroje založeného na metodickém balíčku LC/MS/MS Method Package Lipid Mediator Ver. 3, který umožňuje kvantifikovat 196 eikosanoidů a souvisejících mastných kyselin. Hlavním cílem bylo demonstrovat praktické využití mapy metabolitů pro lidskou plazmu a sérum a usnadnit interpretaci účasti specifických enzymů v přeměnách mastných kyselin.
Použitá metodika a instrumentace
Pro separaci a kvantifikaci byly využity následující přístroje a podmínky:
- UHPLC systém Nexera X3 se stacionární fází Kinetex C8 (150 × 2,1 mm, 2,6 µm), kolona při 40 °C, mobilní fáze A (0,1 % HCOOH ve vodě) a B (acetonitril), průtok 0,4 mL/min, injekce 5 µL vzorku.
- Ultrafast triple quadrupolový hmotnostní spektrometr LCMS-8060 NX s ESI ionizací v pozitivním i negativním režimu, MRM, s optimalizovanými toky plynů a teplot.
Vzorky plazmy (EDTA, heparin) a séra byly preparovány vysrážením metanolem s vnitřními standardy, SPE extrakcí, zaschnutím a rekonstitucí v metanolu. Každý vzorek byl analyzován v triplikátu.
Hlavní výsledky a diskuse
Komplexní analýzou bylo v lidské plazmě detekováno 67 z 196 cílů (68 včetně TXB2 v séru) a v séru 44 cílů. Klíčové poznatky:
- Volné mastné kyseliny (AA, EPA, DHA) dosahovaly nejvyšších koncentrací v séru.
- LOX produkty (HETE) byly významně vyšší v plazmě, zejména 5-HETE v heparinové plazmě (~660 nmol/L).
- COX produkty (PGE2, PGD2) byly přítomny v plazmě bez signifikantních rozdílů mezi typy protisrážlivých činidel.
- CYP produkty (DHET, 20-karboxy-AA) nevykazovaly rozdíly mezi plazmou a sérem.
Metabolické mapy vizualizují kvantitativní profily a umožňují snadno přiřadit enzymové dráhy odpovědné za tvorbu jednotlivých metabolitů.
Přínosy a praktické využití metody
Nový analytický nástroj:
- Umožňuje rychlou a citlivou kvantifikaci téměř 200 lipidových mediatorů.
- Zkracuje dobu analýzy díky ultrafast MRM režimu (555 přechodů/s).
- Podporuje biomarker screening a farmakologický výzkum zánětu.
Pro uživatele se stává přehledným prostředkem pro identifikaci klíčových enzymů a intervenčních bodů v eikosanoidním metabolismu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekávané směry rozvoje:
- Integrace multimodálních dat (metabolomika, proteomika) pro holistický pohled na zánět.
- Využití výpočetních modelů a strojového učení pro predikci metabolických stavů.
- Adaptace platformy na klinické studie a personalizovanou medicínu.
Závěr
Vyvinutý analytický nástroj založený na LCMS-8060 NX a mapě 196 lipidových metabolitů nabízí robustní řešení pro komplexní studie eikosanoidů. Demonstrace na lidské plazmě a séru potvrdila schopnost rychlé a spolehlivé kvantifikace, usnadnila interpretaci metabolických drah a poskytla podporu pro další biomarkerový výzkum.
Reference
1. Yamada M. et al., J. Chromatogr. B, 995, 74–84 (2015).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Comparison of quantitative eicosanoids profiling in human plasma and serum by ultra-fast multiple reaction monitoring
2021|Shimadzu|Postery
Comparison of quantitative eicosanoids profiling in human plasma and serum by ultra-fast multiple reaction monitoring FP-506 Masaki Yamada, Naoko Nagano, Yutaka Umakoshi Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan. 4. Results 1. Overview A total of 68 eicosanoids and related metabolites were detected…
Klíčová slova
plasma, plasmaserum, serumeicosanoids, eicosanoidsheparin, heparinedta, edtaallmaps, allmapsepaofand, epaofandethanolamides, ethanolamideshumanhigh, humanhighfreeand, freeandfatty, fattyquantitative, quantitativeprofiling, profilingaea, aeaoea
Metabolomics: Quantitative Eicosanoids Profiling of Human Plasma and Serum: A New Data Processing Tool Using a Metabolic Map
2022|Shimadzu|Postery
Quantitative Eicosanoids Profiling of Human Plasma and Serum: A New Data Processing Tool Using a Metabolic Map Masaki Yamada1, Yohei Yamada1, Naoko Nagano1, Yutaka Umakoshi1, Stephane Mereau2 1. Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan, 2. Shimadzu Europa GmbH 1. Introduction Quantitative eicosanoids…
Klíčová slova
map, mapclick, clickimport, importmetabolic, metabolicvanted, vantedinsighttm, insighttmeicosanoids, eicosanoidsmapper, mappermultiomics, multiomicsdata, datapicking, pickingbiomarkers, biomarkersfinding, findingtext, textexport
Lipid and Fatty Acid Analysis Solutions
2023|Shimadzu|Aplikace
C10G-E101 Lipid and Fatty Acid Analysis Solutions Lipids and Fatty Acids Lipids are one of the four major biological substances, along with proteins, carbohydrates, and nucleic acids. Fatty acids are also important in living organisms and make up cell membranes…
Klíčová slova
fatty, fattyacids, acidsacid, acidphospholipid, phospholipidlipids, lipidspackage, packageglucosylceramides, glucosylceramidessummary, summaryshort, shortconfiguration, configurationchain, chainmeasurement, measurementbenefits, benefitsmice, micespf
Development of a Fast Eicosanoid Profiling Method Using Plasma Microsamples
2021|Shimadzu|Aplikace
LCMS™-8060 High Performance Liquid Chromatograph Mass Spectrometer Application News Development of a Fast Eicosanoid Profiling Method Using Plasma Microsamples Masaki Yamada, Naoko Nagano, Harumi Kubo, Takanari Hattori User Benefits Eicosanoids and related fatty acids in plasma can be quantified…
Klíčová slova
dha, dhamicrosampling, microsamplingdgla, dglaplasma, plasmaprofiling, profilingsnapping, snappingwingtm, wingtmtargets, targetsinternal, internaleicosanoid, eicosanoidpaf, pafepa, epafast, fastmicrosamples, microsamplespathophysiology